Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1: MSC_0683
Help
Entry
MSC_0683 CDS
T00161
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA POLYMERASE I
KO
K02335
DNA polymerase I [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mmy
Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1
Pathway
mmy03030
DNA replication
mmy03410
Base excision repair
mmy03420
Nucleotide excision repair
mmy03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mmy00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
MSC_0683 (polA)
03410 Base excision repair
MSC_0683 (polA)
03420 Nucleotide excision repair
MSC_0683 (polA)
03440 Homologous recombination
MSC_0683 (polA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mmy03032
]
MSC_0683 (polA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mmy03400
]
MSC_0683 (polA)
Enzymes [BR:
mmy01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
MSC_0683 (polA)
DNA replication proteins [BR:
mmy03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
Other elongation factors
MSC_0683 (polA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mmy03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
BER (base exicision repair)
DNA polymerase I
MSC_0683 (polA)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
MSC_0683 (polA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
DNA_polI_exo1
HHH_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAE77302
UniProt:
Q6MST6
LinkDB
All DBs
Position
complement(781626..784361)
Genome browser
AA seq
911 aa
AA seq
DB search
MKTKILVVDGNSLIFRAFYATAYSPNTSLLKTKSGVLTNAVYSFINMLLSVIHQRGPYDH
ILIAFDKSKKTFRHDLLSDYKANRIKTPNELVEQFSIVREFLTKANIQWFEQENIEADDI
VGSICKYAEKQFDDLQAEILSSDKDMYQLITNKVICLNPVQGVNELEEVDTNKLFEKWQI
LPNQVPDYKAIVGDSSDNLKGVNGIGQKGAIKLIQQYESLENIYNSLEQLKGAIKTKLEQ
DKKMAFLCKDLATIKTDVVLENFSFNKLDFNVDNIYEFLNKYEMYSLKKRFTNILNLDFN
PYQNKKQNLDVKIINSWSKDYEDSINYLYVESLEEDYHKDKIIGIGISNNKGNFYLDFKN
KAQQLSFFEDTTLSSTDSLFEEFLNNSNLKKYTYDIKKTTYLLKNHKYNVLASNFDFDFM
VACYSLNANVISDLSNQIKLVDNMIELETIDEIFGKGVKKNPDIDLDIKSKYISKKAYLL
KKYSDQLIEQLKQTNTYDLYLKIDHPLIEVLYDIEVQGILIDKEQLKLQTQQILKKINHI
EGQMKILVAEEIDNNFNFSSPKQIQELLFDKLKLPNLEKGTTSKEVLEKLITFHPIINLL
LEHRKYTKLYITYLKGFEKFIFDDNKVHTIFNHTLTNTGRLSSSYPNIQNISIRDNEQKE
VRKIFITNNNKTFLSYDYSQIELRVLAQMSKESNLIKAFNQDADIHLQAAKLIFNLSDDQ
ITSEQRRIAKVFNFGILYGLTDFGLANDLNMNVNQAKQMIKDYYSAFPSLLDFKEKQVEI
ATNQGYITTLSNRRRYIDELNSTNHNIRQFGKRIAVNTPIQGTASDILKVAMISIYKKLK
EQNLDARIVCQIHDEIILEVNDNQLEQTKKIVVSELENALEKLFLDLNIKEQVVVKLKVG
ESVGKTWFDLK
NT seq
2736 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaactaaaattttagtagtagatggtaattctttaatttttcgagctttttatgca
actgcttattcaccaaatactagtttattaaaaacaaaaagcggtgttttaacaaatgca
gtttattcttttattaatatgttattatctgtaattcatcaaagaggaccttatgatcat
attttaatagcgtttgataaaagtaaaaaaacttttagacacgatttattaagcgattat
aaagctaatagaattaaaactcctaatgaattagttgaacaatttagtattgttagagaa
tttttaacaaaagcaaacattcaatgatttgaacaagaaaatattgaagctgatgatatt
gttggatcaatttgtaaatatgctgaaaaacaatttgatgatttacaagctgaaatttta
agtagtgataaagatatgtatcaattaattacaaataaagtaatttgtttaaacccagtt
caaggagttaatgaacttgaagaagttgatactaataaattgtttgaaaaatgacaaatt
ttaccaaaccaagttccagattataaagcaatagttggtgattcttcagataatttaaaa
ggagttaatgggattgggcaaaaaggagctattaaattaattcaacaatatgaaagttta
gaaaatatttataatagtttagaacaattaaaaggtgcaattaaaactaaattagaacaa
gataaaaaaatggcttttttatgtaaagatttagcaacaatcaaaactgatgtagtttta
gaaaatttttcttttaataaattagattttaatgttgataatatttatgagtttttaaac
aaatatgaaatgtattctttaaaaaaacgctttacaaatattttaaatcttgattttaat
ccttatcaaaataagaaacaaaatttggatgttaaaataattaattcttgatcaaaagat
tatgaagattctataaattatttatatgttgaatcattagaagaagattatcataaagat
aaaattattggaattggtatttcaaataataaaggtaatttttatttagattttaaaaat
aaagctcaacagttatctttttttgaagatacaacactaagttcaactgatagtttgttt
gaagaatttttaaataattctaatttaaaaaaatatacttatgatattaaaaaaactact
tatttattaaaaaatcacaagtataatgttttagcaagtaattttgattttgattttatg
gttgcttgttattctttaaatgctaatgttatttctgatttatctaatcaaattaaatta
gttgataatatgattgaattagaaactattgatgaaatttttggaaaaggtgttaaaaaa
aatccagatatagatcttgatattaaatctaaatatattagtaaaaaagcttatttacta
aaaaaatattctgatcaattaattgaacaattaaaacaaactaatacttatgatttatat
ttaaaaattgatcatcctttaattgaggttttatatgatattgaagttcaaggaatttta
atagataaagaacaattaaaactacaaacccaacaaatattaaaaaaaattaatcatatt
gaaggacaaatgaaaattttagttgctgaagaaattgataataattttaatttttcttca
ccaaaacaaattcaagaattattatttgataaattaaagctgcctaatttagaaaaaggc
actactagtaaagaagttttagaaaaattaataacttttcatccaataattaatttatta
ttagaacatagaaaatatactaagttatatataacttatttaaaaggttttgaaaaattt
atttttgatgataataaagttcatactatttttaatcatactttaacaaatactggacga
ttaagttcttcttatccaaacattcaaaatatttctattagagataatgaacaaaaagaa
gttagaaaaatttttattacaaataataataagacatttttaagttatgattattctcaa
attgaattaagagttttagcacaaatgtctaaagagtcaaatctaattaaggcatttaat
caagatgctgatattcacttacaagctgctaaactaatttttaatcttagtgatgatcaa
attacaagtgaacaaagaagaatagctaaagtttttaattttggaattttatatggttta
actgattttggtttagcaaatgatttaaatatgaatgttaatcaagcaaaacaaatgatt
aaagattattattctgcttttccaagtttattagattttaaagaaaaacaagtagaaatt
gcaacaaatcaaggctatattacaaccttatcaaatagaagaagatatattgatgaatta
aattcaacaaatcataacattagacaatttggaaagagaatagcagtaaatacaccaatt
caaggaactgcttcagatattttaaaagtagctatgataagtatttataaaaagctaaaa
gaacaaaatttagatgctagaatcgtttgtcaaattcatgatgaaattattttagaagtt
aatgataatcaattagaacaaactaaaaaaattgttgttagtgaattagaaaatgcttta
gaaaaactatttttagatctaaatataaaagaacaagtagttgttaaattaaaagttgga
gaatcagttggtaaaacttgatttgacttaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
