KEGG   Mycoplasma mycoides subsp. capri LC 95010: MLC_6420
Entry
MLC_6420          CDS       T01478                                 
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA polymerase I
  KO
K02335  DNA polymerase I [EC:2.7.7.7]
Organism
mml  Mycoplasma mycoides subsp. capri LC 95010
Pathway
mml03030  DNA replication
mml03410  Base excision repair
mml03420  Nucleotide excision repair
mml03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mml00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    MLC_6420 (polA)
   03410 Base excision repair
    MLC_6420 (polA)
   03420 Nucleotide excision repair
    MLC_6420 (polA)
   03440 Homologous recombination
    MLC_6420 (polA)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mml03032]
    MLC_6420 (polA)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mml03400]
    MLC_6420 (polA)
Enzymes [BR:mml01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     MLC_6420 (polA)
DNA replication proteins [BR:mml03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    Other elongation factors
     MLC_6420 (polA)
DNA repair and recombination proteins [BR:mml03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   BER (base exicision repair)
    DNA polymerase I
     MLC_6420 (polA)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     MLC_6420 (polA)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol_A 5_3_exonuc_N 5_3_exonuc DNA_polI_exo1
Other DBs
NCBI-ProteinID: CBW54370
UniProt: F4MQI7
LinkDB
Position
complement(818635..821370)
AA seq 911 aa
MKTKILVVDGNSLIFRAFYATAYSPNTSLLKTKSGVLTNAAYSFINMLLSVIHQRGPYDH
ILIAFDKGKKTFRHDLLSDYKANRIKTPNELVEQFSIVREFLTKANIQWFEQENIEADDI
VGSICKYAEKQFDNLQAEILSSDKDMYQLITNKVICLNPIQGVNELEEVDTNKLFEKWQI
LPNQVPDYKAIVGDSSDNLKGVNGIGQKGAIKLIQQYQNLENIYNNLEQIKGAIKTKLEQ
DKKMAFLCKDLATIKTDVTLENFSFKKLDFNVDNIYEFLNKYEMYSLKKRFTNILNLDFN
PYQNKKQNLDVKIINSWSKDYEDSINYLYVESLEEDYHKDKIIGIGISNNKGNFYLDFKN
KAQQLSFFEDTTLSSTNSLFEEFLNNPNLKKYTYDIKKTTYLLKNHKYNVLASNFDFDFM
VACYSLNANVVSDLSSQIKLVDNLVELETIDEIFGKGVKKNPDIDLDIKSKYISKKAYLL
KKYSDQLIEQLKQTNTYDLYLKIDHPLIEVLYDIEVQGILIDKEQLKLQTQQILKKINHI
EGQMKILVAEEIDNNFNFSSPKQIQELLFDKLKLPNLEKGTTSKEVLEKLITYHPIINLL
LEHRKYTKLYTTYLKGFEKFIFDDNKVHTIFNHTLTNTGRLSSSYPNIQNISIRDNEQKE
VRKIFITNNNKTFLSYDYSQIELRVLAQMSKETNLINAFNQNADIHLQAAKLIFNLSDDQ
ITSEQRRIAKVFNFGILYGLTDFGLASDLNISVNQAKQMIKDYYSAFPSLLDFKEKQVEI
ATSQGYITTLSNRRRYINELNSTNHNIRQFGKRIAVNTPIQGTASDILKVAMISIYKKLK
EQNLDARIVCQIHDEIILEVDDNQLEQTKKIVVHELENALEKLFLDLNLKEQVVVKLKVG
ESVGKTWFDLK
NT seq 2736 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaactaaaattttagtagtagatggtaattctttgatttttagagctttttatgca
actgcttattcaccaaatactagtttattaaaaacaaaaagcggtgttttaacaaatgca
gcttattcttttattaatatgttattatctgtaattcatcaaagaggaccttatgatcat
attttaatagcatttgataaaggtaaaaaaacttttagacacgatttattaagtgattat
aaagctaatagaattaaaactcctaatgaattagttgaacaatttagtattgttagagaa
tttttaacaaaagcaaacattcaatgatttgaacaagaaaacattgaagctgatgatatt
gttggatcaatttgtaaatatgctgaaaaacaatttgataatttacaagctgaaatttta
agtagcgataaagatatgtatcaactaattacaaataaagtaatttgtttaaacccaatt
caaggagttaatgaacttgaagaagttgatactaataaattgtttgaaaaatgacaaatt
ttaccaaaccaagttccagattataaagcaatagttggtgattcttcagataatttaaaa
ggagttaatgggattgggcaaaaaggagctattaaattaattcaacaatatcaaaattta
gaaaatatttataataatttagaacaaataaaaggtgctattaaaactaaattagaacaa
gataaaaaaatggcttttttatgtaaagatttagcaacaatcaaaactgatgtaacttta
gaaaatttttcttttaaaaaattagattttaatgttgataatatttatgagtttttaaat
aaatatgaaatgtattctttaaaaaaacgctttacaaatattttaaatcttgattttaac
ccttatcaaaataaaaaacaaaatttagatgttaaaataattaattcttgatcaaaagat
tatgaagattctataaattatttatatgttgaatcattagaagaagattatcataaagat
aaaattattggaattggtatttcaaataataaaggtaatttttatttagattttaaaaat
aaagctcaacaattatctttttttgaagatacaacactaagttcaactaatagtttgttt
gaagaatttttaaataatcctaatttaaaaaaatatacttatgatattaaaaaaactact
tatttattaaaaaatcacaagtataatgttttagcaagtaattttgattttgattttatg
gttgcttgttattctttaaatgctaatgttgtttctgatttatctagtcaaattaaatta
gttgataatttggttgaattagaaactattgatgaaatttttggaaaaggtgttaaaaaa
aatccagatatagatcttgatattaaatctaaatatattagtaaaaaagcttatttgtta
aaaaaatattctgatcaattaattgaacaattaaaacaaactaatacttatgatttatat
ttaaaaattgatcatcctttaattgaggttttatatgatattgaagttcaaggaatttta
atagataaagaacaattaaaactacaaacccaacaaatattaaaaaagataaatcatatt
gaaggacaaatgaaaattttagttgctgaagaaattgataataattttaatttttcttca
ccaaagcaaattcaagaattactatttgataaattaaaattacctaatttagaaaaaggt
actactagtaaagaagttttagaaaaattaataacttatcatccaataatcaatttatta
ttagaacatagaaaatatactaagttatatacaacttatttaaaaggttttgaaaaattt
atttttgatgataataaagttcatactatttttaatcatactttaacaaatactggtaga
ttaagttcttcttatccaaatattcaaaatatttctattagagataatgaacaaaaagaa
gttagaaaaatttttattacaaataataataagacttttttaagttatgattattctcaa
attgaactaagagttttagcacaaatgtctaaagaaacaaatttaatcaatgcatttaat
caaaatgctgatattcacttacaagctgctaaactaatttttaatcttagtgatgatcaa
atcacaagtgaacaaagaagaatagctaaagtttttaattttggaattttatatggttta
actgattttggtttagcaagtgatttaaatatcagtgttaatcaagcaaaacaaatgatt
aaagattattattctgcttttccaagtttattagattttaaagaaaaacaagtagaaata
gcaacaagtcaaggttatattacaactttatcaaatagaagaagatatattaatgaatta
aattcaacaaatcataacattagacaatttgggaaaagaatagcagtaaatacaccaatt
caaggaactgcttcagatattttaaaagtagctatgataagcatttataaaaagttaaaa
gagcaaaatttagatgctagaattgtttgtcaaattcatgatgaaattattttagaagtt
gatgataatcaattagaacaaactaaaaaaattgttgttcatgagttagaaaatgcttta
gaaaaactatttttagatctaaatttaaaagaacaagtagttgttaaattaaaagttgga
gaatcagttggtaaaacttgatttgacttaaaatag

DBGET integrated database retrieval system