KEGG   Mycoplasma mycoides subsp. capri LC 95010: MLC_8100
Entry
MLC_8100          CDS       T01478                                 
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA directed RNA polymerase beta' chain
  KO
K03046  DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]
Organism
mml  Mycoplasma mycoides subsp. capri LC 95010
Pathway
mml03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mml00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    MLC_8100 (rpoC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:mml03021]
    MLC_8100 (rpoC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mml03400]
    MLC_8100 (rpoC)
Enzymes [BR:mml01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     MLC_8100 (rpoC)
Transcription machinery [BR:mml03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     MLC_8100 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:mml03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      MLC_8100 (rpoC)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 Peptidase_M23
Other DBs
NCBI-ProteinID: CBW54540
UniProt: F4MR06
LinkDB
Position
complement(1002966..1006733)
AA seq 1255 aa
MENLNRKKAIKIELANPDTIRSWSHGEVLKPETINYKTLKAEKDGLFDERIFGPTKNYEC
VCGRYKKANPMNKGKKCEKCGVELTESIVRRERMGHIELEEPVTHIWMLKVAPYRIAAIL
DLKAKELEEVVYFVSHIVLEQGNQKHFIEKEVLDLGSSRITKTREKLQLTILDVIDLIND
PNHRDTKKANRLLEELKNTAVPFSIDEATSLISKYTGAKFGIGARAVEYLLEKVDLKKEI
EAIKAQLENSKKTPNERTKLLKRLETFDALKRSNQRPEWMVMRVIPVIPPDIRPIIQLDG
GRFTTSEINDLYRRIIIRNERLKKVKEMGAPSIIVNNEKRMLQEAVDALFDNERKPKPVQ
GKNKRPLKSLTSVLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSARSVIAIGPDLKMYQAGLPREMAITLF
KPFVIQWLQDHEYAENVKIAEKMLLQNDPKVWEALEQVIKDRPVLLNRAPTLHRLGIQAF
EPKLVKGKAIRLHPLVTTAFNADFDGDQMAVHVPITKEAVAESRALMLGSSAILGPKDGK
AIVTPGQDIILGNYYLTTEEKDAKGQGMIFSSLDEAFMAYKSNQVDLNSLIGIALSALPE
QKFSDKNQRLNSYLLTTVGKLYFNQIFDDNFPWINSNNIWNAKEAVKEFIYDFSQDIDKV
IENVQVQQPIKKKELSLIIERYFETHGARKTAEMLDKMKDLGFSFSTKSGTTISAGDVVA
FTHKYDEFKQADQKVEQITDFYNMGMLTNSEKKRRIIEVWSDVKDKIQNELATVLRKDVK
NPIFVMVDSGARGNVSNFTQLVGMRGLMNDTKGDIKEIPIKSSFREGLTVSEYFVSTHGA
RKGMADIALKTADSGYLTRRLVDVSQEIVVVNEDCEPTKGFKVSAIIDTKHDNVIVPLKD
RLVGRFTFEDIYDDNKNLIVSANTLIDKNIADKIIMAGISSVIIRSVLTCDNKRGVCQKC
YGLNLATASVVNIGEPVGVIAAQSIGEPGTQLTMRNFHTGGVAGNVDITQGLPRIKELLD
VTTPKGAVAIISEVDGVVSEIEDYNGVFVINIVTENEEVKKYKTEFNSVLRVEQGSSVVA
GQKLTEGAIDLHQLLEFGGIQDVQNYILKEVQKVYRLQGIEISDKYIEIIIKQMLNKVKI
TDSGDSDLLPGEVITIQNYKEVVQDCIVKSIRPPLSKAQIFGIKKAPLESNSWLSSASFQ
DTARVLTRAIIKGKEDKLEGLKENIMLGNLIPAGTGLTGTQEVEQLAEQYHNNEY
NT seq 3768 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaaaatctaaatcgtaaaaaagcaataaaaattgaattagctaaccctgatacaatt
cgttcatgatcacatggtgaagttttaaaaccagaaactatcaactataaaacattaaaa
gctgaaaaagatgggctatttgatgaaagaatttttggaccaactaaaaactatgaatgt
gtttgtggaagatataaaaaagccaaccctatgaataaagggaaaaaatgtgaaaaatgt
ggtgttgaattaactgaatcaattgttagaagagaaagaatgggacatattgaattagaa
gaaccagttactcacatttgaatgttaaaagttgctccttatagaattgctgcaatttta
gatctaaaagctaaagaactagaagaagtagtttattttgtttcacatattgttttagaa
caaggaaatcaaaaacattttattgaaaaagaagttttagatttaggttcatcaagaatt
actaaaactagagaaaaattacaattaacaattttagatgttattgatctaattaatgat
ccaaatcatagagatacaaaaaaagctaatagattattagaagaattaaaaaatactgct
gtgccattttcaattgatgaagctactagtttaattagtaaatatactggtgcaaaattt
ggaattggagctagagctgttgagtatctattagaaaaagtagatctaaaaaaagaaatt
gaagctattaaagctcaacttgaaaattctaaaaaaaccccaaatgaaagaactaaatta
ttaaaacgtttagaaacttttgatgctttaaaacgttctaatcaacgtcctgaatgaatg
gttatgagagtaattccagttattccgccagacattcgtccaattattcaattagatggt
ggtagatttactacttctgaaattaatgatttatatagaagaatcattattagaaatgaa
agattaaaaaaagttaaagaaatgggtgcaccatcaattattgttaataacgaaaaacgt
atgttacaagaagctgttgatgctctatttgataatgaaagaaagccaaaaccagttcaa
ggtaagaacaaacgtccattaaaatctttaactagtgttttaaaaggaaaacaaggtcgt
tttagacaaaacttattaggaaaacgtgtcgattattcggctagatcagttatcgcaatt
ggaccagatctaaaaatgtatcaagcaggtttaccaagagaaatggcaattactttattt
aaaccatttgtaattcaatgacttcaagatcatgagtatgctgaaaatgttaaaatagct
gaaaaaatgttattacaaaatgatccaaaagtttgagaagcactagaacaagtaattaaa
gatcgtccagttttattaaaccgtgcaccaaccttacaccgtttaggaattcaagcattt
gaacctaaattagttaaaggaaaagcaattcgtttacacccattagttacaactgcattt
aatgctgactttgatggtgatcaaatggcagttcacgttcctattacaaaagaagctgtt
gctgaatcaagagctttaatgttaggatcaagtgcaattttaggaccaaaagatggaaaa
gctattgttactcctggtcaagatatcattttaggaaattactatctaactactgaagaa
aaagatgcaaaaggtcaaggaatgatcttttcaagtttagatgaagcatttatggcttat
aagagcaatcaagttgatttaaactcattaattggaattgctttatcagctttacctgaa
caaaaatttagtgataaaaatcaaagattaaattcttatttactaacaactgttggaaag
ctttactttaatcaaatttttgatgacaatttcccatgaattaattcaaataatatttga
aatgctaaagaagcagttaaagaattcatttatgatttttcacaagatattgataaagta
attgaaaatgttcaagttcaacaaccaattaagaaaaaagaattatcactaattattgaa
agatactttgaaactcatggagctagaaaaactgctgaaatgctagataaaatgaaagat
ctaggatttagtttttcaacaaaatcaggaactacaatttcagctggagacgttgttgct
tttactcataaatatgatgaatttaaacaagcagatcaaaaagttgaacaaatcactgat
ttttataacatgggtatgctaactaatagtgaaaagaaacgtagaattattgaagtttga
tctgatgttaaagacaagattcaaaatgaattagcaacagtactacgtaaagatgttaaa
aatccaatttttgtaatggttgattcaggagcccgtggtaatgtttcaaacttcactcaa
ttagttggtatgcgtggattgatgaacgatactaaaggagatattaaagaaattcctatt
aaatcatcattccgtgaaggattaacagtttcagaatatttcgtttcaactcatggagct
agaaaaggtatggcagatattgccttaaaaactgctgactcaggttatttaactagaaga
ttagttgacgttagtcaagaaattgttgttgttaatgaagattgtgaaccaactaaagga
tttaaagtatcagctattattgatacaaaacatgataatgttattgttccattaaaagat
agattagttggaagatttacatttgaagacatttatgatgataataaaaacctaattgtt
tctgctaacacattaattgataaaaatattgctgacaaaatcattatggcaggtattagt
tcagtaattattagatcagttctaacttgtgataacaaacgtggtgtttgtcaaaaatgc
tatggattaaacttagctactgcttcagttgttaatattggtgaaccagtaggagttatt
gctgctcaatcaattggagaaccgggaactcaattaacaatgcgtaacttccatacagga
ggggttgctggtaatgttgatattactcaaggacttcctcgtattaaagaattattagac
gttacaactccaaaaggtgctgttgctataatttctgaagttgatggagtagttagtgaa
atcgaagattataatggtgtatttgtaattaatattgttactgaaaatgaagaagttaaa
aaatataaaactgaatttaactcagtattacgtgttgaacaaggatcaagtgttgttgct
ggtcaaaaattaactgaaggagctattgatttacaccaattattagaatttggtggaatt
caagatgtgcaaaattacattttaaaagaagtacaaaaagtttatagattacaaggtatt
gaaatttcagataaatatattgaaatcatcattaaacaaatgttaaataaagtaaaaatt
actgatagtggtgattctgatttattacctggagaagttattacaattcaaaactataaa
gaagtagtacaagattgtattgttaaatcaattagaccacctttatcaaaagcacaaatc
tttggtattaaaaaagcacctttagaatcaaattcatgattatcttctgcttcattccaa
gatactgctagagtattaactagagcaattattaaaggaaaagaagataaattagaagga
ttaaaagaaaatattatgttaggtaatttaattccagctggtacaggtttaactggaact
caagaagttgaacaactagcagaacaataccataacaatgaatattaa

DBGET integrated database retrieval system