Mesomycoplasma molare: NX772_01615
Help
Entry
NX772_01615 CDS
T08463
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mmol
Mesomycoplasma molare
Pathway
mmol03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmol00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
NX772_01615 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mmol03021
]
NX772_01615 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mmol03400
]
NX772_01615 (rpoC)
Enzymes [BR:
mmol01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
NX772_01615 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
mmol03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
NX772_01615 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mmol03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
NX772_01615 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
CEP63
DNA_pol_phi
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UWD34510
LinkDB
All DBs
Position
341477..345709
Genome browser
AA seq
1410 aa
AA seq
DB search
MSDSNKITRKYASIDENSIDKISLSLATSEDVLEWSHGEVTKPETINYKTYKPEREGLFD
ELIFGPIIDYKCSICGRKYKKSNEGTFCSATDQCKNLKSEILPKISRRSRMGHIELGSPV
VHFWFFRIDHSIISKLLGIKTEDRNKAVSKSSLESLIYYKSHIILESGGIKALPKNQIIE
LNEAGVIYRDALIEIRSKYDENSEAYEELTEALKDLTELTSSKIGKEYGIDFYELNEIIE
EYSDARISTGSAAIEYLLENIDLEAEAKKIHEEIDEIQNLSPEKQTSTKIQERDKLYKRL
QVINSFISSGQKPTSMLIKHLPVIPADLRPLIQLDGGRHSTSDINELYRRIIIRNNRLKD
WKEKDAPVLIIQNELRMIQEAVDALIDNQIRSPSPVAAKDGRPLKSISDALTGKKGRFRQ
NLLGKRVDYSGRSVIVVGPNLKMNQVGIPREMAAKLFEPWIIRRLMEQELASSIKSARKM
IEELNPIIWPHVAKVIEGKLVLLNRAPSLHRLSIRAFEPVLVRGRAIKLHPLVTAGFNAD
FDGDQMAVHVPISPKAIREARELMFASKNILGPKDGEPIVNPSQDMILGLYYLTKEEKDE
TLRKGEGRYFSNYDEMLRAHEVGVVSLHARVALPFSEVKKSVETSYKGFIISTVGKFIFN
NCFPDNFPFVFDTNVDNLYSNQETQLQKYMVPKGASIPEFIKKLPLNEPLNKKHIAKIIR
QTYDNFDIVVSMEDVASVIKEINYENYKNSFELYSTLIDYKEEKISVKHASNLAKFTIKE
FENIYKKIKARNNNFDRELEKEEKVELLEKIWFKYTNLVADILDEIKDLGFKYSMISGTS
ISIGDIKLAPRKDQFIKEGEEYTSKLNNFFKMGMLTDDERYILTVNKWTRIKDEIQNDLI
NITNEETNNPIFMMMKSGARGNISNFVQLAGMRGLMANNVKTLKADAENERVVRSIVEVP
VKSSFLEGLTSYEFYSSTHGARKGGTDTALNTAKSGYLTRRLVDVAQNIVVTQNDCGSDF
GFLVKEIVDTKTNSSIVSLFERIEGRYTNSEIVHPETGEIILEANKFITPELATKIIDSG
IKEVEIRSILSCHTRNGVCKKCYGKDLATNRIVAIGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFH
TGGVAGVEDITGGFARLIELIDAYDRPWGKPAQISPVEGIVYSIEEQHDKENNLTGDKLV
KIKYFDNEAKEHDKVFYVQSNRKLRVKVGDKVIPGQKITEGPIILKELLNYTDARKVQNY
LLKEVQRLYRMQGISISDKYIEIIIRQMLSKILITEAGDSDLFVGSLVDVFEYQEVNGKL
LSEGKKPAFGQIVIKGAKQTPLLSDSFLAAASYQETSKILVHASISSQVDKLEGLKENII
VGHKIPAGTNSKYEEKSKYDIQDPLNYFKD
NT seq
4233 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgattcaaataaaattacaagaaaatatgcaagcatagatgaaaattcaatagac
aaaatatctctttcacttgctacttctgaagatgttcttgaatgatcacacggagaagtt
actaaaccagaaacaatcaactataaaacatataaaccagaaagagaaggtttatttgat
gaattgatttttggaccaattattgattataaatgttctatttgtggtagaaaatataaa
aaatctaatgaaggtactttttgttctgcaaccgatcaatgtaaaaatttaaaatcagaa
attttacctaaaatttctagaagatcaagaatggggcatatagaattaggttcacctgta
gttcacttttgattttttagaatcgatcattctataatttcaaaattactaggaattaaa
acagaagatagaaataaagcagtttctaaatcatctttagagtctttaatttattataag
tcacacattattttagaatcaggaggaattaaagctcttcctaaaaatcaaattattgaa
ttaaatgaagctggtgttatttatagagatgctttaatagaaattagatcaaaatatgat
gagaatagtgaagcatatgaagaactaacagaagctcttaaagacttaactgaattaact
tcttctaaaattggtaaagaatacggaatcgatttttatgaattaaatgaaattatagaa
gaatattcagatgctagaatttctacaggatcagcagctatagaatatttacttgaaaat
atcgatttagaagcagaagcgaaaaaaattcatgaggaaattgatgaaattcaaaattta
agtccagaaaaacaaacttctactaaaattcaagaaagagataaattatacaaaagatta
caagttattaactcttttattagttctggtcaaaaaccaacttctatgttgatcaaacac
ttaccagttataccagctgatttaagacctttaattcaattagatggtggtagacattca
acaagtgatataaacgaactatatcgtcgtattataattagaaataaccgtttaaaagat
tgaaaagaaaaagatgctcctgttttaattattcaaaacgaattaagaatgatacaagaa
gcagttgacgctttaattgataatcaaataagaagtccatccccagttgctgctaaagat
ggtagacctttaaaatctatttcagatgctttaacagggaaaaaaggaagatttagacaa
aatcttttaggtaaaagggttgattattctggacgtagtgttattgttgttggacctaac
ttaaaaatgaatcaagtgggtataccaagggaaatggctgctaaattatttgaaccttga
ataataagaagattaatggaacaagaattagcttcttcaattaaaagtgctagaaaaatg
attgaagaactaaatccaataatttgacctcatgttgctaaggttatagaaggtaaatta
gtgttattaaatagagctccttctttacatagactttcaattagagcttttgaacctgta
ttagtaagagggcgtgctattaaattacatccattagtaactgctggatttaatgctgac
tttgatggtgaccaaatggctgtgcatgtacctatttctccaaaagctattagagaagct
agagaattaatgtttgcaagtaaaaatattttaggaccaaaagatggtgaacctatagta
aacccttctcaagatatgattctagggttatattacttaaccaaagaagagaaagatgag
acattaagaaaaggtgaaggtagatatttctcaaattatgatgaaatgttaagagctcat
gaagttggtgttgtttcacttcatgccagagttgcattacctttttcagaagtaaaaaaa
tctgttgaaacctcttataaaggatttattatttcaactgttggaaaatttatattcaat
aattgcttccctgataattttccatttgtttttgatacaaatgtagataatctttacagt
aatcaagaaacacaattacaaaaatatatggttccaaaaggcgcttcaattcctgaattt
attaaaaaattaccactaaatgaacctttaaataaaaaacatatagcaaaaattattaga
caaacatatgataattttgatatagtggtatcaatggaagatgtggcttcagttattaaa
gaaattaattatgaaaattataaaaattcatttgaactttattcaacattaattgattat
aaagaggaaaaaatttctgtaaagcatgcttctaatttagctaaatttactattaaagaa
tttgaaaatatttataagaaaataaaagcaagaaataataattttgatagagagttagaa
aaagaagaaaaagtagaattgcttgaaaaaatttgatttaaatatactaacttagttgct
gatattcttgatgaaattaaagatttagggtttaaatattctatgatttctggaacatct
atttctatcggtgatattaagttagctccaagaaaagatcaatttattaaagaaggtgaa
gaatatacttctaaactcaataatttctttaaaatggggatgttaactgacgatgaaaga
tatatattaacagttaacaaatgaacaagaattaaagatgaaatacaaaatgatttaata
aatataactaacgaagaaactaataaccctatttttatgatgatgaaatcaggagctaga
ggaaatatttctaacttcgtacaattagctggtatgcgtggattgatggctaataacgtt
aaaaccttgaaagccgatgctgaaaacgaacgtgttgttcgttctatcgttgaggttccg
gttaaaagttctttcttagaaggactaacatcatatgaattctattcttcaacacatgga
gctagaaagggaggtactgatacagcccttaacacagctaaatcaggatatttaactaga
cgtttagtggatgttgcgcaaaatattgtagtaacacaaaatgattgtggttctgatttt
ggatttttagttaaagaaattgttgatactaaaactaattcaagtattgtttcattgttc
gaaagaatcgaaggaagatatacaaactcagaaatagtacatccagaaacaggtgaaata
attttagaagcaaataaatttattactccagaattagctacaaaaattattgattcaggt
ataaaagaagtagaaattcgttctatattaagttgccatacaagaaatggtgtatgtaaa
aaatgttacggaaaagatttagcaacaaatagaatagttgccataggggaagctgttggt
ataatagctgctcaatcaattggtgaacctggtactcaattaacaatgcgtactttccat
acaggaggggttgccggagttgaagatataactggaggttttgcaagattaatagaatta
attgatgcttatgatagaccttgaggtaaacctgcgcaaatttcaccagttgaaggtata
gtttattctattgaagaacaacatgataaagaaaataatttaacaggtgataaacttgta
aaaattaaatattttgataatgaagctaaagaacatgataaagtattttatgttcagtca
aatagaaaattaagagttaaagttggggataaagttatacctggtcaaaagattactgaa
ggaccaattatattaaaagaattattgaattacactgatgcacgtaaagttcaaaactac
ttgttaaaagaagtgcaaagactatatagaatgcaaggtatttcgataagtgataaatat
attgaaataattattcgtcaaatgctttcaaaaattttaataacagaagctggtgattca
gatttatttgttggatcattagtagatgtatttgaatatcaagaagtaaatggtaaacta
ttaagtgaaggtaaaaaacctgcttttggacaaattgttattaaaggtgctaaacaaaca
ccactactatcagattctttcttagcagctgcttcatatcaagaaacttctaaaatatta
gttcatgcttctatttcttctcaagttgataaattagaaggtttaaaagaaaatattata
gttggtcataaaataccagcaggaactaattctaaatatgaagaaaaatctaaatatgat
attcaagatcctttaaattattttaaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
