Mercenaria mercenaria (northern quahog): 123557965
Help
Entry
123557965 CDS
T07835
Name
(RefSeq) CUB and sushi domain-containing protein 3-like
KO
K24469
sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1
Organism
mmer
Mercenaria mercenaria (northern quahog)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmer00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
mmer04990
]
123557965
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
mmer04990
]
EGF-like domain-containing proteins
hEGF domain-containing proteins
123557965
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sushi
HRM
SIBA-E_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123557965
NCBI-ProteinID:
XP_045205733
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(93255347..93325436)
Genome browser
AA seq
3014 aa
AA seq
DB search
MVQVKLFFVTLFVTCVCVNASHFRGAIFTWTPSEDGSTITISFRISWRRTYAGYWCNDSI
ITNGTLIGGGNLVCSSGCNDTIGSLFYQCTDYSEIDDWSTGRHDITYTVTSTQFSFSFSS
CCWISTLVVGKDGNWNVQASVDLSVRSDTGRINSSPTVEMTPVLNLQHGCSYTVKLPVGD
VDGDIVRCRWATGLTECSDVCNGFIGAVLDEEKCTITYTADKNLGLYAAALQIEDYPNIL
STTALSSIPLQFIARIYAGNNCDDVPEFIQPTPEDNACFALDVGDTYNVTIKARGQRNFH
RITTISAIGMVRSLEIQSKDSSMYYVELNVTWTPTISDSGKDHSLCFYATDNSSITSTMR
CIKLPVSVSGPTPLRVERVGLTNTWIIIIDQTFERPTDHAFIEVFETSTNTKILSVDAST
SSDVVFDPIRRQINVTFQYVFDIEEDYHVSIPSGLVEGYVSCGALSVPVNDSSFWKIEVD
CGELTIANGIVLAPDGTDYPHSVTYMCNIGHDLVGTENRTCTANGTWTESEPYCKPRDCG
NFPELVNGYVSTNSTIYNTTVNFFCITGYEVSGNASMFCDHTPAWSSPPPVCVIIDCGAP
TYLENGNVSALEGTTYQKWATYSCNSGYDLMGSSSRQCLINKIWSDAQPFCSPKDCGLLG
PPVNGNIDMTNTTVGNTVTYSCGIGFILHGDSKRECLHSGFWNGSNPTCKVADCGQLNIP
FQGSVIASGSTYGKTGVFSCNVGYELQGHNFTECQASGSWSNPEPSCSLIDCGELPPIDG
GVYLFNGTTYGEILTAECNVGYDLHGSSLRQCQSSGNWSGSTATCTIKDCGPLQNPVDGS
VLALATSYGTSVTYSCKTGYSLTGGDTRVCQADGFWSGTPPTCQIKDCQTLPPPDNGKIY
IPKTTYGSYALYICDEEYHIVGSNNRRCMSDGIWSDQEPVCELTDCGNLTAPLFGEVTFN
STFYKDQASFICYTGYELIGDDVVTCQSDNTWSGSDHVCVLKDCGFLDSPENGIATATAA
TYGTIETFTCNEGFELIGDDILVCTANGTWNGTVPICLIKDCGDLLPPSNGDIFVNKTTF
GSEALYSCRNGFTLNGVENRTCLSNATWSESDPFCKIKDCGTPSAPENGRVTFYNTTYSS
ECVFSCNTGYYFKGFNLSVCSESGTWNNSGVECIIKDCGNLSLPPNGVLDINSTTYGSAA
LFSCTTGYDLKGDTIRSCTESGYWDNDYPECVIKDCGNLTDPVDGRVSYLKTTYQSTASY
TCAVGYNLVGLNITQCTASGAWSPAQPLCEIVDCGALPAPTNGNNDAIITTYGETVNFTC
DTGYALFGNVVRTCLETGLWSGTMTTCKIKDCGFLAAPEDGTIDISSTVYQSKVVYKCNI
AYDLIGVSSRECLSNGSWSQQAPLCRVKDCGTLHDIENGIVYIPFTTFGSVASYICNKGY
HVVGDVTRLCLADGVWDGETPFCELTVCPEMPPPENGHVDHNSTLFEDEMIFRCDTGYTL
FGKAVVVCQKDGTWSDYEHNCTIKDCGQLLPPTNGTILISSTTYLSTAEFQCNEGYDLNG
DSIFLCRDDGLWNGTTPFCKIRECKRLQAPDHGNVSSDGTEFGSWAIYNCDAGYNLAGSR
NSVCLSDRNWSTNTPKCQIKDCGNPLIPGNGDVDFGNTTFGSVSYYSCIQGYDIIGGNTS
ICTEFGNWSNGDIKCTIKDCGHLSVPPNTRLDADSTTFGSIAFFSCEEGYNLYGNSERHC
SKEGVWNNTSPSCIIKDCGTLTDPENGLVIYNASTYGSVAVYRCDVGYNLTGSNKTECSE
GGFWTDSKPSCPIVDCGPLDHLAYGNIDINVTTYGASVNYSCDVGYDLIGVKSRVCLANG
DWDGYDTYCEIKDCGSLVNPVDGIVSVSSTVYEGIATYNCSVGFDLWGENTRKCSADGIW
DKEPPRCLIKDCGSLSNPVNGEVYVPISTYNAYALYVCYEGYHIRGTHTRKCTPEGLWSK
EKPICEQTDCGNPPSPVNGEVTFNGTVYESEAKYMCYTGYELVGEESIVCEEDEKWSETG
QSCMLTDCGSLEAPEDGDIKGTTSTYQSIVTFSCSEGFDLSGDEKLVCTADGKWNGSTPV
CRIKDCGSLPELQNGKIVFNKTTFGSEANYICDVGYSYMGDFTRICRSNATWSETEPLCQ
IKDCKVPSIPSNGEIYFDNTTYGSVIYYLCDVGYNMKGENVSVCTENGQWNNTETKCVIK
DCGNLSNPENGELLISNTYYGSMANFSCNTGFTLHGYQTRTCLETGNWSNDNPLCVVKDC
GELSGPTNGSVYLPSTTYGAVAVYICDTGYDVFGDVTRVCQEDGIWDGNDPTCELTDCEP
LHYPLNGRVIAESRNFGDIAMYVCDTGYTLVGNDTRECLINTSWSNTEPVCEIKDCGPLT
GPDNGHVVYGSTTYGSKVSVTCDEGYDLTGEYEGICEHTGTWSINISECKIKDCGTLTHP
ENGRVKTEGTVFRSTASVICNTGYTPDIQTLQCSQTGTWDGKPSCIIKDCGSIDAPDHGS
VSYSSTTYKSLAVFECDVGYDLEGVSNKTCQHDGTWTNGSAECKIRSCGYPNTPENGFKS
LESDEYKSVVTFSCATGFNLVGKVELTCLENGTWDGLEPLCNIKDCRDPVPITNGQLQFT
ATTFGSSASYICDIGYIMIGQPTIECSSDGMWQNRPMCKIKKCGELQSPENGKVFMSSNT
YGALAIFSCNDGYWRDGNQLSECLDNSTWSNTETICEIKDCGKPLSPTNGNVSYNNTTYE
SVARFSCNNGYNMNGGNLMRCSSDGLWNGSVPDCIIKACNNIDAPANGDVSITTMSYGAT
AVVSCISGYDLVGETHLKCTENGSWSDEVPSCVIKDCGLVGNLTNGEVSNGSTVYGSVKT
FSCDNGYEMLGSNMSNCLENGSWSDNPPKCNIKTTSASAAAAAYWIIGGSTGFIIFVIAV
SIIAVTVSRVMGKGKQGTSYIADNSINMDDIKLTDNWQHHNGYHGSSFRQSDWRSFSLRM
TPGYLSRTSGIYEA
NT seq
9045 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttcaagtcaaactcttttttgtaactttatttgtgacatgtgtctgtgtgaatgcc
agtcattttagaggcgcaatcttcacctggactccatctgaagacggatctacaataaca
atcagctttcgaatatcatggagaagaacatatgcaggatattggtgtaatgattcaatc
attactaatggtacccttataggagggggaaacctcgtttgttcaagcggttgtaatgac
accattgggtcattattttaccaatgtacagattacagtgaaattgatgactggtcaaca
ggaaggcatgacattacttacacagtcacttctacacagttttctttcagtttttccagc
tgttgctggatcagcactctggttgtaggcaaggatggcaattggaatgtacaggcttca
gttgacctttcagtacgatctgacactgggcgtataaattcatcgcctacagtagagatg
acccctgtattaaatcttcaacatggatgctcctacacagttaaacttccagttggagac
gttgatggggatatagtaagatgtcgctgggcaacaggattaacagaatgctcagatgtt
tgtaatggattcattggtgccgtattagacgaagaaaagtgtacaataacatacacagcg
gacaaaaacctaggtctgtacgcagctgcattacaaatcgaagactatcccaacatacta
tctacgacagcattgagcagtattccgctacaatttatcgcaaggatttacgctggaaat
aactgtgacgacgttccagaatttatacaaccgacccctgaagacaacgcatgctttgca
ctggacgttggtgacacttataatgtaaccattaaagcaagaggtcaacgaaattttcat
agaataacgaccatatctgcaattggaatggtgcgatcactagagatacaatcaaaagat
tcctccatgtattatgttgaattgaatgtcacctggactccaacaattagcgactctgga
aaagaccattctttgtgtttctatgcgacagacaattcaagcataacaagtacgatgcga
tgtataaaactgcctgtctcggtttctggaccgacaccgttaagggttgagcgtgtggga
ctaaccaacacatggataataataatagatcagacgttcgaaagaccaacagatcatgcc
tttatcgaagttttcgaaacttctacaaatacaaaaatactatcagtagatgcttcaaca
tcatctgatgttgtttttgatccaatacgccgccaaatcaatgtaactttccagtatgtt
tttgatattgaggaagattatcacgtatctataccctcaggtcttgtggaaggatatgtc
agctgtggtgcactctctgtcccagtcaacgactccagtttctggaaaatagaagttgat
tgtggagaactaactattgcgaatggaatcgtgttagctccggatggaactgattatcct
cacagtgtgacgtatatgtgtaacataggacatgacctagttggcacggaaaacagaaca
tgtacggctaacggaacctggacagagagcgaaccatattgcaagccaagagattgcgga
aactttccagagctggttaatggatatgtgtcaacaaattcaactatatacaacacgaca
gttaactttttttgtattaccggttacgaagtctctggaaatgcaagcatgttttgtgat
catactccggcttggagctcgccgcctccagtttgtgttataatagactgtggtgcacct
acatatcttgaaaatgggaatgtttctgcgttagaaggcacaacatatcagaagtgggcg
acctattcatgtaattcaggttacgacctaatgggtagcagttcaagacagtgcctaata
aacaaaatatggagcgatgctcagccattctgttcgcctaaagattgtggtttgcttggg
ccaccagtaaatggtaacattgacatgaccaacaccactgtaggaaatacagtcacatat
agctgtggcattggattcattttacatggtgacagtaagagagagtgtctgcatagtggg
ttctggaacggatcaaatccgacatgtaaagtagccgactgtgggcagctgaatatccct
ttccaaggtagcgtcattgctagtggatcgacgtatggtaaaactggcgtattctcttgt
aatgttgggtatgaactccaaggacacaatttcactgaatgtcaagcaagtggatcctgg
tcaaatcctgagccttcttgttcacttattgactgtggagaattgccaccaatagacggt
ggtgtatatttatttaatggaacaacatatggagagatattgacagctgagtgcaatgtt
ggttacgatcttcatggaagtagcttacggcaatgtcaatcttctggaaactggagtgga
tctacggcaacctgtacaataaaagactgtggacctttgcaaaatccagttgacggaagt
gtacttgctctagcgacatcgtacgggacatcagtgacgtattcatgtaaaacaggatat
agtttaactggaggggacacacgcgtatgtcaggctgacggattttggagcggaacaccg
ccaacatgccaaattaaagattgccaaactttaccaccgccagacaatggcaagatatat
atcccaaaaactacttacggctcttatgctttgtatatatgtgatgaagagtaccatatt
gttggatcaaacaatcgcagatgcatgtcagacgggatttggagtgaccaagagcctgtc
tgcgaacttaccgattgtggcaatttaactgcacctttgtttggcgaagtaacattcaat
tcaacattttacaaggatcaagctagtttcatatgttacacgggatacgagttgattggc
gatgatgttgtcacgtgtcagtcagataacacctggtctggtagtgaccatgtttgtgtc
ttaaaagattgtggatttctggactctcctgaaaatggtattgcaacagcgacagctgct
acatatggaaccatagaaacattcacctgcaatgagggatttgaactaattggggacgat
attctcgtgtgtacggccaatgggacgtggaatggtactgttcctatttgcttaataaaa
gactgtggagatctgttaccgccatcaaatggagatatttttgttaacaaaacgaccttc
ggttctgaagcactttattcgtgcagaaatgggttcaccttaaatggagtagaaaatcga
acgtgtcttagcaatgccacatggagtgagtcggaccctttctgcaaaattaaagattgt
ggaactccatcagcaccagaaaatggccgtgtgaccttctacaatacaacatacagttct
gaatgtgtcttttcctgcaacactggctactatttcaaaggatttaacttgtctgtttgc
tctgaaagtggcacttggaataactctggtgtcgaatgcataattaaagattgcggcaat
ttgtctttgccgcctaatggagtattggatataaatagtactacatatggttcagcagcg
ctattctcgtgcacgacagggtatgacttaaaaggggatacaattcgaagctgtacagag
tcaggatattgggataatgattaccctgaatgtgtcattaaagattgtggaaacctcaca
gaccccgttgacggacgggtatcgtatcttaaaacgacatatcaatcaacagctagttac
acgtgtgcggttggctataacttagtcggcctaaacataactcaatgtaccgcttcaggg
gcatggtcaccagcacagcctttgtgtgagatagttgattgtggtgctttgccagcacca
accaatggaaacaacgatgcaatcattactacgtacggagaaaccgtgaactttacttgc
gatacaggatatgctttgtttggcaatgtcgtaagaacctgtttagaaacagggctttgg
agcggcacaatgacaacttgtaaaattaaagattgtggtttcttggccgctccagaggat
ggtactattgacatttcatcaacggtttatcagtcaaaagtggtatataaatgcaacatt
gcatacgaccttatcggtgtatcatcgagagaatgcttgtcaaatggatcatggagccaa
caggcaccactttgtcgggtaaaagactgtggcacattgcatgacattgagaatggtatt
gtttacatcccgtttactacatttggatccgttgcttcttatatatgtaataaagggtat
catgtggttggtgacgttacacgactttgcctggccgacggcgtttgggacggagaaaca
cccttttgtgaattgacagtttgtcctgagatgccaccacctgaaaacggacacgttgac
cacaattcaactctgtttgaagatgagatgatatttagatgtgacactggatatacactt
tttggaaaagcagtagttgtatgtcagaaagatgggacatggtccgattatgagcacaac
tgtactatcaaagactgtggacaattgctaccacctacaaatggaactattctcatatcc
tcaacaacatatctgtcaacagcggaatttcagtgtaatgagggatatgacttgaacggt
gatagcatcttcctttgtcgcgatgatggactttggaatgggaccacaccattctgtaaa
ataagagaatgcaagcgtctacaggcaccagatcacgggaatgtttcatcggatggtaca
gaatttggatcttgggcaatatataattgtgatgcaggttataatttagctggatctcgg
aacagtgtatgccttagtgacaggaattggtctactaatactccaaaatgtcagataaaa
gactgtggtaatccgctgattcctggaaacggtgatgtcgactttgggaacacaactttt
ggatcagttagctattatagttgcatccaaggctatgatattatcggtggtaatacttct
atctgtactgagtttggaaactggagtaacggagacatcaaatgcactattaaagactgt
ggacatctttccgttcctcctaataccagactcgatgctgattcgacaaccttcggctct
atagcgtttttcagttgtgaagaaggttacaatctgtatggaaattcagaaaggcattgc
tcaaaagaaggagtttggaataataccagtccaagctgtatcattaaagactgtggtacc
ctgaccgaccccgagaatggtctcgtgatctacaatgcgtcaacctatggttctgtcgct
gtttaccgctgtgatgttggctataatctgacaggcagcaataaaaccgaatgctctgaa
ggagggttttggactgactccaaaccgtcttgcccgattgttgattgcggacccctcgat
catctagcatatgggaatattgatatcaacgtgacgacatatggtgcaagtgtaaattat
tcttgtgatgttggatacgatctcattggagttaaaagtcgggtttgcttggcgaacggt
gattgggatggttatgatacgtattgtgagattaaggattgtggatcacttgtcaatcct
gtagatggtatcgtgtctgtatcttcaactgtttatgaaggaatcgcaacatacaactgc
agtgtaggattcgacttgtggggtgaaaacacacgtaaatgctctgctgatggtatatgg
gacaaagaacctcccagatgtttaatcaaagattgtggcagcctaagtaatcctgtgaac
ggtgaggtatatgtgcctatttcaacatacaatgcctatgctttgtacgtttgttatgaa
ggttatcacattaggggaacccatacccgtaaatgtacccctgagggtttatggagtaag
gaaaagcccatttgtgaacaaacagattgtggtaatcccccttcaccagtgaatggtgag
gtgacatttaatggaacagtttacgaatccgaagcgaaatacatgtgttacacggggtat
gaactagttggtgaggaatccattgtgtgtgaggaagatgaaaagtggtccgaaactggc
cagtcttgcatgttaacggactgtggttcgctagaagctcctgaagatggggatataaag
ggaactacatctacctatcaatcgattgttacgttttcctgctcggaagggttcgatctc
agtggtgatgaaaaacttgtatgtactgccgatggtaaatggaatggatctactccagtc
tgtagaataaaggactgtggatcgctgcctgaactacaaaacggaaagatagtttttaac
aaaactacgttcggttctgaagcgaattacatatgtgatgtcggctactcttatatgggt
gatttcacccgaatatgtagaagtaatgctacctggagtgaaactgaaccattatgccag
attaaagattgtaaagtaccatcaataccttcaaatggcgaaatatattttgacaatacc
acatatggatcggtaatctactacttgtgtgatgtcggttataacatgaaaggagaaaat
gtttctgtctgtaccgagaatggtcaatggaataatacagaaactaagtgtgttataaaa
gattgtggaaatctttcaaacccagaaaatggagagctgttgataagcaatacatattac
ggctccatggcgaatttctcttgcaacactggatttacacttcatggataccaaacacgc
acatgtcttgagacaggcaactggagcaatgataatcctttgtgcgttgtaaaagactgt
ggtgagctgagtggacctacaaatggttctgtctatttaccttcaactacatacggcgct
gtagcagtatacatatgtgataccggatatgatgtttttggcgatgttacacgagtttgt
caagaagatggtatttgggatgggaatgacccgacttgcgaattgacagattgtgagccg
ctacattatccccttaatggacgagttattgccgagtccagaaatttcggagatattgct
atgtatgtgtgtgatacaggttacacacttgttggtaacgatacgcgggaatgcttaata
aatacatcttggagtaacacggagccagtctgtgaaatcaaagactgcggaccacttact
ggcccagataatggacatgtagtttacggttcaactacctatggatccaaagtatcagta
acatgtgacgaaggatatgatttgacaggcgaatatgaagggatttgtgaacacaccggt
acctggagtataaatatatcagaatgtaaaattaaagactgtggtaccttaacacatcct
gaaaatggtagagtcaaaacagagggaacagttttcaggtcaacagcatctgttatatgc
aatactggatatactcctgacatacaaacacttcaatgctctcagactggtacatgggat
ggtaaacccagctgtatcattaaagattgtggatcaatagacgcaccagatcatgggtca
gtttcctattcaagtacaacttacaaatccctagccgtttttgaatgtgatgttggttat
gatcttgaaggagtttctaataaaacctgccagcatgatggaacatggactaacggatcg
gccgaatgcaaaataagaagctgtggttatccaaacacaccagagaatggattcaaatct
ttagagtctgatgaatataagtcagtcgttactttctcctgtgcaactggttttaatcta
gttggtaaagtagagttaacatgtttggagaatggaacatgggatggattagaacccctt
tgtaatattaaagattgcagagatcccgtgcctataactaacggccaactccagtttact
gcaacaacgtttggatcaagtgcttcatacatttgtgacatcggctacatcatgataggg
cagccaaccatcgaatgctcaagtgacggaatgtggcaaaatcggcccatgtgcaaaatc
aaaaaatgtggggaattgcaatcgccggaaaatggaaaagtttttatgtcttcaaacaca
tatggagcactggcgatcttttcttgtaatgatggatattggcgcgatggaaaccaacta
agtgaatgcctagataattcaacttggtcaaataccgaaacgatatgcgaaataaaagat
tgtggtaaaccgttatcaccaacaaatggtaatgtgtcttataacaataccacctacgaa
tctgttgcgaggttttcctgcaataatggttacaacatgaacggtggaaatttgatgcgt
tgtagctctgatggactttggaatggcagtgtaccggattgtattataaaagcgtgcaac
aacatagatgcgccagcaaatggagatgtatcaattacgacaatgtcatatggagctacc
gctgttgtttcctgtatttccgggtatgacctagtcggagaaacacatctgaaatgcacg
gaaaatggaagttggagtgatgaagttccatcttgtgtaatcaaagattgtgggcttgtt
ggtaatctaacaaatggagaggtgtctaatggaagtacagtttatggatccgttaaaacc
ttttcgtgtgacaatggatatgaaatgttggggtcaaacatgtccaattgtttggagaat
ggatcttggagcgacaaccctcctaagtgcaatataaaaacaacatctgcatctgctgca
gcagcagcatattggatcattggtggaagcacaggttttattattttcgtaatcgctgta
agcataatagcggtgacagtatcaagagtgatgggaaaaggaaaacaggggacaagttat
attgctgacaatagtataaatatggatgacatcaaacttacagataactggcagcatcac
aatgggtaccatggatctagctttcggcaaagtgattggcggagtttttcgttgcggatg
actccaggatatttgtcaagaacatcaggtatctacgaagcctga
DBGET
integrated database retrieval system