Mesomycoplasma moatsii: V5E84_01875
Help
Entry
V5E84_01875 CDS
T10790
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mmoa Mesomycoplasma moatsii
Pathway
mmoa03020
RNA polymerase
Brite
Enzymes [BR:
mmoa01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
V5E84_01875 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
mmoa03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
V5E84_01875 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mmoa03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
V5E84_01875 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XLO82589
LinkDB
All DBs
Position
complement(398198..402442)
Genome browser
AA seq
1414 aa
AA seq
DB search
MAIVSRKYYDIEENKIDKVSLGIATPEDVLEWSHGEVTKPETINYKTYKPEPDGLFDELI
FGPVIDYKCPICAKKYKRSSEGLFCEATELCKEKKPEILPKISRRSRMGHIKLNSPVVHF
WFFKIDNSIITKLLGLKVGDTDKSQTRVSLEGVIYYKSHIVLESGGLKSLPKNLIIEINE
AAVIYRDALMEIRDKFDVDSNEYKEITTAIEDLEERATSKEGKDYGIDFYELNEIIEEYS
DARIDSGAKAIEFLLKNFDLHEARKEVKAEIQKLTKQIAADKEKGKQSKIQQREKLYKRI
KIINSFISSGQHPKDMLIYNLPVIPVDLRPLIQLDGGRHSTSDINELYRRIIIRNNRLKK
WQESDAPILILQNELRMIQEAVDALIDNAKRTSNQVVSKDNRPLKSIADALTGKKGRFRQ
NLLGKRVDYSGRSVIVVGPELKMHQVGVPREMATKLFEPWIVKELISKDVTTSIKGAKKL
IDDLNPIIWPHVANAIRNKPVLLNRAPTLHRLSIQAFEPVLIRGKAIKLHPLVTTAFNAD
FDGDQMAIHVPISDKAMYEARELIMANKNILGPKDGEPIINPSQDIVLGLYYLSLEKENQ
KGEGKFFSDFDSMMIAYQNKEIDLHARIAIPYSSIKPELAKENEKRASSCIISTVGKFIF
NNVMPEHMPFIFDNSNESLEDKNDKYFVSLGSDIKEVIKKLEINQPFTKKSVAKIIRRFF
ETYVANTSIRQVASVIKHLNNDLIKNSSYVEKQFQKIKSLVPDKLISKHHAKILAKLVIK
DYQLILKQIEIENKKQHNFESSVVRELEKNEKVALTQNVWFNYTNQVAHVLDKIKELGFK
YSTISGITISYSDVISADNKKENIAEGNAYVDQLKQKFQLGLITDYERYTLTIKKWTEIK
QRIQDNLDEKIKENPFNPIHMMINSGARGNISNLVQLAGIRGLMANNTKQLKADAQNERG
VYSVVEVPVKSSFLDGLSAYEFYSSTHGARKGLTDTALNTARSGYLTRRLVDVGQSIVVR
EEDCGSDFGYVVKSIIDSRTKQIIVDFKERIEGRFTNSPIVDKNGKMIIEKNTLITPELV
KKIVAAKINEVDIRSILGCHTKNGVCKKCYGKDLSTNRVVSIGEAVGIIAAQSIGEPGTQ
LTMRTFHSGGVAGVEDITGGFGRLIELIDAYDKPWGRTAIIANRTGKIVSIKPDYNQVNV
EIIELEYTNENGIKSIEKYETTSNVRKRVKVGDNVVPGQKITDGPIILKDLLRLTSPRVV
QNYLLKEIQRIYRMQGIAISDKYIEIIIRQMLSKVVITDAGDSSFFVGAIEDIFTYQEEA
KKLIIKGKKPPYGTVVIKGAKQTPLLSESFLAAASYQETSKILVHAAISNQVDNLEGLKE
NIILGHKIPVGTSSNYEQDSKYDLLDLNEFFSEK
NT seq
4245 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctatagtttcaagaaaatattatgatattgaagaaaataaaattgataaagtttcg
cttggtattgcgactcctgaagatgttttagaatgatctcatggtgaagttactaaacct
gaaaccattaattataagacttataaaccagaacctgatggtttatttgatgaattaatt
tttggtccagttattgactataaatgtccaatttgtgctaaaaaatataaaagatcttct
gaaggtttgttttgtgaagctacagaattgtgtaaagaaaaaaaacctgaaattctgcca
aaaatatcacgtagaagtagaatgggtcatattaaattaaattctcctgttgttcatttt
tgattctttaaaattgacaattcaattattactaagttattgggtctaaaagttggagat
acagataaaagtcaaacaagagtttctcttgaaggtgttatttattataaatcgcatatt
gttttagaatcaggtggtttaaagtcattgcctaaaaatttaattattgaaattaatgaa
gctgctgttatttatagagatgctttaatggaaattagagataaatttgatgttgattca
aatgagtataaagaaataactacagctattgaagatcttgaagaaagagctacttcaaaa
gaaggtaaagattacggtattgatttttatgaattgaatgaaataatagaagaatattca
gatgcaagaatagattcaggagcaaaagcaattgaatttttattgaaaaattttgattta
catgaagctagaaaagaagttaaagctgaaattcaaaaattaacaaaacaaattgctgca
gataaagaaaaaggaaaacaatcaaaaattcaacaaagagaaaaattgtataaaagaatt
aaaattattaactcttttatatcttcaggacaacatccaaaagatatgctaatttataat
cttccagttattccagttgatttgagaccgcttatccaattagatggtggacgtcattca
acttcagatattaatgaattatatcgaagaattatcattagaaacaatagattgaaaaaa
tgacaagaatcagatgctccaattttaattcttcaaaatgaattgcggatgattcaagaa
gcagttgatgctttgatagataatgcaaaaagaacttcaaatcaagttgtttcaaaagat
aatcgtccattaaaatcaattgctgatgctttaacaggtaaaaaaggaagatttagacaa
aatttacttggaaaacgtgttgattattctggtcgttcagttattgttgttggtccagag
ttaaaaatgcatcaagttggtgttcctcgtgaaatggctacaaagctatttgaaccttga
attgtcaaagaattaatttcgaaagatgttacaacttcaattaaaggtgctaaaaaatta
atcgatgatttaaatccaattatttgaccacatgttgctaatgcaattagaaacaaacca
gttttattaaatcgtgctccaacattacaccgtctttcaattcaagcttttgaaccagtt
ttaattcgtggtaaagctattaagttacatccattagttacaacagcattcaatgctgat
tttgatggtgatcaaatggcaatacatgttccaattagtgacaaagcaatgtatgaagct
cgtgagttaataatggctaataaaaatattttgggacctaaagatggtgaaccaattatt
aacccatctcaagatattgttttaggattgtattatttatctttagaaaaagaaaatcaa
aagggtgaaggaaaattcttttctgattttgattcaatgatgattgcttatcaaaataaa
gagattgatttgcatgccagaattgcaattccttactcatcaattaaacctgaattagct
aaagaaaatgaaaaaagagcaagttcatgcattatttcaacagtaggtaaatttattttt
aataatgttatgccagaacatatgccatttatctttgataattctaatgaatcattagaa
gataaaaatgataaatattttgtttcgttgggttcagatatcaaagaagttattaaaaaa
ttagaaatcaaccaaccatttactaagaagtcagttgcaaaaataataagaagatttttt
gaaacttatgttgctaatacttctattagacaagttgcttcagttattaaacatttaaat
aatgatttgattaaaaactcttcatatgtcgaaaaacaatttcaaaaaattaaatcatta
gttccagataaattaatttcaaaacatcatgcaaaaattcttgcaaaattagtaattaaa
gattatcaattgattttaaaacaaattgaaattgaaaataaaaaacaacataattttgaa
agttctgttgtaagagaacttgaaaaaaatgaaaaagttgctcttacacaaaatgtttga
tttaattacacaaatcaagttgctcatgtgttggacaaaataaaagaattaggatttaaa
tattcaactatttcaggtataacaatttcttattctgatgttatttcagctgataacaag
aaagaaaatattgctgagggtaatgcttatgttgaccagttgaaacaaaaattccaatta
ggtttaataactgattatgaaagatatacacttacaattaaaaaatgaaccgaaattaaa
caaagaattcaagataatcttgatgaaaaaataaaagaaaatccttttaatccaatccat
atgatgataaattcaggagctcgtggtaatatttctaacttagttcagttagcaggaatt
cgtggtttaatggcaaataatacaaaacaattaaaagctgatgctcaaaatgaacgtgga
gtttattcagttgttgaagttcctgttaaatcatcatttttagatggactttctgcatat
gaattctattcatcaacacacggtgctagaaaaggattaacagatactgctcttaacact
gctagatctggatatttaacacgtagattagtagatgttggtcaatcaattgttgtaaga
gaagaagattgtggatcagattttggttatgttgttaaatcaattattgattcaagaaca
aaacaaattattgtagattttaaagaacgtattgaaggtagatttacaaatagtccaata
gttgataaaaatggaaaaatgattattgaaaaaaatacattaattacaccagaacttgtt
aaaaaaatagttgcagcaaaaattaatgaagttgatattcgttcaattttaggttgtcac
accaaaaatggtgtatgtaaaaaatgttatggtaaagatttatcaacaaatagagttgtt
tcaattggtgaggctgtaggtattattgcagctcaatcaattggtgaaccagggacacaa
ttgactatgcgtacattccattcaggtggtgttgctggcgttgaagatattacaggtggt
tttggtcgtttaattgaattaattgatgcttatgataagccttgaggtcgtacagcaatt
attgctaatagaacaggaaaaatagtttcaattaaaccagattataatcaagtaaatgtt
gagattatagaactagaatatacaaatgaaaatggtattaaatcaattgaaaaatatgaa
actacatctaacgttagaaaaagagttaaagttggcgataatgttgttccaggacaaaag
attacagatggtccaattattttaaaagatctattaagattaacttctccaagagttgtt
caaaattatttattaaaagaaattcaaagaatttatcgtatgcaaggtattgcaatttca
gataaatatatagaaattattattagacaaatgttgtctaaagttgtgattactgatgca
ggcgattcaagtttctttgttggtgcaattgaagatatttttacatatcaagaagaagct
aaaaaacttattataaaaggtaaaaaaccaccatatggaacagtagtaattaaaggagca
aaacaaactccattgttatctgaatcattcttagcagcagcttcataccaagaaacatca
aaaattttagttcatgcagcaatttcaaatcaagttgataatttagaagggttaaaagaa
aatattattcttggacataaaattcctgttggaacttcttcaaattatgaacaagattca
aaatatgatcttctagacttgaatgagttttttagtgaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
