Macadamia integrifolia (macadamia nut): 122091637
Help
Entry
122091637 CDS
T07436
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
ming
Macadamia integrifolia (macadamia nut)
Pathway
ming03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ming00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
122091637
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ming03019
]
122091637
Messenger RNA biogenesis [BR:
ming03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
122091637
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122091637
NCBI-ProteinID:
XP_042517603
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(13613374..13617423)
Genome browser
AA seq
469 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWDTSEDKLKEYFGNYGEVSQTVIMRDKITGRPRGFGFVVFSDPAVL
DRVLQEKHTIDGRTVEAKRALSREEQHTSSRSGNPNAGRNLGSGGNTRTKKIFVGGLPPT
LSEDGFRQYFETYGHVTDVVVMYDQTTQRPRGFGFISFDSEEAVDRVLHKTFHELNGKLV
EVKRALPKDANPGGGGRAMGGGNYQGYGSSGGNASSYDGRVDATRYMQPQTAGGGYPAYG
SSGYGAPGYGYGAANNGVGYGSYGVGGYGGASAGYGGPAGAYGNPNAPSAGYLNGPPGGP
RSPWSNQAPSGYGSTGYGANAGYGTAAPWNATGAGGAASSGGSVSASTGQSPSGAASYGN
QGYGYGGYGGGDGSYANPGGYGAVGGRAGSAPSSNAPTGAGGGEQGTGGGYMGSGYGDAN
GSSGYPNAVWRSDASQGGYGTGQANGPPGGQVGYGGGYGGAQARQAQQQ
NT seq
1410 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaaggtaagcttttcattggtgggatttcttgggatacttcagaagat
aaactgaaggagtattttgggaactatggggaggtatcgcagactgtgatcatgcgcgat
aagattactgggaggccgagaggatttggttttgttgtgttttcggatcccgcggtcctc
gatagggttcttcaggagaagcacaccatcgatgggagaacggttgaagctaaaagggct
ttgtcaagagaggaacaacacacttcctctaggtctggaaaccctaatgctggccgaaat
cttggaagtgggggcaatactaggaccaagaaaatatttgtgggaggtttgcctcccact
ttatcagaagatggattccgtcagtattttgagacatatggccatgtaactgatgtagta
gtaatgtatgatcagactacccaacgtcctcgtggatttggtttcatctcctttgattcg
gaggaagctgttgatagagtcctgcacaagactttccatgaattgaatggtaaactagtt
gaagtcaagcgcgcgcttccaaaagatgcaaaccctggaggtggcggccgtgcaatgggt
ggtgggaactatcagggatatggttcttctggtggtaatgcaagttcatatgatgggcgg
gtggatgccactagatacatgcaacctcaaacagccggaggtggttacccggcatatggc
tcttcaggctatggtgcacctggatatggatatggtgcagcaaataatggtgttgggtat
ggtagttatggtgttggtggctatggtggtgccagtgctgggtatggtggccctgctggg
gcttatggaaatcctaatgctccaagtgctggttatctgaatggccctcctggtggccca
agaagtccgtggagtaatcaagctccttctggatatggttccacgggctatggtgctaat
gcaggttatgggaccgcagctccatggaatgctacaggggctggtggcgctgctagtagt
ggaggttctgtttctgcatctacagggcagtctccaagtggagctgccagctatggtaat
caaggttacggttatggtggttatggtggaggagatggatcttatgctaacccaggtgga
tatggtgctgttggaggacgtgctggtagtgccccaagcagcaatgctcccactggtgcg
ggtgggggagaacaagggactggtggtggctacatgggaagtggttatggtgatgctaat
ggtagttcagggtatccaaatgctgtttggaggtccgatgcttcacaaggaggttatgga
actggccaagcaaacggacctccaggtgggcaggttggttatggtggtggttatggtggt
gctcaggccagacaggcacaacagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system