Mixta intestinalis: C7M51_03387
Help
Entry
C7M51_03387 CDS
T06391
Symbol
rfaL
Name
(GenBank) O-antigen ligase
KO
K02847
O-antigen ligase [EC:
2.4.99.26
]
Organism
mint
Mixta intestinalis
Pathway
mint00540
Lipopolysaccharide biosynthesis
mint01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mint00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00540 Lipopolysaccharide biosynthesis
C7M51_03387 (rfaL)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01005 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
mint01005
]
C7M51_03387 (rfaL)
Enzymes [BR:
mint01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.99 Transferring other glycosyl groups
2.4.99.26 O-antigen ligase
C7M51_03387 (rfaL)
Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
mint01005
]
Core region
C7M51_03387 (rfaL)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Wzy_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QHM73046
UniProt:
A0A6P1Q232
LinkDB
All DBs
Position
complement(3643439..3644713)
Genome browser
AA seq
424 aa
AA seq
DB search
MIKGQPFTGWIKISKMKLNWRELLYFFALSTVMLSVICTFIDEKSAKVAFYWAFYFSIPG
IIVSWRQINRSHIWLVGALVLLGASKVIWFYWHYLGQPELNPFNDYLNAGKRLLIAAVIG
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GWRAAVGSFIAILLLGAACYQPMIKPRLDKTITEIDRYSQDQGNKMGSLTSRFAMWNIGI
ACFRAYPLGMNMEQRETWFKRYVKEHHRDASALPYVSVHLHNELIDSATLQGILGALTIL
LFYMIILINALRRKNALLLSVIAIVIISGLTDVVFISRELTVCTSLLLILSVIWKDLITI
QQKR
NT seq
1275 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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acggtttgtacttcgcttctgcttatcctgagcgttatatggaaagacctaattactata
cagcagaagcgatag
DBGET
integrated database retrieval system
