KEGG   Candidatus Mycoplasma mahonii: O3I44_03055
Entry
O3I44_03055       CDS       T09640                                 
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
  KO
K03046  DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]
Organism
mmah  Candidatus Mycoplasma mahonii
Pathway
mmah03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmah00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    O3I44_03055 (rpoC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:mmah03021]
    O3I44_03055 (rpoC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mmah03400]
    O3I44_03055 (rpoC)
Enzymes [BR:mmah01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     O3I44_03055 (rpoC)
Transcription machinery [BR:mmah03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     O3I44_03055 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:mmah03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      O3I44_03055 (rpoC)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 Flavi_glycop_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: WKX02354
LinkDB
Position
complement(650532..654821)
AA seq 1429 aa
MPFKSRKYATIDENSIKSIRLSLAKSDDFKEWSHGEVTKPETINYKTFKPEKYGLFDEMI
FGPITDFKCPICGTKHKRSNEGQICEKTDECKLFQPEILPKSSRRTRMGHIELASPVMHF
WFFKIDHSILAKLLGIRAEGSAKIHSKTTIESIIYFKSHIVLESGGLKTLPKHKIIDINN
AAVFYRDTFRELLKIMTKGGNQDAIEEINFAIKDLEETASSKIGKDYGIDFYELNEIIEE
YSEAKIGTGANAIKYILEKIDLKAEVKVAKTAIAKINNKISKSANHTTQLQARAKLYKRL
LIINAFIESKQDPSDMLITNLPVIPTDLRPLVQIDGGRHSTSDVNELYRRIIIKNNRLKK
WFELEAPILIIQNELRMLQESVDALIDNSRKKPSPVMSKDNRPLKSISDALTGKKGRFRQ
NLLGKRVDYSGRSVIVIGPDLKMHQAGIPRQMAAKLFEPWIIKKLVDANVVSSIKAAKKI
IEEEDNKIWPFVEETMIGKVVLLNRAPTLHRLSVQAFEPVLVRGGAIKLHALVTTAFNAD
FDGDQMAVHVPISPEAIREAKELMLANKNILGPKDGEPIINPSQDMILGLYYLTIEKAKA
KGEGTFYSNYDQMFKAYNHKVIDLYARVIIPASQIGKEYLENDDRYIISTVGKFIFNQSF
PTRFPFIFDGSFKTFDGKYSKYLFPQGTDLRKAIAEMEVNKPFDKKNISKVVRAAFDQYV
SQIPKEDLANVINTINAGNHQDSVMKFSQLLNHKGEQLSVIHAQILSSFVKRRYAQIDKA
ITLKNEGVKRIFEINEKVKLLEKVWFDYTNIVAKSLDNIKLLGFRYSMLSGVTMSIDDIK
NSPIKEAQVIEGDNYVAEIQKMTKKGLLTDDERYNLVIAKWTAIKDLIQADLEKVASSTE
YNPIFMMMKSGARGNISNFVQLAGMRGLMANNKKMYLAFAKNDIQVRSTVEVPVKSSFLE
GLTSYEFYSSTHGARKGLTDTALNTANSGYLTRRLVDVAQNIVVREDDCKSDYGFLVKDI
KDTKTNTVIVSMQERIEGRFTNKPVVNADGEVIIERGVLITNELVRKIVKEKIDSIEIRS
VLGCQVRHGVCKICYGKDLATNTVVQIGEAVGIVAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGVD
DITGGFDRLKQLIDATKKTWERSAVISKTNGQVVSIEYELDENDNKTNKKIISVKATDLS
KTNNGSKVYKYKFLATRRIRRKKGEIVKAGSKLVDGPIVLEDLLEYAGPRPVQNYLLKEI
QRIYRMQGIAISDKYIEIIIRQMLSKIQIEYQGDSELFAGTLVDVQKYKMINRELLIQGK
KPAYGSIILKGAKQTPLLSESFLSAASYQETAKVLVHASISGRRDNLEGLKENIIVGHKI
PAGTSSDYEAKGKYDIRDPRDYFKTKQVEKLNFEEIKMAEDELREEFGQ
NT seq 4290 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgccatttaaatctagaaaatatgccacaattgatgaaaattcaattaaatccataaga
ttatctcttgctaaatctgatgatttcaaagagtgatcacatggagaagttacaaagcca
gaaacaattaactataaaacttttaaaccagaaaaatatggtttatttgatgaaatgatt
tttgggccgattacagactttaaatgccccatttgtggaactaagcacaaaagatctaat
gaaggtcaaatttgtgaaaagactgacgaatgtaaattattccaaccagaaattttacct
aaatcttcaagaagaacaagaatgggtcatattgaactagcttcacctgtaatgcacttt
tggtttttcaaaatcgatcactctattcttgctaaactactaggaatcagagcagaagga
tcagctaaaattcattctaaaacaacaattgaaagtattatttactttaaatcacacatt
gttttagaatcaggtggattaaaaacattgcccaaacacaaaattatcgatattaacaat
gcggccgttttttatcgagacacctttagagaattattgaaaatcatgacaaagggaggc
aatcaagacgccattgaagaaattaattttgccatcaaagatcttgaagaaacagcttct
tcaaaaattggtaaagattatggaattgatttctatgaattaaatgaaattattgaggag
tactcagaagccaaaatcggcactggcgctaatgctattaaatatattttagaaaaaatt
gatcttaaagcagaggtaaaagtagctaaaacagctattgctaaaattaataacaaaatt
tccaaatctgctaatcacactacacaattacaagcaagggctaaattatacaaacgttta
ctaattattaatgcattcattgaatctaaacaagacccaagtgatatgttgattactaat
ttgccagttattccaacagacctaagaccattagtccaaattgatggtggccgtcattca
acatctgatgttaatgaactatacagaagaattattatcaaaaataatagattgaaaaaa
tgatttgaacttgaagcaccaattttaattattcaaaatgaattacgtatgttacaagag
tcagttgatgctttaattgataactctagaaaaaaaccttcaccagttatgtctaaagat
aatagaccacttaaatctatttctgatgccttaacaggtaaaaaaggaagatttagacaa
aatcttcttggtaaacgtgttgattattcaggcagatcagttattgttattggtccagat
ttgaaaatgcaccaagctggaattcctagacaaatggccgcgaagttatttgaaccatga
attatcaaaaaattagttgatgctaatgttgtttcatcaattaaagctgctaagaagatt
attgaagaagaagataataagatttgaccatttgttgaagaaacaatgattggtaaagtt
gtgctgcttaaccgtgcgccaacattacatagattatctgtacaagcttttgagcctgta
ttagtcaggggtggagcaatcaaacttcatgcccttgttacaacagcttttaatgctgac
tttgatggcgatcaaatggcggttcatgttcctatttctcctgaagctattagagaagct
aaagaactaatgcttgctaacaaaaatattcttggtcccaaagatggagaaccaattatt
aatccttcacaagatatgatcttgggcctttattacctaactattgaaaaagctaaagct
aaaggtgaaggtactttctattctaattatgatcaaatgtttaaagcctataaccataaa
gttatcgatctgtatgcaagggtgattattcctgcatcgcaaataggcaaagaatattta
gaaaatgatgatagatatattatttcaacagttgggaaatttatttttaaccaatcattc
ccgacaagatttccgtttatttttgatggtagttttaagacatttgatggtaaatatagt
aaatacttgttccctcaaggaacagatttaagaaaagccattgcggaaatggaagttaat
aaaccatttgataagaagaatatttctaaagttgttcgtgcagcctttgaccaatatgtt
tcacaaattccaaaagaggatttggcaaatgtaattaataccattaacgcaggtaatcac
caagattcagttatgaaattttcacaattacttaaccataaaggtgagcaattaagtgtg
attcatgcgcaaattctttcttcgtttgtgaagagaagatatgctcaaattgataaagct
attacattaaaaaatgaaggggttaaacgaatttttgaaattaatgaaaaagttaagtta
ttagaaaaagtttggtttgattatactaatatcgtggctaagtcacttgataatataaaa
ttactaggatttagatattcaatgctttctggtgtaacaatgtctattgatgatattaaa
aattcgccaatcaaagaagcacaagttattgaaggtgataattatgtagctgaaattcaa
aagatgaccaaaaaaggtttactaactgatgatgagagatataatttagttattgctaaa
tgaacagctatcaaagatcttattcaagctgacttagaaaaagttgcatcttcaactgaa
tataaccccatcttcatgatgatgaaatctggagcccggggaaatatttcaaactttgtg
caattagctggtatgcgtggactaatggctaataataagaaaatgtatttggcttttgct
aaaaatgatattcaggttcgttcaactgttgaagtaccggttaaatcatcctttctggaa
ggattaacaagttatgaattttattcatcaactcatggggctagaaaaggtctaactgat
acagctcttaatacagctaactcagggtatttgactagaagattagttgatgttgcccaa
aatattgttgttagagaagatgattgtaaatcagactatggtttccttgtgaaggacata
aaagatactaagactaataccgttatcgtttctatgcaagaaagaattgaagggagattt
accaataaaccagtagttaatgctgatggtgaagttattattgaaagaggcgttttaatt
actaatgaattagttagaaaaattgtgaaagaaaaaattgattccattgaaattagatcg
gttcttggctgtcaagtgcgtcatggtgtatgtaagatttgttatggtaaagaccttgcc
acaaatactgttgtacaaattggtgaagcagtcggaattgttgctgctcaatcaattggt
gaacctggaactcaactgactatgcgtactttccatacaggtggtgttgctggggttgat
gatatcactggtggatttgatcgtctaaaacaattaattgatgcaacgaagaaaacatga
gaaagatcagcggttatttctaaaactaatggtcaagtagtttccattgaatatgaacta
gatgaaaatgataataaaacaaacaagaaaattatttctgttaaagccactgacttatct
aaaactaataatgggagcaaagtttataaatataaattcttagccactagacggattaga
cgtaaaaaaggtgaaattgttaaagctggttcaaagcttgttgatgggccaattgttctt
gaagatcttcttgaatatgctggacctagaccagtacaaaattatttattaaaagaaatt
caaagaatttatcgtatgcaaggtatcgcgatctctgataagtatattgaaattattatc
agacaaatgctttccaaaattcaaattgaatatcaaggtgattcagaattatttgccgga
acacttgttgatgtgcaaaaatataaaatgattaatcgtgaattattaattcaaggtaaa
aaaccagcttatgggtccattattttaaaaggtgctaaacaaactccattattatctgag
tcattcctatcagccgcttcttatcaagagacagctaaagtgcttgtacatgcttctatt
tcaggaagaagagataatttggaaggactaaaagagaatatcattgtgggtcataaaatt
ccggctggaacttcatctgattatgaggctaaaggtaaatatgatattagagatccaaga
gattactttaaaacaaaacaagtagaaaaattaaattttgaagaaattaaaatggctgaa
gatgaattaagagaagaatttggtcaataa

DBGET integrated database retrieval system