Mycoplasmopsis meleagridis: NCTC10153_00399
Help
Entry
NCTC10153_00399 CDS
T07139
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mmel
Mycoplasmopsis meleagridis
Pathway
mmel03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmel00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
NCTC10153_00399 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mmel03021
]
NCTC10153_00399 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mmel03400
]
NCTC10153_00399 (rpoC)
Enzymes [BR:
mmel01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
NCTC10153_00399 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
mmel03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
NCTC10153_00399 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mmel03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
NCTC10153_00399 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
ColG_sub
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEU77598
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(475425..479969)
Genome browser
AA seq
1514 aa
AA seq
DB search
MSNFMERKIYGRNAIEKITLSLATQKDVLEWSHGEVTKPETINYKSYKPEKEGLFDELIF
GPTTDYKCPICGTKYKKSDENSECNKSELCKKYKPTILPKISRRSRMGHIHLVNPVVHFW
FFKIDHSIISKLLGLRVAKTNRPVAKADLEKLIYYKSHIVLETGGLESLKKNSIIDISDA
AIVYQEALYELKSKLDINDPDYQEKFETISETLEELQLFATSKVGKDYGVDFYEYNEIIE
EFSDAKISTGSRAIEYLLKNLNLQEELEKVNSEINAINFQIQDNPNSNKLQERSKLYKRL
NVINAFINSGQNPLDMLIYDLPVLPADLRPLIQLDGGRHSTSDINELYRRIIIRNNRLKK
WDEDDAPMLIKQNEYRMIQEAVDSLIDNARKKPTPVSSKDGRPLKSISDALTGKKGRFRQ
NLLGKRVDYSGRSVIVVGPELKMHQVGIPREMAAKLFEPWIIKELIKGNNNINSIKAGKK
AVENLDPIIWPYVEKAIEGRPVLLNRAPTLHRLSIQAFEPVLIRGKAIKLHPLTCTPFNA
DFDGDQMAVHVPISDEAVREARELMLASKNILGPKDGEPIINPGQDIILGLYYLTMENKN
ATGTGSYFSSFDEMMIAYENKKVHLHTRVVLPIEAVKKIYLNYSPKKKYIVSTVGKFIFN
NAFPNSFEFIFGKFVNENGKEIVHTSKNIDEFDRYLLPYGANFKEEIDKMPINLALTKKD
IANIVRRIYNDYVAVVNIENISNVINDINEIIQFNKLPEKLSELKDYKGQNLNGAHTQIL
AQIIKEEYKVINERFKQTYKKHNRSSWTVNEYTKLLDKVWFRYTNLVANILDTIKELGYY
YSTISGTTIAVSDVLTHPETKRRIASGDEYIAKLRDYFYRGWITDDERYSLTIAKWSEIK
DTIEKDLKSLTKEKPHNPLFMMFTSGARGNSSNFVQLAGMRGLMNNNTKILKADAENERV
VRSTVEIPVKSSFLDGLTAYEFYSSTHGARKGLTDTALNTAKSGYLTRRLVDVAQSIVVK
EENCGTDYGFEVKDIMDTKTNTIIESLAERIEGRFANKIIIHPLTGEVIVNDNQLITPEI
AQKIINAGIKSVEIRSVLSCYTRNGVCKKCYGKDLALNRVVNIGEAVGVVAAQSIGEPGT
QLTMRTFLTGGVAGVEDITGGFGRLMELIDAYDSPWGKPAIIADKYAKVIKIERLNNVTS
NNANNLRIHLEFEDAQKQKVIEFIDTRSNRRLRVKEGQEVVPGQKIIEGPIILNELLKVA
DTRAVQNYLLKEIQRLYRLQGITISDKYIEIIIRQLLSKIIIIEPGDSQFHAGSLVDIFA
YQKESARLIKEGKKPPFGEVKIKGAKKSPLLSDSFLASASYQETPKILVNASIAKRQDRL
EGLKENIILGRKIPAGTNSAYEDGGKYDIRDSKSYFPNKYDPELDNAQSLDEFNKEFEDE
INSALNNFALDLPFDEQTTEEEMKEIFKQNYFPNEKDDSEEELDLDDFDFDDNEEIDFED
LVNNTESDDSEEEW
NT seq
4545 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaattttatggaaagaaaaatttatggtagaaatgctatagaaaaaattactttg
tcattagctactcaaaaagatgtccttgaatgatcacatggtgaagtaacaaaaccagaa
acaattaattacaaaagttataaacccgaaaaagaaggtctttttgatgaattaattttt
ggtccaactactgattataagtgtcctatttgtggaacaaaatataagaaaagcgacgaa
aattcagaatgtaataaatctgagttatgtaaaaaatataaaccaactattttgcctaaa
atttctcgtcgtagcagaatgggacatattcatttggtaaatcctgttgtacatttttga
ttctttaaaattgatcattcgattatttccaaattattaggtttaagagtcgcaaaaact
aatcgtcctgttgctaaagcagatttagaaaaattaatttattacaaaagccatattgtt
ttggaaactggaggattagagtcgttaaagaaaaatagtatcattgatatttcagatgct
gctattgtttatcaagaagcattatatgaattaaaaagtaaattagacattaatgatcca
gattatcaagaaaaatttgaaactattagcgaaactttagaagaattacaactctttgct
acttctaaagtaggtaaagattatggtgttgatttttacgaatataatgaaattattgaa
gaatttagtgatgctaaaattagtactggatcgagagcaattgaatacttacttaaaaat
ttgaacttgcaggaagaattagaaaaggtaaatagtgaaattaatgctataaattttcaa
attcaagataatcctaattctaataaattacaagaaagatcaaaattatataagagatta
aacgttattaatgcttttattaattctggtcaaaatcctcttgatatgttgatttatgat
ttgcccgttttaccggctgatttgagacctttaattcaattagatggcggtagacattct
acaagcgatattaatgaactttatagaagaataataattagaaataatcgtcttaaaaaa
tgagatgaagatgatgctcctatgcttattaaacaaaatgagtatagaatgatacaagaa
gcagttgattctttaattgataatgctagaaaaaaacctactccagtttcttcaaaagat
ggacgtcctttaaaatccatttcggacgctttgacaggtaaaaaaggaagatttcgtcaa
aatttattaggtaaacgtgttgattattctggtcgttcagttattgtggttggtccagaa
ttaaaaatgcaccaagtaggtattcctagagaaatggcagctaaattatttgagccatga
attataaaagaattaattaaagggaataataatattaattctattaaggcgggaaaaaag
gctgttgaaaatttagacccaattatttgaccttatgtagaaaaagctattgaaggaaga
ccggttttattaaatcgtgctcctacattgcaccgtttatcaattcaagcttttgaacct
gttttaataagaggtaaagcaattaaattgcatcctttaacatgtactccttttaatgct
gattttgatggtgatcaaatggctgttcatgttccaataagtgatgaagcagtaagagag
gctagagaattaatgctagcttcaaaaaatattcttggaccaaaagatggcgaaccaatt
atcaatccaggacaagatattattttaggtctttactatctaacaatggaaaataaaaat
gctactggtacaggatcatatttttcttcatttgacgaaatgatgatcgcttatgaaaat
aaaaaagtgcatttacatacgagagtagtattaccaattgaagctgttaaaaaaatttat
ttaaattattcacctaagaaaaaatatattgtttcaactgtcggcaaattcatttttaat
aatgcttttccaaatagttttgaatttatctttggcaaatttgtaaatgaaaatggtaaa
gaaatagttcacacatctaaaaacattgatgaatttgatagatatttattaccttatgga
gctaattttaaagaagaaattgataaaatgcctatcaatcttgctttaactaaaaaagat
attgcaaatattgtaagacgtatttacaacgattacgtagctgttgttaatatcgaaaat
atttcaaacgttattaatgacataaatgaaataattcaatttaataaattgcctgaaaaa
ttatctgaattaaaagattataaaggacaaaatttaaatggtgctcatactcaaatcctt
gcacaaattattaaagaagaatataaagtaattaacgaaagatttaaacaaacatataaa
aaacataatagaagtagttgaacggttaacgaatatactaaattattagacaaagtttga
tttagatatactaatttagtagctaatatactagatacaattaaagaattaggttactac
tattcaactatttctggtactacaatagctgttagtgatgttttaactcaccctgaaact
aaaagaagaattgcttcaggcgatgaatatattgctaagcttagagattatttctataga
ggttgaattaccgatgatgaaagatattctctaacaattgcaaaatgaagcgaaattaaa
gatacaatagaaaaagatcttaaatctttaactaaagaaaaacctcataacccattgttc
atgatgtttacttcgggagctagaggtaattcatctaactttgttcaattagccggaatg
cgtggtttgatgaataataatacaaaaattttaaaagccgacgcagaaaatgaaagagtt
gttcgttcaactgtagaaattcctgttaaatcatcatttttggatggtcttactgcttat
gaattctattcatctactcatggtgctcgtaaagggttaactgatactgcacttaatact
gctaaatcagggtatttgacacgtcgtttagttgatgttgctcaaagcattgttgttaaa
gaagaaaattgtggaactgactatggttttgaagttaaagatataatggatactaaaaca
aataccattattgaaagtttagctgaaagaattgagggacgttttgctaataagataata
attcatcctctaactggagaagttattgtaaatgataaccaattaattacacctgaaata
gctcaaaaaatcattaatgctggtattaagtcggtagaaattagatcagtattatcatgt
tatactcgtaatggagtatgtaaaaaatgttacggtaaagacttggcattaaatcgtgtc
gttaatattggtgaagctgttggagttgtagctgcacaatcgattggcgaacctggtacg
caacttactatgcgtactttcctcaccggaggtgttgctggagtagaggatattacaggt
ggttttggtcgtttaatggaattaattgacgcttacgattctccttgaggaaaacctgca
ataattgcagataaatacgctaaagttataaaaattgaaagattaaataacgtaacttct
aataatgcaaataatttacgtatccatttagaatttgaagatgcacaaaaacaaaaagta
attgaatttatagatactagatcaaatagacgtttaagagttaaagaaggacaagaagtt
gttcccggacaaaaaattattgagggaccaattattttaaatgaattacttaaagttgct
gatactagagctgttcaaaattacttgctaaaagaaattcaaagattatatcgtcttcaa
ggtattactataagtgataaatatattgaaattataattagacaattactttcaaaaatt
attattattgaaccaggcgattcacaatttcatgcaggatcattggtagatatttttgct
tatcaaaaggaaagtgctagattaataaaagaaggtaaaaaacctccttttggtgaagta
aaaatcaaaggagctaaaaaatcacctttattatcagattcatttttagcttctgcttcg
tatcaagaaacacctaaaattcttgttaatgcttctattgctaaaagacaagatcgttta
gaaggattaaaggaaaatattattttaggaagaaaaataccagcaggaactaattcagca
tacgaagatggaggtaaatatgatattagggattctaaatcatatttcccaaataaatat
gatcctgaattagacaatgctcaatctttagacgaattcaataaggaatttgaagatgaa
atcaattctgctttaaataattttgctctagatcttccttttgatgaacaaactactgaa
gaggaaatgaaagaaatttttaaacaaaattattttcctaatgaaaaagacgattcagaa
gaagaattagatttagatgactttgattttgatgataatgaagaaattgattttgaagat
ttagttaataatacagaatcagatgattcagaagaagaatgataa
DBGET
integrated database retrieval system
