Mycoplasma leachii PG50: MSB_A0633
Help
Entry
MSB_A0633 CDS
T01367
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mlc
Mycoplasma leachii PG50
Pathway
mlc03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mlc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
MSB_A0633
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mlc03019
]
MSB_A0633
Messenger RNA biogenesis [BR:
mlc03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MSB_A0633
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_b_CASP
RNase_J_C
Lactamase_B
RMMBL
Lactamase_B_2
Sacchrp_dh_C
Lactamase_B_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADR24394
UniProt:
E4PUN6
LinkDB
All DBs
Position
718649..720481
Genome browser
AA seq
610 aa
AA seq
DB search
MSNKNNKKNLEINDTENENQINSYDDGDQLNISIDEKEFKPYVFKQKEVKRQYQKTNIPT
KIFALGGLEEVGKNTYCIEYDNELIMIDAGVKFPESTMLGVSAVIPDYSYLVENQKKIKA
LFITHGHEDHIGGIQYLVQQVKIPIIYAPKLAAMLIRDRLKEYKIEDKTIVKEYDADDVW
KTKNFKVSYAALNHSIPDAFGILVQTPNGNIFSTGDYKFDWSPLGHFAELTKLASMGENG
VELLMADSTNSEVEGYTQGEKSIISNIDKLFLQVKGRIFLTTFASNVHRIQHIIETAHKY
NRKIVILGRSFERIIKIIRQIGHLKISEKEFIKSTDIDKYKPEELMILTTGSQGEPMAAL
SRIANNKHLSINIIPGDTVVFSSSPIPGNRADVEKLVNKLTRVGAKVIENTSDNKIHTSG
HASQEEQKLLFSLIRPKYFMPMHGEYRMLKKHIETGESVNLEKGNGFIMANGDVLELLQG
KAKIGKRVEADAVYVDGKDMTGKASNVIREREILSKDGLIAVVISLDSQTNRLIAQPRII
SRGSFYVKDAGSIISDSIQIITNAVNEVLMSSKPTFAAIKKAIKSSLSPYIFRVKKRNPL
IIPVILNKKT
NT seq
1833 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaacaaaaataataaaaaaaatctagaaataaatgacacagaaaatgaaaatcaa
attaatagttatgatgatggtgaccaattaaatattagtattgatgaaaaagaatttaaa
ccatatgtatttaagcaaaaagaagttaaaagacaatatcaaaaaacaaatatacctact
aaaatttttgctttaggtggattagaagaagttggaaaaaatacttattgtattgaatat
gataatgaattgattatgattgatgcaggagtaaaatttcctgaatcaactatgctagga
gtaagtgctgttattccagattattcttatttagttgaaaatcaaaaaaagattaaagca
ttatttattactcatggtcatgaagatcatattggtggaattcaatacttagttcaacaa
gtaaagattcctataatttatgctccaaaattagctgctatgttaattagagatagatta
aaagaatataaaattgaagacaaaactattgttaaagaatatgatgctgatgatgtatga
aaaactaaaaactttaaagttagttatgctgcattaaaccactctattcctgatgcattt
ggaattttagttcaaactcctaatggtaatattttttcaacaggagattataaatttgac
tgatcaccactaggacattttgctgaacttactaaattagcttcaatgggtgaaaatggg
gttgaattattaatggcagattcaactaatagtgaagttgaaggatatacacaaggtgaa
aaaagtattatttcaaatattgataaattatttttacaagttaaaggaagaatcttttta
acaacttttgcttcaaatgttcatagaattcaacacattatagaaacagctcacaaatat
aatagaaaaattgttattttaggtagatcatttgaaagaattattaaaatcattcgtcaa
attggtcatttaaaaattagtgaaaaagaatttattaaatcaactgatattgataaatat
aaaccagaagaattaatgattttaacaacaggtagtcaaggtgaaccaatggctgcttta
tctagaattgctaataataaacatttatcaataaatattattcctggtgatacagttgta
ttttcatcctcaccaattccaggaaatagagctgatgttgaaaagttagttaataagtta
actagagtcggagctaaagttattgaaaatacttcagataataaaatacatacttcaggt
cacgctagtcaagaagaacaaaaattattatttagtttaatcagaccaaaatattttatg
ccaatgcatggtgaataccgtatgttaaaaaaacatattgaaactggtgaaagtgttaat
ttagaaaaaggtaatggttttataatggctaatggtgatgtattagaactattacaaggt
aaagctaaaattggaaaacgtgttgaagctgatgcagtttatgttgatggaaaagatatg
actggaaaagcaagtaatgttattagagaaagagaaattctttcaaaagatggattaatt
gctgttgtaatttcattagattcacaaactaatagattaatagctcaacctagaattatt
tctcgtggtagtttttatgtaaaagatgctggttcaataattagtgattcaattcaaatt
attactaatgcagttaatgaagtattaatgtcatcaaaaccaacttttgcagctattaaa
aaagctattaagtcttctttaagtccatacatttttagagtaaaaaaaagaaatccatta
attattccagtgattttaaataaaaaaacttaa
DBGET
integrated database retrieval system
