Mesorhizobium japonicum MAFF 303099: mlr0587
Help
Entry
mlr0587 CDS
T00043
Name
(GenBank) hypothetical glycine-rich protein
Organism
mlo
Mesorhizobium japonicum MAFF 303099
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
DUF4347
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAB48146
UniProt:
Q98MG7
LinkDB
All DBs
Position
441759..451196
Genome browser
AA seq
3145 aa
AA seq
DB search
MRRRVYVCPRRKADVPIPEFTREFAVEASAARVMGVGTVNQALSRAPQGVVPRFDGRQIH
PLPATATGRPNARTDAPLPRASEILFVDPSVSDLGTILANLRPEVEAILLDAKRPAARQM
ALALEGRDGLDAVHVIAHGAPGRVSFAAGEWSARTLDDDGVDLAAIGRALGDDGGLRLWS
CYAAAGDEGDEFVDGLARATGTNVAAATGLIGAAARGGGWQLARRVRGAVVAQPPLTAGG
IGAYAGVLVARTWVGGVDTNFLNVNNWSVTTGSIGADVLTISGSPTRQPTLSTAGTTTIT
SLNISGSNTLTINGAAVILAATSGITMASPAIITGTGTIAAGTNITGAGTVGIPISTTGT
ITASGGTLNLTGTVSNRTLAIANVAGSILKLDGTVSSGVTFNGTTGTLDLTNLAGFTGTI
SGLNIGASTTTATNQIDFGNASIVSGSLNGSVLTVVDGAGQSYALTLGGAPAAGTVVDLK
FDGASGTDVFFSTPAATNTFTMAQGGADAWGDTARWSGGLPLTQPAAGPNLTFVSNHNAQ
GSLSGNINSLYMPPTLRQATGTGSSIWTVSDTGSSANQFTTSLTLINHGQIFVNGTANLT
SGTAATTNWVMTGTGVGAGGLGNQYFENDGSLNVVGTTAAALANGFSTSATFTGNIYVTG
SGYMNIYGNASLVFGTGVGVSASQTINFVTDGGNNTDGTVTEISSQFVNAAYAGFLPGDT
LVLENLGATPLSEVVIDGNGQATVYIYSGANGTGTLLDEETFLGNFTNGNSDFTFVNSSA
NGGQVTIGATGSAGHAVGPTGPTGPTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATGSTGATG
ATGATGSTGATGATGSTGATGSTGATGSTGATGATGATGSTGATGATGSTGATGATGSTG
ATGSTGVTGATGSTGATGATGATGSTGATGSTGNTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTG
ATGSTGATGATGDTGATGSTGATGSTGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTG
ATGSTGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATGATGATGATGATGDTGATGSTG
ATGATGDTGATGSTGATGSTGATGDTGTTGSTGATGATGATGDTGATGATGATGSTGATG
ATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGDTGVTGSTGATGATGATGATGDTGATGSTG
ATGATGSTGTTGATGATGDTGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATGSTGATG
ATGDTGATGSTGDTGATGATGATGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATG
ATGATGATGDTGATGATGATGATGATGDTGATGSTGATGSTGATGDTGATGSTGATGATG
ATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATGSTGATGDTG
ATGSTGATGATGDTGATGSTGATGATGATGSTGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATG
STGATGATGATGDTGSTGATGATGATGDTGATGSTGATGATGATGATGATGDTGATGSTG
ATGATGATGDTGATGSTGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATGATGATG
DTGATGSTGATGATGATGATGATGDTGATGSTGATGSTGATGDTGATGATGATGDTGATG
ATGATGATGATGDTGATGATGSTGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATG
ATGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATGATG
DTGATGSTGATGATGATGATGATGDTGATGSTGATGSTGATGDTGATGSTGATGATGATG
DTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATG
STGATGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATG
ATGATGDTGATGSTGATGATGSTGDTGATGSTGATGVTGATGDTGATGATGATGATGATG
STGATGATGSTGDTGATGATGDTGATGSTGATGSTGATGATGATGATGATGDTGATGSTG
DTGATGSTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATG
STGATGATGATGDTGATGSTGATGSTGATGDTGATGSTGATGATGDTGATGSTGATGATG
STGATGATGDTGATGSTGATGDTGATGSTGATGATGDTGATGSTGATGATGATGATGATG
DTGATGSTGATGSTGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATG
STGATGSTGATGDTGATGSTGATGSTGDTGATGSTGATGATGATGVTGDRGATGSTGATG
STGATGATGATGASGATGDTGATGSTGATGATGDTGATGSTGATGDTGATGSTGATGDTG
ATGSTGATGATGSAGATGATGATGDTGATGSTGATGATGATGDTGATGATGDTGATGSTG
ATGSTGATGDTGATGSTGATGSTGATGATGATGASGPTGDTGATGSTGATGATGDTGSTG
ATGSTGATGDTGATGSTGATGATGAPGATGATGDTGATGSTGDTGATGSTGATGATGDTG
ATGSTGATGATGSAGATGSTGATGATGATGNTGATGSTGATGSTGATGATGSTGPKGDTG
STGSTGPKGDTGPKGATGATGATGSTGATGPKGDTGPKGDTGPKGATGATGATGSTGSTG
PTGSTGPKGDTGPKGATGATGATGSTGSTGPKGDTGPKGATGATGATGSTGSTGPTGSTG
PKGDTGPKGATGATGATGSTGSTGPTGSTGPKGDTGPKGATGATGATGSTGSTGPTGSTG
PKGDTGPKGATGATGATGSTGSTGPTGSTGPKGDTGPKGATGATGATGSTGSTGPTGSTG
PKGDTGPKGATGATGATGSTGSTGPTGSTGPKGDTGPKGATGATGATGSTGATGPKGDTG
PKGDTGPKGATGATGATGPTGPSSGHHDSIVPSTSTLVTTTQKTANVTSDSLGLKDSGQF
LQPGSTGNGSGGQPSLHHLIGLAAGSVTTDLLNILNTIKGFGHQQNQPSRATTDQTLDAT
KHGTGYASTDHTAKTTLKDLLKPHE
NT seq
9438 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgagacgccgcgtctatgtctgtcctcggcggaaggcagacgtccccattccggagttc
actcgcgagtttgccgtcgaggcgtcggcggcacgggtgatgggagtgggtactgtgaat
caagcgttgtcgcgtgcgccccagggcgttgtgccccggttcgatgggcgccaaattcat
ccgctgccggccacagcaactggtcgcccgaatgcgcggaccgatgcgcccctgccccgc
gcttccgaaatccttttcgtcgacccctctgtatccgatctcggcacgatcctcgccaat
ctgaggcccgaggtcgaggcgatcctgctcgacgccaagcgcccggccgcgcgccagatg
gcgctggcgctcgaaggccgcgacggcctcgatgccgtgcacgtcatcgcgcatggggcg
ccagggcgggtgagcttcgcggcgggtgaatggtcggcgcggacgctggacgacgacggg
gtcgacctcgcggcgatcggccgggcgctaggcgatgatggcggtttgaggttatggagc
tgctatgctgctgccggcgatgagggtgatgaattcgtcgatggcctggcgcgcgcaacc
ggcacgaacgttgccgccgcgacgggacttatcggtgcagcggcacggggcggcggatgg
caactcgccagacgtgtaagaggtgccgtagtagcacagccgccgctgactgcggggggc
atcggcgcatatgccggggtgttggtcgccaggacgtgggttgggggtgtcgacactaat
ttcctcaacgtcaacaactggagcgtgacaactggctcaattggtgcggacgttctaacc
atctcggggagcccaaccagacagcccacgctgagcaccgctggcaccaccacaataact
tcactgaacatcagcggctccaacactctaaccattaatggtgcagccgttattctcgcc
gcgacaagcggcatcactatggccagcccagccatcatcacgggcactggcacgatcgca
gcaggcactaacatcactggcgccggcaccgtaggcataccgatatcgaccaccggcaca
atcacagccagcggcggcacactgaaccttaccggaaccgtgtcgaatcggacgctggca
atcgccaatgttgccggatcgattctcaaactcgacggcaccgtgagctccggggttacc
tttaacggtaccaccgggactctggacctcaccaacctcgcagggttcaccggcaccatc
agcgggctgaacatcggcgccagcaccaccacggcgaccaaccagatcgattttggcaat
gccagcattgtatcgggaagcctgaatggcagcgtcctcacagtcgtagacggcgccggt
cagtcgtacgcgttgacactcggcggcgctccagccgccggcacagttgtcgatttgaag
tttgatggagctagcggcactgacgtcttcttcagcacgccggcagcgacgaacaccttc
acaatggcccagggaggggccgacgcctggggggatacggctcgatggagcggcggctta
cctctgactcagccggccgccggccccaatttgacgttcgtcagcaaccacaatgctcag
ggcagtttatcgggcaatattaattccttatacatgccgccgaccctgcgtcaggcaacg
ggaaccggtagcagtatctggaccgtcagtgacacgggctccagcgccaaccaatttacc
acctcgctgaccctgatcaaccatggtcagattttcgtaaacggcaccgcaaacctgacg
tcgggcacagcggcgacgaccaattgggtcatgactggcaccggcgtcggggcgggcggc
ctcggcaatcaatatttcgaaaatgacggctccctcaacgtcgtaggcacgacagcggcc
gctctcgcgaacggcttctcaacctccgcgactttcaccggcaatatttatgtaaccggc
agcgggtacatgaatatatacggcaacgcgtcgctagtgttcggtactggcgttggcgtg
agcgcgagccagacgattaattttgttaccgacggcggtaataatacagatggtacagtt
actgaaatcagctcccaatttgtcaatgcggcatacgcgggatttctcccgggcgataca
ttagtcctggagaatttgggggctacccccctctccgaggtcgtgattgacggcaatggc
caggcgacggtctacatatatagcggcgcgaacggcacgggcactttgctcgatgaggaa
acattcctcggcaattttaccaacggcaacagcgacttcaccttcgttaacagctccgcc
aatggcggacaggttacgataggcgctaccggatccgcaggccatgcagtcgggccgaca
ggtccgacaggtccgactggcgctacgggttcaacgggcgccacgggctcgaccggcgct
acaggttcgactggtgcgacgggttcgactggcgcgacgggttcgaccggtgcaacgggt
gcgaccggcgccacgggttcaacgggcgccacgggcgcgactggctcaaccggcgcgacg
ggttctactggcgccacgggctcgaccggtgcaacgggtgcgaccggcgccacaggctca
acgggcgccacaggtgcgactggctcaaccggcgccacgggcgcgactggctcaaccggc
gcgacgggttcgacaggcgttacaggcgcgacgggctcgactggtgcaaccggagccaca
ggtgcgaccggctctactggtgccacgggttcgaccggcaatacaggcgccacgggttca
accggcgccacaggcgcgactggtgctaccggcgatacaggcgccacaggttcgaccgga
gctaccggctcgaccggagcaactggcgccactggcgataccggagcgacaggttcgact
ggagcaactggctcgaccggtgccacaggcgcgaccggcgacaccggagccacaggttcg
actggagcaaccggagccacaggtgcgaccggcgatacgggtgccactggttcgactgga
gctacaggttcaacaggcgcgaccggtgataccggagccacgggctcgaccggtgcaacc
ggcgccactggcgcgaccggtgataccggagccacgggctcgaccggtgcaaccggcgcc
acaggtgcgaccggagccacaggtgcgactggcgatacgggcgccacgggttcgaccgga
gcaactggcgcgaccggtgataccggcgccacaggctctactggagctacaggttccact
ggcgcaaccggtgatacgggcaccacaggctctactggagcaaccggcgccactggtgcg
actggcgatacgggcgccaccggagctaccggcgccacgggctcgaccggagcaaccggt
gccactggtgcgaccggcgatacaggcgcaacgggttccacaggagcaaccggcgccaca
ggtgcaactggcgacaccggcgcaaccggcgatacgggtgtcacaggctcgaccggagcc
acgggtgcaaccggagccacaggcgcgaccggggataccggcgccacgggttccaccggt
gccacgggcgccacgggttcgaccggaacaaccggagccacaggcgcgaccggcgatacc
ggagcgaccggcgataccggggccacgggatctactggcgcaaccggtgccacaggtgcg
accggcgataccggtgccacaggttcaacgggagcgacgggctcgaccggagccacaggc
gcgactggggatacgggcgccacgggctcgaccggcgatacgggcgccaccggagccacg
ggcgcaactggtgctacaggtgcaactggcgatacgggcgccacgggttcgaccggagct
accggagccactggtgccacaggcgataccggagccacgggctcgaccggggcaaccggt
gccacaggtgcaactggcgcgaccggtgataccggcgccacgggtgcgaccggagctacc
ggcgccactggtgccacaggcgataccggagcaacaggttcgactggggccacaggctca
actggtgcgaccggtgataccggcgccacaggctcgaccggagcaaccggagccacgggt
gcaaccggcgatacgggcgccacaggctctaccggagcaaccggtgctacgggcgcaacc
ggcgatacgggcgccacgggttcgaccggagctaccggcgccactggtgccacaggcgat
accggagcaacaggttcgactggggccacaggctcaactggtgcgactggtgataccggc
gccacaggttccaccggagcaaccggagccactggtgataccggcgccacaggttcgacc
ggagccaccggtgcgactggtgcgacaggctcgaccggcgcgaccggcgataccggagca
acgggctctactggagcaaccggagccacgggcgcgaccggtgataccggtgcgactggc
tcgactggagcaaccggcgccacaggcgccaccggcgatacgggttcgaccggagctacc
ggagccactggcgccaccggcgataccggagccacgggctcgaccggtgcaaccggcgcc
acaggtgcgaccggagccacaggggcgactggcgatacgggcgccacgggttcaaccgga
gcaaccggcgccacaggcgcgaccggggataccggagccacgggttccaccggagccacg
ggtgcgaccggcgacaccggtgcaacgggctcgactggagcaaccggagcaacaggtgcg
accggcgatacgggtgccacaggctcaaccggagctacaggtgctacgggtgcgaccggc
gatacgggcgccaccggctcgaccggagcaaccggagccaccggtgcaactggcgccacg
ggtgcgactggcgatacgggtgccaccggttcaactggagctacaggttcaactggcgcc
acaggcgataccggcgccaccggcgccacaggtgcgaccggcgatacgggcgccacaggt
gcgaccggagctaccggcgccacgggtgcgactggcgatacgggcgccacgggtgcgacc
ggctcgactggagcaactggcgccaccggcgatacgggcgcaacgggctcgactggagca
accggcgccacaggtgcgaccggcgatacgggtgccactggttcgaccggagcaactgga
gctaccggcgccacaggtgcgaccggcgacaccggtgccaccggctctactggcgcaacc
ggagccactggcgcgactggtgataccggcgccacgggctcgacgggagctaccggcgcc
acaggtgcgaccggcgacaccggtgcaacgggctcgactggcgcaactggcgccactggc
gataccggagcgacaggttcgactggcgcaaccggagccacgggcgcgaccggtgccacg
ggtgcgaccggcgatacgggcgccaccggttcgaccggagcaaccggctcaacaggtgcg
actggagatactggcgcgaccggctcgactggagcaactggcgccacgggtgcgaccggc
gatacgggcgcaacgggctcgactggtgcaaccggagccacgggcgcgaccggtgatacc
ggtgcgactggctcgactggagcaaccggcgccacaggcgccaccggcgatacgggtgcc
acgggctcgactggagctaccggtgccactggtgccacaggcgataccggcgccacgggt
tcgactggtgcaaccggcgccacaggtgcgaccggtgatacaggcgccacgggttcgacc
ggagctaccggcgccacgggtgcaactggcgatactggagccacgggctcgactggagct
accggtgccactggtgccacaggcgataccggcgccacgggttcgacaggagcaaccggt
gccacaggtgcgaccggcgatacaggcgccacgggttcgaccggagctaccggcgccacg
ggttcgactggcgatactggagccacgggctcgactggagctaccggcgtcacaggtgca
actggcgataccggagccacgggtgcaaccggtgccacgggcgcgacgggcgccacgggt
tcgactggcgcaaccggtgccaccggctcgaccggtgatacaggcgccacaggtgcgacc
ggcgatacgggcgcaacgggctcgactggagccacgggttccaccggagcgaccggtgct
acgggtgcaaccggcgccacaggtgcgactggcgatacgggcgccacaggttcgactggc
gatacgggcgccacaggttcgaccggcgcaaccggagccacgggtgcgactggcgcaacc
ggagccacgggtgcgactggcgcaaccggagccacgggtgcgactggcgatactggggca
acgggctcgaccggagcaactggagccaccggcgcaaccggtgatacgggcgccacgggc
tcgactggagcaactggagccacaggtgcgactggcgatacgggcgccacgggttcgact
ggagctacaggttcaacaggtgcgactggagatacaggcgcgaccggctcgactggagca
actggcgccaccggcgatacgggtgcaacgggctctactggcgcaaccggagccacgggt
tccaccggcgccacgggtgcgaccggcgacaccggtgcaacgggctcgactggggcaacg
ggcgatacgggagcaacaggttcaaccggagcaacaggtgcgaccggcgatacgggcgct
acgggctcgactggagcgaccggtgctacgggcgcaaccggcgccacaggtgcaacgggc
gataccggagcaacaggttcgactggggctacaggttcaactggtgcgaccggtgatacg
ggcgccacgggttcgaccggagctaccggcgccacaggtgcgactggcgatacgggggct
acaggctcgaccggggcaactggtgccacgggtgcgactggcgataccggagcaacaggt
tcgactggggctacaggctcaacaggcgcgaccggcgataccggcgccacgggctcgacc
ggagccacgggttcgaccggcgatacgggtgccactggttcgaccggagcaactggagca
accggcgccacaggtgtgaccggcgataggggcgcaacgggctcgactggagccacgggt
tccaccggagcgaccggtgctacgggtgcaaccggagcctcaggtgcgaccggcgatacc
ggagccacgggctcgaccggagctaccggcgcaaccggtgatacgggcgccacgggttcg
acaggtgcgactggcgatacaggcgcgaccggctcgactggagcaactggcgatacgggc
gccacgggctcgactggagctacgggcgccacaggttcggctggagcaactggagccaca
ggtgcgactggcgatacgggtgccacaggctcaaccggagctaccggcgccactggtgcg
accggcgataccggcgccactggtgcgaccggcgataccggcgccacgggctcgaccgga
gctacaggttcaacaggtgcgactggagatacaggcgccaccggctcgactggagccacg
ggttccaccggagcgaccggtgctacgggtgcaaccggagcctcaggtccgaccggcgat
accggagccacgggctcgactggggcaactggcgcgaccggcgatacgggttcgaccgga
gctactggctcaacaggtgcgactggagataccggcgcgaccggctcgaccggagcaact
ggagctaccggagccccaggtgcgaccggcgcaaccggtgacacgggcgcaacggggtcg
actggcgataccggagccacgggttcgaccggggcaaccggcgccactggcgatactggt
gccaccggctcaaccggagcgaccggtgctacgggttccgccggcgccaccggttcgact
ggagcaaccggcgccactggtgcgactggcaatacgggcgctacaggctctactggagcg
acaggttcgaccggagcaaccggcgcaacgggctcgacaggaccgaagggtgacaccggc
tcgactggctcaaccgggcccaagggcgacaccggaccgaagggtgccacgggtgcaacc
ggcgccacgggctcgaccggagcaaccggaccgaagggtgatactggacctaagggcgac
accggacccaagggcgcaacaggtgccactggcgcaaccggctcgactggttcgaccggt
ccgactggctcaaccggacctaagggcgacaccgggcccaagggcgcgacaggtgccact
ggcgcaaccggctcgactggttcgaccgggcccaaaggcgacaccgggcccaagggcgcg
actggtgcaaccggcgccacaggctcaactggttcgaccgggccgactggctcaaccgga
cctaagggcgataccgggcctaagggcgcaacaggtgccactggcgcaaccggctcgact
ggttcgaccggtccgactggctcaaccggacctaagggcgacaccggacccaagggcgca
acaggtgccactggcgcaaccggctcgactggttcgaccggtccgactggctcaaccggg
cctaagggcgacaccgggcccaagggcgcgactggtgcaaccggcgccacaggctcaact
ggttcgaccggtccgactggctcaaccggacctaagggcgacaccgggcctaagggcgcg
actggtgcaaccggcgccacaggctcaactggttcgaccggtccgactggctcaaccgga
cctaagggcgataccgggcctaagggcgcgacaggtgcaaccggcgccacaggctcaact
ggctcgaccggtccgactggctcaaccgggcctaagggcgacaccggccccaagggcgcg
accggtgcaaccggcgccacgggctcgaccggagcgaccgggccgaagggcgatactgga
cccaagggcgatactggacccaagggcgccacaggtgccaccggcgcaaccggtccgacc
ggaccctcaagcggtcaccacgactcgatcgttccgtcgacctcaaccctggtgacgacg
acccagaagaccgccaatgtcacgtccgactcgctcggcctcaaggatagcgggcagttc
ctgcagccgggctcgaccggcaatggcagcggcggccagccgtcgctacaccacctgatc
ggcctagcggccggctcggtgacgaccgatctcctgaatatcctcaatacgatcaaggga
tttggtcaccaacagaaccagccgtcccgcgcgactacggaccagaccttggatgcgacc
aagcacggtaccggctacgccagcaccgaccacacggcgaagacgaccctgaaggatctt
ctgaagccacatgagtga
DBGET
integrated database retrieval system
