Methylophaga marina: GCM100_25160
Help
Entry
GCM100_25160 CDS
T09183
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K15125
filamentous hemagglutinin
Organism
mmaf
Methylophaga marina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmaf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
mmaf00536
]
GCM100_25160
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
mmaf00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Microbial pathogens
GCM100_25160
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
Fil_haemagg_2
Phage_p2_ORF12
Bacteriocin_IIi
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDZ74797
LinkDB
All DBs
Position
2456968..2462685
Genome browser
AA seq
1905 aa
AA seq
DB search
MIMEDRFNKNYLSLLITAALFSSSLYGADALAAGIAVDPSAPANQQAIITQTANGLPQVN
IQTPSSAGVSRNKYSQFDVSKKGVILNNSAGNVQTQLAGWVQGNSLLAGGTARIILNEVN
SQHPSYLNGPMEIAGSKAQLVIANPAGISCDGCGFINADRSTLTTGRALMNNGQLNGFLV
EEGKISIHGAGLDDSGTAYTDLMARAVSVNADIWANNLTVTTGKNRVSTTNDIITKLDTD
DDQPNFSVDVSELGGMYAGKIRLIGTEDGVGVKQSGEIIAEQRLTLTIDGRLINSGAMRA
EGAGSIATAELQNTDSGEIISDNLQIVADSRIDNEGLINVGQLLIESETVNNQPDASIYA
DNATLNTTTLNNNSILAARNNVSISTETLFNNENAEIVSQGNIQIAGVSIGDALTSAQQV
INSGGRIEASGDIAINADELKNLNAGMSTEWVTDSIERIIEVQPEGWAHKYDVSRFPLIH
NHNVEGQPFTDENGNIIRYFEDYTYYDYTAKTQSTHIISSAHAKIIAAGNIEIKGDVLNS
DSQIVAGQKLNISGGSLQNTATPGQKRVSYNGTRQFRDWDGNDEELDFGGIAPYSPAPKN
TEFNLGVSLFEDSHADIKSLANTQTITIPVINSAMFSLVAKPTKFYIETDPQFLDYRDWL
SSDYMLQRLAFDPANTMKRLGDGYIEQRLVTEQVAQLTGHLYLSEYNDQQTQFMALMNAG
VSVAETLQLTPGVAMTAEQIAQLTTDIVWLVNTELTLDNGEVITALVPKVYIKPEAGDLA
PESGLLAGNEVTFDVQGQIFNSASIRGQKNVSLDSESYQQRGGDVQSQSIAINTTDITMD
GGTLAANHSLSLAADNDINISSSMTHSKQDQANSHFERDNIKRYANLYVSDETGQLIVDA
QRNVALNAANIDLSGEQSQTQISAGQNLTLGTVNESETNLSIVDSRDFNKMSEQKDRGTS
LRTNGDVSLMAGNTLQITAADINSQQGKLELTAREVNIENGETHYQSDIATYTNRSSGFS
TRKKQQRDIFSQQTSVASSLTAKNIAVNSATNINVKGSQVLADEGIQFNASKDINITATK
QSFNESHYIKEKKSGLSGTGGAGISIGTREMNTENDIKQLVHSKSTIGALNGDISMVAGE
AFHQKNSDLIAAKSDVDVMAKDINITSLYDKTETKQVTEFSQSGLSLSLMAPAISVATQA
YHHALGSVEEDKKKNRVLNGITAYVQSKQLIEMGENTLDLINEGKSDEALSTSGIKISIS
IGKSESKTQTQTQSQTSQASTIRAGQNVRLTATDKDVGVIGSDILADGDITIDAAKDIHI
LASQNTQQQKTKMTSSSASIGLSLGIGENTGLSLDMAMSKGKGKTDSDGVFYQNSHISAA
KALSLTTGNDLSLIGAQAKGEKVSIDAGNNLTLSSLQDSHYLKGKESNSGMGVGIGIGTS
MFSFNLHHNTQKSNSDYLSVNEQTAILAGQEGFDIHVGAHTELDAALIDSQASADKNQMI
TGTLHTTDKENAMSAEVSQQGFNVGSDALSGKYGVLKTASQNLSNKGEASVDDASSTLSA
IAPAEITLTDPDKQLAVYGKTAEETISDINRNNDNTHRKLNLADIELLKDKAEAEQLSKQ
LVYEAATAFSDEAFRKMFLTKIEFYEVMRDENGEVIKDENNEAIWKKLTDEEKQSLKPGK
DNKVHIFNNGMFNSVDAAKKLALQNHQSDYLIHFPLTNNALSELMVAGYQKFLESEGFGL
TNAVKENIKVMGTYGKEGLIIDAHSRGAMTTGNALVVIDKRNVNESSTLQYVNIYTVGSA
FNNQQMADLLNKNSEQNGRVYAQVHKDDFVGTFIGGNEATGGTTPDGSTSFIEGLKSIFF
DVTVHNSYGDGKPNGASKKYWQDSPDGKAKFILIPASNNKEVLKK
NT seq
5718 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcatggaagatcgtttcaataaaaactatttaagcttattgattacagctgctctt
tttagttcatcactttatggtgctgatgctctggcggctgggattgctgtcgatccatct
gcgccggctaatcaacaggccatcattacgcaaacagcaaatggtttgccacaagttaat
attcagacgcccagttcagcaggggtatcaagaaataaatacagccagtttgatgttagc
aaaaaaggcgtcattcttaataacagcgccggtaacgtacagacgcaactggctggctgg
gtacagggcaacagtctgcttgcaggtggcacagcccgaattattctgaatgaagtgaat
tcacaacatcccagttatctgaatggaccaatggaaattgctggaagcaaagcacagctt
gttattgctaatcctgctggtatcagctgcgatggttgtggttttattaatgcagacaga
agcacgttaacaactggccgagctttgatgaataatggccaattgaatggttttctagtg
gaagaaggcaaaatcagtattcatggcgctggactagatgacagtggtacagcctatact
gacctgatggccagagccgtgtcagtcaatgccgatatctgggcaaacaatctcactgtc
accacagggaaaaaccgggttagtaccactaacgacatcataactaaactggatactgat
gatgaccagcctaactttagtgtcgatgtcagtgagctcggcggtatgtatgcaggcaaa
atccgtttaatcggcacagaagacggcgttggtgttaaacaatctggagagataatcgct
gagcaacgtttaacgctgacaatagatgggcgcctaataaattctggtgcgatgagagct
gaaggtgctggttctatcgcaacggctgaacttcaaaataccgattctggcgaaattatc
tcagacaatttacagatagtggctgattcgaggatagacaatgaaggtctaatcaatgtt
ggtcaattgcttatagagtctgagacagtaaacaatcagccagacgcaagtatttatgct
gataacgccacgctcaatacaacaacactcaataataattctatcttggctgccagaaac
aatgtgtcgatatctaccgaaactctctttaataatgagaatgcggaaatagtcagtcag
ggcaatatacagattgctggcgtctctatcggtgatgcattgacatcagctcaacaggtg
attaattcaggtgggcggatcgaggcttcaggagatatagcgataaatgctgatgagcta
aaaaatcttaatgctggaatgagtactgagtgggtgacagacagtattgagcgaatcatt
gaagtgcagcctgagggttgggcacataaatatgatgtgagtcgttttccattgatccat
aaccataatgtagaaggccagccttttaccgatgagaacggcaatatcattcgctacttc
gaagactatacctattacgactacacggctaaaacacaaagcacacatatcatcagttct
gcacacgccaaaattattgcggcaggtaatattgagataaaaggcgatgtactcaatagc
gatagccaaattgtggcaggtcaaaagctgaatatctcaggaggaagcctacaaaatact
gctacaccaggacaaaaaagagtcagttataacggtacacgtcagttcagggattgggat
ggaaatgatgaagagctcgattttggtggaatagcaccctacagtccagctcccaaaaac
accgagtttaatttaggggtaagcttgttcgaggatagtcatgctgatatcaaaagcctg
gctaatactcaaacgataacgattccagtcatcaatagtgccatgttcagcctcgtcgcc
aaaccgacgaagttttatattgaaactgatccacagtttctggattacagagattggttg
agctcagattatatgttgcaacgactcgcctttgatcctgccaatacgatgaaacgtctc
ggtgatggttatatcgagcagcgcttagtcaccgaacaagttgcccagttaaccgggcat
ctctacctgagtgaatataacgaccagcagacacagtttatggcattgatgaatgcaggt
gtgagcgtggcagaaacacttcagttaacaccgggtgtggcgatgacagcggaacaaatc
gcccaattaacgacagacattgtttggttagtgaatacagagctgacactggataatggc
gaggtaatcactgccttggtaccgaaagtgtatatcaagcctgaagcaggtgacttggct
ccagaaagtggtctgctggcggggaatgaggtgacctttgatgtacaaggccaaatattt
aactctgccagtatcagagggcaaaaaaacgtttcattagatagtgagagttaccaacag
cgtggtggagatgttcaaagtcagtctattgctatcaatacgacagatattacgatggac
ggtggcactttagcagccaatcactcactttcacttgctgctgataacgatatcaatatc
agcagttcaatgactcacagtaagcaggatcaagctaacagccatttcgaacgagataat
attaagcgatacgccaatctttatgtgtctgatgaaacgggtcaattaatcgttgatgcc
cagcgtaatgttgcacttaatgcagcgaatatcgatttatcaggagagcagagccagacg
cagatatctgctggacaaaatttaacattgggcacggtcaatgagtcagaaacaaatctg
agcatagttgatagccgtgattttaataagatgtctgagcaaaaagatagaggcacatca
ctccgtacaaatggtgatgtcagtttgatggctggaaataccctgcaaatcacagctgca
gatattaattctcaacaaggtaagctcgaactcacggcaagagaggtcaatattgaaaat
ggcgaaacccattatcaatcagatattgccacttacactaatcgttcgagtggctttagt
actcgaaaaaaacaacaaagagatatattcagccagcaaacatctgtggcatcttcatta
actgccaaaaatattgctgttaactctgcaacgaatatcaatgtgaagggtagtcaggtt
ctggctgatgaaggcattcaatttaatgcgtcaaaagatattaatatcacggctacaaag
caatcatttaatgagtcccattatataaaagagaaaaaatcaggtctttcaggcacaggt
ggtgcaggcatcagtatcggcacccgagagatgaatacggaaaatgacatcaagcaactg
gttcacagtaaatcaactataggggctttaaatggcgatatttccatggttgcaggagaa
gcctttcaccaaaaaaacagtgatttgattgcagcgaaaagtgatgttgatgttatggca
aaagatatcaatatcacgagcctatatgataagaccgaaacaaaacaggtaacggagttt
tcgcaaagcggtttgtcactatcgctaatggcgccggctatttcagtcgccacccaagcg
tatcatcatgctttgggaagtgtggaagaggacaaaaagaaaaatcgcgtcctgaatggc
attacggcctatgttcaatctaagcaactcattgagatgggggagaacacgctagatctt
atcaatgaaggcaaatccgatgaagccttatccacctcagggataaaaataagtatcagt
atcggtaagtcagagagtaaaacccagacgcagacccaatcacaaacttcacaagcgagc
accattcgggcaggtcaaaatgtgcgtttaacggcaacagataaggatgtgggagtcatt
ggtagcgatattttggcggatggtgatatcaccattgatgctgctaaggatattcatatt
ttagccagtcaaaatacgcaacagcaaaaaaccaaaatgacatcaagtagcgccagcatt
ggtctttctttgggtattggtgagaatacaggtttgagccttgatatggctatgagcaaa
ggaaaaggcaaaaccgatagtgatggtgtgttttatcaaaatagtcacatctctgctgca
aaagcgttatcgctaacgactggcaatgaccttagtttgattggtgcacaagccaaagga
gagaaagtttctattgatgccggtaacaacttaactttatccagcttacaggacagtcat
tatttaaaaggtaaagagtccaattcggggatgggggtcggtattggaataggaacatcc
atgttttcatttaaccttcatcataatactcaaaaatcgaatagtgactatcttagcgtg
aatgaacaaacggccattctggctgggcaagagggatttgatattcatgtcggtgctcat
actgaattagatgctgcacttattgatagtcaagcttcagcggacaaaaatcagatgatt
accggcaccttacatacgacagataaagaaaatgcgatgagtgctgaagtgagtcaacaa
gggtttaacgttggctccgatgccttgtctggaaaatatggcgtgttaaaaacggcgtct
cagaatttaagcaataaaggtgaagccagtgtggatgatgccagttcaacattaagtgca
atcgcgcctgcagagatcacattaaccgatcctgacaaacaactggctgtatatggcaaa
acagcagaagaaacgatctcggatatcaatagaaataatgataatacccatcgaaaactc
aacctagcagatatagaactcctcaaggataaggctgaagcagagcaactttctaaacaa
ttagtctatgaggccgcgacggcgtttagcgatgaagcattcagaaaaatgtttcttacc
aagatcgagttttatgaagtgatgcgtgatgaaaatggtgaagtgatcaaagatgaaaat
aatgaagcgatatggaaaaaattaacggatgaggaaaagcaaagtttaaaacccggtaag
gataataaggtacatatttttaataacggcatgtttaattcagtcgatgcggcaaaaaaa
ctagcactgcaaaatcatcaatcagactatctgattcatttcccattaaccaataatgcc
ttgtcggagctaatggttgcaggttatcagaaatttcttgaaagcgaaggttttggactt
acgaatgctgttaaagaaaatattaaggtgatggggacttatggtaaagaaggattgatt
attgatgctcatagtcgaggcgcgatgactacaggtaatgctttggtagtaatagataaa
agaaatgttaacgaaagttcaactcttcaatatgtaaatatttatacagtcgggtcagca
tttaataaccaacagatggcagatttattaaataaaaactctgagcagaatggtagggtt
tatgctcaagttcacaaagacgattttgttggtactttcattggtggtaatgaagctact
ggtggcactactcctgatggtagtaccagttttatcgaaggactgaaatcgatctttttt
gatgtcaccgtgcataatagttacggggatggaaagcctaatggtgccagtaagaaatat
tggcaagatagtcccgatgggaaagctaaatttatcttaatacccgcaagtaataacaag
gaagttctaaagaaatga
DBGET
integrated database retrieval system