Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1: MSC_0548
Help
Entry
MSC_0548 CDS
T00161
Name
(GenBank) Conserved hypothetical GTPase of unknown function
KO
K06948
30S ribosome assembly GTPase
Organism
mmy
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
mmy03009
]
MSC_0548
Ribosome biogenesis [BR:
mmy03009
]
Prokaryotic type
GTPases
MSC_0548
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MMR_HSR1
RsgA_GTPase
YqeH-like_C
GTP_EFTU
Dynamin_N
Roc
DUF1660
Zn_ribbon_2
zf-RING_14
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAE77174
UniProt:
Q6MT62
LinkDB
All DBs
Position
620924..622027
Genome browser
AA seq
367 aa
AA seq
DB search
MKSCLGCGSLLQTINKFEQGYVNDTEHAYCLRCFKIKNYNQLVDSEINDQQFINKISTLV
NENKNNGLVFYYVLDIFDLFGSRILEIENLIKDFKVILVVNKIDLLPKSIKLEKIRNYIN
NVFKTGCLKNLEIFLTSADRINLVEPLLNKVIKNNKNQQYFIGASNVGKSSLINKMLEIN
QLIPSIVVSKYFNTTLDFIEIQLDTNTTIFDSAGVSRKNSIANLMNKRFQSYCYFKKEIQ
QFTYQLTPNNSIFFSGVCWFDYLSSSNQKTNFHIYTNKEINLHRTNTKNVIRYWNNNRKN
LIPYINNSEKIQVYEFKFTKEHLNNWYDISISGLGWINFKVETEMIIKINIPSDQKTVLV
SLNEPLI
NT seq
1104 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcatgtttaggttgtgggagtttattacaaacaataaacaaatttgaacaaggt
tatgtaaatgatactgaacacgcttattgtttaagatgttttaagattaaaaactacaat
caattagtagatagtgaaattaatgatcaacaatttattaataaaatttcaactttagtt
aatgaaaataaaaataatggtttagttttttattatgttttagatatttttgatttattt
ggatcaagaatattagaaatagaaaacttaattaaagattttaaagttattttagtagtt
aataaaatagatttactaccaaaatctattaaacttgaaaaaattagaaattatattaat
aatgtttttaaaactggttgtttaaaaaatttagaaatctttttaactagtgctgatagg
attaacttagttgaacctttattaaataaagtaattaaaaataataaaaaccaacaatac
tttattggagcaagtaatgttggtaaatctagtttgattaataaaatgctagaaataaat
caattaattccaagtatagttgtttcaaaatattttaatactactttagattttattgaa
attcaattagatacaaatacaactatttttgatagtgctggagttagtagaaaaaacagt
attgctaatttaatgaataaaagatttcaaagttattgttattttaaaaaagaaattcag
caatttacttatcaattaacacctaataattcaatatttttttctggagtttgttgattt
gattatttaagttcatctaatcaaaaaactaattttcatatttatacaaataaagaaatt
aacttacatagaaccaatactaaaaatgttataagatattgaaataataatagaaaaaac
ttaattccatatataaacaatagtgaaaaaattcaagtttatgaatttaaatttacaaaa
gaacatttaaacaattgatatgatatttcaatatctggattagggtgaattaattttaaa
gttgaaactgaaatgattattaaaatcaatattccatcagatcaaaaaactgtactagtt
agtttaaatgaacctttaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
