Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1: MSC_0355
Help
Entry
MSC_0355 CDS
T00161
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha chain
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mmy
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1
Pathway
mmy03030
DNA replication
mmy03430
Mismatch repair
mmy03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmy00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
MSC_0355 (polC)
03430 Mismatch repair
MSC_0355 (polC)
03440 Homologous recombination
MSC_0355 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mmy03032
]
MSC_0355 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mmy03400
]
MSC_0355 (polC)
Enzymes [BR:
mmy01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
MSC_0355 (polC)
DNA replication proteins [BR:
mmy03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
MSC_0355 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mmy03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
MSC_0355 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
DNA_pol3_a_NII
HHH_6
DNA_pol3_a_NI
RNase_H_2
tRNA_anti-codon
Rv2179c-like
DUF166
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAE76992
UniProt:
Q6MTP4
LinkDB
All DBs
Position
complement(402847..407295)
Genome browser
AA seq
1482 aa
AA seq
DB search
MQTKILGIFKKIGIELDQTDYIYFKDAILVETPRISQIKNKGYLHVEIKDFLPIDVLKKI
EDKLKNNQYFNFKLIIDVKNQQFNKDLLIQYLEFIKMHKSLFNNRASWKLLDIYNFELIN
NQLVFLVNSQTIKNEISLELDYCLAKLNQFGFKDLSYLINVNEISLDTLDTKQQINKTYD
KPEYEQQIIKPIEKKPSVNNSYKNKRPSLDKPSYNSLLDVEDDAQNIVIQGMVINKEFKL
SKTGRKIFYIDITDFQSSIRCMYFAKSDALCEFDDLTEDELKSKEIEQIKENKIQINDWI
SVKGKTSLSVYDQEQIFYIDDFKKIKKQVGLRIDDAKIKRVELHAHTKMSVMDGVSDPID
YLELISSWNHKAIAFTDHTNVQAFPDIYKALNSVNKKRSDQDKIKAIYGLEMNMLNNDLW
YVKNPKNQKLKDARMVFFDLETTGLSPELDEIIEFGAIEYNLKTGERKKIDILIKPKTKL
KAFTQKLTNITEKMLEDKPSIEQAFKQINEIIKDAILVAHNANFDFTFLSYWSEKLGYSK
LENTIIDTLTISRIIYPDLKSHRLGSLAKRVNISYDPSIAHRGDYDADILADIYERMLDE
TRKKIKIITDSDWNKIDPINYADNLNYYKNKGFHTNILVKNQAGLKELYKLVTKSHTTNF
YSSPKIFKDDLIQIKQNNNLLFGASCVNSEIFELARTSTLENLKQAISFYDYIEVQPISV
YKNLLQNDSLDLDQLKEIITNIINIAKQENKLVVASSDCHYTNPELKQIREVYINAKGLG
GIRHPLFDFNNRVKDYPDQHLRTTKEMLKEFEWLNDDDLINEIVITNSNKIADMIDSNVI
PIKDGLFTPKIANVNEKLKDKCYQTAKQMYGEMLPEIVEKRLEKELGSITKHGFAIVYWI
SHLLVKQSLDDGYLVGSRGSVGSSFVATMAQITEVNPLKAHYRCLNCKYSDFNTDPAYKC
GYDLPEKNCPNCNQKLIGDGHDIPFETFLGFNGDKVPDIDLNFSGEYQNQAHNFTKKMFG
ENNVFRAGTISTVAEKTAFGYVKTYFEETKRDASLPRKTEINRLAKLAQGVKRTTGQHPG
GIIILPNEYEIEDFTPVNYPADDLNSTWKTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHDDPTALKMLR
DLTNIDPITIPTDDKNVYSLFSSLQALNLTSDKINDEITGAIGIPEFGTGFVRNMLKETQ
PKTFADLVQISGLSHGTDVWLGNARDLIKDKKADISTVIGCRDDIMVYLINMGLESSLAF
MIMESVRKGKGLKKEWIDVMKQYNVPDWYIDSCLKIKYMFPKAHATAYVLMAYRIAWYKI
YYPTEYYATYLTTRADVFDLKTVLGGYDAVLLKLKSQQQRVKNGEKLSKKEEDLEVVYEV
LLEMFARGIKFSNIDFEKSEATKFKVDILQDNSKIIIPPFNVIDSLGEAVALSIINARNT
KPITSVNDLKNRTQTTQTQIKIFEEFNILDSLSVDEQLAFDF
NT seq
4449 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaacaaaaatacttggtatttttaaaaaaatcggtattgaattagatcaaactgat
tatatttattttaaagatgctattttagttgaaactcctagaatttctcaaattaaaaac
aaaggttatttacatgttgaaattaaagattttttaccaattgatgttttaaaaaaaatt
gaagacaaactaaaaaataatcaatattttaatttcaaattaattattgatgttaaaaac
caacaatttaataaagacttattaattcagtatttagaatttattaaaatgcataagtct
ttatttaataaccgtgcttcttgaaaattattagatatttataattttgaattaattaat
aatcaattagtatttttagtaaatagtcaaactattaaaaatgaaattagtttagaactt
gattattgtttagctaaattaaatcagtttggatttaaagatttaagttatttaattaat
gttaatgaaattagtttagatactttagatacaaaacaacaaattaataaaacttatgat
aaacctgaatatgaacaacaaataattaaaccaattgaaaaaaaacctagtgtaaataat
agttataaaaacaaaagacctagtttagataaacctagttataattctttattagatgtt
gaagacgatgctcaaaatattgttattcaaggaatggttattaataaagagtttaaatta
tcaaaaactggaagaaaaattttttatatagatataactgattttcaatcttcaattaga
tgtatgtattttgcaaaaagtgatgcattatgtgaatttgatgatttaactgaagatgaa
ttaaaatcaaaagaaattgaacaaattaaagaaaataaaattcaaatcaatgattgaatt
agtgttaaaggaaaaactagtttatctgtatatgaccaagagcaaatcttttatatagat
gattttaaaaaaatcaaaaaacaagttggtttgagaattgatgatgcaaaaatcaaacgt
gttgaattacatgcgcatactaaaatgagtgtaatggatggagttagtgatccaattgat
tatttagaacttattagtagttgaaatcataaagcaattgcatttacagatcatacaaat
gttcaagcttttccagatatttataaagctttaaatagtgttaataaaaaacgtagtgat
caagataaaattaaagctatttatggattagaaatgaacatgttaaataatgatttatga
tatgttaaaaatccaaaaaaccaaaaactaaaagatgctagaatggtcttttttgactta
gaaactactgggttaagtcctgaattagatgaaatcattgaatttggtgctattgaatat
aatttaaaaactggtgaaagaaaaaaaatagatattttaattaaaccaaaaacaaaatta
aaagcatttactcaaaaactaactaacattactgaaaaaatgttagaagataaaccaagt
attgaacaagcttttaaacaaataaatgaaattataaaagatgctattttagttgctcat
aatgctaattttgactttacatttttatcttattgatctgaaaaactaggttatagtaaa
ttagaaaatactattattgatactttaacaatttcaagaattatttatcctgatttaaaa
tcacacagattaggatcattagcaaaaagagtaaatatctcatatgatccaagtattgct
caccgtggagattatgatgctgatatcttagctgatatttatgaaagaatgctagatgaa
actagaaaaaaaatcaaaattataacagatagtgattgaaataaaatagatccaattaat
tatgctgataatttaaattattataaaaacaaaggttttcatactaacattttagttaaa
aaccaagcaggattaaaagagttatataaactagttacaaaatcacatactactaatttt
tattcatctccaaaaatctttaaagatgatttaattcaaattaaacaaaataataattta
ttgtttggagcaagttgtgttaatagtgaaatttttgaactcgctagaactagtacatta
gaaaatttaaaacaagcaattagtttttatgattatatagaagttcaaccaattagtgtt
tataaaaacttattacaaaatgactcactagatttagatcaattaaaagaaataattaca
aatattattaatatagcaaaacaagaaaataaactagttgttgcaagtagtgattgtcat
tatacaaatcctgaactaaaacaaattagagaagtttatattaatgctaaaggacttggt
ggaattagacatccattatttgattttaataacagagttaaagattatcctgatcaacat
ttaagaactacaaaagaaatgctaaaagagtttgaatgacttaatgatgatgatttaatt
aatgaaattgtaattactaattcaaataaaatagcagatatgatagatagtaatgttatt
ccaattaaagatggtttatttactccaaaaattgctaatgttaatgaaaaattaaaagat
aagtgttatcaaacagcaaaacaaatgtatggagaaatgcttccagaaattgttgaaaaa
agattagaaaaagaactaggttcaattacaaaacatggatttgcgattgtttattgaatt
tctcatttattagtaaaacaatcactagatgatggttatttagtaggatcgcgtggatct
gttggttcatcatttgtagcaacaatggctcaaattacagaagttaatcctttaaaagct
cactatagatgtttaaattgtaaatattcagattttaatacagatccagcttataagtgt
ggatatgatttaccagaaaaaaattgtcctaattgtaatcaaaaattaattggagatggt
catgatattccatttgaaacttttttaggttttaatggagataaagttccagatattgat
ttaaacttttctggtgaatatcaaaaccaagctcataattttactaaaaaaatgtttggt
gaaaataatgtttttagagctggaacaatctcaacagttgctgaaaaaacagcttttggt
tatgtaaaaacttattttgaagaaactaaaagagatgcaagtttaccaagaaaaactgaa
attaatagattagcaaaactagctcaaggagtaaaaagaacaactggtcaacatccaggt
ggaattattattctaccaaatgagtatgaaattgaagattttactccagtaaattatcca
gctgatgatttgaattcaacttgaaaaacaacacattttgattttcactcaattcacgat
aatttattaaaaatggatattttaggtcatgatgatccaactgctttaaaaatgttaaga
gatttaacaaatattgatccaattactattccaactgatgataaaaatgtttattcatta
ttttcatctttacaagctttaaatttaacttcagataaaattaatgatgaaatcactgga
gctattggaatacctgaatttggaactggttttgttagaaatatgttaaaagaaactcaa
ccaaaaacttttgcagatctagtacaaatttctggtctttcacatggtactgatgtttga
ctaggtaatgctagagatttaattaaagataaaaaagcagatatttctacagttattgga
tgtagagatgatattatggtttatttaataaatatgggattagaaagttctttagctttt
atgattatggaatcagttagaaaaggtaaaggattaaaaaaagaatggatcgatgtaatg
aaacaatataatgttccagattgatacattgattcatgtttaaaaattaaatatatgttt
ccaaaagcacatgctacagcttatgtgttaatggcttatagaattgcttgatataaaatc
tattatccaactgaatattatgcaacctatctaacaacaagagctgatgtgtttgattta
aaaacagtgcttggtggttatgatgcagttttattaaaattaaaatctcagcaacaaaga
gtaaaaaatggagaaaaattatctaaaaaagaagaagatttagaagttgtttatgaagtt
ttattagaaatgtttgcaagaggaattaaatttagtaatattgattttgaaaaatctgaa
gctactaaatttaaagtagacattttacaagataactctaaaataattattccaccattt
aatgtaattgattcactaggtgaagccgtggcactttcaataattaatgcaagaaataca
aaaccaattacttcagttaatgatttaaaaaacagaacacaaactacacaaactcaaatt
aaaatttttgaagaatttaatattttagattcattatcagttgatgaacaacttgctttt
gatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system