Mycoplasma mycoides subsp. capri LC 95010: MLC_6430
Help
Entry
MLC_6430 CDS
T01478
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha subunit
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mml
Mycoplasma mycoides subsp. capri LC 95010
Pathway
mml03030
DNA replication
mml03430
Mismatch repair
mml03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mml00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
MLC_6430 (dnaE)
03430 Mismatch repair
MLC_6430 (dnaE)
03440 Homologous recombination
MLC_6430 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mml03032
]
MLC_6430 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mml03400
]
MLC_6430 (dnaE)
Enzymes [BR:
mml01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
MLC_6430 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
mml03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
MLC_6430 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mml03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
MLC_6430 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
HHH_6
PHP
tRNA_anti-codon
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBW54371
UniProt:
F4MQI8
LinkDB
All DBs
Position
complement(821379..824342)
Genome browser
AA seq
987 aa
AA seq
DB search
MNYISLLTIKNQYDFLESLITIDQYIEFIKKNKLSYAFYSETHTMYGVAEFFKKATDNNI
KPIIGLTIEFEDSTKLIIYAKNKKGYQILNFVSSFLNDGFNHYDYEIKEYILELVNNNVV
VVGLINDLDFKSYLINKLNDDFYDVKELNLYFNQISYLDINDQKTYSILNAIKTNKTIEQ
IQNINNYFYPDIDYLIKNYSLENIKKVINEINSKVDFNLFDSNEKHLVKYKNINNLSSYE
YLRQVCLLSLKKYQQKIKPNLDLKLYINRLNYELEVIKQMGFSDYFLIVSDYVNFAKKND
ILVGPGRGSAAGSLISYLLRITDIDPLEYDLLFERFLNPDRSNLPDIDLDFQDNRREEVL
EYLFEKYGKYHVGMITTYQTIGYKMAWRDVCRVFNIDLLIVNKISKVLDQYTNSDFLEFI
KENKLLNDYFQNDLFKEIFITMHKIVGLPRQTSTHAAGIVLTDCDLRELVPIKIGFNGIN
QTQFDMNYLDALGLIKMDILGLRNLTTIQEIKHLIYLNQNLKISLNKIDLNDRKAFELLK
NKQTSGIFQLESKGMTDLISKMQVDSIEQISIASALYRPGPQEMIPIYLENKKTNKFKII
DKSVYEILKPTYGIIVYQEQVMQMLNKVANFSYAKADIIRRAMSKKNNKVMQSMKLEFIN
SAIKNNFSYNKANLIWNWIEKFSNYGFNKSHSISYSYISYWLAYFKAHFTTEFYTSLLDQ
NIGNEIKTQQYIKELYDYKIKVNKPSVINSNFNYQIINKQIYMPLTCIKSIGYEVVKKIN
LAKSENENMYLDIHNFILAMIKQKINVNVLQTLIKAGALDIFNYNKKTMIENLDLLISQA
NAYKQVNNILDDEKINLIIYDEYEDEILASFEKELYGFFIDQNPILKLKTNNFNLNLIDI
SKLEYNKVQVVLGYILKIKEIKDKNNNKMAFVTVFDNTSELELTIFSSDYKDLSDQLIEN
KAYVFKVLKTKTNNKTSIKFISLIKAI
NT seq
2964 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaactatatatctttattaactattaaaaatcaatatgattttttagaatctttaatt
actattgatcaatatatagaatttattaaaaaaaataaacttagttatgctttttatagt
gaaactcatactatgtatggtgttgctgagttttttaaaaaagctactgataataacata
aaaccaataattggtttaacaattgaatttgaagattctactaaactgataatttatgct
aaaaacaaaaaaggttatcaaattcttaattttgtttctagttttttaaatgatggattt
aatcattatgattatgaaattaaagaatatattttagaactagttaataataatgtagtt
gttgttggattaattaatgatttagattttaaatcatatttaataaataaattaaatgat
gatttttatgatgttaaagaattaaatttatattttaatcaaataagttatttagatata
aatgaccaaaaaacttatagtattttaaatgcgattaagactaataaaacaatagaacaa
attcaaaatattaataattatttttatccagatattgattatttaataaaaaattattca
ttagaaaatattaaaaaagttattaatgaaattaattcaaaagttgattttaacttattt
gatagtaatgaaaaacacttagtaaaatacaaaaatataaataacttatcttcatatgaa
tatttgcgtcaagtttgtttattatcattaaaaaaatatcaacaaaaaattaagcctaat
ttagatttaaaactatatattaatagattaaattatgaattagaagttattaaacaaatg
gggtttagtgattattttttaatagttagtgattatgtaaattttgcaaaaaaaaatgat
attttagtaggtcctggtagaggaagtgctgctggtagtttaattagctatttattaaga
attacagatattgatccattagaatatgatttattatttgaaagatttttaaatccagat
cgttctaatttaccagatattgatttagattttcaagataatagaagagaagaagtttta
gaatatttatttgaaaaatatggtaaatatcatgttggtatgattacaacttatcaaact
attggttataaaatggcttgaagagatgtatgtagagtttttaatattgatttattaatc
gttaataaaatttctaaagttttagatcaatacacaaattctgattttttagaatttatt
aaagaaaataaattattaaatgattattttcaaaatgatttgtttaaagaaatatttata
acaatgcataaaattgtaggcctaccacgtcaaacatcaacacatgcagctggaattgta
ttaactgattgtgatttaagagaacttgttcctattaaaattggttttaatggaattaat
caaactcaatttgatatgaattatttagatgctttaggtttaattaaaatggatatttta
gggttaagaaatttaactactattcaagaaattaaacacttaatatatttaaatcaaaat
ttaaaaattagcttaaataaaattgatttaaatgatagaaaagcttttgaacttttaaaa
aataaacaaacctcaggaatttttcaacttgaatcaaaaggaatgactgatctaatttca
aaaatgcaagttgattctattgaacaaatttcaatagcttcagctttatatcgtccaggt
cctcaagaaatgattcctatttatttagaaaataaaaaaactaataagtttaaaattatt
gataaaagtgtttatgaaattttaaaaccaacttatgggattattgtttatcaagaacaa
gtgatgcaaatgcttaataaagtagctaatttttcttatgcaaaagcagatattattaga
agagctatgagtaaaaaaaataataaagtaatgcaatcaatgaaattagaatttattaat
agtgcaattaagaataatttttcttataataaagctaatttaatttgaaattgaattgaa
aagttttcaaattatggatttaataaatcacattctatttcttattcttatataagttat
tgattagcttattttaaagctcattttacaactgaattttatactagtttattagatcaa
aatattggtaatgaaatcaaaactcaacaatatattaaagaattatatgattataaaatt
aaagttaataaaccaagcgtaattaattctaattttaattatcaaattataaataaacaa
atttatatgcctttaacttgtattaaatcaattggttatgaagtagttaaaaagattaat
ttagctaaaagtgaaaatgaaaatatgtatttagatattcataatttcatactagctatg
attaaacaaaaaattaatgttaatgtattacaaactttaataaaagctggagctttagat
atttttaattataataaaaaaacaatgatagaaaatctagatctattaattagtcaagct
aatgcttataaacaagttaataatattttagatgatgaaaaaattaatttaattatttat
gatgaatatgaagatgagattctagcaagctttgaaaaagaattatatggtttttttatt
gaccaaaatcctattttaaaacttaaaactaataattttaatttaaatcttatagatatt
tctaaacttgaatataataaagtacaagtggttttaggttatattttaaaaattaaagaa
attaaagataaaaataacaataaaatggcatttgtaacagtttttgataacactagtgaa
cttgaactaacaatttttagtagtgattataaagatctttctgatcaattaatagaaaat
aaagcttatgtttttaaagtattaaaaactaagacaaataataaaacttcaataaagttt
attagtttaattaaagctatttag
DBGET
integrated database retrieval system
