Methanosarcina hadiensis: RSJ42_17710
Help
Entry
RSJ42_17710 CDS
T10775
Name
(GenBank) PKD domain-containing protein
Organism
mhab Methanosarcina hadiensis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_4
PKD
InlK_D3
Bact_A2M_4th
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XMB89095
LinkDB
All DBs
Position
complement(4124351..4127260)
Genome browser
AA seq
969 aa
AA seq
DB search
MAIIIIGSACAAPDVANESSNITNGLSSSNVTDGSSDITDGLSSSNATDGSSIISGHKIP
EPETRQGKITKDKIPKPETRHDKKLPPGQNIKAASVVKAPAASTPVSNTAVSTAATFTST
PASGTIMDNTKKIAVYMPAMKNWVWCESQNKAVQVAVTFDPMTTAMLSEFDPDYIGDSTA
SLNTLTVGNYELLIVPVSQMSTAAANKIQAYINSGGCVWFLNDPCLTVDGDSGVQLTGML
GNVVSATTSSTTTINVVNDDDITNGLPATFKPAGTTSQSSIFRTFSTPNGTISGLNYQVL
MSYGNAAMLVKFENQTNGARVIYSNPNMFISGGTASYFDAQNASRLFTQTKAWIMKFAQN
PSGVEVTYPNSDKQLTVTSDDHECVPWDQTTIDPMINAETSLGLTPSEINTFYIIPSTYM
TGDKLTYYSQYGDTHTLHPHWKVWDLSNVSVATYVANITAEKGLVNSAAGSSDYGFTSWR
FPMTTYCANSMQAVANSGFIIESSNGVDGDLAGNPADNTLFLPKQVLVNNAKTNMIEYEI
PAGIDIDYATGAEFASANAVYSNQFKYGNFPMNFVILGHYQGMATNCTVTGWGVTSTGLT
DGLKTILSTQQAANANFANINILANYINGVRGSTITGTVDGAVTTITVTNTQPITNFTLK
TTLGNVVSATCDGVAANVKQDSFTGSTYVTANLATAGTHTFVITGSNTPVNPPTPIAPVA
SFTPVTSSGTAPLTVAFTSTSTGTSPTLTWDFGDGTTGSGASISHQFNNTGTTAVTYTVT
LTAQNTAGTNTTTGTVTVNPVIPKPVPSFTYSPESGINTSTMVTFTDTSSNNPTTSSWVF
GDGGTATGATVTHKFTKSGSINVQLTTSNAGGSATLNKTISVGAVIPVASFSYSPTTVRR
GQVVTFTDSSTNYPTSWKWTFSDTGTTVTTTTGKTTHTFKRTGTYTVKLVSSNSAGSSQP
VSKSIRVTY
NT seq
2910 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccataattatcatcggatcagcatgtgctgcacctgatgttgcaaatgaatcatct
aacattacaaatggtttatcttcatctaatgttacagacggatcatccgatattacagat
ggattatcttcgtctaatgctacagacggatcgtcaataatctcagggcataagatccca
gagccagaaactcgacagggtaaaatcacaaaggataagatcccaaagccagaaactcga
catgacaaaaaattacctcctggacagaatataaaagcagcaagtgttgttaaggctcct
gcagcaagtactcctgtatctaatacggctgtctctactgctgcaacatttacatctact
cctgcttctggaactataatggataacactaagaaaattgcagtgtatatgcctgcaatg
aaaaactgggtatggtgtgaatctcaaaataaggctgttcaggttgctgtaacgtttgac
ccaatgacaactgcaatgttgagcgagtttgatccggattacattggggactctacagca
agtcttaatacgctaactgtcggaaattatgaacttttaattgtcccagtatcccaaatg
tctactgctgccgcgaataagattcaggcttatataaacagtggtggatgtgtatggttc
ctaaacgacccgtgtctcacagtagatggtgacagcggcgtccagttaacaggtatgctt
ggaaatgttgtaagtgcaactacaagcagtacaaccactataaatgtggttaatgacgac
gatattaccaatggattaccagcaacattcaaaccagcaggtacaacctcacagtcctcg
atattcagaacattcagtactcctaacggaacaatatctgggctgaattatcaggtactt
atgtcatatggtaatgctgcaatgctggttaaattcgagaatcagactaatggtgcccgt
gtaatttattctaatcctaatatgttcatatcagggggtactgccagttacttcgatgca
cagaacgcatcaagactcttcacccagactaaagcctggattatgaaatttgctcagaat
cccagcggtgttgaggtcacttatccaaacagcgacaaacagctcacagtcaccagtgat
gaccatgaatgcgtcccatgggaccagaccacaatagacccgatgattaatgcggaaact
tcattgggccttacaccaagtgaaattaatacgttctatataattcccagtacatacatg
acaggggacaagctcacttattattctcagtatggtgacactcacacacttcatcctcac
tggaaggtatgggatttatctaatgtgtctgtggctacttatgtggcaaatatcactgct
gaaaaaggacttgtaaatagtgcagctggttcatcggattatgggtttacgtcatggaga
ttcccgatgacaacatattgtgccaactcaatgcaggctgtagcaaacagcggctttatt
attgagtcatcgaatggtgtagatggagaccttgctggcaatccagctgataacacattg
tttttaccgaaacaggtacttgtaaataatgcaaaaacaaatatgatagaatatgaaatt
cctgcagggatcgatatcgattatgcaacaggagcagaattcgccagtgcaaacgctgtc
tattcaaaccagttcaaatacggtaacttccctatgaactttgtaattcttggacattat
cagggaatggctacaaattgtactgttaccggatggggtgtaacgtccacaggacttacg
gatggactaaaaactatcctcagcactcagcaggcggcaaatgcaaactttgcaaatata
aatatacttgcaaattatataaacggcgttagaggatcaactattactggaacggttgat
ggcgcagtaacaaccatcactgtcacaaacacacaaccgattacgaatttcactttgaaa
acaacattgggtaatgttgtttctgcaacatgtgatggcgtagccgcaaacgttaaacag
gatagttttactggtagcacgtatgttacagcaaaccttgcaaccgcaggaactcataca
ttcgtgattaccggttcaaacacgccagtgaatccaccaacaccaattgctccagtcgca
agctttacacctgtcacatcaagtgggaccgccccgctcaccgtggcatttaccagcact
tcaaccggtacgtctcccactctcacctgggattttggagatgggacaacaggatcaggt
gcaagtatttcacatcagtttaataatactggaactactgcagtgacatacacagttaca
cttacagcacaaaacacagctggtacaaacacaacaactggaacggtaactgtgaatcca
gttattccaaagccagtgccttcattcacttattctcctgaatcaggaataaatacatca
accatggtgacattcactgacacaagcagcaacaatccaactacatcatcctgggtgttt
ggcgacggtggaacagctacaggtgcaacagttactcacaaatttactaaaagcggctca
ataaatgttcagctgacaaccagtaatgccggagggagtgctacacttaataaaacaatt
tcagtgggtgctgttataccagttgcttctttcagttactccccaactacagtaaggcgt
ggacaggtagtaacatttactgattccagtacaaattatccaactagctggaaatggaca
ttctctgacaccggaactactgtcactactacaaccggaaaaacaacacacacatttaag
agaactggtacatacactgtgaaacttgtctcatctaacagtgccggtagcagccaacca
gtatcaaagtctatcagagtaacttattaa
DBGET
integrated database retrieval system
