Mesomycoplasma lagogenitalium: QEG99_02415
Help
Entry
QEG99_02415 CDS
T08991
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mlag
Mesomycoplasma lagogenitalium
Pathway
mlag03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mlag00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
QEG99_02415
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mlag03021
]
QEG99_02415
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mlag03400
]
QEG99_02415
Enzymes [BR:
mlag01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
QEG99_02415
Transcription machinery [BR:
mlag03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
QEG99_02415
DNA repair and recombination proteins [BR:
mlag03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
QEG99_02415
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
UPF0175
CEP63
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGI36309
LinkDB
All DBs
Position
complement(597093..601331)
Genome browser
AA seq
1412 aa
AA seq
DB search
MNKNKNNKITRKYATIDENSIDKISLSLATSEDVLEWSNGEVTKAETINYKTFKPEREGL
FDELIFGPVIDYKCSICGRKYKKSNEGTNCSATELCKSSKSEILPKISRRSRMGHIALNS
PVVHFWFFRIDHSIISKLLGIKTEDSNKAVSKSSLESLIYYKAHIILESGGIKALPKNQI
IELNEAGVIYKDALLEIREKYEPDTEEYEELSEALKDLSERATSKLGKEYGIDFYELNEI
IEEYSDAKISTGAEAIKYLLSNINLEEERDKIKTLVDEIQNLSPEKKTSTKIQERDKLYK
RLQVINSFINSGQDPLSMLITNLPVIPADLRPLIQLDGGRHSTSDINELYRRIIIRNNRL
KKWYENDAPILIIQNELRMIQEAVDALIDNQRRSPAPISAKDGRPLKSISDALTGKKGRF
RQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPNLKMHQVGIPREMAAKLFEPWIIRRLIEQELSSSIKSAR
KMIEELNPIIWPHVAKVIEGKLVLLNRAPSLHRLSIRAFEPVLVRGRAIKLHPLVTAGFN
ADFDGDQMAVHVPISPEAIRETRELMFANKNILGPKDGEPIVNPSQDMILGLYYLTKEDK
SEKGRKGEGRFFGTYNEMLRAHEVGAVSLHARVALPFSEVKKSIEISSNGYIISTVGKFI
FNNAFPENFPFVFDTDVDNLYLNQENQIAKYVAPKGTNLAEFIKQLPFNEPLNKKHIAKI
IRQTYDNFDIVVSMEDVASVVKELNFDNYKNSLELYSKLIDYKNEKISAKHATNLAKFTV
EEFENIYKKIKISNHNIDRELEKEEKVTLLEKIWFKYTNLVAEILDEIKDLGFKYSMLSG
TSISIGDIKLAPKKDEFILEGEKYTAELNDFFKMGMLTDDERYILTIDKWTKIKDEIQKD
LNNVTNNEPDNPIFMMMKSGARGNISNFVQLAGMRGLMANNVKTLKADAENERVVRSTVE
VPVKSSFLEGLTSYEFYSSTHGARKGGTDTALNTAKSGYLTRRLVDVAQNIVVTQSDCGS
DFGFVVKEIIDTKTNSSIVSLFERIEGRYTNSPIYHPESGELIVNSNKFITPEIAKEIVD
AGIKEVEIRSILSCHTRNGVCKKCYGKDLATNRIVAIGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRT
FHTGGVAGVEDITGGFTRLIELIDAYDRPWGKPAQISPVKGYVSAIEELKDKAGNITGAI
LVRVKYKDNEDNELEKVFHVQPNRKLRVKLHDNIIPGQKITEGPIILKELLNFTDARRVQ
NYLLKEVQRLYRMQGISISDKYIEIIIRQMLSKILITDAGDSNLFVGSLVDVFEYQEVNG
QLLTEGKKPAFGQIVIKGAKQTPLLSDSFLAAASYQETSKILVHASISSQVDKLEGLKEN
IIVGHRIPAGTNSKYEPKSKYDIQDPINYFKD
NT seq
4239 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaaaacaaaaataataaaattacaagaaaatatgcgacaattgatgaaaattca
attgataaaatttcactttcactcgcaacttctgaagatgttttagaatgatcaaatggt
gaagttacaaaagctgaaaccatcaattataaaacttttaaacctgaaagagaaggattg
tttgatgaattaattttcggaccagttatcgattataaatgttctatttgtggtagaaaa
tataaaaaatctaatgaaggaacaaactgttcagcaactgaattatgtaaaagttctaaa
tctgaaattttacctaaaatttctcgtagatcaagaatgggacatattgcattaaattca
ccagttgtacacttttgatttttcagaatcgaccattctattatttctaagttattagga
ataaaaactgaagatagtaataaagctgtttcaaaatcatctttagaatcgttaatttac
tacaaagcccacattattttagaatctggagggattaaagctcttcctaaaaatcaaatt
atcgaattaaatgaagctggtgttatttataaagatgctctattagaaataagggaaaag
tatgaaccagataccgaagaatatgaagagttatccgaagcactaaaagatttaagtgaa
agagcgacttcgaaattaggaaaagaatatggaattgatttttatgaattaaacgaaatt
attgaagaatattctgatgctaaaatttcaacaggagctgaagcgattaaatatctttta
tctaatattaatttagaagaggaaagagataaaatcaagacattagttgatgaaattcaa
aatttaagtcctgagaaaaaaacatctaccaaaatccaagaaagagataaactatacaaa
agattacaagttattaattcttttattaattcagggcaagatcctctttcaatgttgata
actaatttaccagttattcccgctgatttaagaccattaattcaattggatggaggaaga
cattcaacaagcgatataaacgaattatatagaagaatcatcattagaaataatcgtttg
aaaaaatgatatgaaaatgatgcccctattttaattattcaaaacgaattaagaatgatt
caagaagctgttgatgcattaatcgataatcaaagaagaagtccagcgccaatttctgca
aaagatggaagaccattaaaatcgatttcagatgctttaacaggtaaaaaagggcgtttt
agacaaaatttacttggaaaaagagtcgattattcaggtagaagtgttatcgttgttggt
cctaatttaaaaatgcatcaagtaggaatacctcgggaaatggcggctaaattatttgaa
ccatgaattattagaagattaattgaacaagaattatcatcatcgataaaaagtgcaaga
aaaatgattgaagaattaaatccaattatttgaccacatgttgcaaaagtaattgaagga
aaattggttttattaaaccgtgctccttcattgcaccgtctatccattagagcttttgaa
ccggttttagttagaggtcgtgcaattaaattacacccacttgtaacagctggatttaat
gccgattttgatggtgatcaaatggctgttcacgtgccaatttctccagaggcaattagg
gaaacaagagaactaatgtttgctaataaaaacattttaggtccaaaagatggagaacca
attgttaacccatcgcaagatatgattcttgggttatattatttaactaaagaagataaa
agcgaaaaaggaagaaaaggtgaaggaagattttttggaacttataatgaaatgcttcgt
gcacacgaagttggcgcggtttcactacatgcaagagttgctcttcctttttcagaagta
aaaaaatcaattgaaatttcttccaatggttatatcatttcaacagttggtaaattcatt
tttaataatgcatttccagaaaatttcccatttgtttttgatactgatgttgataattta
tatttaaatcaagaaaatcaaattgctaaatatgtggctcctaaaggaacgaatttagca
gaatttattaagcaacttccatttaatgaacctttaaataaaaaacatattgctaaaatt
attagacaaacttatgataattttgacattgttgtttcaatggaagatgttgcttcagtg
gtaaaagaattaaattttgataattataaaaattcattagaactatattcgaaattaatt
gattataaaaatgaaaaaatttctgcaaaacatgcaactaatttagctaaatttactgtt
gaagaatttgaaaatatttataaaaaaattaaaattagcaatcacaatattgatcgtgaa
ttagaaaaagaagaaaaagtaacattattagaaaaaatttgatttaaatacacaaattta
gttgctgaaattctagatgaaattaaagatttaggttttaaatattcaatgttatctgga
acatcaatttctattggtgatattaaattagcacctaaaaaggatgaatttattttagaa
ggagaaaaatataccgctgaattaaatgatttctttaaaatgggaatgttaactgatgat
gaaagatatattttaacaattgataaatgaactaaaattaaagatgaaattcaaaaagat
ttaaacaatgttacaaataatgaaccagataatccaatttttatgatgatgaaatctgga
gcaaggggaaatatttccaacttcgttcaattagcaggaatgcggggattaatggcgaat
aacgttaaaaccttaaaagccgatgctgaaaacgaaagagttgtgcgttcaactgttgaa
gttcctgttaaaagttcctttttagaaggattaacttcttatgaattttattcttcaact
cacggtgctagaaaagggggaactgatacagcacttaatactgctaaatcgggttattta
actcgccgtttagttgatgttgctcaaaatatcgttgtaacacaaagcgattgtggttca
gattttggttttgttgttaaagaaattattgatactaaaactaactcttcaattgtttca
ctctttgaaagaattgaaggaagatatactaactcaccaatttatcatcctgaatctgga
gaattaattgtaaattcaaacaaatttattactccagaaatagcaaaagaaatcgttgat
gcgggaattaaagaggttgaaattcgttctattttaagttgtcatactagaaatggtgta
tgtaaaaaatgttatggaaaagatttggcaaccaatagaattgttgccattggagaagct
gttggtattatagctgctcaatcaatcggtgaaccgggaactcaattaacaatgcgtaca
ttccatacaggaggagttgccggagttgaagatattactggtggatttactagattaatt
gaattgattgatgcctatgatcgtccatgaggaaaaccagcacaaatttcaccagtaaaa
ggttatgtttctgcaattgaagaattaaaagataaagcaggtaatataacaggtgcaatt
ttagttagagttaaatataaagataatgaagacaatgaactagaaaaagtattccatgtg
caacctaaccgtaaattaagagttaaattgcatgataatattattccaggacagaaaata
actgaaggtccaattattttaaaagagttattaaatttcactgatgctcgtagagtgcaa
aattatttactaaaagaagttcaaagattatatagaatgcaaggaatttcaattagtgat
aaatacattgaaattattattcgtcaaatgctttctaaaattttaattactgatgcaggt
gattctaatttatttgttggatcattagtggatgtgtttgaatatcaagaagttaatgga
caattattaacagaaggtaaaaaaccggcatttggtcaaatcgttattaaaggagctaaa
caaactccgttattatcagattcatttttagccgctgcttcatatcaagaaacttccaaa
attttagttcacgcttccatttcttcacaagttgataaattagaaggactaaaagaaaat
attattgttggacacagaattccagctggaacaaattcaaaatatgaacctaaatccaaa
tacgatattcaagatccaatcaattattttaaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
