Metamycoplasma hominis ATCC 27545: MLBD4_00240
Help
Entry
MLBD4_00240 CDS
T03410
Symbol
valS
Name
(GenBank) fusion of oligopeptide transport protein OppF and valyl-tRNA synthetase
KO
K01873
valyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.9
]
Organism
mhom
Metamycoplasma hominis ATCC 27545
Pathway
mhom00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mhom00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
MLBD4_00240 (valS)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
mhom01007
]
MLBD4_00240 (valS)
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
mhom03016
]
MLBD4_00240 (valS)
Enzymes [BR:
mhom01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.9 valine---tRNA ligase
MLBD4_00240 (valS)
Amino acid related enzymes [BR:
mhom01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (U)
MLBD4_00240 (valS)
Transfer RNA biogenesis [BR:
mhom03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
MLBD4_00240 (valS)
Prokaryotic type
MLBD4_00240 (valS)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1
tRNA-synt_1g
Anticodon_1
tRNA-synt_1_2
Val_tRNA-synt_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIU33800
LinkDB
All DBs
Position
54997..59844
Genome browser
AA seq
1615 aa
AA seq
DB search
MKKIAISSLKVTNLKSINVVNEQFKNLINNLSFTLNANNILGFVGGDSETNNLIFNYLTN
NTINPKRYQGYIEFQTNLGEYSSIYKNSNYQNNIAFGFYNDILNNDLNEDNSYRNIKKYI
NHGAVIGALTEEFVSQWKPVFQDYKLLLQSEFAKLQYGVEIELGSKLDDLFSELSQFDLR
NIDAKNLKFDTLFKKFKDIEILYRTHEMKLFAFVNATIAKYNKGLSFLKRKEYLDSKKEY
EEVIKKIYKPFSKPNRFLNRVRFFSKFLETKKSSKSSIKKFVNKLRRDLNIENYYYKYEL
KKTIKQSSFIHFYKNLYFNGLLLKFINKNLKAILGLKEAKSFELLYEIFDLKNNITNEVN
VISNIDNQKELKNEIKAVIKNNFLNDVMPYIERIKASSYEHTQEVINDVTREIQTSNNYD
LNIGEFGLANKAFEKLKTVESKYKDAKNEYFWNYKTEGNAILKETKKVLRNFNKYSKINS
HKLMRLKLKIFNLINLIKIKEFNNSVLNEQVKKIKENLQFLKILRNEFDSYKYVVSDFKT
ASKKQIKLFVSKINIYKIIAKANIDVNFLVEKLGSLSDDEKIRLECEKILINNPSLIIIG
PNISKLPYEKQCETLNQLNKFVLDNHKMAIYFLDNINIAQKITTDLYIINSSKIIEQGKT
SQLIKNPINPIVKNMLNYKDEKTQEDLSFYMSQEDNMENIYKYEIEPYHFVWCTWSELNR
WINANNVKNKELMSLFIPQNTFQSKGNKTIDNKEPFEETTLINLIDDEDNELRNLNMEKT
FNHKIVEKDRCKKWNDMKIFQTHDESKKPFTIILPPPNVTGNLHIGHALDNYISDTIIRF
KKLQGYDVLWLPGTDHAGIATQAVVEKKLASQNINKYQLGREEFIKKVWEWVDEYSKNIH
NQWQKLGLALDYGFERFTLDDNSNEAVLKVFIELYENGLIYRDKKAINWDPVLETALSNI
EVVPKETKQKMYYIKYPIKNSENFLEVATTRPETMFSDVALAINPQDSRAKQLIKEIIIH
PLTNKEIPIILSNKIDPNFGSGIMKVSAHAVDDIEIIIENKLPINECINKDGKLNDLAGE
FKGLDRFEAREKIAHLLSQKGLLIKEEEVVSNIGYSERSKAPIEILVQPQWFVKMSEFSK
MLLKDLRSDEGVKIFPPRFESTLENWMENAHDWTISRQIWWGHRIPAWYNEQNEIKVQIQ
KPDGNWKQDDDVLDTWFSSGLAPFVFLGWPQDKNKLKRYFPTSLLVTGYDIIFFWVARMY
FFSLYFMDQKPFEHLLLHGLVRDSQGRKMSKSLGNGINPIQVIDEYGSDVLRMSLIFNCT
PGLDINYSDEKIQGAKLFANKFWNIARFVENIPVSITEKIDFNKLDEYDNWILNEYLTFK
KNIEDAMDKYELTIIYKHIQDFVVDKFSNWYLEFLKFKENSYLIHYLFKQILILLHPFMP
FLTDYVFEKLYHEELLCSNLQTFALNKESSNNTPKIISLITALRKYREDKKISKSIELFF
YLNNLVFSSIDLKIINKLSNFSWKENHDFSLKTESFEVFIIQSKQDKENEILELNKLIEF
SQKEIEFNEKLINNPKFMEKANKNTINEKLANLKLHKEKLEFYKNQLKEKQEKIN
NT seq
4848 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatagcaataagttctttaaaagttaccaatttaaaaagtattaatgttgta
aatgaacaatttaaaaacttaattaataatctatcttttacacttaatgcaaacaatata
ttgggttttgtaggtggagatagcgaaacaaataatttaatatttaattatttaactaat
aatacaataaatcctaaaagatatcaaggttacattgaatttcaaacaaacttaggtgaa
tattcttcaatatataagaactcaaattatcaaaataacatagcttttggtttttataat
gatattttaaacaatgatttaaatgaagataatagctatagaaatataaaaaaatatatt
aaccacggagcagttataggggcactaacggaagagtttgtttctcaatgaaaaccagtt
tttcaagattataaattattgcttcaaagcgaatttgcaaagttgcaatatggtgtcgaa
attgaactcggaagtaaattagatgacttattcagtgaattaagtcaatttgatttgcga
aatatcgacgctaaaaatttaaaatttgatactctttttaagaaatttaaagatatagaa
attttatatagaacccatgaaatgaaactattcgcatttgttaatgcaactatagcaaaa
tataataaggggttatcgtttttaaaacgcaaggaatatttagacagtaaaaaggaatac
gaagaggtaataaaaaaaatttataaacctttttcaaagcctaatagatttttaaataga
gtaagatttttttctaaatttttagaaacaaaaaaatcttcaaaatcatctattaaaaaa
tttgtaaataaattaaggcgtgatttaaatattgaaaactattattacaaatatgaatta
aagaaaacaataaaacaatcttcatttattcacttttataaaaatctatattttaatggt
ctattattgaaatttataaataaaaatttaaaggccatattagggctaaaagaagcaaaa
tcgtttgaattattgtatgaaatttttgatttaaaaaacaatattacaaatgaagttaat
gtaatttcaaacattgataatcaaaaagaattaaagaatgaaataaaggctgtaataaaa
aataattttttaaatgatgtgatgccatatattgaaagaattaaggcgtctagttatgaa
cacactcaagaagttattaatgatgttacaagagaaattcagacgtctaataactacgat
ttaaacataggcgagtttggccttgcaaacaaagcgtttgaaaaattaaaaacagttgaa
tcaaaatataaagatgcaaaaaatgaatatttttgaaattataaaactgaagggaatgcc
attttaaaggaaacaaaaaaagttttaagaaattttaataaatattcaaaaataaactca
cataaattaatgagattaaaactaaaaatttttaatttgattaatttaataaaaattaag
gaatttaataattcagttctaaatgagcaagtaaaaaaaataaaagaaaatctacaattt
ttaaaaattttaagaaatgaatttgattcttataaatatgttgtaagcgattttaaaacg
gcatcaaaaaaacaaataaaactttttgtttcaaaaattaatatttacaaaattattgca
aaggcaaatattgacgttaattttttagtagagaaattaggctctttaagcgatgatgaa
aaaattagattagagtgcgaaaaaattttaattaataatccttcacttataataatagga
cccaatatttctaaattaccatatgaaaagcaatgcgaaacattgaatcaattgaataaa
ttcgttttggacaatcacaaaatggcaatttatttcttagacaatataaatattgctcaa
aaaataactacagatttatatattataaattcatcaaaaattattgagcaaggaaaaact
agccaattaataaagaatcctataaatcctatagtcaaaaatatgttaaattataaagac
gaaaagactcaagaggatttaagcttttatatgtctcaagaagacaatatggaaaatata
tacaaatatgaaatagagccataccactttgtttgatgcacatgaagcgaattaaacagg
tgaataaacgccaataatgttaaaaacaaagagcttatgagtttatttattccacaaaat
acttttcaaagtaaaggaaataaaacaatagacaataaggaaccattcgaagaaacaacg
cttataaatttaatcgatgatgaagataacgaactaaggaatttgaacatggaaaaaact
tttaatcataaaatagttgaaaaagacagatgcaaaaaatgaaatgatatgaagattttt
caaactcacgatgaatctaaaaaaccattcaccattattttgccacctccaaatgtaacc
ggcaatctccatattggccatgccctagacaattatatttctgatacaataataaggttt
aagaagttacagggatatgatgtattgtgactaccaggaacagatcatgcaggtatagca
actcaagcagtagttgaaaagaaactagcttctcaaaatatcaataaatatcaattagga
agagaagaatttattaaaaaggtttgagaatgagtagatgaatattcaaaaaatattcat
aaccaatgacaaaaattaggtttggcacttgattatggttttgaaagattcactttagat
gataattctaatgaagctgtattaaaggtatttattgaactttatgaaaatggtttaata
tatcgtgacaaaaaagcaataaattgagatcctgtattagaaacagctctttctaatata
gaagtagtaccaaaagaaacaaagcaaaagatgtactacataaaatatccaattaagaat
tcagaaaactttcttgaagtagccacaacgagacccgaaacaatgttttcggatgtagct
ttagcaataaacccgcaagatagtagagcaaaacaattaataaaagaaataataatacat
ccattaacaaataaagaaattccaattattttatcaaacaaaatagatcctaattttggt
agtggaataatgaaagtttcagcccatgctgttgatgatattgaaattattattgaaaat
aaacttccaataaatgaatgtatcaataaagatgggaaattaaatgatttagcaggtgaa
tttaagggattagatcgttttgaagctagagaaaaaattgcacacttattaagtcaaaaa
ggacttttaataaaagaagaagaagtagtttctaatattggatatagtgaaagatcgaag
gctccaattgaaattttagttcagccgcaatgatttgttaagatgtcagaattttcaaag
atgcttttaaaagatttgcgcagtgacgaaggagtaaaaatttttccaccacgttttgaa
agtacactagaaaattgaatggaaaatgctcacgattgaacaatttcaagacaaatttgg
tgagggcatcggattcccgcttggtacaatgaacaaaatgaaattaaagttcaaattcaa
aagcctgatggaaattgaaaacaagacgatgatgttttagatacttgatttagttcggga
cttgcaccatttgtatttttaggatggccacaagacaagaacaaattaaaacgttatttt
cctacaagcttattagtaactggatatgatattattttcttttgagtagcaagaatgtat
ttctttagtttatattttatggatcaaaaaccttttgaacatcttttattgcatggatta
gttagagattcgcaaggaagaaaaatgtctaaatcgcttggcaatggaattaatccaatt
caagtaattgatgaatacggttctgatgttttaagaatgtctttaatttttaattgcaca
cctggccttgatattaattacagtgatgaaaaaatccaaggcgctaaactatttgctaat
aaattctgaaatatagctagatttgttgaaaatattcctgtttcgataactgaaaagatt
gattttaataagttggatgaatatgataattgaattttgaatgaatatttaacattcaaa
aaaaatattgaagatgccatggataaatatgagttaactattatttataagcatattcaa
gattttgttgttgacaaattctcaaattgatatttagaatttttaaaatttaaagaaaat
tcatatttaatacattatttattcaaacaaatattgattttgttgcatccatttatgccg
tttctaacagattatgtttttgaaaaattatatcatgaagaattgctatgcagcaatctt
caaacttttgctttaaataaagaaagttcaaacaatactcctaaaattatttctttaatt
actgctttaagaaaatacagggaagataaaaagatttcaaaatctattgaattattcttc
tatttgaataatcttgtattcagcagtatagatttaaaaataattaacaaattaagcaat
ttttcttgaaaagaaaatcacgatttttcactaaaaacagaaagttttgaagtatttata
attcaaagtaagcaagacaaagaaaatgaaattctagaattaaataaattaattgaattt
agtcaaaaagaaattgaatttaatgaaaaattaattaataatcctaaatttatggaaaag
gctaataaaaatacaatcaatgaaaaattagcaaatttaaaattgcataaagaaaaatta
gagttttataaaaaccaacttaaagaaaaacaagaaaaaataaattaa
DBGET
integrated database retrieval system