Methylophaga marina: GCM100_02610
Help
Entry
GCM100_02610 CDS
T09183
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
mmaf
Methylophaga marina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmaf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mmaf02000
]
GCM100_02610
Transporters [BR:
mmaf02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
GCM100_02610
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
DUF4402
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDZ72542
LinkDB
All DBs
Position
complement(253757..256372)
Genome browser
AA seq
871 aa
AA seq
DB search
MTLRSETDLSVNEVAMKVKASGDGQTDIGFEQSQLYVELGQGKVEYQGRLAWVGESLVNG
ELTLTQLNPGIIVPEWPGNLSGQVPLKVSQKNKQLAVELESLRLSGTLRQKPLAIEAKLR
TQAEDVWIDTLKANSGDSQLSLNGQLQNGILDIDWTLSSPDLQDLYPGLQGQLSGEGELT
GSVEQPRILADIDGQALAFETTKIETLSGNIDVSLQTNGNTNSSILVTGLTLSDQLINRI
ELAVQGKQQSHQIQLNVDSNMINLDLAVDGQLNKEIWTGQFSQFSFGNEQAGVWQLREKG
ELQLSAQQQDIPRHCWQSEKGNLCLAAIHSQEQWQVSGEFADLPLTLFEPLAVELEQLQG
QLKGRFNLAADKHNNMTGAGKISLENGSVKLNQSDLQQKQAVTLKNTFIEYQLDETQTTA
QLHIEPQIEGVSAINADIATASAEALMADPNQAALKGKITTHIADMSALQFSHPAIEGLQ
GELDVNIGISGTIEQPEIDGKAKLANGQVSVVDAGIIVKNIQADINGNLDKVQMTLMAES
GEGQLNVTGEYVLQNSGWALTANVSGSQLEVMNTPEALVIAEPDMTITVTPEATKVTGKV
SIPRAQIEPTRFNSSVSPSTDVKVISDTQTEQASSSQTQLDITVSLGDKVQIKAMGFQGR
LTGNLQVSGNPNDVLLGNGQITIKDGSYIAYGQLLKVDNGKIRFSGPIDNPELDIKAVRE
TKEVTAGLYIEGNVSAPQATLFSDPDMSQDDILSYLILGKPIEQASATDAALLASAATGI
GLQNGAMIGDDIANTFGLDEFAITGDSKENAALTIGKYLSPKLYLSYGIGVFDSVSSVEL
RYQLSKIWALKAESGTESGVDLLYTYEPSND
NT seq
2616 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacattacgctcagaaactgatttatcggtaaatgaggtcgccatgaaggtaaaagcc
tcaggtgatggacaaaccgatatagggtttgagcaaagccaattatatgttgagttgggg
cagggtaaagttgaatatcaaggccggttagcctgggtgggtgaatccttagtgaatggt
gagctgacattaacacagctcaaccctgggattattgtgccagaatggccaggtaactta
tccggtcaggtaccgttaaaagtcagccagaaaaataagcaactagccgtcgaattagag
tcgctgagattatctggcacactgagacagaaaccgctggcgattgaagccaaactacgc
acccaagctgaagatgtctggattgatactctcaaagcaaactccggtgattcacagttg
agtttaaatggacagcttcaaaatggcatcctagatattgactggacattaagctcacct
gacctacaagatctgtatcctggcttgcaaggacaactgagcggtgaaggcgagttaaca
ggtagtgtcgaacagccacgtattttggctgacattgatggccaagcccttgcttttgaa
acaacaaaaatagagacactctcaggcaatattgatgtcagtctgcaaactaatggcaat
accaatagcagcattcttgttactggactgacgctatccgatcaactcataaatcgtatt
gagcttgctgtgcaaggaaaacaacagtctcaccaaatacagcttaatgttgactcaaac
atgatcaatctcgatttagcagtagacggacagctgaacaaggaaatatggacaggacag
ttcagtcaattcagttttggtaatgaacaggcgggtgtttggcaactgagagaaaaaggt
gagcttcaactcagtgcgcaacagcaagatattccccgtcactgctggcagtctgaaaaa
ggaaatctctgtttggctgcaatacattctcaagaacagtggcaagtatcaggcgagttt
gcggatttacctttgactttgtttgagccactagccgtggaacttgagcagctgcaagga
cagttaaaaggccgctttaacctggcagcagataagcacaataatatgacgggggcaggc
aaaatttctctagaaaatggttctgttaagcttaatcagtcagaccttcaacaaaagcaa
gccgttacgctgaaaaatacctttattgagtatcagttagatgagactcagaccacagca
cagctgcacattgaacctcaaatagagggtgtatcagccatcaatgcagacatagcaaca
gccagtgcagaggctttaatggccgacccaaaccaggcagcactaaaaggtaagatcact
acccatatcgcggatatgtcagcattacaattttcacatccggccattgaaggcttgcaa
ggcgagctggatgtcaatatcggtattagcggaaccatagagcaaccagagattgatggt
aaagcgaagttggctaatggacaggttagcgtggtggatgccggaattattgtgaaaaat
atccaagcggatattaacggtaaccttgacaaggttcagatgaccttaatggctgaatcc
ggtgaagggcagctcaatgtcacaggtgaatatgtgctacagaactcgggctgggcgctg
actgcaaatgtatcagggtcacagcttgaagtgatgaacacacctgaagcactggttatt
gctgagcccgatatgacgattacagtgactccggaagccaccaaagtcacagggaaagta
tcgattccacgcgcccagattgaaccgactcggtttaactcatcagtgagccccagtact
gatgtgaaggtcatttcagatacccaaacggaacaggcgagttcctcacaaactcagttg
gatatcacggtcagtcttggtgacaaagttcagatcaaagctatgggatttcagggacgc
ttgactggtaatttgcaggtgtcaggtaaccctaatgatgtcttgctaggtaatggccag
ataacgattaaagacggaagctatattgcctatggacagttgttgaaagtcgacaatggc
aaaattcgtttttctggtcctattgataatcctgagctggatattaaagcagtacgagaa
acaaaagaggtgactgcaggcctgtatattgaaggtaatgtgagtgcacctcaggcaacg
ttattttctgatcctgatatgagtcaggatgatattttatcttatttgattttaggcaaa
ccgattgagcaagccagcgccaccgatgcggcgctattggcctcagcggcgacaggtatt
ggcctacaaaatggggcgatgattggtgacgatattgctaacacgtttggtctggatgag
tttgctattaccggtgatagtaaagaaaatgcagcgctgacgattggtaaatacttatca
ccaaaactctatctaagctacgggattggcgtgtttgattcagtcagtagtgtggagctt
cgatatcagctaagtaaaatctgggcgttaaaagctgaatcgggcactgaaagtggtgta
gatttactttatacctatgaaccatctaatgattag
DBGET
integrated database retrieval system
