Mycoplasma mobile: MMOB0570
Help
Entry
MMOB0570 CDS
T00176
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha subunit
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mmo
Mycoplasma mobile
Pathway
mmo03030
DNA replication
mmo03430
Mismatch repair
mmo03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
MMOB0570 (dnaE)
03430 Mismatch repair
MMOB0570 (dnaE)
03440 Homologous recombination
MMOB0570 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mmo03032
]
MMOB0570 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mmo03400
]
MMOB0570 (dnaE)
Enzymes [BR:
mmo01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
MMOB0570 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
mmo03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
MMOB0570 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mmo03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
MMOB0570 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
HHH_6
PHP
T2SSK
HHH_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAT27543
UniProt:
Q6KIN3
LinkDB
All DBs
Position
74868..79169
Genome browser
AA seq
1433 aa
AA seq
DB search
MIKKQAFEKFCKEINYLIPQELENTFIIKSVLDHKIDAFVLHFSIFYVVDYKIISNFINT
IKKNFAYKTIIKFSIENLVYKQETILDYINNLIFNIYKIEDFINNLNKNNFQMAENGVLK
IFYTSEHEKNRYQNYQNFIEISMENLGFETFKIIFEKSEIFLQQENDDEKLIADFLKNQN
LSKNIEEKKSKIFKSSSKKMYKKTVKELYDTFEQDVYVEAYVVDKKIFETKNKNLILTIT
ISDNTEAIKLRRFFESKDQLNSFDITNIGDFIVIEGKVDFDTFNKEKIIYPKTITISKDK
KESSVDMEIEKRIELSIRTTMSTMDGFKEADDFVSFAKQLNHESLAIVDIDSVQSFPNFF
NAVKKANIKGIYGASFSTIFKNNQAIKNLKKNTLIKNETYVVFDLETTGLSPIFDDIIEF
GAQKILNGKVIDTLQFFVKPNKEISEKITLITGIKNQDVENAISEKEALKKILEFMGDHT
VVAHNATFDMNFINEKIEKYNFQESNLQIIDTLVVSKIIEPEAKKFSLENLASRSGIIYN
STEAHRADYDADVLAKVWNLYIQKLSDMNVKYFDDIYNFKSNIIYEKTRPFEITILAKNQ
SGLKELFQKISLTSTKQYFNGPKMFFEDLLEKSKNILIGSGTLKSLIINEVFRGTRKGLR
EYLKYFDYVEIIPPKNFSHWIKNEDILKEELLEGLKILVEESKKLNKIVVAVGDVRYVQK
DEKILHEIYINAKGLQGIRHPLFKYDQSETDYPTLNYLNTQEMIDQFLFLQDNDLIKEIV
VKNTHLISNQIENNIEVIKKDLFTPKIENSANLLRELVYAKAFEIYGKNLPELIISRIEK
ELNPIIEQGYDVIYWISHKIVAKSLEDGYIVGSRGSVGSSLVAYLSGITEVNPLPPHYIC
SNCKDCEFIKNLDITSGYDLPHKNCNNCYKALKREGQTIPFETFLGFGANKVPDIDLNFS
NEYQHIVHDEVRKWFGEDHCFRAGTISKTADKTAYGYVLAWAEENNLTFSNAFIGYLASK
IVGTKRTTGQHPGGIIVIPKDFSVEDFTPINFPANDPNSSWKTTHFDFHAIHDNVLKLDL
LGHNDPTAIKFLTSLTNVNVFDIPFNDEKVLSLFTSTKALNIKPEDISGEHTGALGFPEF
GTTFVRKMLVSAKAKSFSDLISVSGLSHGTDVWNNNAEDLILKKNLQLKDIISCRDDIMV
FLITKGVNELKAFQIMENVRKGKGLNSEEEQLLKAHKVSDWYIDSLNKIKYMFPKAHAAA
YVMMAWRIAWFKLYYPLEFYASYFTTRADFIDIKIMSSTKKTISEKLSDFKRRRNSKGED
KLSAKEQGLITVLEIAEEMYARGFKISKISINKSEATNWIIDKESNSLIPPFNAMDGLGV
AVAESIIEQRKKKPFISIEDVIERTSVNKTLNEKFIELEIYEDLNESNQTSLF
NT seq
4302 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaaaaacaagcttttgaaaaattttgtaaagaaattaattatttaattcctcag
gaattagaaaacacttttattattaaaagtgttttagatcataagattgatgcttttgtt
ttacatttttcaattttttatgtagtagattacaaaattatttcaaattttataaataca
ataaaaaagaattttgcttacaaaacaattataaaattttcaattgaaaatcttgtttat
aaacaagaaactattttagattacattaataatttaatttttaatatttataaaattgaa
gatttcataaataatttaaataaaaacaattttcaaatggctgaaaacggggttttaaaa
attttttatacttccgaacatgaaaaaaacagatatcaaaattatcaaaatttcatagaa
ataagcatggaaaatttgggttttgaaactttcaaaattatttttgaaaaatcagaaatt
ttccttcagcaagaaaatgatgatgagaaactaattgctgattttttgaaaaatcaaaat
ttatctaaaaatatagaagaaaaaaaatcaaaaatttttaaatcaagttcaaaaaaaatg
tataaaaaaactgtcaaggaactttatgatacttttgaacaagatgtttatgttgaagct
tatgttgttgataaaaaaatatttgaaaccaaaaacaaaaatctaattttaacaattact
atttcagataatacagaagccatcaagcttagaagattcttcgaatcaaaagatcaattg
aatagttttgatataacaaatattggggattttattgtaatagaaggaaaagtagatttt
gatactttcaataaagaaaaaattatttacccaaaaacaattacaatttcaaaagacaaa
aaagaatcaagtgttgatatggaaattgaaaagagaattgaactttcaattagaactact
atgtccacaatggacggttttaaagaagcagatgattttgttagttttgctaaacaacta
aatcatgaatcattagctatagtagatattgattctgttcaatctttcccaaattttttt
aatgcagtaaaaaaagctaatattaaaggaatttatggtgcttcttttagtactattttc
aaaaataatcaagcaataaaaaatttgaaaaagaacactttaattaaaaatgaaacatat
gttgtttttgatttggaaacaacaggtttaagtcctatttttgatgatattattgaattt
ggagcacaaaaaattttaaatgggaaagtaatagatactcttcaattttttgtaaagcca
aacaaagaaatttccgaaaaaataactttgattactggaattaaaaatcaagatgtagaa
aatgcaatttcagaaaaagaagcgcttaaaaaaattctagaatttatgggtgatcatact
gtagtagctcataatgctacttttgatatgaattttattaatgaaaaaatagaaaagtac
aattttcaagaatcaaatctgcaaattatagatactttggttgtctcaaagattattgaa
ccagaagcaaaaaaatttagtcttgaaaatttagcttcaagatcaggaattatttacaat
tcaactgaagcacatagagccgattatgatgctgatgtgcttgcaaaagtttgaaatcta
tacattcaaaaattgtcagatatgaatgtaaaatattttgatgatatttacaattttaaa
agcaatattatttatgaaaaaacaagaccttttgaaattacaattcttgctaaaaatcaa
tcaggcttaaaagaattatttcaaaaaatttccttaacatctactaaacaatattttaat
ggtcccaaaatgttttttgaagatctattagagaaatctaaaaatattttaattggttct
ggaactttgaaatcattaattataaatgaagtttttagaggaacaagaaaaggcttaaga
gaatacttaaaatattttgattatgtagaaatcattcctccaaaaaatttttctcattga
ataaaaaatgaagacattcttaaagaagaacttttagaaggcttaaaaattttagtagaa
gaatctaaaaaactgaataaaatagtagttgctgtcggagatgtaaggtatgttcaaaaa
gatgagaaaatacttcacgagatttacatcaatgcaaaaggtcttcaagggataagacat
cctttatttaaatatgatcaaagtgaaacagattatccaactttaaattatttaaatact
caagaaatgattgatcaatttctttttttacaagacaatgatcttattaaagaaatagtt
gtaaaaaacacccatttaatttcaaatcaaattgaaaataacattgaagtaattaaaaaa
gatctttttacaccaaaaattgaaaattctgcaaatttattgcgagaattagtttatgca
aaagcttttgaaatttatggcaaaaatttacctgaattaatcatctcaagaattgaaaaa
gaactcaatccaattatagaacaaggatatgatgttatatattgaatttctcataaaatt
gtagcaaaatctttagaagatggatatattgtaggttcaagaggctctgtaggttcttcg
ttagttgcttatttaagcgggattactgaagttaaccctttacctcctcattatatttgt
tcgaattgtaaagattgtgaatttattaagaatttagatatcacttcaggatacgattta
cctcataaaaactgcaataattgttataaagcattaaaaagagaaggtcaaacaattccg
tttgaaacttttttaggttttggagctaataaagttcctgatattgatttaaatttttca
aatgaatatcaacatattgttcatgacgaagtaagaaaatgatttggagaagatcattgt
tttagagctggaacaatatctaaaacagctgacaaaactgcttatggttatgttcttgct
tgagctgaagaaaataatttgactttttctaatgcttttattggttatttagcttcaaaa
attgtaggaacaaaaagaacaacaggacaacatcccgggggaattatagttattccaaaa
gacttttcagtagaagactttactccgattaattttccagcaaatgatcctaattctagt
tgaaaaacaactcattttgatttccatgcaatacatgataatgttttaaagttagattta
ttagggcacaatgatccaacagcaattaaatttttaacttctttaacaaatgtgaatgtt
tttgacattccttttaatgatgaaaaagttttaagtttatttacttcaacaaaagcttta
aacattaaaccagaagacatttcaggtgaacatacaggagctttaggttttcctgagttt
ggaacaacatttgttagaaagatgttggtttctgctaaagctaaatcattttctgatttg
atttcagtatcagggctatcacatggaactgatgtttgaaataacaacgctgaagattta
attttaaagaagaatttacagttaaaagacatcatttcttgtagagatgacatcatggtt
tttttaataacaaaaggtgttaatgaattgaaagcatttcaaattatggaaaatgttcgt
aaaggtaaaggtctaaattcagaagaagaacaactgttaaaagctcacaaggtttctgat
tggtatatagattctttgaataaaatcaaatacatgtttccaaaagctcatgcagccgct
tatgtaatgatggcttgaagaattgcatgatttaaattgtactatccattagaattctat
gcttcttatttcacgacaagagctgattttatagatattaaaattatgtcttctacaaaa
aaaacaattagtgaaaaactaagtgattttaaaagaagaagaaattcaaagggagaagat
aaactaagtgcaaaagaacaaggattaataacagttttagaaattgcagaagaaatgtat
gcaagaggttttaaaatttcgaagattagtataaataaatctgaagcgacaaattgaatt
attgataaagaatcaaatagtttgatacctccttttaatgccatggatggcttaggagtt
gctgtagcagaaagcataattgaacaaagaaagaaaaaacctttcatttcaattgaagat
gttattgaaagaactagcgtaaataaaactttaaatgaaaagtttattgaattagaaatt
tatgaagacttaaatgaatcaaatcaaacaagtttattttaa
DBGET
integrated database retrieval system