KEGG   Methylocaldum marinum: sS8_5495
Entry
sS8_5495          CDS       T05638                                 
Name
(GenBank) putative hemagglutinin/hemolysin-related protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
mmai  Methylocaldum marinum
Pathway
mmai02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmai00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    sS8_5495
SSDB
Motif
Pfam: Big_13 Glucodextran_B Big_12 HemolysinCabind Big_11 SWM_repeat BapA_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: BBA37412
UniProt: A0A250L0P6
LinkDB
Position
complement(5888140..5897169)
AA seq 3009 aa
MIVRYKICPLTDSFTTVAPQEVAHTIVVAEPSKIVLNLTREHVASMIREGNDLIVVLDTK
ETIRLVGFYTDDSKPSELYLVDENDNAILVKIRSISANGEVAAEYQPLDEVAGFVSDSDD
SNLLYWGLGALGIGGLAGGMAAAMGGDSGGRKGNKGNDRGNSSSDDTLGGDDATIVDTTA
PVVTLDPLNTSNTKPSLSGTVDDPAAKIVVTVDDIDYVAINNGDGTWSLGGDVLPPFPEG
EHNVTIIATDPDGNSTTITDSITIDSVPPTLTISAADPVLAAGEATTVIFKFSEAVTGFD
VTDVTVTGGTLTDFAQVGPDTWTAMFTQDGSATPPSIHVADGTYTDLVGNSGFGYTLDGD
GGFTSDIVAPVVTLDPLTTEDTTPSLSGTVDDPTATVVVTVDGVDYAATNNGDGTWSLAD
DTLPQLPKGETTVTVSATDPAGNSVTDTGTITIVDITPPTLLSAVTSVDGSALMLTYDED
IDAANLPGVGDFAVTVDGNPVAVTAIYVIYASEDTVMLTLDTPITPGEIVTLSYTDPTGG
DDLNAIQDIAGNDAASITGMSVVNVVGDITPPTLTISAANPTLGAGDSTTLIFQFSEIVT
DFDATDVSVTGGTLTDFAQSDADAWTATFTHDGSTTSPSIHVADGVYTDLAGNLGIGDTL
DGDSGFTVDIVAPVVALDPLTTGDTTPALSGTVDDPAATIVVTVDGIDYAATNNGDGTWS
LADGTLPSLPEGEVTITVSATDPVGNVGTDSGIITIDTTAPVVTLDPLTTGDATPALSGT
VDDPDATIVVTVDGIDYAATNNGDGTLSLADDTLPSLPEGETAVTVSATDSVGNVGTDSG
TITVDTTAPVVTIDPLNTSDTTPALSGTVDDPEATVVVTVDGVDYAATNNGDGTWSLVDD
TLPSLPEGETAITVSVTDPAGNSGTITESITIDTTAPVVTLDPLTTGDATPSLSGTVDDP
EATVVVTVDGVDYAATNNGDGTWSLADDTLPSLPEGEVTVTVSATDPVGNVGTDSGTVIV
DTTAPVVTIDPLNTSDTTPALSGTVDDPEATVVVTVDGIDYAATNNGDSTWSLADDTLPS
LPEGETAITVSVTDPAGNSGTITESITIDTTAPVVTLDPLTTGDATPALSGTVDDPDATI
VVTVDGIDYAATNNGDGTWSLADDTLPSLPEGETAVTVKATDPVGNSVAIIENITIDTTA
PVVTIDPLNTSDTTPALSGTVDDPEATVVVTVDGIDYAATNNGDGTWSLADDTLPSLPEG
ETAVTVSATDLVGNVGTDSGTITVDTTAPVVTIDPLNTSDTTPALSGTVDDPEATVVVTV
DGVDYAATNNGDGTWSLADDTLPSLPEGETAVTVSATDSVGNVGTDSGTITVDTTAPVVT
IDPLNTSDTTPALSGTVDDPEATVVVTVDGVDYAATNNGDGTWSLVDDTLPSLPEGETAV
TVKATDPVGNSVAIIENITIDTTAPVVTIDPLNTSDTTPALSGTVDDPEATVVVTVDGVD
YAATNNGDGTWSLVDDTLPSLPEGETAVTVSATDSVGNVGTDSGTVIVDTTAPVVTIDPL
NTSDTTPALSGTVDDPEATVVVTVDGVDYAATNNGDGTWSLVDDTLPSLPEGETAITVSV
TDPAGNSGTITESITIDTTAPVVTIDPLNTSDTTPALSGTVDDPEATVVVTVDGVDYAAT
NNGDGTWSLVDDTLPSLPEGETAVTVKATDPVGNSVAIIENITIDTTAPVVTIDPLNTSD
TTPALSGTVDDPEATVVVTVDGVDYAATNNGDGTWSLADGTLPSLPEGEVTITVSATDPV
GNVGTDSGTITVDTTAPVVTIDPLNTSDTTPALSGTVDDPEATVVVTVDGVDYAATNNGD
GTWSLVDDTLPSLPEGETAITVSVTDPAGNSGTITESVTIDTTAPVVTIDPLNTGDTTPS
LSGTVDDPEATVVVTVDGVDYAATNNGDGTWSLAGDTLPSLPEGEVTVTVSATDPAGNIG
THSGTITIDSTAPMVLNVSANVSEESLAGGIPDSNGTEDNTDSATVAGSLTLSDTSGIAS
VAVSGPGGVTSKGQAVTWNGDFAGGVYTLTGTAGATTVATLTLNTDGDYTFTLSEPLDHA
SADVEDVLALEFTVTATDAAGNVSDPATLTLNVEDDMPLAADATTFVLDQQPATAAGSLV
VGFGADGGYVSEITIDGNTYTYDPDADTVTESGSSALVSHSFNPDNDELTISTTQGETLV
VDMRTGEYHYAALAADTAPSPVVNVNPSASLLGLVNAEALGLLDIGTNQMLTAVDANNDI
KSVVVNAGAAINVGVGGYYQLTWSVAMATEFGLTVVEDNDIVNLLLVTTQSYSKLTITSA
DGGTIDNLKLNEFLATVRVEQFGILDLLTLGLLPTISITATDSLGNSATDSETDLLGLSL
LDPADDPAGVTEGASGPNNLVGTNADERLYGYVGDDTLSGEQGNDLLRGGLGADTLDGGS
GDDILIGGKGNDTLTGGSGNDTFLWEKDDQGTAGNPAIDTITDFNAAPVVGGGDIIDLSG
LLQGELARGHTVGNLVDYLHFEVVGGDTVLHISTTGAFSSGFDPNLADQRIVFTGVDLVD
GLATDQEVIARLLANGNLIVDQETTATDQLNGITTFGAVITDNDGDTASTSISFDTRDPA
APDPDNDAPVVQADSTALLGLIGANVLDVIQLGNQAFIAGDPNGDLRSVTVNFQGLAIPL
GDLRLTASRKLANDLGLTFTVESTAGIGATSTLTITALDGGNIDNLAVNELLATVRLESD
IDLLGLVPGLDISVLGTLSITATDSHGLSDTDQVTELLNANVLDGLLAPSGNPDIIEGAS
ANDNLASSVLGTTHERLYGFEGDDVLSGGSGNDLLRGGSGNDVLDGGDGKDVLIDGNGED
TFLAGSGDDIIIVSGTDFAQIDGGDGFDILRLDGNLALDLTSADSGITNIERIDLGNGAS
VLPLTEEAVLALTDEDDTLQITGEADDRVNLVDATYIDNVTIDGITFAQYELGSATVLVD
EEIANVAVV
NT seq 9030 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatcgtccgttacaaaatttgtcctctgacagactctttcaccaccgttgcgccgcag
gaagtcgctcatacgatcgtcgtcgcggagccgagtaaaattgtgctcaacctgactcga
gagcatgtcgcttcaatgatccgtgagggtaacgacctgattgtcgtgctcgacaccaag
gaaacgattcgactcgtcggcttttataccgatgattccaagccaagcgagctctacctc
gtcgacgaaaacgataacgcgattctggtaaagattcgctccattagcgccaatggcgag
gtcgccgccgaataccagcctttagatgaagttgctggttttgtgtccgatagcgatgat
tccaatctgctttactggggtcttggcgcactcggtatcggcggcttggcaggcggaatg
gctgcggccatgggaggagattccggaggtcgcaagggtaataaaggtaacgatcgcggt
aactccagctctgacgatacccttggcggtgatgacgccaccatcgtcgataccacggct
ccggtcgtaacgctcgaccctttgaataccagtaatacaaagccgtccctgagtggtacg
gttgacgatccggctgccaagatcgtggtcactgtagacgacatcgattatgtcgcgatc
aacaatggtgacggtacctggtctctgggtggcgatgtcctgcctccatttcccgagggc
gagcataacgtcacgatcatcgccaccgatccggatggcaattctactaccatcaccgac
tccatcaccattgactctgtcccgccgaccttgacgatcagcgccgccgatccggttctg
gccgcgggtgaagcgactactgtcatcttcaaattcagcgaggccgtcaccggctttgac
gttaccgacgtcactgttaccggcggcaccttgaccgatttcgctcaggtcggccctgac
acatggacggccatgttcactcaggatggctccgccactccgccgagcatccacgtcgca
gacggtacatacaccgatctcgtcggcaattccggcttcggctacaccctcgatggcgat
ggcggattcacgtccgatatcgtcgctccggtcgtaacgctcgatcctttaaccactgag
gacaccacgccgtccctgagcggtacggtcgacgatccgacggcgactgttgtggtcact
gtcgatggcgtcgattatgccgcgaccaacaatggtgatggcacatggtcgctggccgac
gatactctgcctcagctacctaaaggcgagaccaccgttaccgttagcgccaccgatccg
gccggcaactcggttaccgataccggcaccattaccatcgtcgacatcactccgccgacc
ctgctcagcgcggtgaccagtgtcgacggctccgccttgatgctgacctatgatgaggac
attgatgcggctaacctgccgggtgttggcgattttgcggtcaccgtcgacggtaatccg
gttgcggtcactgccatctacgtcatctacgccagcgaggacaccgtcatgctgacgttg
gatacgccgattacccctggtgagatcgtcaccctcagctacacggatccgactggtggc
gacgacctcaatgccattcaggatatcgcgggcaacgatgctgccagcatcactggcatg
tcggtcgtcaatgttgtcggcgatatcaccccgccgaccttgacgatcagcgcagccaat
ccgaccctgggcgcaggtgattccacaactcttatcttccagttcagcgagatcgtcact
gacttcgacgctaccgatgtcagcgtcaccggcggtaccttgactgacttcgctcagtcc
gacgccgacgcttggaccgccacattcactcatgacggctccaccacttcgccgagcatc
cacgtcgcagatggcgtatataccgatctcgccggcaatctcggcatcggtgacaccctc
gacggcgatagcggattcaccgttgatatcgtcgctccggtcgtggcgctagatccttta
actactggcgacaccacgccggcgctgagcggtacggttgatgatccggccgccacgatc
gtagtcacggtcgacggcatcgactatgctgcgaccaataatggtgacggcacatggtcg
ctggccgacggtactctgccctcgttgcctgaaggcgaggtcaccatcaccgtcagcgct
accgatccggtcggcaacgtcggcaccgatagcggcatcattactatcgacaccacggct
ccagtcgtaacgcttgatcctttaactacaggtgatgcaactcctgcgctgagtggtacg
gttgacgatccggatgccacgatcgtggttactgtagacggtattgactatgccgcgacc
aacaatggtgatggtaccttgtcgctggccgacgacactctgccttcgttacccgagggc
gagactgccgtcactgttagcgctactgattcggtcggtaatgttggcaccgatagcggc
accattactgtcgacaccacggctccggtggtaaccatcgatcctttgaataccagcgac
accaccccggcactgagtggtacggttgacgatcctgaagcgactgtcgtggtcactgtc
gacggcgtcgactatgccgcgaccaataatggtgatggtacctggtctctggtagacgac
actctgccttcgctacccgaaggtgagactgccattaccgtcagcgtcactgacccggct
ggtaactcgggtaccattaccgagagtatcaccattgataccacggctccggtggtaacg
cttgatcctttaactacaggtgatgcaactccgtccctgagtggtacggttgacgatcct
gaagcgactgtcgtggtcactgtcgacggcgtcgactatgccgcgaccaataatggtgac
ggtacctggtctctggccgacgatactctgccttcgctacctgaaggtgaggtcaccgtc
accgtcagcgctaccgatccggtcggtaatgttggcaccgatagcggcacggttatcgtc
gacaccacggctccggtggtaaccatcgatcccttgaataccagcgacaccacgccggca
ctgagtggtacggtcgatgatccggaggcgactgttgtggttactgtcgacggtatcgac
tatgccgcgaccaacaatggtgacagtacctggtcactggccgacgacactctgccttcg
ttacccgaaggtgagactgccattaccgtcagcgtcactgacccggctggtaactcgggt
accattaccgagagtatcaccattgataccacggctccggtggtaacgcttgatccttta
actacaggtgatgcaactcctgcgctgagtggtacggttgacgatccggatgccacgatc
gtggttactgtagacggtattgactatgccgcgaccaacaatggtgatggtacctggtcg
ctggcggacgatactctaccttcgctacctgaaggcgagactgccgtcactgtcaaagct
accgatccggtcggcaactcggttgccatcatcgagaatatcaccattgataccacggcg
ccggtcgtgaccatcgatcccttgaataccagcgacaccacgccggcactgagtggtacg
gttgacgatcccgaagcgaccgtcgtggtcactgtcgacggtatcgactatgccgcgacc
aacaatggtgatggcacctggtcactggccgacgacactctgccttcgttacccgagggc
gagactgccgtcactgttagcgctactgatttggtcggtaatgttggcaccgatagcggc
accattactgtcgacaccacggctccggtggtaaccatcgatcccttgaataccagcgac
accaccccggcactgagtggtacggttgacgatcctgaagcgactgtcgtggtcactgta
gacggcgtagattacgctgcgaccaacaatggtgacggtacctggtctctggccgacgat
actctgccttcgctacccgagggcgagactgccgtcactgttagcgctactgattcggtc
ggtaatgttggcaccgatagcggcaccattactgtcgacaccacggctccggtcgtgacc
atcgatcccttgaataccagcgacaccacaccggcactgagtggtacggttgacgatcct
gaagcgactgttgtggtcactgtagacggcgtagattacgctgcgaccaacaatggtgac
ggtacctggtctctggtagacgacactctgccttcgctacccgaaggtgagactgccgtc
actgtcaaagctaccgatccggtcggcaactcggttgccatcatcgagaatatcaccatt
gataccacggcgccggtcgtgaccatcgatcccttgaataccagcgacaccacaccggca
ctgagtggtacggttgacgatcctgaagcgactgtcgtggtcactgtcgacggcgtcgac
tatgccgcgaccaataatggtgatggtacctggtctctggtagacgacactctgccttcg
ctacccgaaggtgagactgccgtcactgttagcgctactgattcggtcggtaatgttggc
accgatagcggcacggttatcgtcgacaccacggctccggtggtaaccatcgatcctttg
aataccagcgacaccaccccggcactgagtggtacggttgacgatcctgaagcgactgtc
gtggtcactgtcgacggcgtcgactatgccgcgaccaataatggtgatggtacctggtct
ctggtagacgacactctgccttcgctacccgaaggtgagactgccattaccgtcagcgtc
actgacccggctggtaactcgggtaccattaccgagagtatcaccattgataccacggct
ccggtcgtgaccatcgatcccttgaataccagcgacaccaccccggcactgagtggtacg
gttgacgatcctgaagcgactgtcgtggtcactgtcgacggcgtcgactatgccgcgacc
aataatggtgatggtacctggtctctggtagacgacactctgccttcgctacccgaaggt
gagactgccgtcactgtcaaagctaccgatccggtcggcaactcggttgccatcatcgag
aatatcaccattgataccacggcgccggtcgtgaccatcgatcccttgaataccagcgac
accacaccggcactgagtggtacggttgacgatcctgaagcgactgttgtggtcactgta
gacggcgtagattacgctgcgaccaacaatggtgacggtacctggtctctggccgacggt
actctgccctcgttgcctgaaggcgaggtcaccatcaccgtcagcgctaccgatccggtc
ggcaacgtcggcaccgatagcggcaccattactgtcgacaccacggctccggtggtaacc
atcgatcccttgaataccagcgacaccacgccggcactgagtggtacggttgacgatcct
gaagcgactgtcgtggtcactgtcgacggcgtcgactatgccgcgaccaataatggtgat
ggtacctggtctctggtagacgacactctgccttcgctacccgaaggtgagactgctatt
accgtcagcgtcactgatccggctggtaactcgggtaccatcaccgagtccgtaaccatc
gacaccacggctccagtagtgacgatcgatcccttgaatacgggtgacaccaccccgtcc
ctcagtggtacggttgacgatcctgaagcgactgttgtggtcactgtagacggcgtagat
tacgctgcgaccaacaatggtgacggtacctggtctctggccggcgatactctgccttcg
ctacctgaaggtgaggtcaccgtcaccgtcagcgctaccgatccagctggcaacatcggt
acccatagcggcactattactatcgatagcacggctccgatggttctgaatgtctctgcc
aacgtgtcggaggagagtctggccggcgggattccggacagcaacggcaccgaggacaac
accgactcggcaacggttgccggctccctgaccctcagcgacacgtccggcatcgcttcc
gtagccgttagcggacccggcggcgtgacctccaagggacaggcggtaacctggaacggc
gacttcgccggcggcgtttacaccttgaccggcacggcaggcgctaccaccgtggctacg
ctcaccttgaacaccgacggggactacaccttcaccttgtcggagccgctcgaccatgct
tcggccgatgtcgaggacgtactggcactcgaattcactgtcacggcgaccgacgcggcc
ggaaacgtcagcgatccggccacgctgactctcaatgtcgaggacgacatgcctttggcg
gcggatgcgaccacattcgtcctcgaccagcaacccgccacggcggccggttcgctggtc
gtcggctttggcgcggatggcggatatgtctccgagatcaccatcgacggcaatacctac
acttacgatcccgatgccgatacagtgaccgagagcgggagctcggctttggtaagccac
agctttaaccccgacaatgacgagttgacgatcagcacgacccagggcgaaaccctggtc
gtcgatatgcggaccggggaataccattatgcggcgctggccgccgacacggcgccaagt
ccggtcgtcaacgtcaacccttccgccagtctgttggggctggtcaatgccgaggcgctt
ggcctgctcgacatcggaactaaccagatgttaaccgcagtagacgccaataacgacatt
aaaagcgtcgtggtgaatgcaggcgcagccatcaacgttggggtcggtggctactaccag
ttgacctggtccgtggctatggcgaccgaatttggcctgacggtggtggaagacaacgat
atcgttaatctccttttggtcacgacgcaatcttattccaaactgacgattacctcggcg
gatggcggaacgatcgacaacctcaagctgaacgaatttctggcgaccgtccgggtagag
cagttcggcatcctagatctcctgaccctgggattgttgccgacgatttcgatcaccgcg
acggattccttaggcaatagcgctaccgattccgagaccgatctgctcggtttgagcctt
ttggatcctgccgacgacccggccggcgtcacggaaggagccagcggtccgaacaacctc
gtcggcaccaacgcggacgagcggctttacggctatgtcggcgacgatactctgagcggc
gagcaaggcaacgatctgctgcgcggcggactcggcgccgacacgctcgacggcggctcg
ggagacgatatcctgatcggcggcaagggtaacgacaccttgacgggcggttccggcaac
gacaccttcctgtgggaaaaggacgatcagggcacggcgggcaacccggccatcgacacc
attaccgatttcaacgccgcccctgtcgtcggcggcggcgacatcatcgatctcagcggc
ctgctgcagggcgaactcgctcgcggccatacggtgggtaacctcgtcgattacctacac
ttcgaggttgtcggtggcgataccgtccttcatatcagcaccaccggagcgttttcaagc
ggattcgaccctaacctggccgatcagcggatcgtgttcaccggggtcgatctggtggac
ggtctcgccaccgaccaggaagtcattgcgcgcctgctcgccaacggcaacctgatcgtc
gaccaggaaaccaccgcgaccgaccagctcaacggtatcacgacctttggcgcggtcatc
acggacaacgacggcgacaccgccagcacatcgatcagcttcgatacccgcgatccggcc
gcacccgatcccgataacgacgcgccggtagtacaagccgacagcacggcgctactaggc
ttgatcggagcgaatgtgctcgacgtgatccagcttggcaaccaggctttcatcgccgga
gatccgaacggcgatctgcgctccgtgacggtgaacttccaaggattggctatccctctc
ggcgatctaaggctcaccgcatcccgcaaattggcgaacgacttgggattaacgttcacc
gttgaaagtacggccggaatcggggcgacgtcgacgttgacgatcacggcgctcgatggg
ggcaacatcgacaacctggcggtcaacgaattgctcgccaccgtccgccttgaatcggac
atcgatctgctcgggctggtacctgggctcgacataagcgtactcggcaccctcagtatc
accgctaccgacagccacggtctatcggatacggaccaagtgaccgagttgctgaatgcc
aacgtactcgatggtctactggcaccgagcgggaaccccgatatcatcgagggcgcgtct
gccaacgacaatctcgcgagtagcgtgctaggaaccacccacgaacgcctatacggtttc
gaaggcgacgacgtcctttccgggggctcgggtaacgatctgctccgcggcggcagcggt
aacgacgtgctggatggcggcgacggcaaagacgtgctgatcgacggtaacggcgaggat
accttcctggccgggtccggagacgacatcatcattgtcagcggtaccgatttcgctcag
atcgacggtggcgatggcttcgacatcctgagactcgacggaaacctggccttggatctg
acttccgccgattccgggatcacgaatatcgagaggatcgatcttggaaacggcgcttcg
gtgttgccgctgaccgaagaagccgtcctcgcgctgaccgacgaggatgacaccctgcaa
atcaccggcgaggccgatgaccgggtgaacctggtcgacgcgacgtacatcgacaacgtt
accatcgacgggatcaccttcgctcaatatgagctgggctcggcaaccgtgctggtggac
gaggagatcgccaacgtcgcggttgtgtaa

DBGET integrated database retrieval system