Mercenaria mercenaria (northern quahog): 123565550
Help
Entry
123565550 CDS
T07835
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1-like
Organism
mmer
Mercenaria mercenaria (northern quahog)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123565550
NCBI-ProteinID:
XP_053406285
LinkDB
All DBs
Position
8:complement(2965447..3044584)
Genome browser
AA seq
1978 aa
AA seq
DB search
MDFSLATGKNSLVLNLTRNDHARLDLIMSDESGEINNDYASRFAVYYSVEQGASLLIECE
ASYCFLHGTIEIKGIQYQIEQDHSSENFQLHTIRRKALPNLDELMKSVGVVSDDGEAYET
PSDAGLSIRKRRSVSAFPDCDIIEVKALVDDTIWDYYKDRYGGDETRALDEIYKYFTSTF
AEVDYRLHCLTDYFTHYDGTCVVKCLRVILVAIEITKTSSWTDGNFKTVSGVTFVKGLDG
LSDCGTLNENMANSQDGWHHLSCFTRENLALYSGSWDNTYRTVAKQNKMCSSNLKYRVAV
HEATGDGVDITVAHALLRTIGARDDASQSCSPNGYFLMREPKADWPENPGFFGQNWYLSD
CTTEDICNYVNGLNPNCMRVRGNLVNETIWKEWEKTPLPGEILSADEQCKVRWGNDSVQC
GDLYPEDMCGQYIRCTSTSHQGCVCKLKVSSETPCGYARVCKKGQCVFIKDVPLGGKCEC
HSQCAGNNTACDPDTGLCVCKEGFFDSNGIDDEGGNCTEKFPLEEECDEDVQCKDPNALC
INGTCKCRPCYYNNNGRCEKQSCLGKSCNVTAQCKGENTVCDPERDICVCETGFFVDDEG
NCVTVNGTICDPCIQQPDSCTQDGTTCSDRGFCECSNNTVEVNGQCFGMDICEPCDPSDS
TCASGLVCSSSTNRCECPPDQVQIGDQCYGTRVAEPCTPVLPTCVDYFAECNGTVCDCKP
GYTWNGSICVGEDPCDPCDPSTPACGTGLVCNPNTYRCECPPDEVQIGDNCFGIDLCDPC
DPETSSCDSSLVCNPDTYRCECPTNQVQIGDICCGSELCEPCDPSANTCNANLVCSSITY
RCECPTNQVQYGDACYGTLVTEVCTTALDTCTDKYADCNGTICDCVDGFTWNGSKCVGEA
ICDPCDPLTPSCDNSLVCNPDTYKCECPPGLVQIGAFCYGTRVTEACTTALDTCIDDDAG
CNGTVCDCLEDFVWNGSICIGNYLCDPCDPSTTSCDSNLVCNPNTYRCECPTDQVQIGDE
CFGISLCDPCDPSTPSCDTSLVCNPNTYRCECPTDQVQIGDECFGISLCDPCDPSTPSCD
TGLECNPNTYRCECPTDQVQIGDECFGLCLCDPCDPSTPSCDTSLVCNPNTYRCECPTDQ
VQIGDECFGISLCDPCDPSTPSCDTGLECNPNTYRCECPSDQVQIGDECFGEDLCDPSDS
TCSSPLVCSSDTYRCECPPGYVQIDGSCYGTLVTEECTTTLDTCVDKYADCNGTICDCIP
GFSWNGSECLGPDLCDPCDPLQSPSSCNSEFVCSSDTYRCECPPTQAQVGDQCVGTRVTE
PCTTTPDTCTDNYAECNGTVCDCEAGFIWNGSYCVGPDLCNPCDPLTLSCDGSLVCSSDT
YRCQCPSNEVQIGNDCYGTRVTEACTNVLDTCIDDNAGCNGTICDCLPGFTWNGLLCVGS
ELCDPCDPHDSTCTSPLVCSSTTDRCECPTGQVQIGDACYGTLVTEPCTTALPTCVDYNA
ECNGTVCDCMPGFTWNGTMCSGEYLCEPCDPSLSTCQSGLVCSSNTYRCECPPDQVQIGD
SCYGTRVTEVCTTANPTCIDNNAECNGTVCDCVDGFYWNGSKCVGENLCEPCDPSSSTCA
APLVCSSSTYRCECPPGQVQVGDECYGRLVTESCTIMPDTCIDDNAGCNGTICDCLMGYV
WNGSKCVGDELCNPCDASTLLCSGQLVCSSDTYRCECPTNQVQIGDACYGTLVTEACTTA
LPTCVDYNAECNGTVCDCIPTFIWNGSICLGPNLWDPCDPSTPSCDSSLVCNPNTYRCEC
PADQVQIGDMCYGLYVTEACTTTLDTCVDDYADCNGTICDCKPGFTWTGSKCVGTDLCDP
CDPSMSTCSTPLVCGNSSNRCECPPDQVQIGEECYGTLVTEPCTTVLDTCIDNFADCNGT
VCDCISGLSWNGSKCVGENLCEPCDPSDSTCSSPLVCSSNTYRCECPPDEVQIGDACC
NT seq
5937 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggactttagtttagcaacagggaaaaatagtttagtactgaatcttacgaggaacgac
cacgctaggctagatttaatcatgtcagatgaaagcggtgaaatcaacaatgactatgct
tctcgtttcgctgtgtattatagcgttgaacaaggggcatctctattgattgaatgtgag
gcaagttactgctttctgcatggtacaatagaaataaagggaatacagtatcagatcgaa
caagatcattcatccgaaaactttcaactacatactatacgaagaaaagcacttcctaac
ctggatgaactgatgaagtcagtcggtgtagtttcggacgatggtgaagcatatgaaacg
ccttcagatgccggtctcagtattagaaaacgacgttcagtgtctgcgtttcctgactgt
gatattattgaagttaaagccttagtagacgacacaatctgggattattacaaagacaga
tacggcggggacgaaacgagagcacttgacgaaatttataaatatttcaccagcactttt
gctgaggtggactataggcttcactgtttaacagactatttcactcattacgatgggaca
tgtgtcgtaaaatgtcttcgagtcattttagttgcgatcgagatcacaaagacttcgtct
tggacggacggcaattttaaaactgtaagtggggtaacatttgttaagggcctggacggg
ttgagtgattgtggcactctcaacgaaaacatggctaacagtcaagacggatggcatcat
ctttcctgctttaccagagaaaacctagccttgtactcgggtagctgggataacacttac
aggactgtggctaaacaaaacaaaatgtgtagcagtaatttaaagtatagagtagcagta
cacgaggcaactggagacggtgttgatataactgttgcccatgcacttctgcgaacaatc
ggggcaagggatgatgcatcgcagtcgtgcagtccaaacggctattttctaatgcgagag
ccaaaggcagactggccggaaaatcccggcttctttggacagaactggtatttgtccgac
tgtacgacagaggacatatgtaattacgtaaacggattaaatcctaattgcatgagagtt
aggggaaacttggttaatgagacaatctggaaggaatgggagaagacgcctttaccagga
gagatactgtctgctgacgagcaatgtaaagttaggtggggcaatgactcggtgcagtgt
ggggatctttacccagaagatatgtgtggacagtatatcagatgcacaagcacttcacat
cagggttgcgtgtgcaaactgaaagtttcatcagaaacaccatgtggttatgctagggtt
tgtaagaaaggacagtgtgtatttattaaggacgtcccactgggcggtaaatgtgaatgt
cactcgcagtgcgccggtaacaacactgcctgtgacccggacacaggtctgtgtgtgtgt
aaagagggcttctttgatagtaatggtatagacgacgagggtggaaactgtactgaaaaa
tttccgctcgaggaggagtgtgatgaagatgtacaatgcaaggatccaaatgctctgtgt
atcaacggtacctgtaaatgtcgtccttgttactataacaacaatggaagatgcgaaaaa
caaagctgtttagggaaatcttgtaatgtgactgcccagtgtaaaggtgaaaatactgtg
tgtgatccagaacgtgacatatgcgtttgtgaaacaggatttttcgtagatgacgaaggc
aattgtgtcacagtgaacggaacaatctgcgatccatgcattcaacaaccggactcgtgt
actcaagatggcacaacttgcagtgacaggggtttctgtgagtgttctaacaacacggta
gaagtaaacggccaatgctttggaatggacatttgtgagccatgtgatccttcggactca
acatgcgcctcagggctggtttgcagctcaagtacaaacagatgtgaatgtccaccggac
caagttcagattggagaccaatgctatgggacacgtgttgctgagccgtgcacacctgta
ctaccaacatgtgtagactactttgctgagtgtaatggtacagtgtgcgattgtaaacca
ggatacacgtggaatggttccatatgtgttggagaagacccatgtgatccatgtgatccg
tcaacaccagcatgtggcaccggccttgtttgtaatcctaacacgtacagatgcgaatgt
ccacctgacgaagtacagattggagataactgctttggaatcgacctgtgtgatccatgt
gatcctgaaacatcatcgtgtgactccagtctagtatgcaacccggacacatacagatgt
gaatgtccaacaaatcaagtgcaaattggagatatatgctgtggatctgaactttgtgaa
ccttgtgatccgtcagcgaacacctgcaatgcaaatctcgtctgcagcagtatcacgtac
aggtgcgagtgtcctaccaatcaagtacagtatggagacgcctgctacggaacacttgtc
acagaggtatgcacaacagcattggacacatgtacggacaagtatgctgattgtaatggt
acaatatgtgactgcgttgatgggtttacttggaacggtagcaaatgcgttggagaagcc
atatgcgatccatgtgatcctttaacaccatcatgtgacaacagtcttgtgtgcaacccg
gacacatacaaatgtgaatgtccacctggcctggtacaaattggagccttctgctatgga
acacgtgtaacagaggcttgcacgactgctctcgacacgtgtattgatgacgatgctggt
tgcaatggtacagtctgtgactgtttggaagacttcgtatggaatggatctatatgcatt
gggaattatttgtgtgatccgtgtgatccttcgactacttcatgtgactccaatcttgta
tgtaacccgaacacatacagatgtgaatgtccaactgatcaagtccagataggagatgaa
tgctttgggatatctttgtgtgacccatgtgatccttcaacaccatcatgtgacaccagt
cttgtgtgcaacccgaacacgtacagatgtgaatgtccgactgatcaagtgcagatcgga
gatgaatgctttgggatatctttgtgtgacccatgtgatccttcaacaccatcatgtgac
accggtcttgagtgcaacccgaacacgtacagatgtgaatgtccgactgatcaagtgcag
atcggagatgaatgctttgggttatgtttgtgtgacccatgtgatccttcaacaccatca
tgtgacaccagtcttgtgtgcaacccgaacacgtacagatgtgaatgtccgactgatcaa
gtgcagatcggagatgaatgctttgggatatctttgtgtgacccatgtgatccctcaaca
ccatcatgtgacaccggtcttgagtgcaacccgaacacgtacagatgtgaatgtccgagt
gatcaagtgcagatcggagatgaatgctttggagaggatctctgtgacccctcagattcc
acatgctcctctccactcgtgtgtagttcagacacatacagatgcgaatgcccacctggt
tatgtacagatcgacggttcatgttatgggacgttagtgacagaggagtgtacaactact
cttgacacgtgtgttgataaatacgcagactgcaatggaacaatctgtgactgtattcct
ggcttctcgtggaatggttctgaatgcctcggaccagatttgtgcgatccgtgtgaccca
ttacaatcaccatcttcgtgtaactctgaattcgtatgtagttcggacacataccgatgt
gaatgtccacccactcaggcgcaagttggagaccaatgtgttgggacacgtgttactgag
ccatgtacaacaacccctgacacatgtactgacaactatgctgagtgtaatggtacagtc
tgtgattgtgaggcaggctttatatggaatggatcatattgtgttggaccagacttatgt
aacccatgtgatcccttaacactgtcttgtgacggcagcctcgtatgcagctctgacaca
tacagatgtcaatgtccatccaatgaagtacaaattggaaatgactgctatgggactcgt
gtcactgaagcatgcacgaatgtcctggacacatgcatcgatgataacgctgggtgtaat
ggtacaatatgtgattgtttaccaggattcacttggaatgggctcttatgtgtcgggtca
gagctatgtgacccctgtgatccacatgactccacctgtacatctccacttgtttgtagt
tcaacaacagatagatgcgaatgtcctactggccaagttcaaataggagatgcatgctac
gggactcttgtcactgagccatgcacaactgcactgcccacatgcgtagattataatgct
gaatgcaacggtacagtatgcgactgtatgccgggattcacatggaatggcaccatgtgc
tctggggaatatctctgtgaaccatgcgatccttctttatctacatgccagtccggttta
gtatgcagttctaatacatacagatgtgaatgtccacctgatcaagtacagattggagat
agctgctacggaacacgtgtaactgaggtatgcacgacagccaatccaacatgcattgac
aataatgctgaatgtaatggtactgtctgtgactgtgtagatggattttattggaatggt
tctaaatgtgtgggtgaaaatctatgtgagccatgcgatccatcatcttccacgtgtgca
gcgccacttgtatgcagttcaagcacttacagatgtgaatgtccgcctggtcaagtacaa
gttggagatgaatgctatggacgacttgtgacagagagttgcacgattatgccggataca
tgtattgacgacaatgctggatgcaatggaacaatatgcgactgtttgatgggatacgtg
tggaatgggtcgaaatgcgtcggagacgaactgtgtaacccatgtgatgcttcaacgcta
ttatgttcgggccagctcgtatgtagttcagacacgtacagatgtgaatgtcctacgaac
caagttcagattggagatgcatgctatgggacactcgttactgaggcatgtacaaccgcg
ctacccacatgtgtagactacaacgccgaatgtaatggtacagtgtgtgactgtataccc
acatttatatggaatgggtctatttgtcttggaccgaacttgtgggatccatgtgatcct
tcaacaccatcatgtgactccagtcttgtatgtaacccgaacacatacagatgtgaatgc
ccagccgatcaagttcaaattggagatatgtgttatggtttatacgtgacagaagcttgt
acaactactcttgacacgtgtgtcgatgattatgctgattgcaatggcacaatatgtgac
tgtaaacctggattcacctggactggttctaaatgcgttggaacagacctttgtgaccca
tgtgacccttcaatgtctacttgttcaacaccactggtatgtggtaattcttcaaacaga
tgtgaatgtccaccggatcaagttcagatcggagaggaatgctatggaacacttgtaact
gagccatgcacaaccgtccttgacacctgcatagacaactttgccgattgcaatggtaca
gtatgtgattgtatatcgggattatcttggaatggatccaaatgcgttggagagaatctc
tgtgagccctgtgacccttcagattccacgtgttcctctccactcgtgtgtagttcaaac
acgtacagatgtgaatgtccgcctgatgaagtacagattggagatgcatgttgttag
DBGET
integrated database retrieval system
