Mangifera indica (mango): 123208882
Help
Entry
123208882 CDS
T07684
Name
(RefSeq) cellulose synthase-like protein D3
KO
K20924
cellulose synthase-like protein [EC:2.4.1.-]
Organism
minc
Mangifera indica (mango)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
minc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
minc01003
]
123208882
Glycosyltransferases [BR:
minc01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
123208882
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cellulose_synt
zf-RING_4
zf-UDP
Glyco_tranf_2_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123208882
NCBI-ProteinID:
XP_044482435
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(7908838..7914020)
Genome browser
AA seq
1142 aa
AA seq
DB search
MASKSFKGSRSNLSTSSDAHDGHKPPLPPTVTFGRRTSSGRYISYSRDDLDSELGSSDFM
NYTVHIPPTPDNQPMDPSISQKVEEQYVSNSLFTGGFNSVTRAHLMDKVIESEANHPQMA
GAKGSSCAIPGCDAKVMSDERGVDILPCECDFKICRDCYIDAVKTGGGICPGCKEQYKNL
DLDEVAVDNGRPLPLPPPAGMSKMERRMSLMKSTKSVLMRSQTGDFDHNRWLFETRGTYG
YGNAIWPKDGNFGNGKDEEVAEPQELMSKPWRPLTRKLKIPAAVLSPYRLLIFIRIVVLA
LFLRWRVTNPNKDAIWLWGMSVVCEIWFAFSWLLDQLPKLCPVNRATDLNILKEKFETPT
PNNPTGKSDLPGVDVFVSTADPEKEPPLVTANTILSILAADYPVEKLACYVSDDGGALLT
FEAMAEAASFANIWVPFCRKHDIEPRNPESYFNLKRDPYKNKVKSDFVKDRRRVKREYDE
FKVRINGLPDSIRRRSDAYHAREEIKAMKMQRQNREDEPVESVKIPKATWMADGTHWPGT
WLTPSSEHSKGDHAGIIQVMLKPPSDEPLLGTADDAMLIDLTDVDIRLPLLVYVSREKRP
GYDHNKKAGAMNALVRASAIMSNGPFILNLDCDHYIYNSKAMREGMCFMMDRGGDRLCYV
QFPQRFEGIDPSDRYANHNTVFFDVNMRALDGLMGPVYVGTGCLFRRIALYGFDPPRSKE
HHPGCCSCCFSHRKKRSIANTSEENRALRMGDSDDEEMNLYLHPKKFGNSSFLIDSIPVA
EFQGRPLADHPAVKNGRPPGALTIPRELLDASTVAEAISVISCWYEDKTEWGSRVGWIYG
SVTEDVVTGYRMHNRGWKSVYCVTKRDAFRGTAPINLTDRLHQVLRWATGSVEIFFSRNN
ALFASPRMKFLQRIAYLNVGIYPFTSIFLIIYCFLPALSLFSGQFIVQSLDVAFLVYLLT
ITVTLSLLAVLEIKWSGIELEEWWRNEQFWLIGGTSAHLAAVLQGLLKVIAGIEISFTLT
SKSASDDIDDEFADLYIVKWSSLMIPPITIMMVNLIAIAVGFSRTIYSTLPQWSRLLGGV
FFSFWVLAHLYPFAKGLMGRRGRTPTIVYVWSGLIAITISLLWVAIDPPSDTNQIGGSFQ
FP
NT seq
3429 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcttccaaatcattcaaaggaagccgatcaaacctttctacatcttcagatgctcat
gatggacacaaacctccattacctccaacagtgacatttggccggagaacttcctctggt
cgctacatcagctactcgcgggatgatctagacagtgagcttggaagtagtgattttatg
aactacacagtacacataccacctacccctgataaccaacctatggatccatcaatctca
cagaaggttgaggaacaatatgtttcgaattcactatttacgggaggtttcaatagtgtt
actcgagcacatcttatggataaggtgattgaatctgaagcaaaccatccccagatggct
ggtgcaaaggggtcttcatgtgcaattccagggtgtgatgcaaaagtgatgagtgatgag
cgtggtgtggatattctcccttgtgagtgtgattttaaaatatgtagggactgctatatt
gatgctgtgaaaactggaggtgggatttgcccaggatgtaaagagcagtacaagaattta
gatttggatgaggtggctgtggacaacgggcggccacttccacttcctccaccagctgga
atgtccaaaatggagagaagaatgtctttgatgaagtcaacgaagtcggtgctgatgagg
agccaaactggggattttgatcacaatcggtggctgtttgagactagaggaacttatggt
tatggtaatgctatatggccaaaggatgggaattttggaaatggtaaagatgaagaagtt
gcagagccacaagagttgatgagcaaaccctggaggccacttacacgaaaattaaagata
cctgctgctgttctcagcccatataggcttctaattttcattcggatcgttgttcttgca
ctgtttttgaggtggagagtaactaatccaaacaaggatgcaatttggctgtggggaatg
tctgtagtttgtgaaatctggtttgctttttcatggcttcttgatcaacttcccaaactc
tgccctgttaatcgtgctacggatcttaatatcttgaaggaaaaatttgaaacacctacc
cccaacaaccccactggaaaatctgatcttccaggcgtagatgtctttgtatctactgct
gatccagagaaagaacctcctcttgtcactgcaaatactatcttgtcaattttagctgct
gactaccctgtggaaaagcttgcttgttatgtttctgatgatggtggtgcacttcttact
tttgaggccatggctgaagcagcaagctttgccaacatttgggttccattttgtcggaag
catgatattgagcctagaaatcccgaatcttacttcaatttgaaaagggatccttacaag
aacaaagtgaagtcagattttgtcaaggatcgtagacgagttaagcgtgagtatgatgag
ttcaaggtccggatcaatggcttgcctgactctatccgtcgccgctctgatgcatatcat
gctagggaggaaatcaaggccatgaagatgcagagacagaatagggaggatgaacctgtg
gagagtgtgaagattccgaaagccacatggatggctgatggtacccattggccagggact
tggttgactccttccagtgagcactctaaaggtgaccatgctggtataatacaggtgatg
ttgaaacctcccagtgatgaaccactgcttggaacagctgatgatgccatgctcattgat
ctgactgatgttgacatccgtctcccattactggtttatgtttctcgagagaagcgtcct
ggctatgatcacaacaagaaggcaggagccatgaatgcattggttcgagcctctgccatt
atgtctaatgggcccttcattctcaaccttgactgtgaccactacatctacaactctaag
gcaatgagggaaggcatgtgcttcatgatggatcgaggaggtgaccgcctttgttatgtg
cagttccctcagagatttgagggtattgatccttctgatcgatatgctaatcacaacaca
gtcttctttgatgttaacatgagagccctagatggacttatgggaccagtttatgttgga
actggatgtctctttaggaggattgcgctctatgggtttgatccacctcggtcaaaagaa
caccatccaggttgctgcagctgctgcttttctcatcgcaagaagcgttccattgctaac
acctcagaagagaatcgggccctaagaatgggtgactcagatgatgaagagatgaacctc
tatctgcaccctaagaagtttggtaactcatccttcctcattgattcaatcccagttgct
gagttccaaggtcgtccccttgctgatcacccagctgtaaagaatggtcgcccacctggt
gctcttaccatcccccgggagcttcttgatgcctcaactgttgcagaggcaattagtgtc
atctcttgttggtatgaagacaagactgagtggggatctcgtgtaggctggatttatggg
tctgttactgaagacgtggtcactggctataggatgcacaacagaggatggaaatcagtc
tattgtgtgaccaaacgtgatgccttccgtggaactgctccaatcaatctcactgatcgg
ctccatcaagtcttgcgttgggcaactggttcagttgagattttcttctcccgtaacaat
gccctttttgccagccctagaatgaagtttctccaaaggatagcatacctcaatgttgga
atctaccctttcacttctatcttcctcatcatctattgttttctcccagctctctccctc
ttctctggtcaattcatcgtccagtcccttgatgtagctttcctagtgtacctccttacc
atcactgtcactctaagcttgctagctgtgcttgaaattaaatggtctggcattgaattg
gaggaatggtggagaaatgagcagttttggttgattggagggactagtgcccaccttgct
gctgtgcttcaaggactattaaaagttattgcagggattgaaatttctttcaccttgaca
tcaaaatcagcaagtgatgatatagatgatgagtttgctgacctctacatcgtcaaatgg
tcctctctaatgataccaccaatcacaatcatgatggttaacttaattgcaattgcagta
gggtttagcaggacaatatacagtaccctaccgcaatggagccgcttactaggtggagtt
ttcttcagtttctgggtgttggcacatctttatcctttcgcgaaaggacttatgggaaga
agagggaggactcctaccattgtttatgtatggtcaggacttattgcaatcaccatctcc
ctcctgtgggtggcaatcgatcctccatctgatactaaccaaattggaggctcattccag
tttccttag
DBGET
integrated database retrieval system
