Methanococcus maripaludis C5: MmarC5_0396
Help
Entry
MmarC5_0396 CDS
T00491
Name
(GenBank) Collagen triple helix repeat
Organism
mmq
Methanococcus maripaludis C5
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
DUF4813
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABO34711
UniProt:
A4FWY2
LinkDB
All DBs
Position
complement(356322..358376)
Genome browser
AA seq
684 aa
AA seq
DB search
MKKICTLLLVFALVSGLNIAYADSAPSLPHTIYGDVSINGLPATGTLKVLVNGVESEQVQ
VNDGEFGKGLFDPKLVVSGASGDELTFSFEAESYTINPAYNIYLVDSAQYVSEIDFASGG
YTQVLLEFTGTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTGDTG
DTGDTGDSGSMPLNPELFYGIATIGETSASGTLNVYVDDVLQDSIEVQNGLFGGSGPLSE
KLVATGYVGESNEVKFTLVSGEETYSSFIAEIGEETYTDELPYVEGVQNIDIEFSEVTGD
AGDTGDTGDTGDTGDSGSMPLNPELFYGIATIGETSASGTLNVYVDDVLQESIEVQNGLF
GGPCPLAEKLVATGYVGESNEVKFTLVSGEETYSSFIAEIGEETYTDELPYVEGEAYYME
ISFSESANTEDSNSNSNTNETNNSSMPLYPELFYGLVYLDDTLPSSTLNVYVDDVLQDSI
EIENGVFGGEGPLDDKLTATGYESSSNVVTFSLVSGEETYSSFTAELSNATYENEVPYDE
GVHYVIITFSSKATETGDSGSTGGGGSSGSSSDDSSSTVIISSDSSETSATTKNSDSGTL
MKTTSSANPGETSEDTEQTTAKNSQDVTSDSETYDNETGVVLQQESPLGGINIYLAMAAI
LLILIALAAAWYQSREKPEVLPQP
NT seq
2055 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatatgtacattactattagtatttgcacttgtttccggcttgaatattgct
tatgcagattctgctcctagcttaccccatacaatttatggggacgtatcaattaatgga
cttcctgcaacaggaacgttaaaagtacttgtaaacggagtggaaagtgagcaagtgcag
gttaatgatggagagtttggtaagggattatttgatcccaaactagttgttagtggagct
tcaggggatgaacttacattttcatttgaagctgaaagttatacaataaatccagcttat
aatatatacctcgtagattcagctcagtacgtttcagaaattgacttcgcatctggaggg
tatactcaagtattattagaattcaccggaacgggtgataccggtgatactggagatacc
ggtgatactggagataccggtgatactggagataccggtgatactggagataccggtgat
actggagataccggtgatactggagataccggtgatactggagataccggtgatactgga
gataccggtgatactggtgacagtggatcaatgccacttaatcccgaattattctacggt
atcgcaacaattggggaaaccagtgcttcaggaactttaaacgtttatgttgatgacgta
cttcaagattcaattgaagttcaaaacggattatttgggggctcaggaccgctttcagaa
aaactcgtcgcaacaggatacgttggagaatccaatgaagttaaattcaccttagtttct
ggagaggaaacttattcaagttttattgcggaaatcggtgaagaaacttacacagatgaa
cttccatacgttgaaggggtacaaaacattgatattgagttttcagaagttactggagat
gccggtgatactggagataccggtgatactggagataccggtgacagtggatcaatgcca
cttaatcccgaattattctacggtatcgcaacaattggggaaaccagtgcttcaggaact
ttaaacgtttatgttgatgacgtacttcaagagtcaattgaagttcaaaacggattattt
ggagggccgtgcccacttgcagaaaaactcgtcgcaacaggatacgttggagaatccaat
gaagttaaattcaccttagtttctggagaggaaacttattcaagttttattgcggaaatc
ggtgaagaaacttacacagatgaacttccatacgttgaaggggaagcgtattacatggaa
ataagtttttctgaatcagcaaatacggaagatagcaatagtaattcaaatactaatgaa
acaaataattcgtcaatgccactttatccagaattattctacggactcgtttatcttgat
gatacattaccttccagcacattgaatgtgtatgttgacgatgtacttcaagattcaatt
gaaattgaaaatggagtatttgggggagaagggcctcttgatgataaactgactgcgaca
ggttacgaaagcagtagtaacgtagtcacgttttcactagtttctggagaggaaacttat
tcaagctttactgcagaattgtcaaatgctacttacgaaaatgaagttccttacgatgaa
ggagtacattacgtaataatcacattctcaagtaaagccactgaaactggggactctgga
agtacaggaggtggcggatctagcggaagtagttcagatgactcttcatcgacagttatt
atcagttcagattcgtcagaaacttcagccactaccaaaaattcagattcaggaactttg
atgaagaccacttcatcagcaaatcctggtgaaacttcggaagataccgaacagaccact
gcgaaaaattcacaggatgtaacttcagatagtgaaacatacgataatgaaacaggagtt
gtgttacagcaggaaagcccacttggtggaataaacatttaccttgctatggctgcaata
ttattgatattgattgcactagctgcagcatggtatcagtcaagagaaaaaccagaagtt
ttacctcagccataa
DBGET
integrated database retrieval system
