Mycoplasma miroungirhinis: HLA92_02115
Help
Entry
HLA92_02115 CDS
T08086
Name
(GenBank) ribonuclease J
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mmio
Mycoplasma miroungirhinis
Pathway
mmio03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmio00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
HLA92_02115
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mmio03019
]
HLA92_02115
Messenger RNA biogenesis [BR:
mmio03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
HLA92_02115
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_C
RNase_J_b_CASP
PUB2_N
RMMBL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJR44220
UniProt:
A0A6M4JBC0
LinkDB
All DBs
Position
complement(507421..509076)
Genome browser
AA seq
551 aa
AA seq
DB search
MDKVNFFALGGQDENGKNCYALEIDSKIYIINSGTKVPINSHNGIDTLIANFDYLEKHEK
NIVGIFITDIHNESFSALPWLLMQIKGLKIYTSSFNKYIILERISKYNIEHNDFEVITFN
QKMTVNNVEITPISLAGALPGIQGFNFNYNNGNILFLTNFVVGNLGPYGNTDLQKIKHQI
PNDPLKILIMDSGHSNSPGKTIDKLWITGQVEYKFIETKSNNRIIVGLYDEDMITAHEIL
LLAKKYNRPVITYGLNYSKLISLVKKMSPTLQLPEFIDYKIANEVENAVILVTGAIERLY
TRFLRIASDNDVYLKFKNTDAVIFIAPPVNGLEVKYALTLDEIARTTSNLIELSSFEYYS
CNPAKQDIVDVIKTLKPEYFIPIQGLYRYLTVAVNDAVSEAKMNLNNCIILNNGKVAEFE
KYKLISQKHTIRHVGDVIIDGFGVGDISHEVIRERETLARDGMIGVSCLIDYKTKQPLGG
LNVVGYGIISKENKEQINDIVNKCFNKEFEELDAKVTNLRDIQEKLRKVIRKKIFKVLFK
EPLVVVNLYEI
NT seq
1656 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacaaagttaacttttttgctctaggtggacaagacgaaaatggtaaaaactgttat
gcattagaaattgattctaaaatttatattattaattcaggaactaaagtacctattaat
agtcataatggtatagacactttaattgctaattttgattacttagaaaaacatgaaaaa
aatatagttggtatttttataactgatatacataatgaaagttttagtgctttaccttga
cttttaatgcaaattaaaggactaaaaatttatacttctagttttaataaatacattatt
ttagaaagaatttccaaatataatatagaacataatgattttgaagttattacatttaat
cagaaaatgacagtaaataatgttgaaattacacctatatcattagccggagcattgcca
ggaattcaaggatttaattttaattataataatggtaatattttattcttaactaatttt
gtagtaggaaacttaggaccatatggaaatactgatttacaaaaaattaagcatcaaatt
cccaatgacccattaaaaattttaataatggattcaggacattctaattctcctggtaaa
acaattgataaattatgaattactggtcaagttgagtataaattcattgaaactaagtct
aataatagaataattgttggtttatatgatgaagatatgattacagctcatgaaatatta
ttactagcaaaaaaatacaatagacctgttattacatatggattaaattattctaaatta
atctcacttgttaaaaaaatgtctccaactttacaacttcctgaatttatagattataaa
attgcaaatgaagttgaaaatgcagttattttagtaaccggagcaattgaaaggttatat
acaagatttttaagaattgcatctgataatgatgtttatttaaaatttaaaaacacagat
gcagttatatttattgctccacctgtaaatggtctagaagttaaatatgctttaacatta
gatgaaattgcgagaactacttctaatttaattgaattatctagttttgaatattattca
tgtaatccagctaaacaagatatagtagatgtaataaagacattgaaacccgaatatttt
attcctatccaaggactatatcgttatttaaccgttgctgtaaatgatgcagtatctgaa
gcaaaaatgaatttaaataactgtattattttaaataatggaaaagttgctgaatttgaa
aaatataaattaatttctcaaaaacacacaataagacatgttggtgatgttattatcgat
ggttttggtgtcggtgatatttcgcatgaagtaattagagaaagagaaacattagctcgt
gatggtatgattggtgtttcttgtttaatagattataaaaccaaacaacctttaggtgga
ttaaatgttgttggttatggaattattagtaaagaaaataaagaacaaattaatgacatc
gttaataaatgttttaataaggaatttgaagaattagatgcaaaagtaactaacctaaga
gatattcaagaaaaattaagaaaagttattagaaaaaaaatatttaaagttctatttaaa
gaaccacttgtggtggtgaatttatatgaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system