Mariniflexile litorale: QLS71_014090
Help
Entry
QLS71_014090 CDS
T10312
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
mlil Mariniflexile litorale
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mlil00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mlil02000
]
QLS71_014090
Transporters [BR:
mlil02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
QLS71_014090
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XBL13445
UniProt:
A0AAU7EDN0
LinkDB
All DBs
Position
complement(3345979..3349026)
Genome browser
AA seq
1015 aa
AA seq
DB search
MYSKINYFRLKNTVFLILTILLCPLGYSSSKTLIKTGFFNVPVQKTINGKILDEAGIPLP
GASILLKGSTSGATTDFDGNFSIQAEIGQTLQISFLGYKTKEIVIDAKVLTIALEMSTAS
LDEVLIVGYGSQTKSDVTGALAQLKADDFKQGVNISADNLIQGKIAGVRVVASSGEPGAG
LDVSIRGVGSIRSGSTPLFVVDGVPLSNESVSASSPNFGLGNSSAKNPLNFLNTSDIASI
TVLKDASAAAIYGARGSNGVVIITTKQGKTGDASITLDSYMSVASVIKKIDVLSASEFRN
AITDSAYDHGGSTDWQEELFRDAITQNLNFSYSKKTESGNYYTSLSYMDQDGIVESSGFK
RTTARLNAEESFFDRKRLKVKVNLTASQINETGVPNGADAGSDGQLIIHSLISNPTQPVF
DANGNYINFNLNQNYNPMYLLHIYDDHTQTLRVLGNIETTFRIVNGLEYKFNYGIDRSVS
ERNSTIYPNFTDRTPDGAYVQNNLDSESILMEHYLTSNFSFDKNNFEILGGFSYQKFNFS
GTSFSITNIDDMGTGVAPEYDPGYSGEQSGVSGYAQENEIQSYFGRLNYNFDNKYLLTAS
LRADGSTRFGENNKYGYFPSFALGWNLDKESFFNNTDVISQLKLRGSWGQTGNQEVQNKI
TQASYSQSASGGYYLYDDYNLVNGIVVNRTANPDLKWEVVTQLNIGADFSLWNNKLYGSL
DYYNKTTTDPILNIPSEPLSPTTTVWKNIDGKIVNKGFEFTLGSEIVKTDNITWSLDLNG
ATLNNEVQDLPVTELYSGSVAGPGLSGVAANIYKSGYEAGSFFMLKHLGFDENGNDMFED
LNEDTVINSDDRQIFEGALPNFTFGINSNLNYKRWNLNLAFIGQTGGLLVNNTNLALNIN
NIASDRNVLSEYYNAGASSSNTVQLSTLYLEKSDFIRLNNARLGYSFNTESLNINWLKGL
NLYVSAQNVFTITNYSGFDPLVNSPRSSGGNQSIGIDYTTYPSSKSYMLGATLKL
NT seq
3048 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatagtaaaattaattatttcagattaaaaaacacagtttttttaattttaaccatc
ctattgtgtccattaggatattcaagtagtaaaacattaataaaaacaggcttttttaat
gttccagttcaaaaaacaattaacggcaaaattttggatgaggcaggaatacctttacca
ggagctagtattttattaaaaggtagtacgagtggtgctactaccgattttgatggtaac
ttttccattcaagcagaaattggtcaaacccttcaaatctcttttttaggatataaaact
aaagaaattgtaattgatgccaaagtactaaccattgctttagaaatgtcaacagcttct
ttagatgaagttttaattgtaggttatggaagccaaacaaaatcagatgttaccggagct
cttgctcagttaaaagcagacgatttcaaacaaggcgttaacatatcggcagataattta
attcaaggtaaaattgcaggtgtacgcgttgtggcttctagtggagaacctggtgcagga
ttagatgtttctatacgtggtgtaggatctatccgaagcggaagtactccattatttgtt
gtagacggagtacctttaagtaacgagagtgtaagtgcttctagtccaaattttggactt
ggaaattcaagcgcaaaaaaccctttaaattttcttaacaccagtgatatagcatctatt
actgtattaaaagatgcttctgcagcagctatttatggagcaagaggttctaatggagtt
gttattataacaactaagcaaggaaaaacaggtgatgcttctattactttagactcttat
atgagtgttgcttcggtaataaaaaagattgatgttttatctgccagtgaatttcgaaat
gctataacagatagtgcttatgaccatggtggaagtaccgattggcaagaggaactattc
cgtgatgctattacacaaaatttaaacttttcttattcaaaaaaaacagagagtggtaac
tactacacatcattatcatatatggatcaagatggtattgttgaaagtagtgggtttaaa
agaactacagcacgcttaaatgctgaagaatccttttttgatagaaaacgtttaaaagta
aaggtgaatttaacagctagtcaaattaacgaaactggtgtacctaatggtgctgatgcc
ggttcggatggacaattaattatacacagtttaatttctaacccaacacagccagtattt
gatgccaatggtaattatataaacttcaatttaaaccaaaattataaccctatgtacttg
ttacatatttatgatgaccatacacaaacactgcgtgttttaggaaatattgaaacaact
tttagaattgttaatggactagagtataaattcaattatggaatagatcgctctgtttct
gaaagaaattctactatctatcctaattttacagacagaacaccagatggtgcttatgta
caaaataatttagattcagaaagtattttgatggagcattatttaacctctaattttagt
tttgacaaaaataattttgaaatcttaggagggttttcttatcaaaaatttaatttttca
ggaacatctttttctattacaaatattgatgatatgggtactggtgttgctccagaatat
gatccaggatattctggagaacaatctggtgttagtggttatgcacaagaaaacgaaatt
caatcttattttggtcgattgaattataattttgataataaatatttattaacagcatct
ttaagagccgatggttccacccgttttggtgaaaataacaaatatggctatttcccttct
tttgctttaggatggaacttagataaagaatctttttttaataatacagacgttatcagc
caattaaaattaagaggtagttggggacaaacaggtaatcaagaagtacaaaataaaatt
acccaagcaagttattctcaatcggcttctggaggatattatttgtatgatgattataat
ttagttaacggcattgtggtaaatagaactgcaaatccagatttaaaatgggaagtagtt
acacaattaaatattggagcagattttagtttatggaataataaattatacggttcttta
gattattacaataaaacaactaccgatcctattttaaatattccttcagaacctttaagt
cctacgactactgtttggaaaaatattgatggtaaaatagtaaataaaggttttgaattc
accttaggttctgaaatagtaaagactgataatattacatggtcattagatttaaatgga
gcgactttaaataatgaagtgcaagacctacctgtaaccgaattatattcgggtagcgtt
gcaggccctggtttatcgggtgttgctgctaatatttataaaagtggttacgaagctggt
tctttctttatgttgaaacacttaggttttgacgagaatggaaatgatatgtttgaggat
ttgaatgaggacaccgttataaacagtgatgaccgtcaaatatttgaaggtgcacttcca
aactttacttttggcatcaacagtaacttaaattacaaacgttggaatttaaatcttgcg
tttattggtcaaacaggtggtttattggtaaacaacaccaatttagccttaaacatcaat
aatatagcttcagatagaaatgtactatccgaatactataatgcaggtgcaagctcatct
aataccgtacagctttctactctttacctagaaaaatctgattttatccgtttaaacaat
gcacgtttaggctattcatttaatactgaaagccttaacatcaattggttaaaaggttta
aatctttatgtaagtgctcaaaacgtatttacaattacaaactattcaggttttgatcct
ttagtaaacagtccacgatcaagcggtggtaatcaatctataggtatagattacacaaca
tacccatcatctaaatcttatatgttaggtgcaactttaaaattataa
DBGET
integrated database retrieval system