Marinicellulosiphila megalodicopiae: TYM08_P2652
Help
Entry
TYM08_P2652 CDS
T10978
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
mmeg Marinicellulosiphila megalodicopiae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Flagellin_N
Flagellin_C
Flagellin_IN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCE02589
LinkDB
All DBs
Position
3127663..3132948
Genome browser
AA seq
1761 aa
AA seq
DB search
MPQIINTNIASLTAQRNLDKSQSANSTALERLSSGLRINSAKDDAAGLAISTRFETQTRG
LNVAIRNAGDGISLAQTAEGALGSMTDSLQRIRELAVQSANATNSDGDRAALQAEAEQLI
AEISRVGEETNFNGQKLLDGTFEGAFQVGANAGERIEFSVANMTADTLGVGETAGVSAVG
TDESLGNGDLIINGSAIGASSANDDTVSYDNAAASSISKAAAINAKSDETGVKALVDKNT
VGGSTMVAEAASGSITLNGVEVNVDTTNDAASSRASVVSAINAVSEQTGVMATDTEDDAL
GVTLTASDGRNITLDYSGDLTAANTGLAETTAGSKAQVSASLDSISPSSALNFGNTEAAS
VTFGLTINTGEDDAGTDALNFSAHTATSTGGGANTVAGLGAVSFTLTTETDSYDVVLDQD
YSSNDIDTTDTDSKTYLDMVEDINAQISGSGVTASVNGDGKLTFSQDASGAGFIKLENGS
EANTRAAFGNNDTTSIFGEAIDQDGETLDLENDAVRADGRDDSISFDVSTTNRDGEVTVN
KITIDDSVRDLDGLVASINESLSAQSGSTVIAQNNEGKLSFETRDNFSGGITVGNFRDGN
NQSEDVTETQNITDSDINALFGMDITTASGAPSTGSGVKGNVDLDATGASPITLSNDTSA
GTKAQISIVGATMDTDAAATAGGVVKITLGDITAEIAANTLVQGADAEYDDFVDDLNTQL
AASDLNGLVVADWDGTNINITAVNATDEDLTITSDADDAAAADVLAELDLIDDLFGVNLS
DGAGQTIAVNDQAANTSTLSATGVAATTKNNTMTIDLTNAGISEEITIAESSDPSGSYAD
NDSLVTAINSAIADNTNLNGKVQAFSEDGGISIRQLDENSTDTLTATGLAATSVLGTQST
VAASTAAVDSATSTVVGDGDGEVGGADTFEGGFTLVADGDVNEINISGGDNTGNGNIAHS
GIAEGSYKAGVASVTSTTKTATVNETRGTGIAGSAISEPITVINSGAQDAIQASIGGAAS
AFNATTTNFGGNAGADAMSFELTLAGAESGNGTVEIALTTDIQSVDALLADINDELTASG
VGITAQSNSAGDGIEFVANNGGDAEITIGELNTGYNGAAVGSTTAGLSAALGMNIDPTAD
TASIDLAASGGTGQDLSAGAVTFDISLADFNGDEVSSASISLSGDYTQAGNGGSLADAQQ
ALIDDLNSQLSSQGAGITVTSDGTTGFGTDKLIFTSDTTESDLVMTLDNFANTSGVSNAN
VDTMLGTGNAVATPGALDSDLSSANTGGGAISRTAGTDGIVSSNSLSHASTHATLGNSTT
VAGENEVSINNTLSFSVDGGEVEEITLDAATYADTDALVDEINDKLGDSTNLQGATAYNE
DGAVVIRSNNTANSGSISAIGGTAADDLGLDAVNGTAVDKELGVKSLEAGDLVINDVAIS
AAKNSYDTASFDGADTSVKSASGIAIAEAINRSSEATGVTAEVNATSVVGGDASGSTNYG
SGDAGNIHINGVDLGTITLTGNQEDDRRTAVDMINDKAGQTGVSATDNGVSISLMAADGR
NLSVAIDNKSASNSGSGDDKGIGFGAAIGLDASVDGIGEGDITGDDSKTTNNTYETAYST
IKLSSAGSIDIKGGLNGNDAIEKLGLETGEFGGATDGQFVKDIDISTLEGANAAISALDN
ALEKVASERANLGAMQNRMETTVSNLAITSENLTASNSRIRDADFATESAELSRTQVLQQ
AGISILAQANQRGQQVLSLLG
NT seq
5286 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccacaaattattaataccaatatcgcgtcattaacggcgcaacgtaatttggataaa
tcacaatctgcaaactcaacagcgttagaacgtttatcatcaggtttacgtattaactca
gcaaaagacgacgcagccggtttagccatttcaactcgttttgaaacccaaacacgtggt
ttaaacgtagccatccgtaacgcaggtgacggtatctctcttgcacaaacggcagaaggt
gcattaggttcaatgaccgattcgcttcaacgtatacgtgagttagcagttcagtctgcc
aacgccactaactcagatggtgaccgagcagcacttcaagcggaagcggaacagctaatc
gcggaaatctcccgtgttggtgaagaaaccaacttcaacggacaaaaattattagacggt
acatttgaaggcgcattccaagtaggtgcaaatgctggtgaacgtattgaattctctgtt
gctaatatgactgctgatactttaggtgttggggaaactgcaggtgtatctgcagtaggt
actgatgaatctttaggaaatggcgacttaattatcaacggttcagcaatcggagcatct
tcagcaaacgacgacactgtatcttatgataacgctgcagcttctagcatatctaaagca
gctgcaattaatgctaaatctgacgaaacgggtgtaaaagcattagtagataaaaatact
gttggtggttcaactatggtagctgaagcagcttctggttcaattacgcttaacggtgtt
gaagtaaatgttgacaccacaaacgatgcagcatcatctcgtgcatctgtagtgtcagcc
attaatgctgtatctgaacaaactggtgttatggcaactgataccgaagatgatgcatta
ggtgtgactctaacggcgtccgatggtcgaaacatcacattagattattcaggtgatttg
actgcggcaaatactggtttagcagaaacgactgcaggttctaaagcgcaagtatctgct
tcactagattctatttctccaagttccgctttgaattttggaaataccgaagcagcatca
gtaacatttggcttaacaataaatacaggtgaagatgatgcaggtactgatgcattaaac
ttttcagctcatactgcaacatcaacaggtggtggagcaaatactgtagcagggttaggc
gctgttagttttactttgacaacagaaacggattcttatgatgttgttttagatcaagat
tattcaagtaacgacattgatacaacagatacagactctaaaacatatttggatatggtt
gaagatatcaatgcacaaatttctggatcgggcgtaacagctagcgtcaatggagacggt
aagcttaccttctcacaagatgcgtctggtgctggtttcattaaattagaaaatggttct
gaagcaaatacaagagcagcatttggtaacaacgatacaactagtatttttggtgaagct
attgatcaagatggtgaaactcttgatttagaaaatgatgcagtacgtgcagatggtcgt
gatgattcaatttctttcgatgtatctactaccaaccgtgacggtgaagttactgtcaat
aaaattacaattgatgatagtgttcgagatctagatggattagtagcttcaattaatgaa
agcttatctgcacaatctggtagtactgtaattgctcaaaataatgaagggaaattatca
tttgaaacgcgcgataatttttctggtggtattacagtaggtaatttccgagacggtaac
aaccaatcagaagatgtaacagaaactcaaaatattactgatagtgatattaacgcatta
tttggtatggatattaccactgcatcaggtgcaccaagcactggttctggtgtaaaaggt
aatgtagatttagatgcaacaggcgcatcaccaataacgttaagtaacgacacatctgca
ggcacaaaagcacaaatcagcattgttggcgctactatggatacagatgccgcagcgact
gctggtggtgttgtaaaaatcacattgggtgatataactgctgagattgcagcaaataca
ttagttcaaggtgcagatgctgaatatgatgattttgttgacgatttaaatactcaatta
gctgctagtgatttgaatgggttggtcgtagctgactgggacggtactaatatcaatatt
actgctgttaatgcaactgacgaagacttaactattaccagtgacgctgatgatgctgca
gctgctgatgtacttgcagaacttgatctaatagatgatctttttggtgtaaatttaagt
gatggtgctggtcaaactattgctgtaaacgaccaagcagccaatacatctactctatca
gcaactggtgtagctgcaacgaccaaaaataacaccatgactattgacttaacgaatgca
ggtatttctgaagaaatcacaattgctgagagctctgatccaagtggatcttatgccgat
aatgattctttagtaacagcaatcaactcagccatagctgataacaccaatttaaatggt
aaagttcaggcattcagcgaagacggtggtatttcaattcgtcaattagatgaaaactca
accgatacattaactgctactggattagcggcaacctcagtacttggcactcaatctaca
gttgctgcatctacagctgcagtggatagcgccacttcgactgtcgtaggtgatggcgat
ggggaagttggtggggcggatacttttgaaggtggctttactcttgttgcagatggcgac
gttaatgaaataaatatttcaggtggggacaatacaggtaatggtaatattgcacattca
ggtattgcagagggctcatataaagcaggcgttgcatccgtaacatctaccacaaaaacg
gctaccgttaatgaaactagaggtacgggtattgcaggatcagcaattagtgaaccaatt
actgtaattaattccggtgctcaagatgctattcaagcatcaattggtggagctgcaagt
gcatttaacgcaactacaactaattttggtgggaacgctggcgctgatgcaatgagtttt
gaattaacactagcaggtgcggagtctggtaatggaacagtcgagattgctttaaccact
gacatccagagtgttgatgcattattagcagatattaatgatgaattaacagccagtgga
gtgggaataactgcccaatctaattcagcaggtgatgggattgaattcgttgctaataac
ggcggtgatgcagaaataacaataggtgaattaaacacagggtataatggggcagctgtt
ggttcgaccacagcagggttatctgcagcactaggtatgaatattgaccctacagctgat
actgctagtatagatttggcagcatctggtggtactggccaagatttaagtgctggagca
gttacatttgatatatcccttgcagatttcaatggtgatgaagtttctagcgcctcaata
tcactaagcggtgattatactcaggctggtaatggcggtagccttgcagatgctcaacaa
gcattaatagatgatttaaactcccaattatcctcacaaggggcaggcataacagttaca
tcagatggcaccacaggttttggtactgataaattaatttttacatcagatactactgaa
tctgacttagtaatgactttagataactttgccaatacttcgggggtttcaaatgcaaac
gtagataccatgttaggtaccggtaatgctgtagcaacacctggggcattagatagtgat
ctttcatcagcaaatactggcggcggtgctatttcccgtacagctggtacggacgggatt
gttagctcaaattcattaagtcacgcttctactcatgcaacattaggtaatagcactaca
gttgctggtgaaaatgaagtttcaattaacaatacactttcattctcagttgatggtggt
gaagtagaagaaatcacattggatgcagccacttatgcagatacagatgcattagttgat
gaaataaatgacaaattaggtgattcaaccaatcttcaaggtgctacagcttacaacgaa
gatggagctgtagttattcgctctaacaacacagcaaactcaggcagtatttccgcaatt
ggcgggacggcggctgacgacttagggttagatgctgttaacggtacagctgtggataaa
gagttaggtgttaaatccctagaagctggtgacttagttataaacgatgtagctatttct
gctgctaaaaactcttacgacaccgcgtcgttcgatggtgcagacacttccgttaaaagt
gcgtcaggtattgcaatagccgaagcaataaatcgatcaagcgaggctacaggtgtgact
gctgaagtaaatgcaacttcagttgtaggtggagacgcatcgggctcaaccaactatggg
tctggtgatgctggtaacatccatattaatggtgttgatttaggcactattacactaact
ggtaatcaagaagatgaccgtagaaccgcagttgacatgatcaatgacaaagcaggtcaa
acaggcgtttcagctactgataatggggtatctatttcattaatggcagcagatggacgt
aacctttcagttgcaattgataacaagtcggcatcaaattctggtagtggtgacgataaa
ggcattggttttggtgcggcaataggtttagatgcatctgttgacggaattggtgaaggt
gatatcacaggtgatgatagtaaaacaactaacaacacttatgagacagcttattcaaca
attaaactaagttcagctgggtcaattgatatcaaaggtggtctaaacggcaacgatgca
attgaaaaactaggccttgaaaccggcgaattcggtggcgcaactgacggtcaattcgta
aaagacattgacatatcaaccctagaaggtgcaaatgcggcaatttcagcattagataac
gcacttgaaaaagtggccagcgaacgagcaaacttaggtgcgatgcaaaaccgcatggaa
acaacggtaagtaacttagcgatcacttctgaaaacttaacggcctctaactctcgaatt
cgagatgcggatttcgcgacagagtcagcagagttgtctcgtacacaggttcttcaacaa
gcaggtatctcaattcttgctcaggcgaaccaacgtggtcaacaagtattatcacttctt
ggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
