Methanobrevibacter millerae: sm9_1388
Help
Entry
sm9_1388 CDS
T04203
Name
(GenBank) DNA helicase
Organism
mmil
Methanobrevibacter millerae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4011
MTES_1575
AAA_12
AAA_11
DUF3320
AAA_19
AAA_30
ResIII
nSTAND3
DEAD
UvrD-helicase
IstB_IS21
AAA_16
AAA_22
FtsK_SpoIIIE
Bcl-2_3
MeaB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALT69169
UniProt:
A0A0U3EC30
LinkDB
All DBs
Position
complement(1553380..1561101)
Genome browser
AA seq
2573 aa
AA seq
DB search
MIIMLSNSSTNIIEKEFKNLRKELLDLTLRNQLLNFKSRAKTVVINNQTPINVFQTLVLQ
ENKMYFVSNKKDKKEEKSSVWDHIPFDFSKFSEGNKKLEIDLTPNELQKRLYYINNQAKT
MLQEQGYNILYLAVGFLEWIDKSKPKQTNQAPLVLIPVSMERKKVGESFNLEWTGEDIQT
NISLKAKLLEGGIELPDFEFKKYGEVVDHYIEKVKHAVQKMENWKVNHKIALGFFSFTKF
VMYNDLNPDSWADNVDLTKNELIQAIFNPAKNDVEAFNEEDIDTQLDYQTMYQVLDADSS
QIAAIQDVKAGRNLVVEGPPGTGKSQTIVNLIAELLAEGKSVLFVSEKMAALDVVKDRLT
NVGLGKFVLELHSHKTRRKKFLKDLQKATTVRAVDTLNIDQTIRKLETLKRQLDDYASVI
HKPVFAVNFSAFQLYGMKEAADDHFSRKQSIMPLVRFNSPESVTLKDLDDTILALESVAE
LYQTISKENPWSKCSPKSLLPADLREIEMLINDTLKSLDAFLIERGRVYDIYGIKKPNTL
NEFEKSLSAFDIIKTQNSELIDAQILKSGAWDKNNDDPYRLIQELAKYQKVADVLNKFNP
SIYHANIDRIIYELNELSHKKFRFFKGNQHLELVERYYNYPVQDDINTIIDDLSKAKVAI
KLKKNLEANEALAKQYYGGYWYLNADINDLKAIAQWMTQFTALTREGIFSQNTIDILSKD
LFDINPERDLVDYIDSGKQFSSDLDKLKSKLNPRSKLIFKKGANDVDFEDWQSQLYNWRG
QLSSLHLWSQYLNTKNSLKGTIADSFVDSIEKRNIKKDDIKSLVEGNFADSLLNILFVEN
QELATFIGELHENRIREFKDLDKKILILNRKRIFHKLNQNIPQIFGATENPQAKVLAGEF
TRKSGHLPVRKLLEKAGGMIKQIKPCFMMSPLSVAQYLDPTNEELQFDVVIFDEASQVKP
EDALGAFMRGKTAVVMGDTQQLPPTSFFDQMASGESDEEEATSLDMESILHLCKLSFPVK
MLKWHYRSRHESLINVSNKEFYDNELLVYPSPSHNDSELGLKFHYNPNTAYDRGSSSANP
KEAEDVVEAIFEHFDRYGDTKSLGVGTFSVAQKNAILEKLEEKRRERPEFEPLFSENKDE
RFFVKNLETIQGDERDVILISVGYGFDNERKMSLNFGPLNQDGGERRLNVLITRARQKCV
VFSNFKASSMKLTANPPHGVRALREFLEYAENLTMGAHTAEEHNAAPFEDAIASFLEENG
YVVDKQIGCAGFRVDLAIVDEENPGKYILGITTDGKMYASSKVARDRDRLREQVLEGLGW
KLYHLWSTDWYRNRDLGRKKLLEFIEKSIKETREEQRIAREKEEKRRQEAEKKAEELRKK
REKELEEQRKKEEEAKAAELGENVEVIPPDGLDFDDDIIFVSKDELDEFDNDDFEFVEES
PSDFVDVVDEPMEDIVKESPSDFVDVVDEPMEDIVKESPSEFVVESDIDEEYSAFDDFVF
HDDLAEEKTSDAKNINKESVFDKEVDIKKDTDDLIVDDVENVKDNAVVDSGNDLDINVDD
SEIVDSGNDLDINVDDSEIVDSVDENDDIAVDDIAVDDLDVDDSADKKDDFDVNTDHVDE
IDVNHDESNKFNIDEVIEELTEDETDDELIDKENNHFDDGVEDEDTYASDKNDSENVQYT
DEKISQEIQEELSEEIDDDIDSKGVKFDSTISKASGGGILSSIKNKFSFFHDDESNGDES
IDEVNDIIKDKLDNDDFIYVDHSNDEKDIVVSDSVVDESNIEEDVLDESVGDLNQDVDDV
EEDVLEHKPIDKDKNTSKVTFNKSSDMDMDEFSHIENEKESDVKVDVEDDFDIKPINQSK
SNKSVDLKDKSIDSDSDDDYVFVNHGEGSADLGSDVNDSDDMDDVELDDGKVDLGSDDDY
IYVDHSNDEEDIVVSDSVVDESNINDDLLDESVGDLKQDEDDGKVDLGSDDDYIYVDHSN
DEESTIDYSDDEPPVVEVNPLKNIFFGNSKPKNPNGISESKFSDAIRGTSRLSLTKEEVE
TVHAEIMDEDIDEHETAPRDDDVVEVEVISSDYKNNPNVNPLMDRTIDDEFIQSDNDDVD
SYNVDKIVFKKNVDGMSEMTKNKTIKEKDFDRVIDEAFENHPDGSLGDDDISNIASALVS
KAFDDVISDTLNKKNDEYAQFYDDNYDNYQSDIVNDDIGINNNQKTNKVSTSPDGVTYYK
GINDVNSPLRKNNLYYDGDKNKSKSVKDSIKSSIRDIKYIHKSLNEIENPTEVGYVSVVD
RTEEYDENDYIEPIQDYEGEEYVPQDEGLTFAEKEELRYERELQMEKLKKELSSDDNAIV
TIHEEERREDIKDQALEDIIQIADEDYKEIEKERFKNNNTLKSFDDNKLPKRGNIEDEIV
DYKFASDFGLNSQEDLFNQPINNVSNSINEIVNVEGPIHVNEVVKRVKDSCHIKRAGSKM
KKQVLKAIKESENSGNIIRIGDFLYDASSNDVVIRKRVKPKIDLISDEEISKNIETILSH
KQNITTASLTREVSRNFGFKSTSRKTSVKIKSVLDSMIAEGTVKLDNDIVELN
NT seq
7722 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcatcatgttatccaattcatccactaatataatcgaaaaggagtttaaaaactta
cgtaaggagttattagatttaactttaagaaatcaattgcttaattttaaatctagggct
aaaactgttgttattaataaccaaacaccaattaatgtctttcaaacattagttttacaa
gaaaataaaatgtattttgtatctaataagaaagataaaaaagaggagaaatcttcagtt
tgggaccatattccatttgattttagcaagttttctgaaggaaataaaaagttagaaata
gacttgactccaaacgaacttcaaaaaagactgtattatattaataaccaagctaaaaca
atgcttcaggaacagggttataatattttgtaccttgcagtcggatttttggagtggatt
gataaatccaaaccgaaacaaaccaaccaggctcctttagttttaattcccgtttccatg
gaaaggaaaaaggtgggtgaatcatttaacttggaatggactggggaggatattcaaacc
aacatttcccttaaagcaaaactccttgaaggaggtattgaacttccagattttgaattt
aaaaaatatggtgaagttgtagaccattatattgaaaaggttaagcatgctgttcagaaa
atggaaaattggaaagttaatcacaaaattgctttaggtttctttagttttacaaaattt
gtcatgtataatgatttaaatcctgatagttgggcagataatgtggatttaactaaaaat
gaactgatacaagcgatattcaatccagctaaaaatgatgtggaggctttcaatgaagag
gatattgacactcaacttgattatcagacaatgtatcaggttttagatgctgattcatca
cagattgccgcaattcaggatgtaaaggctggaagaaatcttgttgtggaaggaccacca
ggaacaggtaaatcacaaacaattgtaaatttgattgcggagctgcttgcagaaggtaaa
tcagttttattcgtatctgaaaagatggcggcattggatgttgtaaaggacagattgact
aatgtgggtttgggcaaatttgttttagaattgcattcacataaaactagacgtaaaaaa
ttcctgaaagacctgcaaaaagcaaccactgtcagagctgtcgatacattaaacatagac
cagacaattagaaagttagaaaccttaaaaagacaacttgatgattatgctagtgttatt
cataaacctgtatttgcagttaatttctctgcatttcaattatatggaatgaaagaagct
gctgatgatcatttttcacgcaagcaaagcataatgcctttggttagatttaatagtcct
gaatcagtaacattaaaagatttggatgatactattttggctttggaaagtgtggctgaa
ctgtatcaaactatttcaaaggagaatccttggagcaaatgttcaccaaaaagtttgctt
cccgcagatttaagggaaatagaaatgctgataaatgatacattgaaatctttagatgca
tttttaattgaacgtggaagggtatatgatatatatggaattaaaaagccaaatacatta
aatgaatttgaaaagtcactttcagcatttgacataattaaaactcaaaattcagaatta
attgatgctcaaatattaaaatcaggagcatgggataaaaacaatgatgatccttacaga
ttgatacaggaattagctaaatatcaaaaggttgctgatgtattaaataagtttaatcca
agtatttatcatgcaaatattgacagaataatttatgaattaaacgaattgtctcataaa
aaattccgtttctttaaaggaaatcagcatttggagctagtcgagagatattataattat
cctgttcaggatgatatcaatacaattattgatgatttaagcaaagctaaagttgctata
aaacttaaaaagaatttagaagctaatgaagcattagccaaacagtattatggtggatat
tggtatttaaatgcagatattaatgatttaaaagctatcgctcagtggatgacacagttc
actgcacttacaagagaaggaattttttcacagaacactattgacattctatctaaagat
ttatttgacattaatcctgaaagggatttggttgactatatagactctggaaagcaattt
agcagtgatttggataaattaaaatcaaaattaaatcctagaagtaaattaatatttaaa
aaaggtgctaatgatgttgattttgaagactggcaatcacagttatacaactggagaggt
cagctttcaagtcttcatttatggtctcaatatctgaacactaaaaattcccttaaagga
acaattgccgattcttttgttgattcaatcgagaaaagaaatattaaaaaggacgatatt
aaatctttagtggaaggaaacttcgctgattctcttttaaatattctttttgtagaaaat
caggaattggctacattcattggtgaacttcatgaaaacaggataagggaatttaaggat
ttggataagaaaatattaattttaaatcgtaaaagaattttccataagttaaatcagaat
attccgcagatatttggtgctactgaaaatcctcaggcaaaagtacttgcaggggaattt
acaagaaaaagtggacacttgccggtaagaaaattactcgaaaaagcaggaggtatgatt
aaacagataaaaccatgttttatgatgtctccattgtcagtggcacagtatcttgacccg
actaatgaagaactacaatttgatgtggttatttttgacgaagcaagtcaagtaaaaccc
gaagatgctttgggagcatttatgagaggtaaaaccgcagttgtaatgggtgatactcag
caattgcctccaacatcattctttgatcagatggcaagtggagaaagtgatgaggaagaa
gcaacatcactcgatatggagagtatattacatttatgtaagttatccttcccagtaaag
atgttgaaatggcactacagaagccgtcatgagtcattaattaatgtttctaataaagag
ttttatgataatgaattgcttgtatatccttcaccttctcacaatgattcggaattagga
ttaaaattccattataatcccaacactgcatatgatagaggttcatcatctgcaaatcca
aaagaagcggaagatgttgttgaagcgatatttgaacattttgacagatatggtgataca
aaaagtttgggtgtaggaacattttctgtagctcaaaaaaatgctattttggaaaaattg
gaagaaaaacgtcgtgaaaggccagaatttgaaccattattctcagaaaataaggatgaa
agattctttgttaaaaaccttgaaacaattcagggggatgaaagagatgttattttaata
agtgtgggatatggttttgacaatgaaagaaaaatgtcacttaacttcggtcctctaaat
caggatggtggggaaagaagattaaatgtattgattacacgtgcaagacaaaaatgtgtt
gtgttttccaactttaaagcttcaagtatgaaattaacggcaaatcctcctcatggtgta
agggcactacgagaattcttagaatatgctgaaaatttaactatgggtgcacatacagca
gaagaacataatgcagcaccttttgaagatgctattgcaagttttttagaagaaaatggc
tatgttgtcgataaacaaattggttgtgcaggatttagggtagatttggctattgtggat
gaagaaaatcctggaaaatatattttgggaattacaactgatggaaagatgtatgcatca
agtaaggttgcacgtgaccgggatagacttcgtgagcaagtattggaaggattaggatgg
aaactttatcatttatggtctaccgattggtatagaaaccgtgatttgggacgtaaaaaa
ttattggagttcatagaaaaatcaattaaggaaactcgtgaagaacaaagaatagctcgt
gaaaaagaagagaaacgcagacaagaagctgagaaaaaagctgaagaattgagaaaaaaa
cgcgaaaaagagttagaagaacaaagaaagaaagaagaagaggctaaagcagctgaactt
ggagaaaatgtagaggtaattccaccagacggacttgactttgatgatgacataattttt
gtaagcaaagatgaacttgatgaatttgataatgatgattttgaatttgtagaggaatct
cctagtgattttgttgatgttgtagatgaacctatggaggatattgttaaagaatctcct
agtgattttgttgatgttgtagatgaacctatggaggatattgttaaagaatctcctagt
gagtttgttgtagaatcagatattgatgaagaatatagtgcattcgatgattttgtattc
catgatgatttggccgaagaaaaaacatctgatgctaaaaatataaataaggaatcagtt
ttcgataaagaagttgatattaaaaaagatactgatgatttaattgttgatgatgttgaa
aatgtaaaagataatgctgtggttgattctggtaatgatttagatattaatgtggatgat
agtgaaattgttgattctggtaatgatttagatattaatgtggatgatagtgaaattgtt
gattctgttgatgagaatgatgatattgctgtagatgatattgctgtagatgatcttgat
gtggatgattctgccgacaaaaaagatgattttgatgttaataccgatcatgttgatgaa
atagatgttaatcatgatgaatctaataaatttaatattgatgaggttatagaagagtta
actgaagatgaaactgatgatgaattaatcgataaagagaataatcattttgatgatggt
gttgaagatgaagatacatatgcaagtgataaaaacgatagcgaaaatgttcaatatacg
gacgaaaaaatctcacaggaaatccaagaagaactctccgaagaaatagatgatgatata
gattcaaaaggtgttaaatttgattcaactatatccaaggcatcaggtggaggaatttta
tcttcaataaaaaataaattttcatttttccatgatgatgaaagtaatggtgatgaatct
attgatgaagtaaatgacataataaaggacaaacttgacaatgatgacttcatttatgtt
gatcatagtaatgatgaaaaggatattgtagtgtctgactctgttgttgatgaatcaaat
attgaagaggatgttttagatgagtctgttggtgatttaaatcaggatgtggatgatgtt
gaagaggatgttttagaacataaacctattgataaagataaaaatacatctaaagttact
tttaacaagtcttcagatatggatatggatgaattttcacatattgaaaatgaaaaagaa
agtgatgtaaaagtcgatgtagaagatgattttgatataaaacctataaaccaatcaaaa
agcaataaatctgttgatttgaaagataaaagtattgattctgattctgatgatgattat
gtttttgtaaatcatggtgaaggatctgctgatttgggttctgatgttaatgatagtgat
gatatggatgatgttgaattagatgatggtaaggttgatttgggttctgatgatgattat
atttatgtagatcatagtaatgatgaagaggatattgtagtgtctgactctgttgttgat
gaatcaaatattaatgatgatcttttagatgagtctgttggtgatttaaagcaggatgaa
gatgatggtaaggttgatttgggttctgatgatgattatatttatgtagatcatagtaat
gatgaagagagtactattgattattctgatgatgaacctcctgtagttgaagtaaatcca
ttaaaaaatatattctttggaaatagcaaacctaaaaatcctaatggaataagtgaatct
aaatttagtgatgcaattaggggtacttctagacttagtttgacaaaagaagaggttgaa
actgtccatgctgagattatggatgaagatattgatgagcatgaaactgcacctagggat
gatgatgtggttgaagttgaagtaatttcttctgactataaaaataatcctaatgtcaat
ccattaatggacagaactattgatgatgagtttatccaatctgataatgatgatgttgat
tcttataatgtagataaaattgtatttaagaaaaatgtggatgggatgtctgaaatgaca
aaaaataaaactattaaagaaaaggattttgatcgtgtaattgatgaagcttttgaaaat
catcctgacggcagccttggtgatgatgatatttcaaatattgcttcagcattggtaagt
aaggcatttgatgatgtaatttcagatacattaaataagaaaaacgatgaatatgctcaa
ttttatgatgataactatgataattatcaatcagatatcgtaaatgatgatattggtatt
aataataatcaaaaaacaaacaaggtatctacatcacctgatggagttacttattataaa
gggataaatgatgtaaatagtcctctcagaaagaataatttgtattatgatggggataaa
aataagtctaaatcagttaaggactctattaaaagcagtattcgtgatatcaaatatatt
cataaatctttaaatgaaatagaaaatcctactgaagttggttatgtttctgtagttgac
agaacagaagaatatgatgaaaatgactacattgaaccgattcaggactatgaaggcgaa
gaatatgttcctcaggatgaaggtttgacatttgccgaaaaagaagagttgaggtatgaa
agagaacttcaaatggaaaaactcaaaaaggaattgtctagcgatgataatgctattgta
acaattcatgaagaggaaaggcgtgaagatattaaagatcaggctttggaagatattatt
cagattgctgatgaagattacaaggaaatagaaaaagaaagatttaaaaataataatact
ttaaagagttttgatgacaataaacttccgaaaagaggaaatattgaagatgaaattgtt
gattataaatttgcaagtgatttcggtttgaattcacaggaagatttatttaaccagcct
attaataatgtttctaattcgataaatgaaattgtcaatgttgaaggaccaattcatgta
aatgaggttgttaaaagggttaaagacagctgccatattaaaagagcagggtctaaaatg
aaaaaacaggtcttgaaagccattaaagaatctgaaaattcaggaaatattataagaatc
ggtgacttcttgtatgatgcatcaagtaatgatgttgttataagaaagagggttaaacct
aaaatagatttgatttctgatgaggaaatttctaaaaacatagaaacaatattgtcccat
aaacaaaacataacaacagctagtttaacaagagaagtttcacgtaatttcggtttcaaa
tccacatcccgcaaaacttcagttaaaatcaaaagcgttttggattcaatgattgctgaa
ggtacagttaaattagataatgatattgttgagcttaactag
DBGET
integrated database retrieval system
