Methanosarcina horonobensis: MSHOH_3183
Help
Entry
MSHOH_3183 CDS
T03933
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
mhor
Methanosarcina horonobensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
DUF2341
TcdB_toxin_midN
FG-GAP_3
SpvB
FG-GAP
GIY-YIG
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKB79666
UniProt:
A0A0E3SF43
LinkDB
All DBs
Position
complement(3900826..3907539)
Genome browser
AA seq
2237 aa
AA seq
DB search
MPDWTERGSSLLVILLTPNVYCLENIETSQDGNYESSQADFDSYEENNENAVEKEETSEA
ISDLDSESVDDDSETASEDTVLTATSEDDIEPLGNAKAYLSPALENENDYFDASLFTGSF
VYSYPIEALKGRAGLEPKVSLTYSSAMGSGGTYGSLGMGWSLNENCVIRDTRYTPDNTSD
DRFILVLDGSTYKLVYVEEDESYHTEIESFMKIEKSTTGSNSFGDYWILKMPDGTKYRFG
YNSDSEQRNSVESRNYVSKWWLDLIEDVNGNQIKYKYLENPKSGEIGSTYLDSITYNDNH
AVIDFEFTEKPDSFTVYEYGNKICENSLISSITVQNDETILWEYDLDYNTQQSKLYLTSI
TKAGLNNAEFPPTIFEYGSIIEGWQESSSWISPIDFGGGRDRGERLVDINGDGLEDIIQG
YIASNNAVCCSAWINTGDGWELNSSWETPTYFRHYTHDGGARLADVNGDGLVDIIQNGSY
ISSAWLNTGVGWEQNNSWTPPLDFGWSSDSGVRVLDINGDGLADIIKGYKSDYVHEYYDA
YLNTGEGWIQDNSWNPPVCFSYDGSDQGIRLVDVNGDGLVDLVKYGSAWLNNGSGWEQDN
SWGAPVSLLSIGICLADVNGDGLVDILKGYLYSEGSTYNAWINTGDGWEEKNSWNPPTLI
GSYTKGLGVRFADLNGDGLTDIIQGNGLSCCYTWINTNTDSTEDYKTPGLLKKIQHPTGG
STTIKYEPSTNFDNTGNDGVSDLSMSMWVTSSVTRDNGITGTGRVVSTTNYTYKNGMQYF
NPPEEIEFRGFGEVTVENEYSIIKHFFHQDNVLKGIENHTEVWDKNGNLYSSSNMEYTAQ
RTYPDVNLILLDSISKTQFDGLVKSPTSSAGWSSFIKYNEYDDYGNPLSITDYGDVNTTG
DGKYLYYEYANAEGPWILGKKTHEWLKDSNQTKKSESWYYYDGTNDNSAISKGQLTKTIS
WNNMGDNPTVLYDYDNYGNIIQITNPEGASKNIEYDDNHLYPASIENALGQKECYEFNDL
GRITKITDSNGISTAYVYDDLHRISKMLKVDDTLDSPSTEYTYYQDGVAPEKVLTKTKDC
GSEENNYIVNGSIFKNYKTITISPSADGTLTDYQVSFDVAYEPEMQSDFDDVRFVDDNGI
PLPYWIEEKTDSVSAKVWVKVPEIDGIHGTTINMYYGNSGVPSASNGNAVFDFFDDFESG
VLDTAKWNTIGSPTIIDDSGDKVLRLTPNNDVNTFNKFSGTEYTVGGLMKFESFGYFGGP
RMSLEVKEPNNQLARFSYRIESYPDGTGWTGTSITYASSSASFIPIAQARPSWSTGVWDR
FSFSSSNNLQKLSSDKLNLSGTYANNLSGSIYIGTWDNGNDIRFSHIYVRKFASFEPTYV
VGDTETGYDEGSTNTSYSYSTFDSTDSYDGFGQLIQKKYEGEDGWIIQNTAYNELGLVES
AEVPHYSDQSGLSVTYEYDATGRPTVITNTDGTTLRYHYKLDNTTITNQNGVNKTLTSDV
FGNVVRVYEFNGNETYVTSYGYDALNSLIEISPGCNDPQMPPSVYFTYDSLGRKVAMNDP
DMGSWTYEYDLNGNLVNQTDARGVSTILSYDDLGRVTSIYYPNDEDVSFTYDLKFNGTLS
KVKKGNVSSDYNYDLRYRVKDEAVTIDGTRYTTSYKYDSMDRVIRITYPNAASVNLRYNN
QTLLESVEGVIDNLDYNARNQITRKEYSNGVVTTYTYDSQKLLLDRIYSAGLQDLNYDFD
NVGNVLQIVDNAQNSVKTYGYDDLDRLVSAEMYSGSRVNLNYLIDFTYDQYGRIEINDAT
YGPVPFIEETALYEYSLTPFHAPVTYSVGSLGYDTNDLDYDANGNLIDDEDFIYVYNDAN
QLSEVRYSANNSLVEKYWYDANGQRIKKQNSTGEFTYYVNKFYEIENGTVISYFFLNDER
IAKKTSEGMEWYLSDHLGSTSLMIDENGVEVERTDYFPYGQVRSGGLEKYGFTGQENDAD
TGLMYYGARYYSPEYSIFVQPDTMLPDPYNPQVLNRYSYALNNPVKYSDPSGHYVESALD
VAFILMDLNDIRQDPSDLWAWGALGADGVCAVVPIATGGGLGVKAIKATNGIDNAVDTTK
AIEKSVEVVDTVADAGKAVDNVGDTLKVSDNVPESLMVGEANTYVYYGVRDGENVYVGIT
NNPTKRIYQHGDRFDVLYVLNRGEPLTRKQSRAIEQAEIVSNPSFENKINSISPNRDFYD
KAVEWGQNWLKGNGYKR
NT seq
6714 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgccggattggacagagaggggtagttcactgctagttatattgctcacgcctaacgta
tattgtcttgaaaacatagaaacaagtcaagatggaaattatgagagctcacaagcagat
ttcgattcatatgaggaaaataacgaaaatgcagtagaaaaagaggaaacgagtgaggca
atttccgatcttgatagtgaaagcgtggatgatgattcagaaactgcttctgaagatact
gtgttaactgcaacttctgaagatgatatcgaacctttagggaatgcaaaagcatatctt
agtccggccctggagaatgaaaacgattactttgacgcaagtctatttacgggttctttt
gtatattcttatccgattgaagctttaaaaggaagagctggcctggaaccaaaggtttct
ttaacatactccagtgctatgggctctggaggaacatacggttcactggggatgggctgg
tcattgaatgaaaactgtgtcatcagagataccagatatactcctgataacaccagtgat
gatagatttattcttgttctggacggctcaacttacaaacttgtttatgtggaggaagat
gagtcatatcacacagaaatcgaaagttttatgaaaattgaaaaaagtacaacaggcagc
aattcttttggggactactggatcctgaaaatgccggatggaacaaaataccgttttggt
tataacagtgattccgaacaaagaaactccgttgaatcaagaaattatgttagtaaatgg
tggctcgatttaatagaagatgttaatggcaaccagattaagtacaagtatcttgaaaac
ccgaaaagcggggaaataggaagcacatatcttgacagcataacttataatgacaatcat
gcagttattgattttgagttcacggaaaaaccagactccttcacggtttatgaatacggg
aataaaatttgtgaaaatagtttaatatccagcatcaccgttcagaacgatgaaactatt
ctctgggaatatgatcttgattacaacacacaacagtcaaaactatatcttacatctatc
acaaaagcagggctaaacaatgcagagttccctcccactatttttgaatatggctctata
atcgaaggatggcaggagagtagttcatggatatccccgattgatttcggaggaggaaga
gacagaggagaaaggttggtagatatcaacggcgatggattagaagatattattcagggt
tatatagctagtaacaacgcagtttgttgttcggcatggataaataccggagatggctgg
gaactgaacagctcctgggaaacaccaacatatttcagacattatacccatgatggagga
gcccgccttgcagatgtcaacggagatggattggttgatattatccagaacggatcttac
atttcttctgcctggttgaatactggtgtcgggtgggaacaaaacaactcctggacacct
ccattggattttggctggtcaagtgatagcggtgtaagagttttagatatcaatggagac
ggattagctgatataattaagggttacaaaagtgattatgttcatgaatactatgatgcc
tatctcaataccggtgaaggctggatacaggataactcgtggaacccccctgtttgtttt
tcatatgatggaagtgatcaagggatacgactcgttgatgtcaatggagatggattggtt
gatctcgttaagtacggttctgcctggttaaataatggcagtggatgggaacaggataat
tcctggggagccccagtatccctcctttcaattggtatctgcttggcggacgttaacgga
gatggtttagtagatattctcaagggttatctttatagtgaagggtccacctacaacgct
tggataaataccggtgatggttgggaagagaaaaattcatggaatcctcctacattaatc
ggaagctataccaaaggcctgggagtgcgctttgcagatttgaacggggacgggctgaca
gatattattcaaggaaacggtcttagttgctgctatacttggataaacactaacaccgat
agtacagaagattacaaaaccccaggtctgctcaaaaaaatacagcatccaaccggcgga
agtacaacaataaaatatgaaccttccacaaattttgataacactggaaacgacggcgtt
tcagatctgtccatgagtatgtgggtcacaagcagtgtgacaagagataatgggattaca
ggcaccggaagagtagtttcaacaacaaattacacttataaaaacggaatgcaatacttc
aatccaccagaggaaatcgaattcagaggatttggtgaggtcactgttgaaaacgaatac
tcgataataaaacactttttccaccaggacaatgtgctgaaaggtattgagaatcatact
gaagtatgggacaaaaacggaaacctttacagttcttcgaacatggaatatactgctcag
agaacatatcctgatgttaacctgattttgctggactcgatatctaaaacacaatttgac
gggcttgttaagagcccaaccagttcagccggctggtcctctttcatcaaatataatgag
tatgacgattacgggaacccgctttccataacagattacggtgatgtgaacactactggg
gatggaaaatatctttattatgaatatgccaatgcggaaggtccgtggattctcgggaaa
aaaacgcatgaatggctgaaagattcaaatcagacaaagaagagcgaatcatggtactat
tatgacggaacaaatgataacagtgccataagcaaagggcaactcacaaaaacaatatca
tggaacaatatgggagataatcccactgttttgtacgattatgataactatggaaatata
atccagattacaaatccggaaggggcttcaaagaacatagaatatgatgataaccactta
taccctgcttccattgaaaacgccttgggtcaaaaagagtgctatgagttcaacgatctt
ggcaggataacaaaaataacagacagcaacggtatttctacggcatatgtctatgatgac
ctgcacagaatatcgaagatgctgaaagtcgacgacacacttgattctccatctacagag
tacacgtactatcaggatggtgtagcacctgaaaaagtattaaccaaaacaaaggactgc
ggtagtgaagagaacaattacatcgttaatggttccatattcaagaattataaaactatc
acaatttccccgtctgcagatggcactttgactgattaccaggtgagtttcgacgtcgct
tacgagcctgaaatgcaatcggatttcgatgatgttcgttttgttgatgataacggcatt
ccacttccatattggattgaagagaaaacagattccgtttcagcaaaggtctgggtaaag
gttcctgagatagatggtatacatggtacaactatcaatatgtactatggtaactctggt
gtaccttcggcatcaaacggtaatgcggtttttgacttctttgacgattttgagagcgga
gtactagatactgctaaatggaatacaataggttcgccgacaattattgatgatagtgga
gacaaagtactcagactgacaccaaacaacgatgtaaatacatttaacaaattttccggt
acggagtataccgttggaggactgatgaaatttgagtcatttggctatttcggtggacca
cgtatgtcacttgaggtcaaggagccaaataatcagttggcacgtttctcataccgtata
gaatcatatccagacggcactggatggacgggcacttcaataacgtatgcttcgtcgtca
gctagttttattccaattgcacaagcccgaccatcatggtctactggtgtgtgggataga
ttttcattttcttcatcgaataacttacagaagctatctagtgacaaactcaatctttct
ggtacttatgcaaacaatctttccggttctatatatataggtacatgggataatggcaat
gacattagattttcacacatatatgtccgtaagttcgcatcattcgaacctacatatgta
gttggagatacggaaaccgggtatgatgaaggatcaacaaacacgtcttattcttattcc
acgttcgattccaccgattcatacgacggcttcggtcaactgatccagaaaaagtacgaa
ggagaagacggctggattatccagaatactgcatataacgaactgggccttgtggaaagc
gctgaagtcccgcattactctgaccaatccggcttatccgtaacctatgaatacgatgca
accggacggccaacggtcatcaccaatactgacggcactactctgagatatcattacaaa
cttgacaacactacgattaccaatcagaacggggttaataaaacactaacaagtgatgtt
ttcggaaatgttgtcagggtctatgagttcaacgggaatgaaacctacgttacatcttat
ggttacgatgctcttaatagcctcatagagatttcgccgggctgtaacgaccctcagatg
ccacccagcgtttatttcacctacgattcccttggccggaaagtggcaatgaatgaccct
gacatgggaagctggacctatgagtatgaccttaacggcaacctggtcaaccagaccgat
gctcggggagtttcaacaattctcagttatgatgacctgggcagggttacttcaatatat
taccctaacgatgaggatgtcagtttcacatatgaccttaagtttaatggtacgctctca
aaggtgaaaaaaggaaatgtttcgtcagattataactacgacctgcgctacagagtcaag
gatgaagctgtaactattgacggcacacgttataccacatcctacaagtatgacagtatg
gacagggtcataaggatcacttatccaaatgccgcaagtgtcaacctgagatacaacaac
cagacccttcttgaaagcgttgagggcgtgatcgacaaccttgactacaacgcaaggaac
cagatcacaagaaaggaatattccaacggcgtggtcacgacctatacctacgacagtcaa
aaactgctgctggacaggatctattccgcaggcctccaggacctcaattacgatttcgac
aacgtcggcaatgtcctgcagattgtggacaatgcccagaattccgtaaaaacctacgga
tacgacgatcttgacaggcttgtcagtgccgagatgtactcaggtagtagggtgaacttg
aactacctgatagacttcacctacgaccagtatggccgtatcgagattaacgatgctaca
tatggccccgttccctttattgaagaaactgcactttatgaatattctctgacacctttc
catgctcctgttacttatagtgtaggcagcctgggttatgatacaaacgacctggactat
gatgcaaacggaaacctgatcgacgatgaggatttcatctacgtctacaacgatgcaaac
cagttgagtgaagtccgttactcggctaacaattcccttgtggaaaagtactggtacgat
gcaaatggccagagaatcaaaaaacagaactcaactggcgaattcacttattatgtaaac
aagttctacgaaattgaaaatggcactgtcatcagctacttcttccttaatgacgagcgc
atagctaagaaaacatccgaaggcatggagtggtacctttccgaccacctcggcagcact
tctctgatgattgacgaaaatggtgttgaagtcgaacgcaccgattacttcccatacggt
caggtgaggtcaggcggtcttgagaaatacggtttcacaggtcaggaaaatgatgccgat
acagggttgatgtactacggcgcaagatattattcgcctgagtacagtatttttgttcag
cctgatacgatgcttcctgatccgtataatccgcaggtattgaacaggtactcttatgct
ctgaataatcctgtgaagtatagtgatccgagcgggcattatgttgaaagtgctcttgat
gtcgcatttattttgatggatttgaatgatatcaggcaggatccatccgacctgtgggcc
tggggagcacttggtgcagatggagtatgtgctgttgtacctattgcaaccggtggcggg
cttggggtaaaagcaatcaaagctactaatgggattgataatgctgttgatacaacaaag
gccatcgagaaaagtgtcgaagttgtagatactgttgcagatgccggaaaagcggtggat
aatgttggagatacactaaaagtttctgataatgttccagagtctttaatggtaggagaa
gcaaacacctatgtgtattatggtgtccgagacggtgaaaatgtctatgttggaattaca
aataatccgacaaagagaatttatcagcatggagatagatttgacgtattgtacgtttta
aacagaggagaaccgttaacaagaaaacaatcaagagctattgagcaagctgaaatagtg
agtaatccctcgtttgaaaacaaaattaatagcatcagccctaatagagacttttatgat
aaagcagtagaatgggggcaaaattggttaaaaggcaatggctataagagatga
DBGET
integrated database retrieval system
