Miniphocaeibacter halophilus: JFY71_06035
Help
Entry
JFY71_06035 CDS
T08075
Name
(GenBank) helix-turn-helix transcriptional regulator
Organism
mhap
Miniphocaeibacter halophilus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_18
HTH_AraC
Cupin_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQK06907
LinkDB
All DBs
Position
1238277..1239794
Genome browser
AA seq
505 aa
AA seq
DB search
MNNIDISLVNINNTDKDFIHYCQEKMDCFLVIKGFVTIGVNNEEYILKENDIIVTNNGDR
YYLVGNESNIVIKMTIDIDYLSEIYSEIRSYTFLCNPKDEKISSGNKYVNLKSSISKILY
INLEKKKGYKFELFSQFFDFIKYLLINFGIKNRQINEIIKADKDFSNIKKYISCNYNKTI
TLTDLAKKNYISPQYFSKLFKSKIGIGFHKYITNIRIDNSIQDLLFTDETIVNVALKNGF
PSSKSFSTNFKDRYKLTPTEYRLKNQDKIKYSEFEVKEFNPSSTDTIMELKRYIKKYELF
KTEMNPKNDLDMIKINLDLDSKEYLDVPTPIINILNIDFLENDITIQQLKYVKDKFNVKY
VYFSAFDDIKIENVLGHSPLKLYGIYKYLDPLYIQKLYPFFKIDFSNVYFKVLKGLFTLK
EYYEYLEQSLNSIVKIFPLYYISDFKFEITNDSFVNQKDYIDFYNNCYRIIKKSLGEVSI
GIKTFYNRFEPSKKEIIELLEKICK
NT seq
1518 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatattgatatttctctagtcaatattaataacacagataaggattttattcat
tactgtcaagagaaaatggattgcttcttagtaattaagggatttgtcactataggagtc
aataatgaagaatatattctcaaggaaaatgatattattgtaaccaataatggagatagg
tattatttggtaggtaatgaatccaatatagtaataaagatgacaatagatattgactat
ttatctgagatatattctgaaataagaagctatacatttttatgcaatcctaaagatgag
aaaattagtagtggaaataagtacgtgaatttaaaatcttctattagtaagattctttat
ataaaccttgaaaagaaaaaaggctataaattcgagttgttttcacagttttttgatttt
attaaatatttattaataaattttggcataaagaaccgacagattaatgaaataataaaa
gccgataaggatttttcaaatattaagaaatatatatcttgtaattacaataagactatt
acattaaccgatttagcaaaaaaaaattatatatctcctcaatatttttcaaaactattt
aaatctaaaattggaattggatttcataaatatataaccaatataagaatagataattcc
attcaagatttattgtttactgatgaaactatagtaaatgttgcgttgaagaatggattt
ccaagttctaaatcattttctacaaattttaaagatagatataaattaactcctacagaa
taccgtttgaaaaatcaggacaaaataaagtatagtgaatttgaagtaaaggaatttaat
ccttcttcaacggatactattatggaattaaaaaggtatataaaaaaatatgaattattt
aaaacagaaatgaatcctaaaaatgatcttgatatgattaagataaatttagatttggac
tctaaggaatatttagatgttccaactccaattataaatattttgaatatagattttctt
gaaaatgatataacgattcaacaactaaaatatgttaaagataaatttaatgtaaaatat
gtttatttttctgcatttgatgatattaaaattgaaaatgttttaggtcattcacctttg
aaattatatggaatatataaatatttagatccattatatattcaaaaattatacccattt
ttcaaaattgatttttctaatgtttattttaaagttttaaaagggttatttacactaaaa
gaatattatgaatatctagagcaaagtttaaattctatagttaaaatatttcctttatat
tatatttcagattttaaatttgaaattactaatgattcctttgttaatcaaaaagattat
atagatttttataacaactgctatagaattattaagaaatctttgggggaagtaagtata
ggaattaaaactttttacaatagatttgaaccatcaaaaaaagagattatagaacttttg
gaaaaaatctgcaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
