Mangifera indica (mango): 123220927
Help
Entry
123220927 CDS
T07684
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
minc
Mangifera indica (mango)
Pathway
minc03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
minc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
123220927
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
minc03019
]
123220927
Messenger RNA biogenesis [BR:
minc03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
123220927
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123220927
NCBI-ProteinID:
XP_044499470
LinkDB
All DBs
Position
7:16829467..16833189
Genome browser
AA seq
461 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEDKLKDYFSQYGDVLQTVVMREKTTGRPRGFGFVVFADPSIL
DRVLQDKHTIDGRTVEAKRAMSREEQQTSARTGNFNPFRNNGGGGNIRTKKIFVGGLPPT
LTEDGFRQYFEGYGNVTDVVIMYDQNTQRPRGFGFISFDTEDAVDRVLHKTFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGGGGRNMGAGGSGFGGYQGYGASGGNSSAFEGRMDSNRYMPSQNTGSG
FPPYGSSGYGTPGYGYGPSSNSVSYGGYGSYGGANAGYGGPAGAAYGNPNVANAGYVSGP
PGAPRSSWGTQAPSGYGTMGYGNAVPWGTGSGGPGSTPTGQSPSGATGYGNQGYGYGAYG
GSEGSYGNASGYGAVGGRSGSVPSGNAGNQGAGELQGSGGSYIGSGYGDSNGNSGYGNAG
WRSDASQASGNYGAQANGPHGGQAGYGGGYGGAQARQAQQQ
NT seq
1386 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcagggtaagctgtttattggtgggatttcatgggaaacaagcgaggac
aagttaaaggattacttttcccaatatggcgacgttttgcagaccgtggttatgagagag
aaaaccaccgggagacccagaggttttggttttgtggtttttgcagatccttccattctc
gatcgtgtccttcaggataagcacaccatcgatggacgaactgttgaggcgaagagagcc
atgtcaagagaggagcagcaaacatcagccagaactggaaacttcaatccttttagaaac
aatggaggtggtgggaacatcaggaccaaaaaaatatttgttggagggttgcctcccact
ctaactgaagatggatttcgtcaatattttgaaggttatggcaatgtcactgatgtggta
atcatgtatgaccagaatactcaacggcctcgtggatttggctttatttcctttgatact
gaagatgcagttgacagagttttacataaaacttttcatgatttgaatggtaaacaagtt
gaagtgaaacgggctcttcctaaagatgccaatcctggaggaggtggccgtaacatggga
gctggtggttctggttttggtggttatcagggttatggtgcttctggtggcaattcaagt
gcatttgagggtcgtatggattctaataggtacatgccgtctcagaatactggaagtggc
tttccaccttatggttcatcggggtatggtacaccaggctatggatatggtccatccagc
aacagtgtcagttatggtggttatggcagttacggtggtgccaatgctgggtatggtggc
cctgcaggtgccgcctatgggaacccaaatgtagctaatgctggttatgtaagtggtcca
ccaggtgcacccagaagctcgtggggtacccaggctccctctggttatggtaccatgggc
tatggaaatgctgtcccttggggtactggtagtggtggtcctggttcaacacctacgggt
cagtctcctagtggggccactggttatgggaatcagggttatggttatggtgcgtatggt
ggaagtgaaggttcttatgggaatgcctctgggtatggagctgttggtggacgttctggt
agtgtcccaagtggtaatgctggtaatcagggtgcaggagaattgcaagggagtggtggc
agctacattggaagtggctatggtgattctaatggaaattcagggtatggaaatgcaggt
tggagatctgatgcatctcaagcttctggaaattatggagctcaagccaatggtcctcat
ggtggacaagctggctatggtggtggatatggtggtgctcaggcccggcaagcccaacaa
caatga
DBGET
integrated database retrieval system
