KEGG   Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1: MSC_0684
Entry
MSC_0684          CDS       T00161                                 
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha chain
  KO
K02337  DNA polymerase III subunit alpha [EC:2.7.7.7]
Organism
mmy  Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1
Pathway
mmy03030  DNA replication
mmy03430  Mismatch repair
mmy03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmy00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    MSC_0684 (dnaE)
   03430 Mismatch repair
    MSC_0684 (dnaE)
   03440 Homologous recombination
    MSC_0684 (dnaE)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mmy03032]
    MSC_0684 (dnaE)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mmy03400]
    MSC_0684 (dnaE)
Enzymes [BR:mmy01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     MSC_0684 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:mmy03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     MSC_0684 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:mmy03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     MSC_0684 (dnaE)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha DNA_pol3_finger HHH_6 PHP tRNA_anti-codon Dehydratase_LU
Other DBs
NCBI-ProteinID: CAE77303
UniProt: Q6MST5
LinkDB
Position
complement(784370..787333)
AA seq 987 aa
MNYISLLTIKNQYDFLESLITIDQYIEFIKKNKLSYAFYSETHTMYGVAEFFKKATDNNI
KPIIGLTIEFEDSTKLIIYAKNKKGYQILNFVSSFLNDGFNHYDYEIKEYILELVNNNVV
VIGLISDLDFKTHLIDKLNDDFYDVKELNLYFNQISYLDINDQKTYNILNAIKTNKTIDQ
IQNTNNYFYPDNDYLIKNYSLENIKKVINEINFKVDFNLFDSNKKHLVKYKNINNLSSFE
YLRQVCLLSLKKYQQKIKPNLDLKLYISRLNYELEVIKQMGFSDYFLIVSDYVNFAKKND
ILVGPGRGSAAGSLISYLLRITDIDPLEYDLLFERFLNPDRSNLPDIDLDFQDNRREEVL
EYLFEKYGKYHVGMITTYQTIGYKMAWRDVCRVFNIDLLIVNKISKVLDQYTNSDFLEFI
KENKLLNDYFQNNVFKEIFITMHKIVGLPRQTSTHAAGIVLTDCDLRELVPIKIGFNGIN
QTQFDMNYLDDLGLIKMDILGLRNLTTIQEIKHLIYLNQNLKISLNKIDLNDKKAFELLK
NKQTSGIFQLESKGMTDLISKMQVDSIELISIASALYRPGPQEMISIYLENKKTNKFKII
DQSVFEILKPTYGIIIYQEQVMQMLNKVVNFSYAKADIIRRAMSKKNNKVMQSMKLEFIN
SAVKNNFSYNKANLIWNWIEKFSNYGFNKSHSISYSYISYWLAYFKAHFTTEFYTSLLDQ
NIGNEIKTQQYIKELYDYKIKVNKPSVINANFNYQIINKQIYMPLTCIKSIGYEVVKKIN
LAKSENENMYLDIHNFILAMIKQKISVNVLQTLIKAGALDIFNYNKKTMIENLDLLISQA
NAYKQVNNILDDEKINLIIYDEYEDEILASFEKELYGFFIEQNPILKLKTSNFDLNLIDI
SKLEYNKVQVILGYILKIKEIKDKNNNKMAFVTIFDNTSELELTIFSSDYKDIYQDLVIN
KAYVFKVLKTKTNNKTSIKFVSLIKAI
NT seq 2964 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaactatatatctttattaactattaaaaatcaatatgattttttagaatctttaatt
actattgatcaatatatagaatttattaaaaaaaataaacttagttatgctttttatagt
gaaactcatactatgtatggtgttgctgagttttttaaaaaagctactgataataacata
aaaccaataattggtttaacaattgaatttgaagattctactaaactgataatttatgct
aaaaacaaaaaaggttatcaaattcttaattttgtttctagttttttaaatgatggattt
aatcattatgattatgaaattaaagaatatattttagaactagttaataataatgtagtt
gttattggtttaattagtgatttagattttaaaacacatttaattgataagttaaatgat
gatttttatgatgttaaagaattaaatttatattttaatcaaataagttatttagatata
aatgatcaaaaaacttataatattttaaatgcgattaaaactaataaaacaatagatcaa
atccaaaatactaataattatttttatccagataatgattatttaataaaaaattattca
ctagaaaatattaaaaaagttattaatgaaattaatttcaaagttgattttaatttattt
gatagtaataaaaaacatttagttaaatataaaaatataaataatttatcttcatttgaa
tatttacgtcaagtttgtttattgtcattaaaaaaatatcaacaaaaaattaagcctaat
ttagatttaaaactatatattagtaggttaaattatgaattagaagttattaagcaaatg
gggtttagtgattattttttaatagttagtgattatgtgaattttgcaaaaaaaaatgat
attttagtaggtcctggtagaggaagtgctgctggtagtttaattagttatttattaaga
attacagatattgatccattagaatatgatttattatttgaaagatttttaaatccagat
cgttctaatttaccagatattgatttagattttcaagataatagaagagaagaagtttta
gaatatttatttgaaaaatacggtaaatatcatgttggtatgattacaacttatcaaact
attggttataaaatggcttgaagagatgtatgtagagtttttaatattgatttattaatt
gttaataaaatttctaaagttttagatcaatatacaaattctgattttttagagtttatt
aaagaaaataaattattaaatgattattttcaaaacaatgtatttaaagaaatttttata
acaatgcataaaattgtaggtttaccacgtcaaacatcaacacatgcagctggaattgta
ttaactgattgtgatttaagagaacttgttcctattaaaattgggtttaacggaattaat
caaactcaatttgatatgaattatttagatgatttaggtctaattaaaatggatatttta
gggttaagaaatttaactactattcaagaaataaaacatttaatatatttaaatcaaaat
ttaaaaattagcttaaataaaattgatttaaatgataaaaaagcttttgaacttttaaaa
aataaacaaacttcaggaatttttcaacttgaatcaaaagggatgactgatttaatttca
aaaatgcaagttgattctattgaattaatttcaatagcttcagctttatatcgtccaggt
cctcaagaaatgatttctatttatttagaaaataaaaaaactaataagtttaaaattatt
gatcaaagtgtttttgagattttaaaaccaacttatggaattattatttatcaagaacaa
gtaatgcaaatgcttaataaagtagttaatttttcttatgcaaaagctgatattataaga
agagctatgagtaaaaaaaataataaagtaatgcaatcaatgaaattagaatttattaat
agtgctgttaagaataatttttcttataataaagctaatttaatttgaaattgaattgaa
aaattttcaaattatggatttaataaatcacattctatttcttattcttatataagttat
tgattagcttattttaaagctcattttacaactgaattttatactagtttattagatcaa
aatattggtaatgaaattaaaactcaacaatatattaaagagttgtatgattataagatt
aaagttaataaaccaagtgtgattaatgctaattttaattatcaaattataaacaaacaa
atttatatgccattaacttgtattaaatcaattggttatgaagtagttaaaaagataaat
ttagctaaaagcgaaaatgaaaatatgtatttagatattcataatttcatactagctatg
attaaacaaaaaattagtgttaatgtattacaaactttaataaaagctggagctttagat
atttttaactataataaaaaaacaatgatagaaaatctagatctattaattagtcaagct
aatgcttataaacaagttaataatattttagatgatgaaaaaattaatttaattatttat
gatgaatatgaagatgagattttagcaagttttgaaaaagaattatatggtttttttatt
gaacaaaatcctattttaaaacttaaaactagtaattttgatttaaatcttattgatatt
tctaaacttgaatataataaagtacaagtaattttaggttatattttaaaaattaaagaa
attaaagataaaaataataataaaatggcgtttgtaacaatttttgataacactagtgaa
cttgaactaacaatttttagtagtgattataaagatatttatcaagatttagttattaat
aaagcttatgtttttaaagtattaaaaactaaaacaaataataaaacttcaataaagttt
gttagtttaattaaagctatttag

DBGET integrated database retrieval system