Mycoplasma leachii PG50: MSB_A0486
Help
Entry
MSB_A0486 CDS
T01367
Name
(GenBank) HD domain protein
KO
K03698
3'-5' exoribonuclease [EC:3.1.-.-]
Organism
mlc
Mycoplasma leachii PG50
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mlc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mlc03019
]
MSB_A0486
Messenger RNA biogenesis [BR:
mlc03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MSB_A0486
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HD
tRNA_anti-codon
TraI_2
HROB
DUF5689
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADR24421
UniProt:
E4PU95
LinkDB
All DBs
Position
complement(568534..569514)
Genome browser
AA seq
326 aa
AA seq
DB search
MKKVKDINIEDHLIDTILRIERVIVSTGSSGNNYLILHLADSTGRIEARKWVVNEKDKQL
LKPNTIVLLKDTIVHEYRNILQLKVEDYQVIDEKDLLKYHLNKTDLYITAPLDIKTSYLE
LISLLNSINNQTYKTITLNLIEKYKKEFLTFPAAMSIHHNVTSGLFWHSYTLVKNVLSLK
ENYFYANIDWDLLICGAILHDIGKVIEISDVNGSDYSLEGKLLGHISIGNAEINKLADKL
NLYKDQNNKINKEITLLQHMILASHGKKEFGSPIEPVLIEAVILSALDDLDAKVYKINDE
LSKIEIDNWTQKIISIDNKMFYKHKK
NT seq
981 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaagttaaagatattaatatagaagatcatttaatcgatactattttaagaatt
gaaagagttatagtttcaacaggaagtagtggaaataattatttaatattacatttagct
gatagtacaggtagaattgaagctagaaaatgagtagttaatgaaaaagacaaacagtta
ttaaaaccaaatactattgttttattaaaagatactattgttcatgaatatagaaacata
ttacaattaaaagttgaagattatcaagtaattgatgaaaaagatttattaaagtatcat
ttaaataaaaccgatttatatataactgctcctttagatattaaaactagttatttagaa
ttaattagtcttttaaatagtattaataatcagacttataaaactattacacttaattta
atagaaaaatataaaaaagagtttttaacttttcctgcagctatgagtattcatcacaat
gttactagtgggttgttttgacatagctatactcttgtaaaaaacgttttgagtttaaaa
gaaaactatttttatgcaaatattgattgagatttattaatatgtggagcaattctacat
gatattggtaaagtaattgaaattagtgatgttaatggtagtgattatagtttagaagga
aagctattaggtcatatttcaataggaaatgctgaaatcaataaactagcagataaacta
aatttatataaagatcaaaataataaaattaataaagaaattactttactacaacatatg
attttagctagtcacggtaaaaaagaatttggttccccgatcgaaccagtactaattgaa
gcagtaattttatcagctttagatgatttagatgctaaagtttataaaattaatgatgaa
ttatcaaaaatagaaatagataattgaactcaaaaaataatcagtattgataataaaatg
ttttataaacataaaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
