Mycoplasma leachii 99/014/6: MLEA_000850
Help
Entry
MLEA_000850 CDS
T02144
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mlh
Mycoplasma leachii 99/014/6
Pathway
mlh03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mlh00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
MLEA_000850 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mlh03021
]
MLEA_000850 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mlh03400
]
MLEA_000850 (rpoC)
Enzymes [BR:
mlh01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
MLEA_000850 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
mlh03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
MLEA_000850 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mlh03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
MLEA_000850 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
EF-G-binding_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBV66826
LinkDB
All DBs
Position
97884..101651
Genome browser
AA seq
1255 aa
AA seq
DB search
MENLNRKKAIKIELANPDTIRSWSHGEVLKPETINYKTLKAERDGLFDERIFGPTKNYEC
VCGRYKKANPMNKGKKCEKCGVELTESIVRRERMGHIELEEPVTHIWMLKVAPYRIAAIL
DLKAKELEEVVYFVSHIVLEQGNQNHFLEKEVLDLGSSRITKTREKLQLSILDVIDQIND
PEHRDTKKANRLLEELKNTSIPFSIDEATSLISKYTNAKFGIGARAVEYLLEKVDLTKEI
EAIKIQLENSKKTPNERTKLLKRLETFDSLKRSKQRPEWMVMRVIPVIPPDIRPIIQLDG
GRFTTSEINDLYRRIIIRNERLKKVKEMGAPSIIVNNEKRMLQEAVDALFDNERKPKPVQ
GKNKRPLKSLTSVLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSARSVIAIGPDLKMYQAGLPREMAITLF
KPFVIQWLQDHEYAENVKIAEKMLLQNDPKVWEALEQVIKNRPVLLNRAPTLHRLGIQAF
EPKLVKGKAIRLHPLVTTAFNADFDGDQMAVHVPITKEAVAESRALMLGSSAILGPKDGK
AIVTPGQDIILGNYYLTTEEKNAKGQGMIFSSLDEAFMAYNSGQIHLNSLIGIALSALPK
QKFSDKNQRLNSYLLTTVGKLYFNQIFDDNFPWINSNNIWNAKEAVKEFIYDFSQDINNV
IENIQVQQPIKKKELSLIIERYFETHGARKTAEMLDKMKDLGFSFSTKSGTTISAGDVVA
FTHKYDEFKEADQKVEQITDFYNMGMLTNSEKKRRIIDVWSEVKDKIQNELATVLRKDVK
NPIFVMVDSGARGNVSNFTQLVGMRGLMNDTKGDIKEIPIKSSFREGLTVSEYFVSTHGA
RKGMADIALKTADSGYLTRRLVDVSQEIVVVNEDCEPSKGFEVSAIIDTKHDNVIVPLKD
RLVGRFTFEDIYDDDKNLVAFANTLIDKNIAEKIIMSGISSVVIRSVLTCDNKRGVCQKC
YGLNLATASVVNIGEPVGVIAAQSIGEPGTQLTMRNFHTGGVAGNVDITQGLPRIKELLD
VTTPKGAVAIISEVDGVVSEIEDYNGVFVINIVTENEEVKKYKTEFNSVLRVEQGSSVVA
GQKLTEGAIDLHQLLEFGGIQDVQNYILKEVQKVYRLQGIEISDKYIEIIIKQMLNKVKI
TDSGDSDLLPGEIITIQNYKEVVQDCIIKSIRPPLSKAQIFGIKKAPLESSSWLSSASFQ
DTARVLTRAIIKGKEDKLEGLKENIMLGNLIPAGTGLTGTQEVEQLAEQYHNNEY
NT seq
3768 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaatttaaatcgtaaaaaagcaataaaaattgaattagctaaccctgatacaatt
cgctcatgatcacatggagaagttttaaaaccagaaactattaactataaaacattaaaa
gccgaaagagatggcttatttgatgaaagaatttttggtccaactaaaaattatgaatgt
gtttgtggaagatataaaaaagctaaccctatgaataaagggaaaaaatgtgaaaaatgt
ggtgttgaattaactgaatcaatcgttcgtagagaaagaatgggacatattgagttagaa
gaaccagttactcacatttgaatgcttaaagttgctccttatagaattgctgcaatctta
gatttaaaagcaaaagaattagaagaagtagtttactttgtttctcatattgttttagaa
caaggtaatcaaaatcattttctagaaaaagaagttttagatttaggttcatcaagaatt
actaaaactagagaaaaactacaactatcaattttagatgttattgatcaaattaatgat
cctgagcatagagatactaaaaaagctaatagattattagaagaattaaaaaatacttct
attccattttcaattgatgaagcaactagtttaattagtaaatatactaatgcaaaattt
gggattggagctagagctgttgaatatctattagaaaaagtagatttaactaaagaaatt
gaagcaatcaaaattcaacttgaaaattctaaaaaaaccccaaatgaaagaactaaatta
ttaaaacgtttagaaacttttgattctttaaaacgttctaaacaacgtcctgaatgaatg
gttatgagagtaattccagttattccaccagatattcgtcctattattcaattagatggc
ggtcgttttactacttctgaaattaatgatttatacagaagaatcattattagaaatgaa
agattaaaaaaagttaaagaaatgggtgcgccttcaattattgttaataatgaaaagcgt
atgttacaagaagctgttgatgctttatttgataatgaaagaaaaccaaaaccagttcaa
ggaaaaaacaaacgcccattaaaatctttaactagtgttttaaaaggaaaacaaggccgt
tttagacaaaacttattgggaaaacgtgttgattattcagctagatcagttattgcaatt
ggaccagatctaaaaatgtatcaagcaggtttaccaagagaaatggcaattactttattt
aagccatttgtaattcaatgacttcaagatcatgagtatgctgaaaatgtaaaaattgct
gaaaaaatgttattacaaaatgatccaaaagtttgagaagcactagaacaagtaattaaa
aatagacctgttttattaaatcgtgctcctacattacaccgtttaggaattcaagcattt
gaacctaagttagttaaaggaaaggcaattcgtttacacccattagttacaactgcattt
aatgctgactttgacggggatcaaatggcagttcacgtacctattacaaaagaagctgtt
gctgaatcaagagctttaatgttaggttcaagtgctattttaggaccaaaagatggaaaa
gcaattgttactcctggtcaagatattattttaggaaactactatttaactactgaagaa
aaaaacgctaaaggtcaaggaatgattttttcaagtttagatgaagcgtttatggcttat
aatagtggtcaaattcatttaaactcattaattggaattgctttatcagctttacctaaa
caaaaatttagtgataaaaatcaaagattaaattcttatttactaacaactgttggaaaa
ctttactttaatcaaatttttgatgataatttcccatgaatcaattcaaataatatttga
aatgctaaagaagcggttaaagaatttatttatgatttttcacaagacattaataacgta
attgaaaatattcaagttcaacaaccaattaagaaaaaagaattatcacttattattgaa
agatactttgaaactcatggagctagaaaaactgctgaaatgctagataagatgaaagat
ctaggatttagtttttcaacaaaatcaggaactacaatttcagctggagatgttgttgcc
tttactcataaatatgatgaatttaaagaagcagatcaaaaagttgaacaaattactgat
ttttacaatatgggtatgttaactaatagtgaaaagaaacgtcgaattattgatgtctga
tcagaagttaaagataaaattcaaaatgaattagcaacagtattgcgtaaagatgttaaa
aatccaatttttgtaatggttgattcaggagctcgtggtaatgtttcaaactttactcaa
ttagttggtatgcgtggattgatgaacgatactaagggagatattaaagaaattcctatt
aagtcatcattccgtgaaggattgactgtttcagaatactttgtttcaactcatggagct
agaaaaggtatggctgatattgctttaaaaactgctgattcaggttatttaactagaaga
ttagttgacgttagtcaagaaattgttgttgttaatgaagattgtgaaccaagtaaagga
tttgaagtatcagctattattgatacaaaacatgataatgttattgttccactaaaagat
agattagttggaagatttacatttgaagatatttatgatgatgataaaaacctagttgct
tttgctaatacattaattgataaaaatattgctgaaaaaattattatgtcaggaattagt
tcagtagttattagatcggttttaacttgtgataacaaacgtggtgtttgtcaaaaatgt
tatggattaaacttagctactgcttcagttgttaatattggtgaaccagttggagttatt
gctgctcaatcaattggagaaccaggaactcaattaacaatgcgtaacttccatacagga
ggagttgctggtaatgttgatattactcaagggcttccacgtattaaagaattattagac
gttacaactccaaaaggcgctgttgctataatttctgaagttgatggagtagttagtgaa
attgaagattataatggtgtatttgtaattaatattgttactgaaaatgaagaagttaaa
aagtacaaaactgaatttaactcagtattacgtgttgaacaaggttcaagtgttgttgct
ggtcaaaaattaactgaaggagctattgatttacaccaattattagaatttggtggaatt
caggatgtacaaaattacattttaaaagaagttcaaaaagtttatagattacaaggtatt
gaaatttcagataaatatattgaaatcatcattaaacaaatgttaaacaaagtaaaaatt
actgatagtggtgattctgatttattacctggagaaattattacaattcaaaactataaa
gaagtagtacaagattgcattattaaatcaattaggccacctttatcaaaagctcaaatc
tttggtattaaaaaagcacctttagaatcaagttcatgattatcttctgcttcattccaa
gatactgctagagtattaactagagcaattattaaaggaaaagaagataaattagaagga
ttaaaagaaaatattatgttaggtaatttaattccagctggtactggtttaactggaact
caagaagttgaacaactagcagaacaataccataacaatgaatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
