Megasphaera massiliensis: LCQ47_07500
Help
Entry
LCQ47_07500 CDS
T07781
Name
(GenBank) YadA-like family protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
mmax
Megasphaera massiliensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmax00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mmax02000
]
LCQ47_07500
Transporters [BR:
mmax02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
LCQ47_07500
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
ESPR
YadA_anchor
ATG16
YadA_head
Cast
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UBS52756
LinkDB
All DBs
Position
complement(1592848..1598583)
Genome browser
AA seq
1911 aa
AA seq
DB search
MNKIYKVVWSKAKNAYVVVSEIAKSHSKPVSTKLNAGKSAAAVLAVLALVSVPGVTTVQA
VSDIKVGDGSKTNSYVGQVGSIAIGNNAYVENMYGNQEKTFTFGQTDLTQLAAGIAIGQN
TYARSGSVMIGDHKYVGALGDVTVDGSSNAGVRAKSLYINSTTLGANAYNSGSFSTVNGS
YSIATSDYQGLGGFSAIFDGPKAAKNFGANIYGSLNSIESATSSSNYSGVASSVIGTANR
TANSNGALIFGAGNEITNSITAISAPSSGGASAKELQTTLMTSIKNSQSGGATLAIGGGN
TADYTQKTSIIGVNNTVKGTSSNISQYNSVTGFNNTATNVDNTIVVGTNRTVSDLANTVV
IGTADSATETTVSNAVAIGSNANATVDGGVALGSGSVASVASGVAGYDPKTNAASTTDSA
TWKSTLAAVSVGVPTDGGAATATRQITGVAAGMQDTDAVNVAQLKSSKVTLTPGENVTID
SVTNADGTTYTIKSTDTNTTLASGTVSYTDGDGTLVLTDSAGNNVTVSGLKNTYVTSAAL
NGNTLTLTRNDGGTVTVDGIASSADITSLTNTVNANKTHFYSVNSTDEKAGNYNNNGATG
TNALAAGVAASAQTNNSVAVGTNARVLGNGGNRDTGTGSIAIGENAVVTTNGINLTSIAM
GKGATVLNGSGKQDKALSFTPDNYASGSDTPIDADKSPGGIAIGANAYARTGSVQIGNHT
MKGYTMGGSEINDQSQANLVGMTTIGSNSYNKGALGSMLGAYSVMTGSFTGAGGFNSLLY
GSQNFGANVVGSLNSIRSAGYSGSSGIANSIVGVANIAENANGALIYGAGNKITNSVQSI
SGIDTLTSTLTVDEMADALRKGIQSSGGGGSTLAVGGGNTADYTQNTAIIGVNNTVTGTS
SDIAQYNSVTGYKNTATNVDNVTITGINNTVTDTKTAVVIGDNRTLTGVNNNVIIGSSDA
GTTTTVNNAVAVGRNTNVSYDGGVALGANSLATVDKGAVGYDPLGEITDTDSIGALNKTQ
YDALKSSIATSNDTVNSLTSDIADLKQQQSQYSRWSNEYFDLQDQIDAKQTELTAAQSSL
AADQTEMNKLVSTWQATGAAVSVGDSATGLTRQITNVAAGTNDTDAVNVAQLKQVAAAAE
DAGKTTLNFTGDDTSAANTIARGNGQTLNITGGASEFTTADNIGVVKDGDNALKVKLAKD
LNMADGSIAFNNGVKLSSAGLSNGGQKITNVAAGEADTDAVNVSQLKGSTIKSGTATYAD
NGTGSMTLTMENGDTVKVEGLSDKYINGASLANNTLTITRNDGTNFTVKNIATMDDISNQ
VGDVALNFAGDDATAKVTTKNNGTLNITGGAASDNLTDDNIGVVKAADDTLQVKLSKDLN
ALDSVRVGGSKEGEGIYIAKQSVNNSKGVAEEGNYITGLTNTTWNPTANGYVTGRAATED
QLKSVYDTINSNVTANKVVAGKNISVEVNEDGTGTKVSLENNITLGSDTDAAKQVNINGD
AATVTAGDGANKVVVDGTNGQVTIGDAANGGIVMGNQSNVTGTKADGTTDSQNGQYLTGL
DNTKWDPANQGIVENRAATEGQLKDVTDSISKQISDIDTAVKSSSRVFESDSGADNQVTR
KNTDAMKLKGGADANNLSDNNIGVVNNSDGTGFDIKLSKDIKGLNSIAVNNVEVNNKITV
GTGDNQTVIEGNTVNTGSVTTGNTTINNDGLKIVNEDSSKNITVQNNNVSMGGNRIQNVG
DATESTDAINKGQFDRAINNIGTGMNEMNNRIGNLDRRVDRVGAGAAALAALHPLEFSPE
AKWDISAGVGNYRGANAVAIGAFYRPNVNTLVSIGSSYGGGENMINAGVTFRIGDGETIN
YPSKKVMAQKITDLESVVSQQNNKLEAQSEQLEAQNKKIEELMKAVAALTK
NT seq
5736 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaaatttacaaagttgtttggagcaaagcaaagaatgcgtatgtcgtcgtttct
gaaattgcaaagagtcacagcaaacccgtgtcgacaaaattgaatgccggtaaatccgct
gccgcagtcttagctgttttggcactggtatctgttccgggggttacgactgttcaagct
gtatctgatattaaagttggcgacggttcgaaaaccaacagttatgttggtcaggtaggc
agtattgccatcggtaacaatgcctatgttgaaaatatgtatggtaatcaggaaaaaacg
tttacctttggacaaaccgatctaactcagttggcagccggtattgccatcggtcaaaat
acttatgcccgttccggcagcgtcatgattggcgaccataaatatgtcggtgctctcggt
gatgttacggttgacggttcatcgaatgccggtgtaagagcgaaatctttgtatattaac
tccaccaccctcggtgccaatgcctacaattcaggctccttttctacggtaaacggctct
tattctattgcaacgtctgattatcagggccttggcggcttttccgctatttttgacgga
ccgaaagcggccaaaaactttggtgccaacatttacggttccttgaacagcattgaatcg
gctacctcttcctctaactattccggtgttgccagcagtgtcatcggtacggccaataga
acggccaactccaatggtgccttgattttcggtgccggtaatgaaattaccaactcgatt
acggctatttctgcaccgtcaagcggcggtgcctcggcgaaagagttgcagaccacgttg
atgaccagcattaagaactctcaaagcggcggtgcaacccttgctatcggcggcggcaat
acggctgattacacccagaagacttccatcatcggtgtaaacaataccgttaaaggtacg
agcagcaacatcagccaatacaactctgtaaccggctttaacaacacggctaccaatgta
gacaatacgattgttgttggcacgaaccgaacggtgtctgacttggccaataccgttgtt
atcggtaccgcagattccgctacggaaacgaccgttagtaacgcagttgccatcggcagc
aatgccaatgcaacggttgacggcggtgtcgccttgggttccggttctgtagccagcgtg
gcatccggtgttgccggctatgatccaaagactaatgcagcttctacgacggactccgca
acttggaaatctaccttagccgctgtttctgtcggcgttccgacggatggcggtgccgct
acggcaactcgccagattacaggcgttgctgccggtatgcaggatacggatgctgtaaac
gtcgcccagctcaaatcctctaaagtaactttgacacccggtgaaaatgttactattgat
tccgtaacaaacgctgatgggactacttataccattaaatctaccgacaccaatacgacc
ttagccagcggtaccgtttcctataccgatggtgacggaactttggttttgaccgattcg
gcaggtaataacgttaccgtaagcggtcttaaaaacacctatgtcaccagtgcggccttg
aacggcaataccttgaccctcactcgtaatgacggtggcacggttaccgtagacggcatc
gcatcttcggcagatattacttctttgacgaatacggtaaatgccaataaaacgcacttc
tacagcgttaactctactgatgaaaaagcaggtaactacaacaataacggcgctaccggt
acgaatgcgttggctgccggtgtagcggctagtgctcagaccaacaattccgttgctgtc
ggtaccaatgctcgtgtgttgggcaatggcggtaatagagacaccggtaccggcagtatt
gccatcggtgaaaacgcagtcgttactactaacggtatcaacttaacaagtattgctatg
ggtaaaggcgcgactgtattaaatggcagtggtaaacaggataaagccttaagctttacg
ccggataactatgcatccggcagtgacacgcctattgatgcggataaatccccgggcggc
atcgctatcggtgccaatgcttatgcccgtacaggcagcgtccaaattggcaatcacacc
atgaagggttacaccatgggcggttctgaaatcaatgaccagtcccaggcaaacctggta
ggcatgacgaccatcggctccaactcctataataaaggtgccttgggcagcatgctcggt
gcgtactctgtcatgactggcagcttcaccggcgccggtggtttcaacagccttctctac
ggttcgcagaatttcggtgccaacgtagtcggttccttgaacagcattcgctctgccggt
tacagcggttccagcggtattgcgaacagcattgtcggtgtagccaacattgctgaaaat
gctaacggtgccttgatttacggtgccggcaataaaattaccaactctgtacaatccatt
agcggtatcgataccttgaccagcacgttaacggttgatgaaatggctgatgccttacgt
aaggggattcaaagctccggtggcggcggctctaccttagctgtcggcggcggcaacacg
gccgactatacgcagaatacggctatcattggtgtaaacaatacggttaccggtacaagc
tccgatattgctcagtataactccgttacgggctataaaaacacggcaactaacgtagat
aatgtaaccatcaccggtatcaacaatacggtcaccgatactaagacggccgttgtaatt
ggtgacaaccgtaccttgaccggcgttaataacaacgtcatcatcggttcttccgatgca
ggcactacgacaacggttaataatgccgtggctgtcggtcgaaatacgaatgtatcctat
gacggcggcgtagccctcggtgctaactcgctggctacggtagataaaggtgctgtcggc
tatgatccgttgggagaaattaccgatacggatagcattggcgcacttaataaaacgcag
tatgatgcacttaaatcctctatcgcaacgagcaacgatacggtaaatagcttgacttcg
gacattgccgacttgaaacagcagcaaagtcagtatagcagatggtctaatgaatatttt
gaccttcaagaccagattgatgccaaacagactgaactgactgcggctcaaagttcctta
gctgctgaccaaactgaaatgaataagttagtttccacttggcaggcaaccggcgctgct
gtatccgtaggggacagtgcaaccggcttaacccgtcagattactaacgtagcagccggt
acgaatgataccgatgccgtaaacgtggctcagctcaaacaggttgcagctgcagcagaa
gatgcaggaaagacaaccttgaacttcaccggtgatgacacttccgctgccaatacgatt
gctcgcggcaatggtcagaccctgaatattaccggtggtgcttctgagtttacgacggct
gacaacatcggcgtcgtaaaagacggcgacaatgctctgaaagtgaaattggctaaagac
ctcaacatggctgacggcagcatcgccttcaataacggtgtgaagctgtcgagcgcaggc
ttaagcaatggcggtcagaagattaccaatgtagcagccggtgaagccgataccgatgcc
gtcaacgtatcgcagttgaagggcagcaccattaagtccggtacggcaacctatgccgat
aacggtaccggctccatgacgttaactatggaaaatggcgacactgttaaggttgagggc
ctttctgataaatacatcaacggtgcatcgcttgctaacaacaccttgaccattactcgt
aacgacggcacaaacttcaccgtcaagaatattgcgactatggacgatatctcgaatcaa
gtcggcgacgtagccctgaactttgccggtgacgatgctacagctaaggttacgacgaaa
aataacggaacccttaacattaccggtggtgctgccagcgacaacttgactgatgacaac
atcggcgttgtaaaagctgctgacgacaccttacaggttaaattgtcgaaagacttgaac
gcccttgacagcgtccgcgtcggcggttctaaagaaggcgaaggcatttacattgctaag
cagtctgtaaataactccaaaggtgtggctgaagaaggtaactacattaccggtttaacg
aatacaacttggaatccgactgctaacggttatgtaaccggccgtgcagctaccgaagat
cagttgaaatccgtttacgacacgatcaactccaatgtgacggccaacaaggtagttgcc
ggtaagaacatcagcgttgaagtaaatgaagatggcaccggtacaaaggtatccttggaa
aataacatcaccttgggctccgatacggatgcagccaaacaggtcaacatcaacggtgac
gccgcaacggtgacggccggtgacggtgccaataaagtcgtcgttgacggcacgaatggt
caggtcacgattggcgatgcagctaatggcggcattgtcatgggcaaccaatcgaatgtt
accggcacaaaagctgatggcactacggattctcagaacggtcaatacctcaccggtctc
gacaacacgaaatgggatcctgcaaatcagggtatcgttgaaaaccgtgcagcaaccgaa
ggtcagttgaaagatgtaacggacagcatttccaagcagatcagcgacatcgatacggcc
gttaaatcctccagccgtgtctttgaaagcgacagcggtgccgataatcaggtaacccgt
aagaatacggatgccatgaaactgaagggtggcgctgatgccaataacctctccgacaac
aacatcggtgtcgtaaataacagcgacggcacgggctttgacatcaagttgtcgaaagac
atcaagggcctcaacagtattgcagtgaacaatgttgaagtcaacaataagattaccgtc
ggtaccggtgacaaccagactgtcatcgaaggcaacacggtgaacaccggctcggttacg
acgggcaacacgacgatcaacaacgacggtctcaagattgtcaacgaagattcgtcgaag
aacatcactgtccagaacaacaacgtcagcatgggcggcaacagaatccaaaatgtcggc
gatgctacggaatcgacggacgccattaacaaaggccagttcgaccgcgccatcaataac
atcggcacgggaatgaatgaaatgaacaaccgtatcggcaacctcgaccgtcgtgtcgat
cgcgtcggtgccggtgccgcagccctggcagctctccatccgctggaattcagcccggaa
gcgaaatgggacatctcggccggtgtcggtaactaccgcggtgctaacgccgttgccatc
ggggccttctatcgtcccaatgtcaacaccttggtcagcatcggttcctcctacggcggt
ggtgaaaacatgatcaacgccggcgtaaccttccgaatcggtgacggcgaaacgatcaac
tacccgtccaagaaggttatggcacaaaagattacggatttggaatcggttgtatcccaa
cagaacaataaacttgaagcacaaagtgaacagcttgaagcacagaacaaaaagattgaa
gaattgatgaaagctgtagctgctttaacgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
