Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1: MSC_0497
Help
Entry
MSC_0497 CDS
T00161
Symbol
cbf
Name
(GenBank) CMP-BINDING-FACTOR
KO
K03698
3'-5' exoribonuclease [EC:3.1.-.-]
Organism
mmy
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mmy03019
]
MSC_0497 (cbf)
Messenger RNA biogenesis [BR:
mmy03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MSC_0497 (cbf)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HD
tRNA_anti-codon
TraI_2
HROB
DUF5689
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAE77125
UniProt:
Q6MTB1
LinkDB
All DBs
Position
562974..563954
Genome browser
AA seq
326 aa
AA seq
DB search
MKKVKDINIEDHLIDTILRIERVIVSTGSSGNNYLILHLADSTGRIEARKWVVSEKDKQL
LKPNTIVLLKDTIVHEYRNILQLKVEDYQVIDEKDLLKYHLNKTDLYITAPLDIKTSYLE
LISLLNSINNQTYKTITLNLIEKYKKEFLTFPAAMSIHHNVTSGLFWHSYTLVKNVLSLK
ENYFYVNIDWDLLICGAILHDIGKVIEISDVNGSDYSLEGKLLGHISIGNAEINKLADKL
NLYKDQNNKINKEITLLQHMILASHGKKEFGSPIEPVLIEAVILSALDDLDAKVYKINDE
LSKIELDNWTQKIISIDNKMFYKHKK
NT seq
981 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaagttaaagatattaatatagaagatcatttaatcgatactattttaagaatt
gaaagagttatagtttcaacaggaagtagtggaaataattatttaatattacatttagct
gatagtacaggtagaattgaagctagaaaatgagtagttagtgaaaaagacaaacagtta
ttaaaaccaaataccattgttttattaaaagatactattgttcatgaatatagaaacata
ttacaattaaaagttgaagattatcaagtaattgatgaaaaagatttgttaaagtatcat
ttaaataaaactgatttatatataactgctcctttagatattaaaactagttatttagaa
ttaattagtcttttaaatagtattaataatcagacttataaaactattacacttaattta
atagaaaaatataaaaaagagtttttgacttttcctgcagctatgagtattcatcacaat
gttactagtggattgttttgacatagctatactcttgtaaaaaacgttttaagtttaaaa
gaaaactatttttatgtaaatattgattgagatttattaatatgtggagcaattctacat
gatattggtaaagtaattgaaattagtgatgttaatggtagtgattatagtttagaagga
aagctattaggtcatatttcaataggaaatgctgaaatcaataaactagcagacaaactg
aacttatataaagatcaaaataataaaatcaataaagaaattactttactacaacatatg
attttagctagtcatggtaaaaaagagtttggttccccgatcgaaccagtactaattgaa
gcagtgattttatcagctttagatgacttagatgctaaagtttataaaattaatgatgaa
ttatcaaaaatagaactagataattgaactcaaaaaattatcagtattgataataaaatg
ttttataaacataaaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system