Mariniflexile litorale: QLS71_003335
Help
Entry
QLS71_003335 CDS
T10312
Symbol
secDF
Name
(GenBank) protein translocase subunit SecDF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
mlil Mariniflexile litorale
Pathway
mlil02024
Quorum sensing
mlil03060
Protein export
mlil03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mlil00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
QLS71_003335 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
QLS71_003335 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
QLS71_003335 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
mlil02044
]
QLS71_003335 (secDF)
Secretion system [BR:
mlil02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
QLS71_003335 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
SecDF_P1_head
SecD_1st
Sec_GG
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBL15056
UniProt:
A0AAU7EHX8
LinkDB
All DBs
Position
complement(840956..843946)
Genome browser
AA seq
996 aa
AA seq
DB search
MQNKGLVKLFALLFGLVSIYQLSFTFKANQVEKAAQEVAINKIPESDPDFRAKRSAEEAN
YLQSVATDTVFNIGIAKFTYNDVKSKAMNLGLDLKGGINVILQVSVKDILKGLANNTKNP
VFNKALNDAEELQKNSQNTYLEDFFLAFDKIKGDTKLASPDIFYTKALDGEIEGNMSDDD
VKAVIRTKIDESIVSAFEVLRKRIDEFGVTSPNIQRLGSSGRILVELPGVKDVERATSLL
QSTAQLEFWDAYKGEQFFNFLAQANDVLKETAEVKKDTLTAEPQDEENATDSTIDDLLGE
AATDSTAVQTVNPLFDLIRGQGYQGGPVIAQFEIKDKTKVLNYLNSPKVRALLPAEMRYT
KFAFGKPEKDSEIVDLYALVGNRDNVPQLSGAVVTDARNDFGQTNKPTVSMQMNAKGAKI
WEEMTGKAYAQGTQIAIVLDNIVYSAPGVTTGPISGGNSEISGNFTLNEAVDLANVLRAG
KLPASADIISSEVVGPSLGQEAIDSGTMSFLIALVLVLVWMILYYGKAGGFADVAMALNI
LLIFGILSGLGAVLTLPGIAGIVLTIGMSVDANVIIFERIREEIAKGKGQKEAIQDGFSN
ALSSILDANITTGLTALILFIFGTGPIKGFATTLLIGIGTSLFTAIFITRLLVDWYVNRG
GKLEFSTAITKNLFRNLSIEFLKKRKIAYVISGAFILVSLGSLFTNGLDQGVDFVGGRTY
QVRFAQDVNASEIADVLKGAFGSADAKTVGGDNQLKITTKYKVNETGTEVDEEIRLKLFN
TLQPYMAGLSYEQFIDLNDENKQVGLMQSFKVSPTIADDIKQASFWAILGSLIVVFLYIL
FRFKKWQFSLGAVAAVFHDVLMVLGVFSLTYRFMPFSMEIDQAFIAAILTVIGYSLNDTV
IVFDRIREYVNEHTNWNFDKVVDVSLSSTLGRTLNTSSTTLVVLLSIFIFGGESIRGFMF
ALIVGIIVGTYSSLFIATPLMYDTVKREEDKKKIKE
NT seq
2991 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaataaaggactcgtaaagttatttgctcttttgtttggtttggtaagtatctac
caattatcattcacattcaaagcaaatcaagtagaaaaggccgctcaagaagtagccatt
aataaaattccagaatcagatccagatttccgtgctaagcgaagcgctgaagaagcaaac
tatttacaatctgtagctacagatactgtatttaacattggtattgctaaattcacttat
aacgatgtgaaatcaaaagccatgaatttaggtctagatttaaaaggtggtattaacgtg
attcttcaagtttcagtaaaagacatcttaaaaggattagctaacaatactaaaaatcct
gtatttaataaggctttaaacgatgcggaagagcttcaaaagaacagtcaaaatacttat
ttagaagattttttcttagcgtttgataaaattaaaggcgatactaaattagcgtctcca
gatatattttataccaaagcattagatggtgagattgaaggaaacatgtctgatgacgat
gttaaagcagttatcagaaccaaaattgatgaatctatcgtttcagctttcgaagtattg
cgtaaacgtattgatgagtttggtgtaacatctccaaatattcaacgtttaggatcttct
ggtcgtattttagtagaattaccaggtgttaaagacgtagaacgtgctacaagtttacta
caaagtactgcgcaattagaattctgggatgcttacaaaggcgaacaattttttaacttt
ttagcacaagctaatgatgttttaaaagaaactgctgaggttaaaaaagatacccttaca
gcagagccacaagatgaagagaatgccaccgattcaactattgatgatttgttaggtgaa
gcagctactgattctacagcagtacaaacggtaaacccacttttcgatttaattcgcgga
caagggtatcaaggcggtccagtgattgctcaattcgaaattaaagacaaaacaaaagtt
cttaattacttgaattcacctaaagtaagagcattgcttcctgctgaaatgcgttacact
aaatttgcttttggaaagccagaaaaagatagtgaaatagtagatttatatgctttagtt
ggtaatagagataatgttccacaattaagcggtgctgttgtaacagatgcacgtaacgat
tttggacaaaccaataagccaactgtgtctatgcaaatgaatgctaaaggcgctaagatt
tgggaagaaatgactggaaaagcgtatgcccaaggaactcaaatagcgattgttttagat
aacattgtatattctgctccaggtgtaactacagggcctatttctggtgggaattctgaa
atttcaggaaacttcacattaaatgaagctgtcgatttagcaaacgtattacgtgcggga
aaattaccagcatcggcagatattatatctagcgaagtggtaggaccatctttaggtcaa
gaagctatcgatagtggtactatgtccttcttaattgctttagtattagtacttgtttgg
atgatactttactacggaaaagcaggtggttttgctgatgttgccatggctttaaatatc
ttattaatcttcggtattttatcaggcttaggagctgtattaacattgcctggtattgcg
ggtatagtacttaccataggtatgtcggttgatgcgaacgtaattatttttgaacgtatt
cgagaagagatagctaaaggtaaaggacaaaaagaggcgattcaagacggatttagtaat
gcattatcatctattttagatgccaatataactacaggtttaaccgctttaattttattt
atttttggtacaggtcctattaaagggtttgctactactttattaattggtattggtaca
tcgttatttacggctatttttattactagattattagttgattggtacgtaaacagagga
ggtaaattagaattctctacagcaattactaaaaatttatttagaaatttaagtattgag
ttcttaaagaaacgtaaaattgcttatgttatttctggagcttttattttagtaagttta
ggttcgttatttacaaatggattagaccaaggtgtcgattttgttggaggtagaacatac
caagtgcgttttgcgcaagatgtaaatgcttcagaaatagccgacgttttaaaaggtgct
tttggaagtgcagatgctaaaacagttggtggagataatcaattgaaaattactactaaa
tataaagttaatgaaactggaactgaggtagatgaggaaataagattaaaattatttaat
acgttacagccttatatggctggcttgagttatgagcaatttatagacttaaacgatgaa
aataagcaagtaggcctaatgcaatcttttaaagtaagtccaacgattgctgatgatatt
aaacaagcatctttttgggcaatcttaggatctttaatagttgtgttcctttatatctta
tttcgtttcaaaaaatggcaattctcgctaggagctgttgctgcagtatttcatgatgtt
ttaatggtattaggtgtattctcattaacataccgatttatgccatttagtatggaaata
gatcaagcatttatcgcggctattttaacggtaattggttactcgttaaatgataccgta
attgtattcgatagaattagagaatatgtaaacgagcatactaattggaattttgataaa
gtggttgatgtatcattaagtagtactttaggcagaaccttaaatacatcgtctactact
ttagtagtattattatccatctttatttttggaggtgaatccattagaggctttatgttt
gcattaatagtaggtattatagttggtacttattcatcgttatttattgcaacaccttta
atgtatgatacagtaaaaagagaagaagacaaaaagaaaataaaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
