KEGG   Mycoplasmopsis maculosa: NCTC10168_00621
Entry
NCTC10168_00621   CDS       T07105                                 
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III polC-type
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
mmau  Mycoplasmopsis maculosa
Pathway
mmau03030  DNA replication
mmau03430  Mismatch repair
mmau03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmau00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    NCTC10168_00621 (polC)
   03430 Mismatch repair
    NCTC10168_00621 (polC)
   03440 Homologous recombination
    NCTC10168_00621 (polC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mmau03032]
    NCTC10168_00621 (polC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mmau03400]
    NCTC10168_00621 (polC)
Enzymes [BR:mmau01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     NCTC10168_00621 (polC)
DNA replication proteins [BR:mmau03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     NCTC10168_00621 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:mmau03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     NCTC10168_00621 (polC)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T DNA_pol3_finger HHH_6 PHP RNase_H_2 HHH_3 T2SSK DNA_pol_A_exo1
Other DBs
NCBI-ProteinID: VEU75689
UniProt: A0A449B538
LinkDB
Position
1:complement(722768..727153)
AA seq 1461 aa
MDYLNYNVKKFHLFCESVQIKVPENLKNTELLNLEYKKNTDEFNNFIDSIYFKLKFNDFI
TPSEFIFIYKEIKSKKDIFKIEVDFIMSKIQYTKESIIDFINVLINEKNKFNKILKLNLN
EILELKNNELIIKLDNNEFNYYKEIFESIHEKIKKFGFKEIIFTFIKNEEKQEYVLEENI
QEKNEKIKKMLDHFSNKAIEITKNNSYPENKFRNPKKTFANINYQNISLEKIKDVDNNSY
VSFVGEVFKKDKKPVYRNGQSSFTFYVSNYKEAVKCNWYSKGEFKREDLDLIEIGNWVKI
NAQIPSLERVSRGFFVYVNTITSSNSLFEINIDNNPIKRIELHACSKMNTMDGLMQPNEI
VERAKKLGMSSVGIMDLDGVQGYPEFYLACKKNNIKGIYGATYSVIDDYNKSVYGPILKG
NISDFEFVSFDIETTGLSPRFHELIEFGSITVDTNLRKKDKNQFFAKPKNKLSQFTIDLT
KITDKLIEDEGFSIKESLLKIYDILNNKVALAHNARFDYNFLKEQFRLNEIPFPNVTVID
TLAISRMLNPEKRSHKLGQVANRLGIDYDSEIAHRADYDANVLADIWINLLNELKKININ
TFEDLTKYTSKEFESRKYPNEISTIIKNTNGLKEQYKLITKSLTENYNNGPKTYLSTIQN
INRNNILIGSGTLKSRLYDKYFYSCQEDFLKELEIYDFIEILPPQNMKHFVDRNIITEND
LLKGIEEIIHFAKKMNKLVIATSDARYLDDKDKEFFKTLVYAKGIKNVRHYLYDSDFKYD
LPLPDQKFLNTQEMIDSFNFLNNKELVNEIVIENPNKINEMTEDLQIIKEGLFTPKFDNS
DVKLREYVYKTAHEIYGENLPPLIKDRIEAEINPIINYGFSVIYWITHKLVKMSVDQGYV
VGSRGSVGSSFVATLSGISQVNPLPPHYICKKCKFFELVENPEVRNGYDLDDKECNNCGE
LVKGEGHNIPFETFLGFKADKVPDIDLNFSGEFQGKIHDEIKNIFGENHTFRAGTIQTVA
EKTGYGYAKNYMEEVNKDFSDSFALFIGTKLEKIKRTTGQHPGGVIIIPKEFEVYDFTPV
NYPANDTESSWFTTHFDYHAIHDNVLKFDMLGHDNPTIIRKLQEYTGVSVDDIPHKDEKV
IESFINIEALSIKKEQVQNEPTGALGIPEFGTNFVRQMLVQAKPKSFADLVSVSGLSHGE
NVWLENAQDLILKQGLKIDDVISCREDIMYMLINKGVENSLAFKIMEKIRKGKGLTDEEI
DLLKNHNVPEWQIKSMNKIVYLFPKAHAVAYVLMAWWISWFKVYYPLAFYASYFASHARA
IDISNMVDKRNGTKVTTKLIELKNKNSDLISTKEKDLIPVLEITEELYARGMYIEQIDIE
KSQAHEWIVDNDKNCLIPPFDSIDGLGPAVAESIVQARNESPFKSKEDFKNRTDVNKTLF
ETIKAMGILKNLNDTDQFTLF
NT seq 4386 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggactatttaaattataatgttaaaaaatttcatcttttttgtgaaagcgttcaaata
aaagtaccggaaaatttaaaaaacactgaacttttaaatcttgaatacaagaaaaacact
gatgaatttaataattttattgattctatttattttaaattaaaatttaatgattttata
actccttctgaattcatttttatttataaagaaataaaaagtaaaaaagatatttttaaa
attgaagtagattttataatgtcgaaaattcaatacacaaaagaaagtattattgatttt
attaatgttttaattaatgaaaaaaataaatttaacaaaatacttaaattaaatttaaat
gaaattttagaattaaaaaataatgaattgattattaaacttgataataatgaatttaat
tattacaaagaaatttttgaatcaattcatgaaaaaataaaaaaatttggttttaaagaa
attatttttacgtttatcaaaaacgaagaaaaacaagaatatgtattagaagaaaatatt
caagaaaaaaatgaaaaaataaaaaaaatgttagatcacttttctaataaagcaatagaa
attacaaaaaataattcataccctgaaaataaatttagaaatcctaaaaaaacatttgca
aatataaattatcaaaatatttcattagagaaaattaaagatgtcgataataattcatat
gtaagttttgtgggcgaagtttttaaaaaggacaaaaaaccagtttatagaaacggccaa
tcttcatttacattttatgtttcaaattataaagaagccgttaaatgcaattgatattca
aaaggcgaatttaaaagagaagatcttgatttaatagaaataggtaattgagtaaaaatt
aacgctcaaataccttctcttgaaagagtttctagaggtttttttgtttatgttaataca
ataacttcttctaattctttgtttgaaataaacatagataataatccaataaaaagaata
gaattgcatgcttgctcaaaaatgaatacaatggatggattaatgcaaccaaatgaaatt
gtagaaagagctaaaaaactcggtatgtcgtctgttggaataatggatttagatggggtt
caaggttatcccgaattttatctagcttgtaaaaaaaataatattaaaggtatatacggt
gcaacttattcagtaatagatgactataataaatctgtatacggccctattttaaaaggt
aatatatcagattttgaatttgtttctttcgatattgaaacaactggtttaagtccaaga
ttccatgaattaatagaatttgggtcaataacagtagatactaatttaagaaaaaaagat
aaaaatcaattttttgcaaagcctaagaataaattatctcaatttacaatagatttaaca
aaaattactgataaattaatcgaggacgaaggtttctcaataaaagaatctcttttaaaa
atttatgatattttaaataataaagttgccttagcacacaatgcaagatttgactataac
tttttaaaagaacaatttagattaaatgaaattccttttcctaatgtcactgttatagac
acattagcaatttctagaatgttaaaccctgaaaaaagaagtcataaattaggtcaagtt
gcaaatagacttggaattgattatgattctgaaattgctcaccgtgcagactatgatgca
aatgttttagcagatatttgaattaaccttttaaacgaattaaaaaaaataaatattaat
acatttgaagatttaacaaaatatacttcaaaagaatttgaatcaagaaaatatccaaat
gaaataagtacaataattaaaaatactaacggtttaaaagagcaatataaacttattaca
aagagtttaactgaaaattataataatggtccaaaaacttatttaagtacaattcaaaat
attaatagaaataatatattaataggttcaggcactctaaaatcaagattgtatgataaa
tatttttattcatgtcaagaagattttttaaaagaattagaaatatatgattttattgaa
atattaccacctcaaaatatgaaacattttgtggatagaaatataattaccgaaaatgac
ttactaaaaggaatagaggaaattatacactttgctaagaaaatgaataagcttgttata
gcaacatctgatgctagatatttagatgataaagataaagaattttttaaaacattggtt
tatgcaaaaggaataaaaaacgtaagacactatttatacgattcagactttaaatatgat
ttacctttgccagaccaaaaattcttaaatactcaagaaatgattgattcttttaacttc
ttgaataataaagaattagttaacgaaatagttattgaaaacccgaataaaattaacgaa
atgactgaagatttacaaatcataaaagaaggtttatttacacctaaatttgataattct
gatgtcaaactaagagaatatgtttataagacagcccatgaaatatatggagaaaattta
cctccgctaattaaagatagaattgaagcagaaattaaccctatcattaattatggtttt
agtgttatttactgaattactcacaaacttgttaaaatgtctgtagatcaagggtatgtt
gttggtagtcggggatctgttggttcttcatttgttgcaacactttctggcattagtcaa
gttaatcccttgccacctcattacatttgtaaaaaatgtaagttttttgaattagtcgaa
aatccagaagttagaaatggttatgatttagatgacaaagaatgcaataattgtggtgaa
ttggtaaaaggtgaaggccataatataccttttgaaacttttttaggttttaaagccgat
aaagttcctgatattgacttaaacttttctggtgaatttcaaggtaaaatacatgatgaa
atcaaaaatatatttggggaaaatcatacttttagagctggcactattcaaactgttgct
gaaaaaactggatatggttatgctaaaaactatatggaagaagttaacaaggatttttcg
gactcatttgccttatttataggaacgaaattagaaaaaattaaaagaacaacaggccaa
catcctggaggtgtaataataattcctaaagaatttgaagtttatgattttacaccagta
aattatcctgctaatgatactgaatcttcatgatttacaacacattttgattaccatgct
atacatgataatgtattaaaatttgatatgttagggcatgataatcccactataataaga
aaacttcaagaatatactggagttagcgttgatgatatacctcacaaagatgaaaaagtt
atagaatcttttataaatattgaagctttatcaataaaaaaagagcaagttcaaaacgag
cctactggcgcattaggaattcctgaattcggaactaactttgttagacaaatgttagta
caagctaaaccaaaatcatttgctgacttagtatctgtttctggattaagccatggggaa
aatgtttgattagagaatgctcaagacttaattttaaaacaaggcttaaaaattgatgat
gttatttcttgtcgtgaagatataatgtacatgttaataaacaaaggtgtagaaaactca
ttagcttttaaaataatggaaaaaatacgtaaaggaaaaggtttgacagacgaagaaatt
gatttattaaaaaatcataatgttccagaatgacaaataaaaagtatgaataaaatagtt
tatcttttcccaaaagctcacgctgttgcttatgtgttaatggcttggtggatttcgtga
tttaaagtatattaccctctagctttttatgcaagttattttgcaagtcatgcaagagca
atagacatttctaatatggttgataaacgtaatgggacaaaagtaacaaccaaattaatt
gaattaaaaaataagaattctgatttaatttcaacaaaagaaaaagacttaatacctgta
ttagaaataacagaagaactgtacgcaagaggaatgtatatcgaacaaattgatattgaa
aaatctcaagcacatgaatgaatagttgataatgataaaaattgtttaatacctcctttt
gattcaatagatggtttagggcctgctgttgcagaatctatagttcaagctagaaatgag
tctccttttaaatcaaaagaggattttaagaatagaacggatgtaaataaaactcttttt
gaaactataaaagctatgggtattttaaaaaatcttaatgatacagatcaatttacttta
ttttaa

DBGET integrated database retrieval system