Mucilaginibacter jinjuensis: PQO05_17795
Help
Entry
PQO05_17795 CDS
T08815
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
mjj
Mucilaginibacter jinjuensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
P-loop_SecA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WCT10592
UniProt:
A0ABY7T2G0
LinkDB
All DBs
Position
complement(4072636..4076031)
Genome browser
AA seq
1131 aa
AA seq
DB search
MIKIISDQGDTAENHSVIFEGVTIETLSEAIIAQHAPADIYTDGKAYQYVMPVKLGIGYG
VFIKQYSTFAFPHVTVSQQDGFISLSCACHAEEGRLCEHQALVLNAIVKRDELRIFFDEK
YRREKLQKFAADYGLQHEPDLDSFFKIEFDNKKLVIAPRQSSLMPVTRESLHALNELITP
VAEPFILPTAEEGKKVFLVLKEHKYYKYLFIELYEAQTTKEGKIKNPTTPISPLDFVWKT
EDTQQMKFYTGISKFQNHLNAKKSEADLIALRAIVKNPLGYEFYRHWPAMSDKITSASVD
RIRVQVLPHDGLKLTVTQQDQFFEVSGGINIEGKVFRPKDFAVVYTYFIDTILGNLYLVD
NLQVLNIIELLKKRPGNLLIHASKFNEFKSLWLSKLEDKITVDYQYIKPATPAQLKQQRF
YEDTEKIIYLSDFGNHVMIIPVMRYGEMEISTRTRRLIYAVDEKGKEFVVPRKDYEEADF
TALLTRQHPYFAEQLDNDLHYFYLHKKYFLDEEWFLNVFEDWQRHDITVLGFNELEGNKL
NPNKVKITIKILSGINWFNALVDVRFGKKKALLKHVHKAVKNKSRYVQLDDGSLGIIPAE
WLDKFADYFSSGEIADDDTIQIPKVNFATIEELYDEEMLDEGVKQELNTYRKRVNGFDSI
KEVQVPAELNATLRHYQQAGLNWLNFLDEFNFGGVLADDMGLGKSIQIIAFILSQRERVK
QNTNLLVVPTSLIFNWQQEVAKFAPTIRIHTIYGADRVKSTKGFDQYEIILTSYGTLLSD
INFIKDYEFNYVFLDESQNIKNPESQRYKSVRLLKSRNKIAITGTPIENNTFDLYGQLSF
ACPGLLGSKQYFKEIYAIPIDQFKYSKRAIELQNKIRPFILRRTKQQVATELPEKTEMVL
HCEMKAEQRNIYDAYEREFRDYISATNNDQLKKSSINVLKGLTKLRQICDSPLLLNGDKL
PGNQSAKIDTLIEQIESKEPQHKILVFSQFVGMLDLIRKELQGRGIGHTYLTGQTRNREA
AVNEFQNNPDVRVFLISLKAGGTGLNLTEADYVYLVDPWWNPAVENQAIDRCHRIGQTKH
IVAIRLICPGTVEEKIMILQQSKKDLANDLIRTDGSFVKSLNKDDLLNLIS
NT seq
3396 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgattaagataattagtgatcagggtgatacggccgaaaaccatagcgtaatatttgaa
ggggttaccattgaaaccctttctgaagctattattgcacagcatgcacccgccgatatt
tacactgatggcaaagcttatcaatatgtaatgcctgttaaactggggattggttatggt
gttttcatcaaacaatacagcactttcgccttcccgcatgtaaccgtttctcagcaggat
ggctttatatcgctctcctgtgcctgccatgcagaagagggccgcttatgcgagcaccag
gctttggtattgaatgctatagttaagcgtgatgagcttcgcatattttttgacgaaaaa
taccggcgcgaaaaactccagaaatttgcagctgattacggcctgcagcacgaaccggat
ctggatagtttttttaaaatcgaattcgacaataaaaaacttgttattgcaccaaggcaa
tcgtcattaatgccggttacacgagagagcctgcatgctttaaatgaattgatcacacca
gttgcagaaccttttattttacccacagcagaggaaggcaaaaaggtttttttagtgtta
aaagagcataaatattataagtacctatttatagaattatacgaagcccaaactactaaa
gaagggaagattaagaaccctacaaccccaatatcgccacttgattttgtctggaaaacg
gaggacacccagcaaatgaagttttatactgggattagtaagtttcaaaaccaccttaat
gcaaaaaaatcagaggccgacctaattgctttgagggccatagttaaaaacccattaggg
tatgaattttataggcactggcccgcaatgtctgataagataacttcggcttctgttgat
cggataagagtacaggttttgccccatgatggccttaagttaacagttacccaacaagat
caattttttgaggtgtcggggggcattaatatcgagggaaaagtttttaggcccaaagac
tttgctgtggtatacacctattttatagatacaattctgggtaacctttacctggtggac
aacctgcaggtgctaaacattatcgaattactaaaaaagagaccgggtaacctgctgatc
cacgccagtaaattcaatgagtttaaatcactttggctgagtaagctggaagataaaatt
accgtcgactaccagtacattaaaccggccacccctgcgcagttgaaacagcagaggttt
tacgaggatacagagaagatcatctacctgtcggattttggcaaccatgtgatgattatc
cctgtaatgcgttatggtgaaatggagatctctacccgcacccgcaggcttatttatgcg
gtggatgaaaaagggaaagagtttgtagtgccacgcaaagattatgaagaggccgatttt
acagccctgcttacccggcagcatccttattttgccgagcagctggataacgatctgcat
tatttctacctccacaaaaaatatttcctggacgaagaatggtttttaaatgtgtttgaa
gactggcagcgccacgatattaccgtactaggctttaatgaactggaaggtaacaagctt
aaccccaataaggtaaagatcactattaaaatattgagcggcatcaactggtttaatgcc
ctggttgatgtacgtttcggtaaaaagaaagctttgcttaaacatgtacacaaagcagtt
aaaaacaagagccgctatgtacagttggatgatggcagcctgggtattatcccggcagaa
tggctggacaaatttgccgattactttagttcgggcgaaattgctgatgacgatacaatt
caaatcccaaaagtaaactttgcaaccattgaggagttgtacgatgaggaaatgctggac
gaaggtgtaaagcaggagctcaatacttatcgtaaaagagtaaatggctttgatagcatt
aaagaagtacaggtacctgcagagttaaatgcaacgcttcgtcactaccagcaagcggga
ttaaactggcttaactttttagatgagtttaattttggcggggtattagccgatgatatg
ggcttgggcaaatcgatccagatcattgcttttattttatcgcagcgcgagcgggtaaag
caaaacaccaatttgcttgtggtgccaacttcgctcatatttaactggcagcaggaggta
gctaaatttgcgccaaccatccgcatccataccatttatggtgcagatagggttaagagc
accaaagggttcgaccaatacgagatcatcctaacctcgtacggtacgctgttatcagat
attaatttcattaaagattatgagtttaactacgttttcttagatgagtcgcagaatatc
aagaacccggaatcgcaacggtataaatctgttcgattgctgaaatcgcgtaacaagatt
gccattacgggtacaccgatcgagaataataccttcgatctatatggccagctctctttt
gcctgcccgggattgctggggagcaagcagtatttcaaagagatttatgccataccgatt
gatcagtttaagtacagcaagcgggctattgaattgcagaacaagattcgtccgtttatt
ctgcgccgcaccaagcaacaggttgctaccgaactacccgagaaaaccgaaatggtattg
cactgtgaaatgaaagccgagcagcggaatatttatgatgcgtatgaacgtgagttccgc
gattatatttcggcaaccaataacgatcagctaaaaaagagttcgattaatgtgctgaag
ggtttaaccaaattacggcagatctgcgattcaccattgttgttaaatggggataagttg
ccgggtaaccagtcagccaaaattgataccttgattgagcagatcgagagtaaagaacct
cagcataaaatactggtgttctcgcaattcgtaggcatgctcgatttgatcaggaaagaa
ctacagggcagggggataggccatacttacctaaccggccaaacccgtaaccgcgaagcc
gcggttaatgagtttcaaaacaatcccgatgtccgcgtattcctcatcagcctcaaagca
gggggaaccggactcaaccttaccgaggccgactatgtttacctcgttgatccctggtgg
aacccggctgttgagaaccaggccattgaccgctgtcaccgtataggccaaaccaagcac
attgttgctatccggctaatttgtccgggtacggtcgaagaaaagatcatgatactacag
caatctaaaaaagacctggcgaatgatctgatccgtaccgatggttcatttgttaaatcg
ctcaataaagatgatttgttgaacctgattagttaa
DBGET
integrated database retrieval system