Metamycoplasma hyosynoviae: MHSN_02550
Help
Entry
MHSN_02550 CDS
T05673
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
mhyv
Metamycoplasma hyosynoviae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Lipase_GDSL
Lipase_GDSL_2
DUF6841
TPR_Vitellogenin
uS17m_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASI54044
UniProt:
A0A4P1QGQ1
LinkDB
All DBs
Position
complement(642833..650194)
Genome browser
AA seq
2453 aa
AA seq
DB search
MSNSKINKKFLMILSSLGFTSATTTLLTMSCSCREADLNKIAQNVKIHEIPNKSEIKASE
LTKDQVKFYNYDTLKYTCEVIRLESNNSQGTVDVYYQLKNKKTNNVSKLQKITLNSFKLA
QSPNPGGGEDQPNPPIIPSDPRQLEVQKSKNIIKKDERVRYLALGDSITAGFTGVLDKDY
QGTLNPDGSLSGMSYPVYLAHFLNKDKANRVEKFNNFATSNSTILEWLDLLDAEYISANP
DIFKNEESVYQHTFDGRYTDKTEFKKQLVKEIKDSNLITLTLGANDFFRFFGELLRSTNI
SKIIEQVISATQQGKPLDYGALLSFYLEFIGKAKTEITARLKTLIQKISELNPKTNIAVF
NYPAPFLRLLVSLYDFLPDGIKSMIKGKDIISFLISPLSEAIYSAVKAAAKPNVSFVNVF
DSEFWAENQDKLTSVFLDLHPTTSGYKKLATDAFIKLTNSSISKANLKRFGWTESYLNDN
ANTHQQFIELNNEDYTSFYKSTFGTNKEDSLKKLYEEDAVYDSVKSHISLTHISRRFRSF
TDAQITEIVISILTKSQRWSYLQELDPEANIPSFFKENGEAATFALVKWIKKSKYINDQL
DNFQKLLIETDWDKDGIPGIKVLKKQHILELFSKTFFDKQNLLFLLKEFLASDFTKDFKD
GFAKAIEGFIKNAFKSNKLDAVIEFIAAKFEDKYKNFIDKSDLVILLKEIFHSDNLPSFF
GTSLKSILTAGNTELSSEETFNKITSFEGLIKILFSNQNENSEIGKSFTKLFQEIIKKPN
VNPVLVRVLNKFIKSNPQFAPLFEGIEADGIKNIIGAFTNVFIKFEDKFNVSTSLAKALM
AEIAQNGLSFKFDKFKDVFIGEISQTFGSFEKALEILKLLADEQQLKDHKDVLKKLIENI
IKFAEKSFKLKETIEKQEFLNKFLTKEQISTIYTKLVSSQNISKIADYFVNVLSVKDLDL
TNVTTPKQLLQKILETPSVNPLDLLKDLIKSNLIDNTSITDVLAKILKQKFGSLPFMGYV
SEQQISVLMRNFLTLCVNLDDKQHFLKRIILTVADILLDKTPSSESVYKRLYEALKTELF
GTKEKVKSIIKDLLSEPIMQGGKTWIIKYLKGLNNAEITALLNDGSIEKLLKKLYDSEDI
IDLSAETIFTIFSSLTFEDISSLDKTRIIKKIIGEGSTFYNSIPDKVVELIKKLIKETDN
QKIIAAFVKSYLEIKFPKLKGKITSENFEKFIKKIIEFVVETEDKHSALKNGIKWALRYF
ETNISSFDVSKFIKDFAAKTTTKLLSMLKGNEDEFINKIFETLKEVLNLQDTTQQNFLTK
FIWDLIPAGIKSNVSKFIDEDKFTHLFNQFIESNKAKELLTSLLKAMIKNVEGKMTSIKS
FDDFIKVVFSDPEAYNETIKLVSDNLAEILNKSSIKGILKSVLKNLLPSGVNDDSTVGDI
VNNFIPNSLKKLEQEFKLFEDISKAIISSISTNGFDLEKIKLVVFDKLISKIKNNEQEFV
NKFFNVIKEVFGVTVSQQSTFLDEFIWKLIPSEIKSKLGSDFTQEKLRYFINEFVLSDKI
KEIFAKTLKAIVQNVDGKFATIKTFDEFIKQAFSNTDAFDEVITLISNNIDAIIKKPSVV
GLLKSVIKGFASSWIKIDDADIDKLISNIISEFAKKANTEFKLVEDILKVAITSLGTNGF
NITKLQENVFAKFKEKLDSLMDLKTLVKFINNNVALFKQPENLNIIKSILKANADSLVKK
LPQSVSNYISESELINVLKSIFDNEKIYETIFDIIDKIDKDVATYNDLSITNPLEILYKF
VDKEKQYIKDKIKLIGKDFVSNSANQDVLVRLIKANFKEYTKIELSNEHDAFFKKLIQHM
FDILADIKVKNTAILDYILDIVLDNIREPQKISQKLLDPTFIQELYSVPFLVSILNQQQI
KTSADQVVKLFDEIFREFQKDDEKIETFLNKFKIVGLINKDPATQSITKDFIKNTIKNDK
LFPFIKAILLSIFKNSDKLQTAKRWIDVIKVTFENDTNELKSTFVEFVKAMLNDPNASLA
KQIDVVLTKSWKDNPSLYRRNVIDNNQHTIEKFVDTFFKASIKENNLFTIIINNVFDKLK
TVNVKAKDQMKEIKNKIILGAIKFVTKTGNDKAIHLPTLVGSYKDNIVTLFEHIDSAAFT
NMINYVFDATIFNLDAGVYSFLFGGRFKAEATTYLQEIKNNVKGERLILPSAIRARRSIP
PRGQEAYEEVEDIKIDFQIGTGLELLSLISADKLIGSIFIPSVDQFLNSVSTKKYSSVDE
LNKIVKKLPGYRATSRVYTALSVMLCSNMSADEFWMPKPSFWDFVKWGQYTLGAYPENYI
SKGVQFAYKKVLEKDNLKSKIKSLYNGSNNHKFIGLTSSISYDDHYFAGYAEGKDSRTEE
FRKWTNWSEDSITAYIVNYNKTENKHHNKHNIVLIAKMLQYGYLYKDMDKDNK
NT seq
7362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaatagcaaaataaacaaaaaatttttaatgatattatcatcgttaggttttact
tctgcaacaacaactcttttaactatgagttgttcttgccgtgaagctgatttaaataaa
atcgcccagaacgtaaaaattcatgagattccaaataaatcagaaatcaaagcttctgaa
ctaactaaagatcaagttaaattttacaattatgacactttaaaatacacttgtgaagtt
attaggttagaatctaataactcacaaggtacagttgatgtgtactatcaactaaaaaac
aagaaaacaaacaatgtttcaaaacttcaaaaaatcactcttaatagttttaaattagct
caatctccaaatccaggaggtggtgaagatcaaccaaatcctccaattattccttctgat
ccaagacaacttgaagttcaaaaatcaaaaaatatcatcaaaaaagatgaacgtgttaga
tatttagcattaggcgattctattacagcgggatttactggcgttcttgataaagattat
cagggaacactaaatcctgatggatcgctttcaggaatgtcatatccagtatatttagca
cattttttaaacaaggataaagcaaatagagttgaaaaattcaataactttgctacatct
aattctactattttagaatgattggatttacttgatgctgaatacatttcagctaatcct
gatattttcaaaaatgaagaaagtgtatatcaacatacttttgatggaagatatacagat
aaaactgaattcaaaaaacaattagttaaagaaattaaagattcaaatttaattacttta
acacttggtgctaatgacttctttagattttttggcgaacttttaagatcaaccaatatt
tcaaaaataattgaacaagtaatttcagcaactcaacaaggaaaaccactagattatggt
gctttattaagtttttatctagaatttattggtaaagctaaaacagaaattactgctaga
ttaaaaactttaattcaaaaaattagcgaacttaatccaaaaactaatattgcagtattt
aattatccagcaccttttttaagattgctggtttctttatatgattttttacctgatggt
attaaatcaatgattaaaggtaaagacattataagttttctaatttcacctttatcagaa
gcaatttattcagctgtaaaagcagctgctaagcccaatgtaagctttgtaaacgtattt
gatagtgagttttgagctgaaaatcaagataaactaacttctgtatttttagacctacat
ccaacaacttcaggatacaaaaagcttgcaacagatgcttttattaaactaactaattca
agtattagtaaagccaatttaaaacgttttggatgaactgaatcttatttaaatgataat
gctaatactcatcaacaatttatagaacttaataatgaagattatacaagtttctataaa
tcaacttttggaaccaataaagaagattctcttaaaaaactatatgaagaagatgcagtt
tatgattctgtaaaatctcatatttcacttacccatatttcaagaagatttagaagtttt
actgatgcacaaattactgaaattgttatatctatactaacaaaaagccaacgttgaagt
tatttacaagaacttgatcctgaagctaatattccaagtttcttcaaagaaaatggcgag
gctgcaacatttgcattagttaaatgaattaaaaaatctaagtacataaatgaccaatta
gataatttccaaaaacttttaattgaaaccgactgagataaagatggaattccaggaatt
aaagttcttaaaaaacaacatattttagaactatttagtaaaacattttttgataaacaa
aatcttttattcttactaaaagaatttttggcttctgattttacaaaagatttcaaagat
ggatttgcaaaagcaattgaaggatttatcaaaaatgcatttaaatctaataaattagat
gcagtaattgaatttattgcagctaaatttgaagataaatacaaaaacttcattgataaa
agtgatttagtaattttattaaaagaaattttccattccgataatcttccttcatttttt
ggtacttcactaaaatcaatattgaccgcaggaaacactgaactaagttcagaagagact
ttcaataaaattacttcttttgaagggctaattaaaatactattttcaaatcaaaatgaa
aacagtgaaattggaaaatcattcaccaagttgttccaagaaataattaaaaaacctaat
gtaaatccagttcttgtaagagttttaaataaatttattaaatctaatccacaatttgcc
ccattatttgaaggtattgaagcagatggtattaaaaacatcattggtgcatttactaat
gtatttatcaaatttgaagataaatttaatgtatcaacttcacttgcaaaagcattaatg
gctgaaattgcacaaaatggactttcatttaaatttgataaatttaaagatgtatttatt
ggtgaaatttcacaaacatttggttcatttgaaaaagcacttgaaattttgaaactttta
gctgatgaacaacaactaaaagatcacaaagatgtattgaagaaattaattgaaaacata
attaaatttgcagaaaaatcatttaaattaaaagaaactattgaaaaacaagaattttta
aataagtttttaaccaaagaacaaatttcaacaatttacacaaaattagtttcaagtcaa
aatatttctaaaatagcagattattttgtaaatgttttatcagtaaaagatttagattta
actaatgtcaccacgccaaaacaattacttcaaaaaatactcgaaactccttctgtaaat
ccattagatcttttaaaagatctaattaaaagtaatttaattgataatacatcaataact
gacgtgcttgcaaaaatattaaaacaaaaatttggctcacttccatttatgggatatgta
tctgagcagcaaatttctgttttaatgcgtaatttcttaacactttgtgttaatttagat
gacaagcaacatttcctaaaaagaatcattcttactgttgctgatattcttctagataaa
acaccttcttcagaaagtgtatataagagattgtatgaagcacttaaaacagaattattt
ggtactaaagaaaaggttaagtctataattaaggacttgttaagtgaaccaataatgcaa
ggcggaaagacttgaattattaaatacttgaaaggtttaaataatgcagaaataacagca
ttattgaatgatggaagtattgaaaaattacttaaaaagttatacgatagcgaagatatt
attgatttatcagcagaaacaatatttacaatattttcttctttaacttttgaagatatt
tcaagccttgataaaacaagaataattaaaaaaataattggtgagggttctactttctat
aatagcattcctgacaaagttgttgaattaattaagaaattaattaaagaaactgataat
caaaagattatagctgcatttgtaaaaagttatttagaaatcaaattccctaaattaaaa
ggtaaaattacatctgaaaactttgaaaaattcattaaaaagattattgaatttgtagtt
gaaaccgaagataaacattctgctttgaaaaatggaattaaatgagcgttgagatatttt
gaaactaatatctcatcatttgatgtttcaaaattcataaaagattttgctgctaaaacc
actacaaaacttttatcaatgttaaaaggtaatgaagatgaatttatcaacaaaattttt
gaaactttaaaagaagttttaaacttacaagatacaactcaacaaaactttttaaccaaa
ttcatctgagatcttattccagctggtattaaatcaaatgtttctaaatttattgatgaa
gataaatttacacatttatttaatcaatttattgaaagtaataaagcaaaagaattgcta
acttctttactaaaagcaatgattaaaaatgttgaaggtaaaatgacttcaattaaatca
tttgatgattttattaaagtagtattttcagatcctgaagcttataatgaaactattaaa
ttagtttctgataatttagcagaaatattaaataaatcttctataaaaggaatattaaaa
tcagtacttaaaaacttattaccttcaggtgtaaatgatgatagtacagtgggtgatata
gtaaataactttattccaaactctttaaagaaattagaacaagaatttaaattatttgag
gatatatcaaaagcaattatttcttctatatctacaaacggttttgatttagaaaaaatc
aaacttgttgtatttgataaattaatttcaaaaattaagaataatgaacaagaatttgta
aataaattcttcaatgttattaaagaagtatttggggttacagtatctcaacaatccact
ttcttagatgaatttatttgaaaattaattccttctgaaattaaaagtaaattaggatca
gatttcactcaagaaaaacttagatattttattaatgaatttgttttaagtgacaaaatt
aaagaaatatttgcaaaaacattaaaagcaatagttcaaaatgttgatggcaaatttgca
accattaaaacatttgatgaatttattaaacaagcattttcaaatactgatgcttttgat
gaagtaattacgttaatttcaaataatattgatgctattattaaaaaaccatcagttgta
ggtttattaaaatctgtaatcaaaggttttgcttcatcatgaattaaaatagatgatgct
gatatagacaaattaatttctaatataatttctgaatttgctaaaaaagctaatactgaa
tttaaattagttgaagatattttgaaagtagctattacttcacttggaactaatggattt
aatattacaaaattgcaagaaaatgtatttgctaaatttaaagaaaaattagattcatta
atggatctaaagacattagttaaatttattaataataatgttgcattatttaaacaaccc
gaaaatctcaatataattaagagcattttaaaagcaaatgctgattcattagttaaaaaa
cttccacaaagtgtttcaaattacatttcagaatcagaattaattaatgttcttaaatca
atatttgataatgaaaagatatatgaaacaatatttgatattattgacaaaattgataaa
gatgtagctacttacaatgatctttcaattacaaatccattagaaattttatacaaattt
gttgataaagaaaaacaatacattaaagataaaatcaaactaattggcaaagattttgta
tctaattcagcaaatcaagatgttttagttagattaattaaagctaactttaaagaatat
acaaaaattgaattatcaaatgaacatgatgcgtttttcaaaaaactaattcaacatatg
tttgatatcttggctgatattaaagttaaaaacactgctattttagattatatacttgat
attgttttagataacattagagaacctcaaaaaatatctcaaaaattattagatcctaca
tttatccaagaattatattcagttccatttttagtaagtatactaaatcaacaacaaatt
aaaacttcagctgatcaagtagttaaattatttgatgaaatttttagagaattccaaaaa
gatgatgagaaaattgaaactttcttaaataaatttaagatagttggattaattaataaa
gatcctgcaactcaatcaattacaaaagacttcattaaaaatactattaaaaacgacaag
ttatttccatttattaaagctatattactatcaatttttaaaaattcagataaacttcaa
actgcaaaaagatgaattgatgttataaaagttacttttgaaaatgacacaaatgaattg
aaaagcacatttgtagaatttgtaaaagcaatgttaaatgatccaaatgcttctcttgct
aaacaaatcgatgttgttttgacaaaatcttgaaaagataatccttcactatatagaaga
aatgtaattgacaataatcaacatacaattgaaaaatttgtagacacattttttaaagct
tcaataaaagaaaataatttatttactatcataattaataatgtatttgataaattgaaa
acagtaaatgttaaagcaaaagaccaaatgaaagaaatcaagaataagattattcttggt
gcaattaagtttgtaacaaaaactggaaatgataaagcaattcacttacctactttagtt
ggaagttataaagataatattgttactttatttgaacatatagattcagcagcattcact
aatatgataaactatgtatttgatgcaacaatatttaatttagatgctggtgtatattca
ttcttatttggtggtagatttaaagcagaagctacaacatatttacaagaaattaaaaat
aatgtaaaaggcgaaagattaatacttccttctgctattagagcgcgtagaagcattccg
ccacgtggtcaagaagcatatgaagaagttgaagatatcaaaattgatttccaaataggt
acaggtcttgaattattaagtcttatatcagctgataaattaataggttcaatatttatc
ccatcagtagatcaattcttaaatagtgtatctacaaagaaatattcttcagttgatgaa
ctaaataaaatagttaaaaaattgccaggatatcgtgcaacttcaagagtttatacagca
ctgtctgtaatgttatgttcaaatatgtcagctgatgaattctgaatgcctaaaccaagt
ttttgagattttgtaaaatgaggacaatatacattaggtgcttatccagaaaattatatt
tcaaaaggtgttcaatttgcttataagaaagttttagaaaaagacaacttaaaatctaaa
attaaaagtctatataacggaagcaataatcataaattcattggtttaacaagcagtata
agttatgatgatcactattttgcaggttatgccgaaggtaaagattcacgaactgaagaa
tttagaaaatgaactaattgatcggaagattctattactgcatatatagtaaattacaat
aaaactgaaaataaacatcataataaacataacatagtattaattgcaaaaatgcttcaa
tatggttatctatacaaagatatggataaagacaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system