KEGG   Mercenaria mercenaria (northern quahog): 123561328
Entry
123561328         CDS       T07835                                 
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2 homolog 1-like
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
mmer  Mercenaria mercenaria (northern quahog)
Pathway
mmer03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmer00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    123561328
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mmer03019]
    123561328
   03041 Spliceosome [BR:mmer03041]
    123561328
Messenger RNA biogenesis [BR:mmer03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     123561328
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     123561328
Spliceosome [BR:mmer03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    123561328
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 RRM_PARP14_3 RRM_3
Other DBs
NCBI-GeneID: 123561328
NCBI-ProteinID: XP_045209559
LinkDB
Position
10:70419721..70612196
AA seq 583 aa
MGFTKMADEKYSDKERFREDSGDRDRDRFRNKRKRHDSDQGEESEKFRKLFIGGLSYDTT
DDELKAYFEKWGDVVDSIVMKETGTQRSRGFGFVTYSESKMLEDCQACRPHVINGRQVDT
KRAMPRNAGGSSGGDGLKESVYKLFVGGIRDITTNDSLREEFSQFGAVKHVELMMDKVTG
RHRGFAFVTYEDFDSVDKAVIKKHLEIDGKMVEVKKAESISSRKNKRDSMDTRMSKGNMG
KSGMGMNNNSSMGNMGGGMGMNNNSMGMGMGNMGMGGNMGMGGNMGMGNMGNSGMGGNMG
NMGNMGMGGNMGNMGMGGNMGMGGNMGMGGNMGMGGNMGNMGMSNMGMGMGMPNYGMGMG
NMGGMGMGNMGMGNMGMGSMQGSGSNPQTTAAVTDGKDKSVTAYSGQSSTGQSGSQQGQT
TGQGQMGQGQMMGNMGGMMGNPMGMMGMMNPMMANQMAMMGMGNYGYGNMMGMGGNSQMQ
GQMPNQMQGQMGNQMSGQMGGQGSGQMAQMQGQMGNPMQGQISAMAGSYGTQQGNTGTDG
KSASSYGMASQAAYGSQNDQGWSGMGDYSGAGSVKSDNTGSQR
NT seq 1752 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgggttttacaaagatggctgacgagaaatacagtgacaaagaaaggttcagggaggac
agtggtgatcgggaccgtgaccgattcaggaacaaaaggaagagacatgatagtgaccag
ggcgaagagtccgaaaagttccgtaaactttttattggaggccttagttatgataccact
gatgatgagttaaaagcttactttgagaaatggggcgatgttgttgattctattgtgatg
aaagagactggaacacagaggtctcggggatttggatttgtaacatacagtgagtcaaag
atgttagaagattgtcaagcatgtcgacctcatgttatcaatggaagacaagtggatact
aaaagagctatgcctcgtaatgctggaggtagttcaggtggtgatggtttgaaagagtca
gtttacaagttatttgttggtggcatcagggatattacaaccaatgactcactacgtgaa
gaattttctcagtttggagcagtaaagcatgtggagctgatgatggataaagtgactgga
cgtcatagagggtttgcctttgtcacttatgaagactttgattctgtggacaaagctgtt
attaagaaacacttagaaatagatggtaagatggttgaagtgaagaaagcagagtccatt
tccagcagaaaaaataaaagagactcaatggacacaagaatgagtaaaggaaacatggga
aagtctggaatgggaatgaataacaatagcagtatgggaaatatgggtggtggcatggga
atgaataacaatagtatgggaatgggaatgggcaatatgggtatgggaggaaatatgggt
atgggtggaaacatgggcatgggtaatatgggaaattctggaatgggaggaaatatgggc
aacatgggaaatatgggaatgggtggaaatatgggtaacatgggtatgggtggcaacatg
ggaatgggtggcaacatgggaatgggtggtaatatgggaatgggtggcaatatgggaaac
atgggtatgagtaatatgggaatgggcatgggaatgccaaattatggcatgggtatgggt
aatatggggggtatgggcatgggtaacatgggcatgggaaatatgggtatgggtagcatg
caaggttcaggaagtaacccacaaacgactgctgctgttacagacggcaaagataaatct
gttacagcatatagtggtcaatcatctacaggtcagtctggtagtcaacaaggtcaaact
actggtcagggtcaaatgggtcaaggtcaaatgatgggcaatatgggtggtatgatggga
aaccctatggggatgatgggaatgatgaatccaatgatggcaaatcagatggccatgatg
ggaatgggtaattatgggtatgggaatatgatggggatgggaggtaacagccagatgcaa
ggccagatgcccaatcaaatgcaaggccagatgggaaatcagatgtctggtcaaatggga
ggtcaaggcagtggtcaaatggcacaaatgcaaggacaaatgggaaatccgatgcaaggg
cagataagtgctatggcaggcagctatggtacacaacaaggcaacactggtactgatgga
aagtctgcttcatcatatggcatggcttctcaggcagcttatggttctcagaatgatcaa
ggatggtctggcatgggtgattattcaggggctggatcagtaaagtcagacaacacagga
agccaaaggtga

DBGET integrated database retrieval system