Mesomycoplasma hyorhinis HUB-1: MHR_0154
Help
Entry
MHR_0154 CDS
T01301
Name
(GenBank) putative Serine-rich adhesin for platelets
Organism
mhr
Mesomycoplasma hyorhinis HUB-1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF1410
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADM21626
LinkDB
All DBs
Position
202576..208200
Genome browser
AA seq
1874 aa
AA seq
DB search
MEGRFNSTAEHPLKDVTRLELTSQHSNNIIEVKPTSFNNNTLEFNLDNLDKLSEYHINNL
FINNEVIPWAYDLTQTTTKLSNPRVFNTTANQAKLVSVTQTDSSAHKAVVNIQFDPQKDY
FLLGNSISVKFKKTSGTPSQNPYVTKQVTIDNEGVASVEIDQQSLATNPTNQNLTAGAVY
KIESIDFHNTKVADANKLANTKIALDVYKQNSSDVAASIPLSSDDSEFRTQPIVETLQAE
RLENSTGQINIQINSEDTKLTTKYAWITYQSQKDNSIKTLKSANHIANSNGQYKANFDLR
SLNVLERYKVLSVKLGDDNQADAKANDLELNQQIDQQNHRDFYTKPTIATIQAIQVDYPD
ARGTTAVVDIKFDNIHDTYLNGSSAKITYERIAENGRQIGQDITHIQTLSKKNFQIINSS
VKFTLTGDTNNTSDTQKVILVKSQIDQQQQIQHTNTVKSIGTQKNESNKQVNQNQLVEGT
RYRIKKIELVDPSDDLKQLRFQFKQSQDSNKKINETTLIEPLRISTYDYKIQVDETPTAV
NTTIATYYSTSYNLQDSDKNKFNLYVKNLSTNEVEIVSSANSITNLNPTDNDGNYKVEFV
LINKKASIYKILSTTYDNQNIIMSSYINPETSQANIYTTPASKSKVKELKYLANSQLEET
QATVTAYFDDTNEDLTRVKRKAKLFYKKVDAISASASQLLESAEVEIKENKAEFKLGQTN
QRLTANTQYVVEKIEINSKSDFQNEIQANQLDTSKFNIIAQKNDSTFDVKIQDNDKLFET
KAQFGTSYTNEGENSATVTLSFENPGHQIQNNKIAYIVFAESTLAQTNQNDIFQEAASRT
HLSNANVNQNILTFNLRGLKKGTQYKVKKVIIDNIEYNIEQNSIATFSTILTKATVTNIV
YNYSDFATTEANSQNNTDNNVKAKFRIYFQTIDNFLNNQYINVKLNSKKNALSEQTQTSS
AINKVVQVHVDKAQQNSGLVYADVELTNSDQIKAATEYSIEQIQVLNSNRSQDVKQGVTV
EGLTNNGNITKDFYTITNIESFNATVDETSAELTFKLNSYDPQLINEPVVLVLSDNNNQK
YYSQVVPNPQNPGQIKFYLSYLDKLKSYTIESLQFSKGASGVNIAFKPNVSKTFKTIAKD
FEIKDIMQVSNTANSVKLKLTFNGELDKYLDTKQIKLKYKEYKDGVEGSQKTSKTIATIK
SPTTVTQTAPNTFEAEFDLQGLDVDSGTRYKIEGVELVDTSIQNNQQQPLQSRISDDIAK
FFSNKLLFETKVAQPKLKSIELLQTTNEQGEENTYIAPVKLVFYDKNDALAKDKIGLLSN
GAVSNNGLNAWNFEFWTDQKKSNVKFLDNVEIDHNSVEKTTTVKVFMQGNAKDWVTLNST
IESQNSNQKTKNKRIRFKYSYYEDLDRKTAVSVGNLNSDVIHTYADANSNSAQNTDPLYV
DSPDWFVLEKTTGTFLPDAKMIYSFEVYDPNNKINTLQEELQPEQSPTWKRRELYNTMTQ
NIEYGNQIAWQTINKIQLELKSKQSILNFRNLTYSEGNNREFDVNAQYSDISATDAEDIP
NYTNSLNNNSKINFRYKYPSQDSEYKPSNIDNSQSRYTQQQKNTRINTYVREIKATGAQQ
NSKIINLQVGSGTDSLNLRQKVLSKILSINFDNLSIKDKPVLFAKNSSKFINTIQTPFSI
TNNAWWFGAINNPNSNSNILGLTSNIDLNTNVDQNKFGIKNIRYNNDTNSVTVDYQRNTD
AQIQTAFPEAVYASFINQKGDLYFFGGKDGNPLSYRNDYDFTNNTMTFYLGSEQIPYDQR
PKFGEILSFVGVVVAPYLGDGTPTNRYSITNRSITLTEQDSSGSTIDFSNMYLTNFVKQE
PIYKRIKIGSSNFN
NT seq
5625 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaggtagatttaattctacagctgaacatccattaaaagatgtaactagattagaa
ttaacttctcaacactctaataatataattgaagtaaaaccaacaagttttaataataat
actttagaatttaatttggataatcttgataaattatcagaatatcatattaataattta
tttattaacaacgaagtaattccttgagcttatgatttaacacaaactactacaaagtta
tcaaatccaagagtatttaatactacagcaaatcaagcaaaattagtttcagttactcaa
acagattctagtgcgcataaagcagtggttaacattcaatttgatccacaaaaagattat
ttcttattaggaaattcaatttcagttaaattcaaaaaaacttcaggaacaccttcacaa
aatccatatgttacaaaacaagtaactatcgataacgaaggtgttgcaagtgtggaaata
gatcagcaatcattagcaactaatccaacaaaccaaaatttaacagctggtgctgtttac
aaaattgaatctatagattttcacaatactaaagttgcagatgcaaacaaattagcaaat
acaaaaattgctttagatgtatataagcaaaattcttctgatgttgcagcttcaattcct
ttatcttcagatgattctgaatttagaactcaacctattgtagaaactcttcaagcagag
cgtttagaaaattcaactggacaaatcaatattcaaattaactcagaagatactaaatta
acaactaaatatgcttgaattacttatcaatcacaaaaagataattcaattaaaacttta
aaatctgcaaatcatattgctaattcaaatggtcaatacaaagcaaactttgatttaaga
agtttaaatgtgctcgaacgttataaagttttatcagttaaattaggtgatgataaccaa
gcagatgctaaagcaaatgatttagagttaaatcaacaaattgatcaacaaaatcatcgt
gatttttatacaaaaccaacaattgctactattcaagctattcaagtagattatccagat
gcaagaggtactactgctgttgttgacattaaatttgacaatatacatgatacttattta
aatggttcatctgctaaaattacttatgaaagaatcgcagaaaatggtagacaaattggt
caagatataacacatattcaaactttatcaaagaaaaatttccaaataattaattcttca
gttaaattcactttaaccggtgatactaataatacttcagatacacaaaaagttatttta
gtaaaatcacaaatagaccaacaacaacaaatccaacacactaatacagtaaaatcaatt
ggaactcaaaaaaatgaaagcaataaacaagttaatcaaaatcaattagttgaaggaact
agatatagaattaaaaagatagaattagtagacccttctgatgatcttaaacaacttcgt
tttcaatttaaacaatcacaagattcaaataaaaaaattaatgaaactacacttatagaa
ccacttagaatctctacttatgattacaaaatccaagttgatgaaaccccaacagcagta
aatactacaattgcaacttattattcaactagttataatttgcaagatagtgataaaaat
aaatttaatttatatgttaaaaatttatcaactaatgaagtagaaattgtttcatccgcc
aatagtattactaatttaaacccaactgataatgatggcaactataaagtagaatttgta
ttaataaataaaaaagcttctatttacaagattctatctacaacatatgataatcaaaac
attataatgtcatcttatataaatccagaaacttcacaagctaatatttatacaacacca
gcttctaaatctaaagtaaaagaattaaaatatttagctaattcacaattagaagaaaca
caagctacagttactgcatattttgatgatactaatgaagatttaactagggtaaaaaga
aaagcaaaattattttacaaaaaagtagatgctataagtgcttctgcttcacaacttctt
gaatctgctgaagtagaaataaaagaaaataaagctgaatttaaattaggtcaaactaat
caacgattaactgcaaatactcaatatgtagttgaaaaaattgaaattaattctaaatca
gattttcaaaatgaaattcaagcaaatcaattagatacaagtaaatttaatattattgct
caaaaaaatgattctacttttgatgtaaaaatccaagataatgacaaattattcgaaacc
aaagcccaatttggaacttcttacacaaatgaaggagaaaattcagctactgttacatta
agttttgaaaatccaggacaccaaatccaaaataacaaaatagcctatattgtttttgca
gaatccactctagctcaaactaatcaaaatgatattttccaagaagctgcatctcgtact
catttatcaaatgcaaatgttaatcaaaatatattaacttttaatttaagaggattaaaa
aaaggaacacaatacaaagttaaaaaagtaattattgataatattgaatacaatattgaa
caaaattcaatagctacattttccactattttaacaaaagctacagtaactaatattgtt
tataattattctgattttgcaactactgaagcaaattcacaaaataatacagataataat
gtaaaagctaaatttagaatttactttcaaacaattgataattttttaaataatcaatat
ataaatgttaaattaaattctaaaaaaaatgctttatcagaacaaacacaaacatctagt
gcaattaataaagtagtacaagtgcatgtagataaagctcaacaaaatagtggattagtt
tacgctgatgttgaattaactaattctgatcaaattaaagcagctacagagtacagcatt
gaacaaattcaagttttaaattcaaatcgttcacaagatgtaaaacaaggtgtaacagta
gaaggtcttactaataatggaaatattactaaagatttttatacaattacaaatatagaa
tcatttaatgctacagtagatgaaactagtgctgaattaacttttaaattaaattcatat
gatcctcaattaattaatgaacctgtagttttagtattaagtgataacaataatcaaaaa
tactattcacaagtagttccaaatccacaaaatccaggtcaaattaagttttacttatca
tatttagataaattaaaatcttatactattgaatcactacagttttcaaaaggtgcatct
ggtgtaaatattgcatttaaaccaaatgtttctaaaacttttaaaaccatagctaaagat
tttgaaatcaaagatattatgcaagtatctaatactgctaattcagtaaaattaaaatta
acttttaatggtgagttggataaatatttagatacaaaacaaattaaattaaaatacaaa
gaatacaaagatggtgtagaaggttcacaaaaaacttcaaaaaccatagctactattaaa
tctcctacaactgtaactcaaactgcacctaatacatttgaagcagaatttgatttacaa
ggacttgatgttgactccggtacaagatataaaattgaaggagttgaattagttgataca
tcaattcaaaataatcagcaacaacctctacaatctagaatatcagatgatattgctaag
ttcttttctaataaattattatttgaaacaaaagtagcacaaccaaaattaaaatccatt
gaattattgcaaacaacaaatgaacaaggtgaagaaaatacttatattgctcctgttaaa
ttagtattttacgataaaaatgatgcattagccaaagacaaaattggtttactttcaaat
ggagcagttagcaataatggtttaaatgcttgaaactttgaattttgaacagatcaaaaa
aaatctaatgttaaatttttagacaatgttgaaatagatcacaattcagttgaaaaaacc
acaactgttaaagtctttatgcaaggtaatgctaaagactgagtaacattaaattcaact
attgagtctcaaaatagtaatcaaaagaccaaaaacaaaagaattagattcaagtattct
tattacgaagatcttgatcgtaagactgcagtgagcgtaggaaatctaaatagtgatgtt
attcacacttacgctgatgcaaatagtaattcagctcaaaatactgatccactttatgtg
gattcaccagattgatttgtgttagaaaaaactactggaacatttttacctgatgcaaaa
atgatttattcttttgaagtatatgatccaaataataaaattaatacattacaagaagaa
ctccagcctgaacaatcacctacttgaaaaagacgtgagttgtataacacaatgactcaa
aatatagaatatggaaatcaaatagcttgacaaactatcaataaaattcaattagagcta
aaatctaaacaatccattttgaactttagaaatcttacatatagtgaaggaaataataga
gaatttgacgtaaatgcacaatatagtgatattagtgcaactgatgcagaagacattcca
aactatacaaattcattaaataataattctaaaattaattttagatataaatatccttca
caagattcagaatataaaccttctaatatagataattctcaatctagatatacacagcaa
caaaaaaacacaagaattaatacatatgtaagagaaataaaagccacaggagcacagcaa
aattcaaaaattattaacttgcaagttggctctggaactgatagtttaaatctaagacaa
aaagtactttctaaaatactttcaattaattttgataatctttcaataaaagataaacct
gtattatttgctaaaaattcttctaaatttattaacactattcaaactccattttcaatt
acaaataatgcttgatgatttggagcaataaataatccaaattcaaatagtaatattttg
ggtctaacttctaatattgatcttaatacaaatgttgatcaaaataaatttggaattaaa
aatataagatacaataatgatactaattcagttacagttgattatcaacgaaatacagac
gcacaaattcaaactgcatttcctgaagcagtttacgcttcatttataaaccaaaaaggt
gatttatacttctttggtggaaaagatggaaatccattatcatatagaaatgattatgat
tttacaaataatacaatgactttttatttaggttctgaacaaattccatatgatcaaaga
ccaaaatttggtgaaattctttcatttgtaggtgtagttgtagctccatatttaggtgat
ggcactccaacaaatagatacagcattacgaatagatctattacattaactgaacaagat
agttcaggttcaactatagattttagtaatatgtatttaacaaattttgttaaacaagag
ccaatttataaaagaattaaaataggttctagtaattttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
