Methanobrevibacter millerae: sm9_1022
Help
Entry
sm9_1022 CDS
T04203
Name
(GenBank) adhesin-like protein with cysteine protease domain
Organism
mmil
Methanobrevibacter millerae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_3_5
Big_1
Peptidase_C1
Lectin_like
Chlam_PMP
Glyco_hydro2_C5
MG4
Peptidase_C1_2
Filamin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALT68811
UniProt:
A0A0U3CG72
LinkDB
All DBs
Position
1135633..1140705
Genome browser
AA seq
1690 aa
AA seq
DB search
MFNKFNFSLIIIAIFLLFIVLIPSSIAFELEEGDNITSRVIEEEEIVLTSSKSNDIYFDV
SAPSGGDGSKGNPYNQFKQQYIRNDAIIHLAKGDYFLDTTISAQYNNLTVYGAGMDKTFI
TSHHALTIKHFYLSDLTLSGVNIINHGTIDIRNVCIEDAKANVHDQYNNSFGGAIYNPGE
HYDPYLYLTNCIFKNNSAMYGGALYMTYGHLKIINTTFESNTAYNYGGAIAAGANSKIEI
YDSDFINDKSIKDSGGAIYFRYADVKISNSNFINCYGQFGGAICDLGANTTISNSKFTGN
RASYRGGAIYSLYGKFFVNDCDFRNNHGKNGGAIFLDNATSHYITTSLFISNTADVCGGG
IYSILNIIPSNAGNYYANNKAQESNDLYVTHNINLWLGDGNYTMIVSDHIREEISYIPSY
YNLVNYGLVTPVKDQETSGDCWAFSAIAALESCLLKATGVTYDLSEENMKNLISLYSDYG
WNMETNKGGFDTMALGYLTSWLGPVFESEDEFDDHSTLSPVLHSKFHIQDVLSLSRKSYT
DNADIKKAIMKYGAVASGLYNDDAYLNKNKASYYYNGNQITNHAVTIVGWDDTYSRYNFN
NVPQGNGAWICKNSWGPNWGNNGYFYVSYYDTKLAEIGKLHSAYTFIFNNTIDLDKNYQY
DVIGLTDFLATGKNTVWYKNVFKATDNELLAAFSSYINDESDYQVQVYVNNELKFSQNGV
SPEGYYTYKLDKFIPLYTGDVFEIVVKLTTKDIVSIPISESKYTNKYIYDKGMSYISYDG
KTWTDLYELKLGSAHSQVACIKAFTTLETLNTVISMPDYSIESGKIVTLEANVLDAHNNR
VTLGSVTFNIDGNEYVVDVNDGKATFNYRFSNEGTYNVKATYHGLHYNPSSVSSTVTVEE
IYSSTKISLAFNSVRAGENVRITATVLDSNNNKLNTGTVTFTTNGRSQTVNVNNGVAVFT
TSYDKAGSYDITATFKASHYGSSSTKSTITITQGVLSSKITATSTVTNNNVRIIAVVRDA
NNNLVSSGKVTFNINGEKSVVDVTRGQAVLNTVLPRSSTVYLSFEGSNYLSSTTSIRVEV
SDMPSSKITLTNMEVNVGNYVNIVATVTDSSNNPINGGTVSFTVDGKTTNIGVSNGKATL
TTSFSKSGLFGVTAVYTGNSYSSSSAKSTITVKDRISSSKITVSDVTAGAGKSVSIVARV
VDSNNNLVNSGTVNFIVNSKSTTVGVSNGVATFITSFDKSGTYNLLSTFSGNNYLSSSTN
SKIIVEKNTISVTLSIGDATYGSSNVAVITSDVAFNGLLNVGGSVYSVYVNNGVTRFTIP
SKLSVGSYKGILTYSGDDKYNPISINDKFIVTGDDFSLVAKDIVMYYKDGTRLGAYLYDS
NGRPLANNTVTFSLQGIDYSKTTNQNGYSSIAINLNSGKYVAVVKHASSSKSVTIEVKST
VIADDVTKYYRNDTQFYATILDKNGNSVKNTVVKMNINGVIYEKTTNNQGIVKLNLNLVP
NTYILTVTNPSTSEMATSIVKILPRLVENHDLVKYYRNASRYSVKVLSKSGNAEVGKTVT
FNINGVFYQRVTNSEGVASLNINLGPDTYIITAEYDESRVSNKITVLNILKANDLIKRYG
TSSQFTVTLLDGNGRLYANQVIKFNINGVFYERITNANGVASLNINLQAGKYIITSSYNG
LNLANTVTIY
NT seq
5073 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtttaataaattcaatttttcgctgataattattgcaatattcttattatttattgtt
ttaattccttcttccatagcttttgagttagaagaaggtgataatattacctctcgagta
attgaagaagaagagattgttttaactagttccaaatcaaatgatatttattttgatgtt
tccgctccaagtggtggtgatggttcaaaaggcaatccctataatcaatttaaacaacag
tatattagaaatgatgcaattattcatttggcaaaaggagattactttttagatacaact
atttcagcccaatacaataatttaactgtttatggtgcgggaatggacaagacattcata
acaagccatcatgcattaacaataaagcatttttatttgtctgatttgacattgtccgga
gttaacattataaaccatggaacaattgacattagaaatgtttgcatagaagatgcgaag
gcaaatgtacatgatcagtataataactcttttgggggagctatctataaccctggggag
cattatgatccgtatttatacttgacgaactgtatttttaaaaacaactctgccatgtac
ggcggagcactttacatgacttatggccatttaaaaattatcaacaccacctttgaatca
aacactgcttataattatgggggcgcaattgccgcaggtgcaaactcaaaaattgaaatt
tatgattctgattttattaacgacaaatccattaaggattctggtggtgcaatttatttc
agatatgctgatgtaaaaatatccaattctaattttatcaattgttatggtcaatttggt
ggtgcaatttgtgatttaggtgcaaacactacaatttcaaattcaaaattcacaggcaat
agggcttcatataggggcggagccatttactcattatatggtaaattctttgtaaatgac
tgtgattttagaaataatcatggaaaaaatggtggagcaatatttttggataacgctact
tcacactatattaccacttcacttttcatttccaacactgctgatgtctgtggtggagga
atatattctattttaaatataattccatccaatgcaggcaactactatgcaaataacaaa
gcacaggaaagtaacgatttgtatgtaacacacaatattaatttatggcttggagatgga
aattatactatgattgtaagcgaccatatccgtgaggaaatatcatacattccttcatat
tataatctggttaattatggtttagtcactccagttaaagaccaggaaacaagtggggac
tgctgggcattttcagcaattgcagcattggaatcatgccttttaaaggctactggtgtt
acttatgatttatctgaagaaaacatgaaaaatttaatcagcctttattctgattatgga
tggaacatggaaacgaataagggcggttttgatacaatggcacttggatatctgacaagt
tggttagggccagtgtttgaatctgaagatgaattcgatgaccattccacattatcccct
gttcttcattcaaaattccatattcaggatgtcctttcattatccagaaagtcctataca
gataatgctgatataaaaaaggctatcatgaaatacggtgccgttgcaagcggattatat
aatgatgatgcatatttgaataagaataaggcttcctattattataatggaaatcagatt
accaatcatgcagtcacaattgtcggatgggatgatacatactcaagatataattttaat
aatgttcctcaaggaaatggagcttggatttgtaaaaatagctggggacctaactgggga
aacaatggatacttctatgtttcatattatgatacaaaacttgcagaaataggcaaattg
cactctgcttatacattcatatttaacaataccattgatttggataagaattatcaatat
gatgttattggactcactgactttttggcaactggaaaaaatactgtttggtataaaaac
gttttcaaagccactgataacgaactgctggccgcattttcatcatatatcaatgatgaa
agtgattatcaggtacaggtttatgtaaacaatgaactcaagttctcccagaatggtgtt
tcacctgaaggatattatacttataaattggataagttcattccattatataccggagac
gtttttgaaatcgtcgttaaattaacaacaaaggatattgtaagcattcctatttcagaa
agcaaatatacaaataagtacatctatgataaaggaatgtcctatatcagctatgatgga
aaaacttggacagatttatatgaattgaaattagggtcagcacattctcaagtagcatgt
attaaggcatttacaactctggaaacattaaacactgttatttcaatgcctgattattca
atagaatctggaaaaattgttacccttgaagctaatgtcttggatgcccataacaatagg
gttacattgggcagtgtaacattcaatattgatggaaatgagtatgttgttgatgtcaat
gatggaaaagccacgttcaattacagattttcaaatgaaggtacatataacgttaaggca
acataccacggcctacactataatccttcatcggtctcatctacagtaactgttgaagag
atttattcatcaacaaagatttctttggcattcaattcagttagggcaggcgaaaatgtc
aggataactgcaactgttcttgattcaaacaataataaactgaacacaggtactgtcaca
ttcacaactaacggcaggagccaaactgttaatgtaaataatggtgttgccgtatttaca
acttcctatgataaggccggaagctatgatatcacagccacattcaaggcttctcattat
ggctcttcaagtaccaaatcaacaataactataactcaaggtgttttatcatctaaaata
actgctacgagtacagtaactaacaataatgtaagaatcattgctgttgttagggacgca
aataataatctggtttcatcaggtaaagtcactttcaatattaacggagaaaaatcagtg
gttgatgtaactagagggcaggctgttttaaatactgttcttccgcgcagctcaacggtt
tatttatcttttgagggtagtaactatctttcttcaacaacttcaataagggtggaagtt
tctgatatgccttcctcaaaaataacattgactaatatggaagtgaatgttggaaattat
gtaaatattgtagcaacagtcacagattccagcaataatccgattaatggagggactgtc
agcttcacagttgatggaaaaaccacgaatattggtgtttcaaatggaaaagcaacttta
acaacatcattttcaaaatcaggattatttggagtaactgcagtttatacaggcaattct
tattcttcatcatctgcaaaatcaactataacagttaaggatagaataagttcatccaaa
ataactgttagtgatgttacagccggcgctggtaaaagcgtaagcattgttgctcgcgtt
gttgattccaataataatttggtaaacagtggaactgttaattttattgtaaactcaaag
tcaacaactgttggtgtgagtaatggtgttgcaacattcatcacttcatttgataaatcg
ggaacttataatttgctttcaacattttcaggaaataattatctgtccagttcaaccaat
tcaaaaataattgttgaaaaaaacacaatttcagtcacattatctattggagatgcgaca
tatggatcaagtaatgttgcagtaataacatcagatgttgcatttaatggattattgaat
gttggaggaagtgtttattctgtgtatgttaacaatggagttacaagattcactattcct
tcaaaattgtccgtaggaagttataaaggaattttaacatactctggtgatgataagtat
aatccaataagtattaatgataaatttatagttactggcgatgatttttcattagttgca
aaggatattgttatgtattataaggatggaaccagattgggtgcttatttgtatgacagt
aatggtcgtcctttagcaaataatactgttacattttccctccagggcattgactattca
aagaccacaaatcagaatggttattcatcaattgcaattaatttgaactctggaaaatat
gttgcagtagtcaaacatgcttcttcaagcaagtctgtcactattgaagtaaaatccaca
gtcatagccgatgatgtaactaaatattatcgcaatgatacacaattttatgcaacaatt
ttggataagaacggcaattctgtgaaaaatactgttgttaaaatgaatattaatggagta
atctatgaaaaaaccactaataatcagggcatagtaaaattaaacctgaatcttgtgcca
aatacttatattttgactgtaacaaatccatctacatctgaaatggcaaccagtattgtt
aaaatacttccaagacttgtagaaaaccatgatttggtaaaatattatcgcaacgcttca
agatatagtgttaaagttttatccaaatcaggtaatgcggaggttggaaaaacagttaca
ttcaatattaatggagtattttaccaacgtgtaaccaattcggagggtgttgcaagtctt
aatattaatttgggaccagatacttatattataactgcagaatatgatgaatcaagagta
tctaataaaatcacggtattgaatattttaaaagccaatgatcttattaaaagatatggg
acttcatctcagtttacagtaacacttttggacggcaacggtagattatatgcaaatcag
gtaatcaaatttaatattaacggtgtattttatgaaagaattaccaatgctaatggtgtt
gccagtttaaacattaatctgcaagcgggaaaatacattattacttcatcatacaatgga
ttgaacttagcaaatactgttacaatatattag
DBGET
integrated database retrieval system