Mesomycoplasma hyopneumoniae 7448: MHP7448_0092
Help
Entry
MHP7448_0092 CDS
T00264
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mhp
Mesomycoplasma hyopneumoniae 7448
Pathway
mhp03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mhp00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
MHP7448_0092
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mhp03019
]
MHP7448_0092
Messenger RNA biogenesis [BR:
mhp03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MHP7448_0092
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_b_CASP
Lactamase_B_2
RMMBL
RNase_J_C
Lactamase_B
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ53469
LNCC_Brazil:
MHP0092
UniProt:
Q4A8S0
LinkDB
All DBs
Position
complement(119568..122033)
Genome browser
AA seq
821 aa
AA seq
DB search
MSLMVNPTRFFGLGGMQEIGKSTLVIEDDYDIVIIDAGIKFANLFHTGIRGMVPNYQYLQ
EKQAKIRGLFVTHGHEDHIGGIIFLVQEVDIKKIFAPKIAIQYLKAKFEDQKIRPKIEFI
EINKNDTHRFESFTVDFWTAQHSIPDAFGIRITSRHGSIMCTGDFRFDYTPIGNYTDFER
LKEIGNQKLTVLFSDSTNAMRPNHSPSERDILGDIEMHMRSATRKIIITAFASNLTRIKA
LIEIGIKLEKKILVFGRSMVNGINIGRRSGYINVDDNVFLGKNLEGVEENQMLILTTGSQ
GEQLAALDRMSNRKHPKISIEPQDLIIFSSSPIPGNKIKIEHLINRLYKLSAIIKENGPD
GYLHTSGHAYKAEHEKIFQLTKPKYFFPYHGEYRMCLAHSRTAIESGVDPKNVIIPENGQ
VFKMYNQEIYKTNEKIPCDPVYIDGETISRDNSRIINERQEMRENGFVFVLIPFDRQKNS
INGRISVITKGAFSTKNGTQIIAEIRRLCFASIKFFIEKQPKWSPPQIKQLIKNRLNSYF
HRTKRWKPVILTQILYVDQKEDFLKNYQEKTTEKFVVKKIKTNLTKESEKNKEIPTKKGK
KMENHPKTEQNYNKLAKKSDLNKKVQNLQIRQKNVNVKSSKTEKDQENKIKKSIEKVTRK
INSTLRKTKNDNQSDILIEKSPNSNQKNPNKFKNKNPQKTENLVFFKKENLKKSYENDAK
KIKKSLINSKNLPYNNNNNNNNKENVKNSGDPQALLARKKLYPLKNKKQNTLFQTKKQEL
NVPKSPKKFKKSNFITAINTKINKENNKKNSQKSNKIPKNA
NT seq
2466 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccttaatggtgaatccaacacgttttttcggccttggtggtatgcaggaaatcggt
aagtcaactttagttatcgaggatgattatgatattgtaattattgatgctggaatcaaa
tttgccaacctttttcataccggcattagaggaatggtgccaaattatcagtatctgcaa
gaaaaacaagctaaaatacgtggtctttttgtaactcatggtcatgaagatcatattggc
ggaataatttttttagttcaagaagtggatattaaaaagatttttgccccaaaaatcgct
attcaatatttaaaagcaaaatttgaagaccaaaaaattaggccaaagattgaatttatc
gaaatcaacaaaaacgatactcatcgttttgaaagttttacagtcgatttctgaaccgcc
cagcattctatcccggatgcttttggaattagaataacctctagacatggttcaattatg
tgcacaggcgactttcgatttgattatactccaattggaaattataccgattttgaaaga
ctaaaagaaattgggaaccaaaaattaacagtgcttttttctgattcaacaaatgcaatg
aggcctaaccattcgccttcagaacgggatattctaggtgatattgaaatgcatatgcga
tctgctacaagaaaaattatcatcaccgcttttgcttcaaatttaacaagaattaaagca
ctaattgaaattgggataaaattagaaaaaaaaatccttgttttcgggcgctcgatggta
aacggaattaatattggtcgtcgttcaggatatataaatgttgatgataatgtttttctt
ggtaaaaatttagaaggtgttgaggaaaatcagatgttaattttaacaacaggatcccag
ggcgaacaacttgcggctttggatcgaatgtcaaacagaaaacatccaaaaatcagcatc
gaacctcaggatctaattattttttcctcttcgccaattcctggaaataaaattaaaatt
gaacatttgatcaatagattatataaattaagcgcaattattaaggaaaatggacctgat
ggttatcttcatacctccggtcatgcttataaagccgaacatgaaaaaatttttcaacta
acaaaaccaaagtactttttcccttatcatggtgaatatcgaatgtgccttgcccactcg
cggaccgcaattgaatccggagttgatccaaaaaatgtaattatccctgaaaacggtcaa
gtttttaaaatgtataatcaagaaatttataaaacaaatgaaaaaattccttgtgatccg
gtttatattgacggtgagactatctctcgggataactctcggattattaatgagcgacaa
gaaatgcgggaaaatggttttgtttttgtcttaattccatttgatagacaaaaaaattca
ataaatgggcgaatttcggttattacaaaaggagctttttcaactaaaaatggaacacaa
attattgctgaaattcgccgactttgttttgcatcaattaagttttttattgaaaaacag
ccaaaatgatcaccaccgcaaattaaacaattaataaaaaatcggctaaattcgtatttc
catagaacaaaacgttgaaaaccagtaattttaacacaaattctttatgttgatcaaaaa
gaagattttctaaaaaattaccaggaaaagaccacggaaaaatttgtggttaagaaaatt
aaaactaatcttaccaaagaaagtgaaaaaaataaagaaattccaactaaaaaaggcaaa
aaaatggaaaaccatccaaaaactgaacaaaattataataaactagctaaaaaatcagat
ttaaataaaaaagtacaaaatttacaaattaggcaaaaaaatgtgaatgtcaaatcttct
aaaacagaaaaagatcaagaaaataaaataaaaaaatcaattgaaaaagtgactagaaaa
ataaattccactttaagaaaaacaaaaaatgataatcaaagtgatattctaatagaaaaa
tcaccaaattctaatcagaaaaacccaaataaatttaaaaataaaaatcctcaaaaaacc
gaaaacttagtattctttaaaaaagaaaatttaaaaaaaagctatgaaaatgatgctaaa
aagataaaaaaaagtcttataaactcaaaaaatttaccttataataataataataataat
aataataaagaaaatgttaaaaattcaggagatccacaagccttattagccagaaaaaaa
ctttatcctttaaaaaataagaaacaaaataccctttttcaaacgaaaaaacaagaactg
aatgtaccaaaaagcccaaaaaaatttaaaaaatctaattttattactgctataaatact
aaaattaataaagaaaataataaaaagaactcacaaaaaagtaataaaataccgaaaaat
gcttaa
DBGET
integrated database retrieval system