KEGG   Allocoleopsis franciscana: Mic7113_4040
Entry
Mic7113_4040      CDS       T02374                                 
Name
(GenBank) PAS domain S-box
Organism
mic  Allocoleopsis franciscana
SSDB
Motif
Pfam: AAA_16 Pkinase Guanylate_cyc PK_Tyr_Ser-Thr GAF GAF_2 GAF_3 PAS_4 ABC1 Kinase-like KAP_NTPase PAS NACHT PAS_9 Rad17 NB-ARC AAA_22 Kdo RsgA_GTPase Pkinase_fungal TPR_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFZ19745
UniProt: K9WH54
LinkDB
Position
complement(4703087..4708909)
AA seq 1940 aa
MNRITVDITGITFKSQIYESVNSLVYRGFRESDGQPIILKMLKQDYPTPDDLSRYQREYE
ITRQLNLEGVVKVYDLQNYQNTLVILLEDFGGESLKRWLSQKPFSLSEFLPIALQITQSL
GQVHHHNIIHKDINPSNLVFNPQTGQVKLIDFGISTVLARENPSLTSPQLLEGTLAYISP
EQTGRMNRSLDYRTDFYSLGVTFYELLTHQLPFQTEEALELVHCHIAKQPVPPHVLEPDI
PKIISDIVMKLMAKTAEERYQSAWGIHRDLAECWHQLQHTGKISTFLLASADISSRFQIP
QKLYGREREVEVLLRAFERVATGEIEVEKEKSEALVSQVSPEKSHIEMMLVAGYSGIGKS
VLVQELYKPITQKRGYFIRGKFDPFQRDVPYSAVIQSLTELVRQVLTESEAELQQWRDKL
LQAFGANGQVIIDVIPEVELIVGSQSPVPTLGATESQNRFNLVFQNFIKVFGSKKHPLVI
FIDDLQWADSATLKLIKLMMTEGVTGTTGEMPTFKKSQHLFFIGAYRDNEVNSIHPLAIA
LEEMRQQGAIINQITLAPLELKHITDLIADTLHSDLSSVKSLAELVLRKTGGNPFFSNEF
LKTLYAENLIRFNLPATSEFESNINHPQNSPWSWDIEQIQAISITDNVLELMLGKLKKLP
EFTQQVLRLAACVGFEFDLKTLSIICEKSTLQVSFELIPAIQSELILAISQLDSQLLIQK
YKFSHDRIQQAAYALINEEDKKIIHLQIGRLLLQNAAPDGLSEKIFKIVDHFNMGIEMIT
KPEERDKIAKLNLRAGQRAKAATAYGVAIKYLNAGFKLLPDNSWETQYELALDLHIEAVE
VEYLNTNYERSAMLSAVVKHQAKTLLEKVRVYEIEIQSEISQNKLQEALQTGLQVIKMLG
VSLPHHPNKLNFWSAQFWTKLQLLGKPIADLKTLPFLIDSHKIAAMRILMNLAAPAYNVN
PALLPLVALKMVNLCIEYGNSPWAAYAYGLYGLMLCNSPKTLDSGYRFGQLSLRILEQFD
ARELKSKVFQVFNSHVRFWKEPLRETIIPLQETVQAGLETGEVEYAGYASAEYCIHLFFS
GENLEFLEQKFSQYGDLIEKINQDFSSHYINIWRQLGLKLLDPNLEQYSLIGECFNETEM
LPIFRRDNTVLFIFSVYLAKTLLCYLFKNKDEALENARLAERYKEGSVGLFKYSVHNFYY
SLVLLSHYPQFTKKEQRKGIQLVSTNQKLMKHWAKHAPCNFQHKYELVEAEKAKVLGKKW
QAAELYKQAIQSARKNGYIQEEALAYELAAEFYLDCGMEEIAQTYMTKAYYGYSCWQALA
KVKDLEKRYPQLISKSVIANRRKNTITKTTSISTSSRSIESLDLASVMKASQAISGEIIL
DKLLASLMKILIENAGAQKGLLILETEGKRLIEASGDVGLNQVTVLQSLPVENSVMVSST
IINYVARTQESVLLNDATHEGQFTLDPYIKAHQPKSILCVPLINQGKLISIVYLENNLTT
GAFTPERLALLKLLSSQAAISIENAKLYTEVRASESRLNQFLEGVPVGVAVFDTTGKPCY
SNRITYQLFGKGVIPETTIEEISKIHHVYKAGTAQEYPTEKLPAVRALKGESVRINDIEI
HREDKIIPIETWGTPIYDEKGNIAYAIVALQDITERKKAEIEREKFTAKLFQLNQSFSRF
VPRQFLQLLDKESIIDVQLGDAVQQEMSVLFSDIRDFTTLSERMTPQDNFKFINAYLSRM
EPAIIEHQGFIDKYIGDAIMALFSGEADNALKAGISMLHRLTEYNQQRMKSGYMPIQIGI
GINTGSLMLGTVGGYNRMDGTVISDAVNLASRVENLTKNYGVSLLITHQTFLQLNEPVYA
IRPIDRVKVKGKSEVVAVYEVFDADPPEVREGKLTTFQIFIEALHNYNSRHFRKAKQLFS
ECLRLNPRDKVAQIYQQRCQ
NT seq 5823 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatcgtattactgtcgatattacaggtattacatttaaatcacaaatttatgaaagt
gtcaactcattggtttatcgagggttccgagaatcggatgggcaaccgattatcttgaaa
atgctcaaacaagattatcccacgcctgacgacctgagccgctatcaacgggaatatgaa
atcactcgtcagctcaacctagagggggtagtgaaagtctacgacttacaaaactatcaa
aatacccttgtcatactgttagaggattttggcggggaatccttgaagagatggctctct
caaaaacccttctccttatcagaatttctacccattgccctgcaaattactcaaagttta
ggacaagttcatcatcacaatattattcataaagatattaatccctcgaatctcgttttt
aaccctcaaaccggacaagttaaactgattgattttggcatttctacggttttagcacgg
gaaaaccccagcctcaccagtcctcaactgttagaaggaaccttggcttatatttctccg
gagcaaaccggaagaatgaaccgttccctagattaccgcacggatttttattcccttgga
gtcaccttttatgaactattgactcatcagcttcctttccagacagaggaggctctagag
ttagtccattgtcatattgcgaaacagcctgtacctccccatgttcttgagccagatatc
cctaaaataatttccgatatcgtgatgaaattgatggcgaagacagcagaggaacgctat
caaagtgcttggggaattcacagggatttagccgagtgttggcatcaattacaacacaca
ggaaagatatcaacttttctgctcgcgagtgctgatatttcttctcggtttcagattcct
caaaaactttatggtcgagaacgagaagttgaagttttactgagagcttttgagcgagtt
gcgactggggaaatcgaggtagaaaaagagaaatctgaagctttggtttctcaagtgtcc
ccggaaaaatctcatattgaaatgatgctagtcgcgggttattccgggattggtaaatcc
gtattagtccaagaattgtataaaccgataactcaaaaacggggttatttcatccgaggt
aaatttgacccgtttcagcgggatgttccctacagcgcagtaattcaatccttgactgaa
ttagtccgccaagtgttaacagaaagtgaagctgagcttcagcaatggcgagacaagtta
ttacaagcttttggtgctaatggacaggtaattattgatgtgattcctgaggttgaactg
attgttggttctcaatcacccgtccccactttaggtgctactgagtcacagaatcgtttt
aatttagtttttcaaaactttattaaagtttttggttccaaaaagcatcctttagttata
tttatcgatgatctccagtgggctgattccgcaacactaaagttgatcaaactgatgatg
acagaaggggtaacaggcacaacaggggagatgcccacttttaaaaaatcacaacactta
ttttttattggagcgtatcgagataatgaagtcaattctatccatcccttagcgatcgct
cttgaagaaatgcgtcaacaaggagcgattatcaaccaaattaccttagcacctttagaa
ctcaaacatattaccgacctgattgccgacacgttacacagcgaccttagctcggtaaaa
tcattagcggaactagtacttcggaaaactggcggcaatcctttttttagcaatgaattt
ctgaaaacattgtacgcagaaaacttaatcaggtttaacttacctgctacttcagaattt
gagtctaacattaatcatcctcaaaattcaccatggagttgggatattgaacaaattcag
gcaattagtatcacggataatgtacttgaattaatgcttggcaagttaaaaaagttgcct
gaatttacacagcaagttttacgattagcagcttgtgtaggttttgaatttgacttgaag
accctttctattatttgtgaaaaatcaactttacaagtttcttttgaactcattccagct
attcaatccgaattaattctagctatatcacagttggattctcaacttttgattcaaaaa
tataagttttcccatgaccgaatacaacaagccgcctatgctttaattaatgaagaagat
aaaaaaatcatacatttacaaattggccgcctgctattgcaaaatgctgcgccagatggt
ttatcagagaagatatttaaaatcgtcgatcatttcaatatgggtattgagatgattacc
aagccagaagagcgagataaaatcgctaaattaaatttaagggcaggccaaagagccaaa
gcagcgacagcttatggagtagcaatcaagtatctgaatgcaggattcaaactattgcca
gacaatagctgggaaacccagtatgaattagcactcgatttgcacattgaagctgtagaa
gttgaatatttgaacacgaattatgaacgctctgcaatgctttctgctgttgtgaagcac
caggctaagacattgttagaaaaagtcagagtttatgaaattgaaatccagtctgagatt
tcgcaaaataaactccaagaagcgttacagaccggattacaagttataaaaatgctagga
gtttccttacctcatcatccgaacaagctaaatttttggtcagcacagttttggacaaaa
ttacaacttctgggtaagccaattgcagatttaaagactttaccatttttaatagattcc
cataaaatagctgcaatgcgaattttaatgaatcttgctgctcctgcttataacgtgaat
ccagctttgctacctctggttgccttaaagatggtgaatttatgtattgaatatggtaac
tcgccgtgggcagcttatgcttatggtctttatggattaatgctgtgtaattctccaaaa
actctggattctggctatcgattcggtcaactttccttaagaatcttagaacaatttgat
gccagagaacttaaaagtaaagttttccaggtttttaactcccatgtcagattttggaaa
gagcctctcagggaaacaatcattcctttgcaagaaacggttcaagccggactagaaact
ggagaggtagaatatgcgggttatgcatccgccgaatattgcatccacctattttttagt
ggagaaaatttagaatttttggaacaaaaatttagtcagtatggtgacctaattgaaaaa
attaatcaggatttctcttctcattatatcaatatatggagacagctcggattaaagcta
cttgaccccaacctggaacaatacagtttgattggtgaatgttttaatgaaactgaaatg
ttaccaattttcaggcgagataatacagttttatttattttctctgtatatttagctaaa
actttactttgttatttatttaaaaataaagatgaagctctagagaatgctagattagct
gaaagatacaaagaagggagtgttggattatttaaatatagcgtacacaatttttattat
tctttagtcttgttatctcactatcctcagtttaccaaaaaagaacaaagaaaaggaatt
cagctcgtatcaaccaatcaaaaactaatgaaacattgggcaaaacatgctccatgtaac
ttccagcataaatacgaactggtagaagcggaaaaagcaaaagtgcttgggaaaaaatgg
caagccgcagagctttataaacaagcaattcaaagcgctcgaaagaacgggtacattcaa
gaagaagccttagcttatgagttagcagcagagttttatttagactgtgggatggaggaa
attgctcaaacttatatgactaaagcttactatgggtacagttgttggcaagctttagcg
aaagttaaggacttagaaaaaagataccctcagttaatcagtaaatcagtaatagctaat
cggcggaaaaacactattacaaaaacgacaagtatttcaacgagtagcagatccatcgaa
tctttggatttggcttctgttatgaaagcctctcaagctatttccggtgaaattatacta
gataaattacttgcttccttaatgaaaatactcatcgaaaatgctggtgctcaaaaagga
ttattgatactagaaactgaaggtaaacgattaattgaagcctctggtgatgtaggtctt
aatcaagtgactgtgttgcagtcacttcccgttgaaaacagtgtgatggtttcatcgact
attatcaattatgttgccagaactcaagaaagcgtacttctaaatgatgccacccatgag
ggccaatttactctcgatccctatatcaaagcgcatcagcctaaatcgattttgtgtgta
cctctgattaaccaagggaaacttatcagtattgtttatttagaaaataacctcaccaca
ggtgcttttactccagaacgattggcactattaaaactcttatcgtctcaagctgctatt
tcgatcgaaaatgccaaactgtatacagaggtacgagccagtgaaagtcggttgaaccaa
tttctagaaggtgtacccgtgggtgtagccgtgttcgataccactggcaaaccctgctac
tctaatcggatcacttatcagttatttggtaaaggtgttatcccggaaactacaatagaa
gagatctccaaaattcatcacgtttataaagcaggaaccgctcaagaataccctacagaa
aaattacctgctgtaagagccttaaaaggtgagagtgtgagaattaatgatatagaaatt
catcgagaagataaaattattcctatagaaacttggggtaccccaatctatgatgagaaa
gggaatattgcttatgcaattgtcgccttacaagatattaccgagcggaaaaaagctgaa
atagaacgggaaaagtttacagctaagctgtttcaactcaatcaatctttttcccgtttt
gtgcctcgtcaatttctccaattgttagataaagaaagtattattgatgtccagttaggg
gatgccgtacagcaggaaatgtcggtattgttttctgatattcgtgacttcacgactctg
tcagaaaggatgactcctcaagataattttaaatttattaatgcttatctctctcgcatg
gaacccgccattattgagcatcaaggatttattgataaatacattggcgatgcaattatg
gcgctgtttagcggtgaggcagataatgcactcaaagcgggaatttctatgctacaccgc
cttacggaatataatcaacaacgaatgaaatcgggttatatgccgatccaaattggaatt
ggcatcaatacaggttctttaatgctaggaacggtgggaggatacaatcggatggatggt
acggtgattagtgatgccgtgaatttagcctcgcgtgtggaaaatctaacaaaaaattat
ggggtatcgttgttaattactcaccaaacttttttacaattgaacgaacctgtctatgct
attcgtcctattgatcgcgttaaagttaagggaaaatcagaagtggtagctgtttatgaa
gtctttgacgctgatccaccagaagtaagagaaggaaagctaactactttccaaatattt
atagaagccttgcataactataattcccgtcacttcaggaaagctaaacaattgttttct
gagtgtttacgcctaaacccaagagataaggtagctcaaatttatcaacaacgttgtcaa
tga

DBGET integrated database retrieval system