Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1: MSC_0300
Help
Entry
MSC_0300 CDS
T00161
Name
(GenBank) CONSERVED HYPOTEHTICAL PROTEIN
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mmy
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1
Pathway
mmy03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmy00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
MSC_0300
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mmy03019
]
MSC_0300
Messenger RNA biogenesis [BR:
mmy03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MSC_0300
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_C
RNase_J_b_CASP
RMMBL
RNase_HII
NADH-UOR_E
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAE76941
UniProt:
Q6MTU5
LinkDB
All DBs
Position
complement(341373..343124)
Genome browser
AA seq
583 aa
AA seq
DB search
MPDIKFTALGGQDERGKNLYVLEIDNDFFILDAGVKYPEKDILGIDTVIPKFDYIKQNKK
KIKGIFLTNPSAYNMGAVPYLLKEIKAPIYCNEITELIAKIKFQKLRLKNKDHILKVVHD
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IAKNGVLALISDAEFASRKDFTVPNHKIDKYILVPFKEKKTKIIVAIFEEDIHKLSQICM
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SKLAKIATSNDSLVEFTEKDLIILTNTPVAGVEKRHAQILDELARTDARLLALSDKNIWS
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TQMRGVLYIQEDNPIFKILQREITNLILEGQALYKKEPKKYDLNEIKKDITSKIKQLIKQ
ESGKTPIVLVIINESDGKAYVPRNNKKRYNNNNKSTKSKKDKS
NT seq
1752 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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gataaatcataa
DBGET
integrated database retrieval system
