Metabacillus litoralis: KDJ21_009575
Help
Entry
KDJ21_009575 CDS
T08411
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
Organism
mlit
Metabacillus litoralis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UHA61861
LinkDB
All DBs
Position
1993938..1996967
Genome browser
AA seq
1009 aa
AA seq
DB search
MSWFTKWSFKNKAAVFLMSTLILVMGVLSYFRLPMEFLPSADQPFISVVTMGNGMDASTM
EDQVTTPIENAIDGVNGKKNVFSTTGDGYSSVDIHLESSVDKKEAKREIEEALANVQLPQ
NVMKPNIVQLNTSMIPVSYIALTFDEGINPETIQYAQDEIVPYFKNIDGVADIQTNGIIP
SFVSVELDEKKMAEKQVSIESVMTLLQGQIVSAAIAENTIDGKASNIKVIGDVDTIEKLE
NTEVIPGAPLKDIAEIKIEKQDNNLTKVNGSDALTFVITKDSQSNAVTISKEAEKVSEEI
NEKYDQLETTVVLASADMVESSVHSMIKEVLLGALFATIVIMIFLRNLRSTLITIVSIPL
SLGFTLFLLAQSGVTLNILTLGGVAVAVGRLVDDSIVVIENIFRRAQTEKFSVKMVIDAT
KEVGSAITSSTLTTVAVFLPMGLIGGSLQDFLLPFALTITYSLLASLIVALTIVPVMSAG
LLKNAQMKEHKPSVKFTRFLTWSLNHKWVVLLTSFILFAGSIGGYMLLPKGSVDKTKADY
VYVSLKYPNETPIEKVKEESAKLEEFVMEQNELENVYLQLGNSADSAKYGEVGDPTQTQI
MAILKKDADMQAFIDKVNTQKEEYKDATLEVTEASMMSGGSTSITVDVIGEDVEELTDLS
EKITAEIKDIDGVEKVSSNQDETKTVYSFVVDPSLAKADQIAQQAAVMLNQTPLGSIEVN
DQQTMVMLEPVYTPDTEKELSEVPIMTANGMTTISKVAQLQQTEEPTSTFHKDGEQYVRV
TANVNPEKLSEISTEVNSKIFGDKETEGIDIPDDIDVFVGGASADQASDFNDLFMTMLAS
IGIVFLIMVITFKTIRAPIAILFSLPLAAIGAILGIMISGISVDVTALLGALMLIGIVVT
NAIVLLDRVKQNEKTMIIRDAVVEAATIRMRPIIMTAVATISAMLPLLFKEAESGNLVSA
SLAIVVIGGLSVATLLTLVVIPVVYELLYFRKSKKQRNQVKKQEDTIAV
NT seq
3030 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcatggtttacaaaatggtcatttaaaaacaaagcagctgttttcttaatgtcgacg
ttgattttagtgatgggagttttaagttattttcgcttgcctatggaatttttaccctca
gcagatcagccgtttatctcagttgtaacgatggggaacggaatggatgcaagcacgatg
gaggatcaagttaccaccccgatagaaaatgcgatagacggagtaaatggcaaaaaaaat
gtattttcaacgactggtgatggctattcatcagttgatattcatctagaatctagtgtt
gataaaaaagaagcaaagcgtgaaattgaggaagcgttggcgaatgttcaattacctcag
aatgtaatgaagcccaatatagtccaacttaatacatcaatgattccagtatcatacatt
gctttaacatttgacgagggtattaatccagaaaccatacaatatgcacaagatgaaatt
gttccttactttaaaaacattgatggtgtagcagatattcaaacaaacggtattattcct
tcttttgtatccgttgaattagatgagaaaaagatggctgaaaagcaggtgtccattgag
agtgtgatgacattgcttcagggacagattgtttcagcagccattgctgagaacactatt
gatggaaaagcatctaacattaaagtgattggtgatgttgatacaattgaaaaactagaa
aatacagaagttatcccaggtgctcctttaaaagatatagcagaaattaaaatagaaaaa
caagataacaatcttacaaaagtaaatggatctgatgctttaacatttgttattacaaaa
gacagtcaatcgaatgctgtaacgatcagtaaagaagcggagaaagtatcagaagaaatt
aacgagaaatatgatcagttggaaacaaccgttgttttagcctcagcagatatggttgaa
tcatctgttcacagtatgattaaagaagttttattaggtgcactttttgccacaatagtt
ataatgatcttcttacgtaatttacgctcaaccttaattactatcgtatctattcctttg
tcattaggttttactttgtttctactagcacaatcgggtgttacattaaatattttaaca
cttggtggtgtggcagttgcggtagggcgtttagtagatgatagtattgttgttatagaa
aacatctttagaagagcacaaacggagaagttttcagtcaaaatggtcattgatgcaacg
aaagaagtaggatctgccatcacttcatcgacgttaacaacagttgctgtctttttaccg
atgggattaataggaggtagcttacaagatttcctattaccatttgccttaacaatcact
tattcattactagcatccttaatcgttgctttaacaattgttccggttatgagtgcagga
ttattaaagaatgcacaaatgaaagagcacaaaccttctgttaagtttactagattttta
acttggtcactgaatcataaatgggttgttcttttaacatcatttattctgttcgcgggg
tcaatcgggggttatatgttacttcctaaaggctctgtagataaaacaaaagcagattat
gtttatgtgtcgttaaaatatcctaatgaaacaccaatagaaaaagtaaaagaagagtcg
gcaaagcttgaagaatttgtaatggaacaaaatgagcttgaaaatgtttatttacaactt
gggaactcagcggattctgcaaaatatggtgaggtaggagatccaacccaaactcagatt
atggcaattctaaaaaaagatgcagatatgcaagcatttatagacaaggtgaacacacag
aaagaagaatataaagatgctacattagaagtgacggaagcatctatgatgagtggcggt
tctacatcgattaccgtagatgtgattggtgaggatgttgaggaattaacggatctttca
gaaaagataactgcagaaattaaggatattgatggcgttgaaaaggtttcatcgaaccag
gatgaaacaaaaactgtttattcctttgttgttgatcctagtctggctaaggctgatcaa
atcgctcaacaggcagctgttatgctgaatcaaacgccgcttggttcaattgaagtgaat
gatcaacaaacaatggtcatgcttgagcctgtttacacacctgacacggaaaaagaatta
tctgaagttccgattatgacagcaaacggaatgacaactatttcgaaggttgcccagctt
caacaaactgaagagcctactagcacattccataaagatggtgagcaatatgtgagggta
acagctaatgtaaatcctgaaaaactttcagaaatttctactgaagtaaatagtaagatt
tttggagataaagaaacagaaggaatagacattccagatgatattgacgtgtttgttggc
ggggctagtgcagaccaagcaagtgactttaatgacttatttatgacaatgctcgcttcc
attggaattgtgttcttaatcatggtgattacgtttaaaacaatccgtgcaccgattgct
attctgttctcacttccactagctgcaattggtgcaattctaggaattatgattagtggt
atttccgttgatgtaacagcattacttggggcacttatgttaatcggaattgttgtaaca
aatgcgatcgtcctacttgatcgagtgaagcaaaatgagaaaacgatgattattcgtgat
gcagtagttgaagctgcaaccattcgtatgagaccaatcattatgacagcagtagctact
atttcagctatgctaccactactatttaaagaagcagagtcaggaaacttagtttctgca
agtcttgccattgtagtaattgggggactaagtgtagctacactcttaactcttgtagtg
attccagttgtttatgagctcctttattttagaaaatcaaaaaagcaaagaaatcaagtt
aagaagcaagaagatacaattgcagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
