Mercenaria mercenaria (northern quahog): 123523264
Help
Entry
123523264 CDS
T07835
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
mmer
Mercenaria mercenaria (northern quahog)
Pathway
mmer04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmer00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
123523264
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
mmer00536
]
123523264
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
mmer00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
123523264
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
hEGF
EGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Cwf_Cwc_15
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123523264
NCBI-ProteinID:
XP_053406221
LinkDB
All DBs
Position
8:78899402..78992015
Genome browser
AA seq
2855 aa
AA seq
DB search
MAFHLCVKSVNALLLIFILFNGLTDARRRRERQYQNDGVSSTRSNYRNSLKGANVCGSSR
QRHCCRGWTANPGSRRCIVPVCSAGCGSGGMCMRPGLCLCVTGQISPYCGSKSSGGTSSL
CNPPCKNGGICVARNLCRCPSGFSGGSCDNDLRTGPCYTQLSNNMCRGQIPGVSCTKHLC
CSTLGMAWGDPCEQCPATPHPCKRGYILNPQKNTCQDIDECTAIPGLCVSGNCMNTVGSY
VCRCQEGQTENRITGVCEDINECLTQRDICGAGRCTNTEGSYFCTCQPGYELTEDRSRCI
AVRRKYCYTRVISGRCSNALSTQQSLTDCCCGAGKGWGEDDLCQPCPDKGTDAYVKLCQR
PEPHTRMCAFLPNLCKNGRCVDTTYSYRCECYQGYRISDDGSECLDVDECRTQSGLCLNG
ECINLPGSYECQCREGFVLAPGGRYCTDMNECAEKNMCPNGVCINMDGTYKCQCNRGFKQ
SANQQVCTDIDECTENGRVCLNGQCLNTPGSFRCICNEGYRLSPDGAFCLDDDECQTSGM
CANGMCKNLRGSYKCICNSGFILAPGGDVCIDIDECSSQPGICVNGECINNQGSFRCRCS
QGFTLGPDRRTCLDTKKDLCFMQYSRGECSSPSGMLATKSQCCCMVDSMDPPGIAWGRDC
ERCLSMSDPGYKILCPNGPGTDHNGGDINYCAMRRDLCENGACENIPRGYRCRCDVGYRP
DSSERRCLDVQECLENTRLCEGGQCRNTPGSYHCICPDGTRLNAANQMCEDIDECASSPC
IDGTCQNIAGSFRCNCDHGYTLDSTGKICIDARKGWCWMEIRNGECEANVKQRMTKSECC
STVGKGWGSPCQECAVTPSSPCRPGYTFTFEGCKDVNECVLFPGLCKGGGTCVNTEGSFT
CQCPAGMELDATGKICLDKRKSSCYLEYSRGRCHQGMEGMFTRSMCCCSVGKAWSQQCEP
CPVKGSVEYEALCIDGGMIIGPDFPVDINECQDIPGICVNGDCRNTLGSFTCTCNPGFAL
DARGLNCTDIDECRISYGICENGVCVNTPGAFRCECNQGYMAVMMDQMCMDVNECTENPS
LCRGGTCINEQGDYRCQCPDGLELSTDGTECHDVDECSASSSICSHGYCENFMGGYQCTC
SQGFRPNTLRTTCLDIDECSERNGGCQSLCINSPGSFTCGCEMGFILQPDGRSCQDFDEC
RDDSETCNGGKCTNIPGGYRCTCVGGLRPSEDLKQCIDVDECSERRKVCESGLCENTHGS
YRCLCDNGYAVQNLSNTCTDIDECKTGEDLCAEDAYCYNTQGTYKCDCKAGFEGDGFSCR
DINECRRGRVCAAEAVCIDVPGSFSCVCGEGFTGDGFRCQDIDECTLNPDLCEHGRCYNI
PGSFRCTCDMGFALTEDEKACEDINECVMFPNLCVNGVCENLDGSFQCNCRQGYKPDATG
GNCTDINECDNPENCLYGNCINSIGSYTCECPPNFVLNPSGTGCIDDRRGFCYLDVRQQR
RSGRCSKVIANDVTRATCCCSVGKGWGELSGYCDLCPRNGTREYRTLCIAETGFGPDPDT
LLPEDIDECRDFIGVCKNGECLNTFGSYTCICPDGYRLDEDILECIDIDECAEFPDFCDP
GRCVNSPGNFSCLCPDGYMPMPGEGCMDMRKDICYAAVFNGTSRGYPPRCEHELSSQVTK
RQCCCKDSIGQGWGTPCEPCPVKNSREYLELCKPLPIREDTNECAIYQFLCENGRCIDTD
TGEGYLCECGQGFVYNRISKRCDDVDECRSRRNPCQGNAVCINTVGSYRCDCIPGYKLSA
SGRRCSDIDECEEVAGICTNGDCVNLDGSFSCRCKQGFRLASSRNACLDVDECTLQPGLC
RNGTCENKIGSYECHCNPGFKLSVNQDCEDIDECENYIGICMNARCLNTQGSFLCECLPG
YTHSSDRMNCRDIDECSEISGICRNGFCTNNDGSYQCTCFDGYTLTSNGESCRDVNECRT
IPGVCSNGRCINEEGTFRCQCPSGYVLSEDGRSCIDLRRGNCYRVFERGLCQDPIPVNMT
KYQCCCTTGAAWSHIGSEFCEVCPIKGEAGFEDLCDDMGRGKGPSGDEDLNECMLDPELC
LNGKCVNTDGSYRCECLPGYGLDSTGRICVDHDECETRDMCGNGTCTNSVGSFTCTCNAG
FEPGQQEICEDINECDGPLNQCAFRCFNTKGSFKCICPMGYQVASDGIHCEDVDECSTPA
NICRYACKNLIGTFMCICPEGYRETGRDQCTDIDECREQPNVCQPGRCLNTQGGYRCDCP
RGYRPSTDGKQCLDYREDYCYMELVSGRCRPTRDTPRSTHASCCCAGAKAWGRRCEICPR
PGTAEYKSLCPRGGGYDPDGGDIDECRMFPNLCVNGRCLNTAGSYRCVCMQGYKADSVTG
QCVDTDECAEGGACDHVCQNMIGSYRCTCRQGYILNMDGKTCRDIDECATGQHNCPHECT
NTEGGFDCGCPEGYTQDRNKQCIDIDECAEQRHLCAPGGQCRNTKGGYMCVCNRGYKLDS
TGQKCIDIDECEDGQCENLCENSAGGYYCGCPEGYTEYYAQCVEIDVCTTSPCVFECVPT
GKEFMCACPPGYQMIGEGHCIQTISPADYSSMFPPGVELPHDTSLGTGELPEGEGCYSCN
VGDVPLEVPLAKRNKRSIIGSGAERIINIEELTEWQDDDDDDDDDDDDDSYEALLKRSGE
VVIEDIRRRPYKFRPRLLKIVKREAIRQKGNQLRRHRTRKHQSLRDEPSVDIQKSVPVFL
NLTDVSRKTKLIKMLPALAALQGNVDYRITNREDKLFFLKEKKGINSLHARRKKLHKGMS
YHVDIEAIPIHEEQSVNGHEMFLGKSVFRFYIYVL
NT seq
8568 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcattccatttatgtgttaagagtgtaaatgctttgcttttgatatttatactgttc
aatggactgacggacgcccgacgacggcgggaaaggcaatatcagaacgacggtgttagc
tccactcgatctaattatcggaattctctcaaaggggcaaatgtgtgtggaagttcgaga
cagcggcattgttgtcgaggatggactgcaaatcctggcagcagaaggtgcattgtgcct
gtttgcagtgcaggctgtggtagcggtggcatgtgtatgagacccggcctgtgtctgtgc
gttactggtcagatatcaccatactgtggctcaaaatcatcaggaggaacatcatctctg
tgcaatcccccttgtaaaaatggtggtatctgtgtggctcgcaatctgtgcagatgtcct
tccggcttctctggcggctcctgtgataacgatttaaggactggtccatgttatactcag
ctgtcaaacaacatgtgccgaggtcagattcctggtgtcagttgtaccaagcatttatgc
tgctccaccctgggaatggcttggggtgacccgtgtgagcagtgcccagcgacaccacat
ccttgcaagaggggatacattcttaatccacagaaaaatacatgccaagatatagacgaa
tgcacagccatccccggactctgtgtctccggtaattgtatgaacacagtcggttcgtac
gtctgccggtgtcaggagggtcaaacagagaaccgaattaccggagtatgtgaagatatc
aacgagtgtttaacacaaagggacatctgtggggccggtcgttgcacgaatactgaaggt
agttatttctgcacgtgccaaccaggatacgaactcacagaagacagatctaggtgcatc
gctgtcagaagaaagtactgctatacccgtgtgataagtggacgatgttcaaacgcacta
tccacccagcagtccctaaccgattgttgttgtggtgctggcaagggatggggagaagac
gatctctgtcagccatgtccggacaaaggcacagatgcgtatgtaaaactttgccaaaga
ccggagcctcacaccagaatgtgtgcatttttgccaaacctttgcaagaatggacgctgc
gtggacacaacctattcctaccgctgtgagtgctaccaaggttacagaatttctgacgac
ggctcggaatgtctagatgtagacgaatgtcgaacacaatcaggactttgtttgaatggt
gaatgcatcaacttgcccggaagttacgaatgtcagtgtagagagggatttgttcttgct
ccgggtggcagatactgtacagatatgaatgaatgtgcagagaagaacatgtgtccaaac
ggagtgtgtattaatatggatggcacctacaaatgtcagtgtaaccgaggcttcaaacag
tccgctaatcaacaagtctgcacagacatagacgagtgcacagagaatggacgtgtgtgt
ctgaatggacagtgtttgaatacaccgggaagttttagatgtatttgtaatgaaggatac
agactttcaccagatggcgctttctgtcttgatgacgatgaatgccagacttcaggaatg
tgtgctaatggcatgtgtaaaaatctccggggcagctacaaatgtatctgtaattctgga
tttatcctagcaccaggtggcgatgtctgtatagatattgatgagtgtagcagccagcca
gggatctgtgtgaatggagaatgcatcaacaaccagggaagttttagatgtaggtgctca
caaggatttactctgggaccagacagaagaacatgcttggatacaaaaaaagatttatgt
ttcatgcagtacagccgaggtgaatgtagcagcccatcaggcatgctagcgacaaagtca
cagtgttgctgtatggtggattccatggacccaccgggtatagcctggggacgggactgt
gaacgctgtctgtcaatgtcagaccctggatacaaaattctgtgtcccaatggaccagga
actgatcataacggaggagatataaattattgtgccatgagacgagatctgtgtgagaat
ggagcatgtgagaatatacctcgtggatatagatgtagatgtgatgttgggtaccgtcca
gactcttcagagaggagatgccttgatgtacaggagtgtctggagaacactcgtctatgt
gaaggtggtcagtgcaggaatactcctggttcctaccattgtatttgcccagatggtacc
aggcttaatgcagcaaatcaaatgtgtgaagatatagacgagtgtgcatcctccccctgt
atagatggtacatgtcaaaatatagccggaagctttaggtgtaactgtgaccatggttac
acgctggattccaccggaaaaatctgtatagatgcaagaaagggttggtgttggatggag
atcaggaatggagaatgtgaggctaatgtaaaacagagaatgaccaagtctgagtgctgt
agtacagttggtaaggggtggggcagtccgtgtcaggaatgtgcagtgacaccatcttca
ccctgtcgtcctggatatacattcacttttgaaggctgtaaagatgtgaatgagtgcgta
ttgttcccgggcctgtgtaagggagggggtacttgtgtgaacactgaggggtcatttacc
tgtcagtgccctgctggaatggagttagatgctacaggcaaaatttgtttagacaaaaga
aaatccagttgttatctagagtacagtcgtggtagatgtcatcaaggaatggagggtatg
tttacccgctcaatgtgctgctgttcagtgggaaaagcctggagccagcagtgtgaacca
tgccctgtgaaaggctctgttgaatatgaagcactatgtattgatggtggaatgattatt
gggcctgatttccctgttgatatcaatgagtgtcaagatatacctggtatttgtgtgaat
ggtgactgccgcaacactcttggtagttttacatgtacttgtaacccgggatttgctctt
gatgcaaggggacttaactgtacagatattgatgaatgtagaatctcctacgggatctgt
gaaaatggtgtatgtgtcaatactccaggagcattccgctgtgaatgtaaccaaggttac
atggctgtcatgatggaccagatgtgtatggatgtaaatgagtgtacagagaacccttca
ttgtgtcgtggagggacgtgcatcaatgagcaaggtgattacagatgtcagtgtcctgat
gggcttgaactctcaacagacggcacagagtgtcatgatgtggatgaatgttccgccagc
agcagtatctgttcccatggttactgtgagaatttcatgggtggttaccagtgtacatgt
agtcagggtttcagaccaaatactctgagaactacttgtcttgatatagatgaatgctcg
gagcggaatggaggttgtcaatcgctgtgtatcaattcacctggaagctttacatgtgga
tgtgagatgggatttatacttcagcctgatggacgatcctgtcaagattttgatgaatgc
agggatgactcagagacttgcaatggtggaaaatgtaccaatataccagggggatacaga
tgtacatgtgttggcggtctgaggccttcagaggatctcaaacagtgtattgatgtggat
gagtgttcagagagaaggaaggtatgtgaaagtggactatgtgagaacacacatggatca
tacagatgtttatgtgataacggatatgctgtacagaacttgtctaacacgtgtacagac
atagatgaatgtaagacaggggaagatctctgtgctgaagatgcatactgttataacaca
cagggaacatataaatgtgactgtaaagctggttttgaaggtgatggattctcctgtaga
gatatcaatgagtgtagaagaggccgggtatgtgcagcagaggccgtgtgtattgatgtt
cctggtagtttctcttgtgtctgtggtgaaggttttacaggcgatggatttagatgtcaa
gatatagatgaatgtacgttaaaccctgacctgtgtgaacatggtagatgttacaatata
ccaggcagtttcagatgtacatgtgacatgggctttgccctcactgaagacgagaaagca
tgcgaagatatcaacgagtgtgtgatgttccctaacttgtgtgtgaatggtgtatgtgag
aacctagatggatcattccagtgcaactgcagacaggggtacaagccagatgctacagga
ggaaactgcacagatataaatgaatgtgataacccagagaattgtctgtatgggaactgt
ataaacagtataggaagttatacctgtgaatgtccaccaaactttgttctgaacccgtca
gggacaggatgtatagatgataggcgtggtttttgttaccttgatgtaagacagcagaga
cgatctggacgatgtagcaaggtgatagcaaatgatgttacccgggcaacatgttgttgt
tcagttggtaaaggctggggagagttaagtggatactgtgatctctgtccaagaaatggt
acaagggaatacaggactttgtgtatagcagaaactggttttggtcctgaccctgacaca
cttctacctgaagatattgatgagtgtagggattttattggtgtgtgtaagaatggagaa
tgtttgaacacatttggaagttacacatgtatatgtcctgatggctacagactggatgag
gatatacttgaatgtatagacatagatgagtgtgcagagttcccagacttttgtgaccca
ggtagatgtgtgaacagccctggtaacttctcttgtctctgtcctgatggttatatgcca
atgcctggagaaggatgcatggatatgaggaaggatatatgctatgcagcagtgttcaac
ggtaccagccgaggctatcctcccagatgtgagcatgagttatcgtctcaggtgaccaag
agacagtgttgctgtaaagatagcattggtcagggttgggggacaccatgtgagccatgt
cctgtgaagaactcccgtgaatacttggaactgtgtaaaccattacctatcagagaggac
acaaatgagtgtgctatatatcagttcctgtgtgagaatggtcgctgtatagatacagac
acaggggaggggtatctgtgtgaatgtggacagggatttgtctataacaggatcagcaaa
agatgtgatgatgtggatgagtgtagaagtagaagaaatccgtgccaaggaaatgctgtg
tgtataaatacagtgggcagctacaggtgtgactgtattccagggtataaactctcagca
agtggaagaagatgttcagatatagatgagtgtgaggaagtggctggtatatgtacaaac
ggagactgtgtcaacctagatggtagtttcagttgtcgttgcaagcagggtttccgactt
gcatcttccagaaatgcttgtttagatgtagacgagtgtacgttacagccaggattatgt
aggaatggtacatgtgagaacaagattggaagttacgaatgtcactgtaacccaggattc
aaactgtcagttaatcaggattgtgaagatatagatgaatgtgagaattacataggtata
tgtatgaatgcacgttgcttgaacacacaaggcagttttctgtgtgaatgtttgccaggg
tatacacattcttcagacaggatgaattgtagagatatagacgagtgttctgagatctca
ggtatatgtagaaacggattttgtacaaacaatgatggctcctaccagtgtacctgtttt
gatggatatacattgacatctaatggtgaatcttgcagagatgtgaatgagtgtcgtaca
atacctggagtatgttctaacggtagatgtataaatgaggaaggcactttcagatgtcag
tgcccttcaggatatgtcctctcagaagatggaagaagctgtattgatttacgacgagga
aattgttaccgggtgtttgagaggggtctgtgccaggaccctattcctgtcaacatgaca
aagtatcagtgctgctgtacgactggtgcagcatggtcacatattggctctgagttctgt
gaggtttgtcctatcaaaggagaagctggttttgaagacttgtgtgatgatatgggaaga
gggaagggtccaagtggagatgaagatttgaatgaatgtatgttggatcccgagttatgt
ttgaatggtaaatgtgtgaatacagatggctcatatagatgtgaatgtttacctggctat
ggtctagattctactggtcgtatctgtgttgaccatgatgaatgtgagactcgagatatg
tgtggaaatggaacatgcaccaactctgtgggcagctttacgtgcacctgtaatgcagga
tttgagcccggacaacaggaaatatgtgaagacatcaatgagtgtgatggaccactgaat
cagtgtgcattcagatgcttcaatactaaaggatcttttaaatgtatttgtccaatgggt
taccaggtggcttcagatggcatacattgtgaagatgtagatgagtgttcaacacctgct
aatatatgtcgctatgcctgtaagaatttgattggtacatttatgtgtatatgtccagag
ggctacagggagactggcagagaccagtgtactgacatagacgaatgcagggagcaacca
aacgtatgtcagccaggacgatgtttaaatactcagggtggttacaggtgtgattgtccc
cgaggttacaggccaagtactgacggcaaacagtgtcttgattacagggaagactactgc
tatatggagctggtatctggacgttgtagacccactagggatacaccacgatctacacac
gctagctgttgctgtgctggggcaaaagcttgggggagaagatgtgaaatttgtcctcga
ccaggaactgctgagtacaaaagtttgtgtcctagaggtggtggctatgacccagatgga
ggagatattgacgagtgtcgtatgtttccaaacctatgtgtgaatgggcgatgtctgaat
actgctggctcctacagatgtgtgtgtatgcaaggctacaaagctgacagtgtaactgga
caatgtgttgatactgatgagtgtgcagaaggcggggcttgtgatcatgtttgccagaat
atgattggttcttacagatgtacctgtcgtcaaggttacattcttaacatggatggaaaa
acatgtagagatattgacgaatgtgcaacagggcaacacaattgtccacatgaatgtaca
aacactgagggagggtttgactgtggatgtcctgagggttacacacaggacagaaataaa
cagtgtatagatatagatgagtgtgcagaacagcgccacctgtgtgcccctggtggacaa
tgtagaaacaccaagggaggctatatgtgtgtgtgtaacagaggttacaaactggattct
acaggacaaaaatgtattgatattgatgagtgtgaagatggacaatgtgagaatctgtgt
gaaaacagtgcaggtggatattactgtggatgccctgagggttacactgaatactatgca
cagtgtgtagaaattgatgtgtgcactacaagcccctgcgtatttgaatgtgtcccaact
ggtaaggagttcatgtgtgcgtgccctccaggatatcagatgataggagaaggtcactgt
atacagacaatctcaccagcagactacagctcaatgtttcctcctggtgtggaactgccc
catgatacctctcttggtacaggagaactaccggaaggcgagggatgctattcttgtaat
gtaggagatgtgccattagaagttcctctggcaaaaagaaacaaacgcagcatcattggc
agtggggcagaacgtatcatcaacatagaggaattgactgaatggcaagatgatgacgat
gatgatgatgatgatgatgatgatgatagctatgaggctttactcaaaagaagcggagaa
gttgttattgaggatataaggagacgtccttataagttcagaccacggctgctgaaaatt
gtcaaacgagaagctatacgccaaaagggaaatcagctaagaagacatagaacacggaaa
caccagagcttgcgggatgaaccctctgtcgatattcagaaatctgtgccagtcttcctg
aacttaaccgatgtcagtcgtaaaacaaaactcataaaaatgctaccagctttagctgca
ctacagggaaatgtagattacagaattaccaaccgtgaggacaagttattctttctgaag
gaaaagaagggaattaactcattgcacgcaagacgtaaaaagttacataaaggaatgtca
taccacgttgatattgaggccatacctattcatgaagagcagtctgttaatggacatgaa
atgtttctagggaaatctgttttcagattttatatatatgtgttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system