KEGG   Mycoplasma miroungirhinis: HLA92_02115
Entry
HLA92_02115       CDS       T08086                                 
Name
(GenBank) ribonuclease J
  KO
K12574  ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mmio  Mycoplasma miroungirhinis
Pathway
mmio03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmio00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    HLA92_02115
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mmio03019]
    HLA92_02115
Messenger RNA biogenesis [BR:mmio03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     HLA92_02115
SSDB
Motif
Pfam: RNase_J_C RNase_J_b_CASP PUB2_N RMMBL
Other DBs
NCBI-ProteinID: QJR44220
UniProt: A0A6M4JBC0
LinkDB
Position
complement(507421..509076)
AA seq 551 aa
MDKVNFFALGGQDENGKNCYALEIDSKIYIINSGTKVPINSHNGIDTLIANFDYLEKHEK
NIVGIFITDIHNESFSALPWLLMQIKGLKIYTSSFNKYIILERISKYNIEHNDFEVITFN
QKMTVNNVEITPISLAGALPGIQGFNFNYNNGNILFLTNFVVGNLGPYGNTDLQKIKHQI
PNDPLKILIMDSGHSNSPGKTIDKLWITGQVEYKFIETKSNNRIIVGLYDEDMITAHEIL
LLAKKYNRPVITYGLNYSKLISLVKKMSPTLQLPEFIDYKIANEVENAVILVTGAIERLY
TRFLRIASDNDVYLKFKNTDAVIFIAPPVNGLEVKYALTLDEIARTTSNLIELSSFEYYS
CNPAKQDIVDVIKTLKPEYFIPIQGLYRYLTVAVNDAVSEAKMNLNNCIILNNGKVAEFE
KYKLISQKHTIRHVGDVIIDGFGVGDISHEVIRERETLARDGMIGVSCLIDYKTKQPLGG
LNVVGYGIISKENKEQINDIVNKCFNKEFEELDAKVTNLRDIQEKLRKVIRKKIFKVLFK
EPLVVVNLYEI
NT seq 1656 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggacaaagttaacttttttgctctaggtggacaagacgaaaatggtaaaaactgttat
gcattagaaattgattctaaaatttatattattaattcaggaactaaagtacctattaat
agtcataatggtatagacactttaattgctaattttgattacttagaaaaacatgaaaaa
aatatagttggtatttttataactgatatacataatgaaagttttagtgctttaccttga
cttttaatgcaaattaaaggactaaaaatttatacttctagttttaataaatacattatt
ttagaaagaatttccaaatataatatagaacataatgattttgaagttattacatttaat
cagaaaatgacagtaaataatgttgaaattacacctatatcattagccggagcattgcca
ggaattcaaggatttaattttaattataataatggtaatattttattcttaactaatttt
gtagtaggaaacttaggaccatatggaaatactgatttacaaaaaattaagcatcaaatt
cccaatgacccattaaaaattttaataatggattcaggacattctaattctcctggtaaa
acaattgataaattatgaattactggtcaagttgagtataaattcattgaaactaagtct
aataatagaataattgttggtttatatgatgaagatatgattacagctcatgaaatatta
ttactagcaaaaaaatacaatagacctgttattacatatggattaaattattctaaatta
atctcacttgttaaaaaaatgtctccaactttacaacttcctgaatttatagattataaa
attgcaaatgaagttgaaaatgcagttattttagtaaccggagcaattgaaaggttatat
acaagatttttaagaattgcatctgataatgatgtttatttaaaatttaaaaacacagat
gcagttatatttattgctccacctgtaaatggtctagaagttaaatatgctttaacatta
gatgaaattgcgagaactacttctaatttaattgaattatctagttttgaatattattca
tgtaatccagctaaacaagatatagtagatgtaataaagacattgaaacccgaatatttt
attcctatccaaggactatatcgttatttaaccgttgctgtaaatgatgcagtatctgaa
gcaaaaatgaatttaaataactgtattattttaaataatggaaaagttgctgaatttgaa
aaatataaattaatttctcaaaaacacacaataagacatgttggtgatgttattatcgat
ggttttggtgtcggtgatatttcgcatgaagtaattagagaaagagaaacattagctcgt
gatggtatgattggtgtttcttgtttaatagattataaaaccaaacaacctttaggtgga
ttaaatgttgttggttatggaattattagtaaagaaaataaagaacaaattaatgacatc
gttaataaatgttttaataaggaatttgaagaattagatgcaaaagtaactaacctaaga
gatattcaagaaaaattaagaaaagttattagaaaaaaaatatttaaagttctatttaaa
gaaccacttgtggtggtgaatttatatgaaatttaa

DBGET integrated database retrieval system