Mycoplasma mycoides subsp. capri LC 95010: MLC_4810
Help
Entry
MLC_4810 CDS
T01478
Symbol
nifS
Name
(GenBank) Nitrogen fixation protein NifS
KO
K11717
cysteine desulfurase / selenocysteine lyase [EC:
2.8.1.7
4.4.1.16
]
Organism
mml
Mycoplasma mycoides subsp. capri LC 95010
Pathway
mml00450
Selenocompound metabolism
mml01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mml00001
]
09100 Metabolism
09106 Metabolism of other amino acids
00450 Selenocompound metabolism
MLC_4810 (nifS)
Enzymes [BR:
mml01000
]
2. Transferases
2.8 Transferring sulfur-containing groups
2.8.1 Sulfurtransferases
2.8.1.7 cysteine desulfurase
MLC_4810 (nifS)
4. Lyases
4.4 Carbon-sulfur lyases
4.4.1 Carbon-sulfur lyases (only sub-subclass identified to date)
4.4.1.16 selenocysteine lyase
MLC_4810 (nifS)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Aminotran_5
Aminotran_1_2
Cys_Met_Meta_PP
Met_gamma_lyase
DegT_DnrJ_EryC1
DNA_primase_S
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBW54209
UniProt:
F4MQ26
LinkDB
All DBs
Position
611668..612906
Genome browser
AA seq
412 aa
AA seq
DB search
MNDQFKKIKKQFPLLKKHPNLIYFDNGATTLKPNSVINAQTNYLKNISTNPHSSDYKIGY
QSLEILNNTRELVKNFINANHTSEIIFTSGTTQSINMIAKGLINLINQDDEILITSLEHS
SNLVPWIWLKQKTNAVIKNLELTNEFGIDINKLDQLITPKTKIVSFAHISNTTGYINDVK
KIIQKIRSINQNVIIVVDVAQSIAHFKVDVKDWDVDFIAFSAHKMYGPFGVGILYGKYQL
LDKLEPLNLGGGSSLTISKDFTSYTLKSLPEKLEAGTLNISNIYGFKKAIEFILKIGINN
IHLYETKLKQYTRQQIKANHLENKITFYNLNNDSPLLLFNVNQINAQDISSFLDVKYNIT
SRSGAHCVRRLEDVIHIKSALRISFAIYNTTDEIDKLIDALKNTDKFLDIYF
NT seq
1239 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaatgatcaatttaaaaaaattaaaaaacaatttcctttattaaaaaaacatcctaat
ttaatttattttgataatggagctacaactttaaaaccaaattctgtaataaatgctcaa
actaattatttaaaaaatatttcaacaaacccacattcaagtgattataaaattggatat
caaagtttagaaattttaaacaacactagagaacttgtaaaaaactttattaatgcaaat
catacaagtgaaattatttttacttcaggaactactcaatctattaatatgattgcaaaa
ggtttaattaatttaattaatcaagatgatgaaattttaattactagtttagaacattct
tcaaacttagttccttgaatttgactaaaacaaaaaactaatgctgttattaaaaattta
gaactaacaaatgaatttggaattgatattaataaattagatcaattaattacacctaaa
actaaaatagttagttttgctcatatttcaaatacaacaggatatattaatgatgttaaa
aaaattattcaaaaaattagatcaattaatcaaaatgtaataattgttgttgatgttgct
caatcaattgctcattttaaagttgacgttaaagattgagatgtagattttattgctttt
tcagctcataaaatgtatggaccatttggggttggtattttatatggtaaatatcaatta
ttagataaattagaacctttaaatttaggtggcggttctagtttaactattagtaaagat
tttactagttatactttaaaaagcttacctgaaaaactagaagctggtactttaaatatt
tcaaatatttatggttttaaaaaagcaattgaatttattttaaaaataggaattaataat
atacatctatatgaaactaaattaaaacaatacactagacaacaaattaaagctaatcat
ttagaaaataaaattactttttataatttaaataatgattctcctttattattatttaat
gttaatcaaattaatgctcaagacatttctagttttttagatgttaaatataatataaca
agtagatctggagcacattgtgttagaagattagaagatgtaattcatataaaaagtgca
ttaagaattagttttgcaatttataatacaactgatgaaattgataaattaattgatgca
ttaaagaacacagataaatttttagatatatacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system